MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome

Total Repeats: 43549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009328	CGA	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
2	NC_009328	TGA	2	6	463	468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893680
3	NC_009328	CGT	2	6	483	488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
4	NC_009328	GCC	2	6	605	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893680
5	NC_009328	CGG	2	6	664	669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893680
6	NC_009328	GTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
7	NC_009328	TTA	2	6	780	785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893680
8	NC_009328	GAC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
9	NC_009328	TGA	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893680
10	NC_009328	GAA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893680
11	NC_009328	CCA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	138893680
12	NC_009328	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893680
13	NC_009328	CGT	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
14	NC_009328	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893680
15	NC_009328	GTT	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893680
16	NC_009328	GCA	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
17	NC_009328	CGA	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
18	NC_009328	GGC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893680
19	NC_009328	ACG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
20	NC_009328	AAC	2	6	1804	1809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893681
21	NC_009328	TGC	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
22	NC_009328	CAA	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893681
23	NC_009328	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
24	NC_009328	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893681
25	NC_009328	CGT	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
26	NC_009328	GTT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893681
27	NC_009328	TCT	2	6	2443	2448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
28	NC_009328	GTC	2	6	2525	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
29	NC_009328	GAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893681
30	NC_009328	GGA	2	6	2621	2626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	138893681
31	NC_009328	TTC	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
32	NC_009328	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893681
33	NC_009328	ATG	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893681
34	NC_009328	TTG	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893681
35	NC_009328	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893682
36	NC_009328	GCT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893682
37	NC_009328	GGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893682
38	NC_009328	CAT	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893683
39	NC_009328	ATG	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
40	NC_009328	CAG	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
41	NC_009328	GCA	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
42	NC_009328	ATG	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
43	NC_009328	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
44	NC_009328	GGC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893683
45	NC_009328	GCG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893683
46	NC_009328	CCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	138893683
47	NC_009328	TAG	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
48	NC_009328	GCC	2	6	4036	4041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893683
49	NC_009328	ACG	2	6	4069	4074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
50	NC_009328	TGA	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
51	NC_009328	GCA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
52	NC_009328	ACA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893683
53	NC_009328	GAT	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
54	NC_009328	CCT	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	138893683
55	NC_009328	ACA	2	6	4321	4326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893683
56	NC_009328	AAG	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893683
57	NC_009328	GCC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893683
58	NC_009328	CTT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893683
59	NC_009328	AAC	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
60	NC_009328	TCG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
61	NC_009328	ACA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
62	NC_009328	CGG	2	6	4770	4775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
63	NC_009328	TGG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893684
64	NC_009328	GGC	2	6	4807	4812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
65	NC_009328	CGA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
66	NC_009328	GAC	3	9	4962	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
67	NC_009328	AAC	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
68	NC_009328	GGT	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893684
69	NC_009328	TGC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
70	NC_009328	ACG	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
71	NC_009328	AAC	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
72	NC_009328	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893684
73	NC_009328	CGT	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
74	NC_009328	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
75	NC_009328	AAT	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	138893684
76	NC_009328	ATC	2	6	5881	5886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893684
77	NC_009328	GCC	2	6	6063	6068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893684
78	NC_009328	GAT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893684
79	NC_009328	ACG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
80	NC_009328	TGC	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
81	NC_009328	CGT	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
82	NC_009328	GAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893684
83	NC_009328	AAC	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893685
84	NC_009328	CCG	2	6	6668	6673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
85	NC_009328	CCG	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
86	NC_009328	GCC	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
87	NC_009328	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
88	NC_009328	CAA	2	6	6947	6952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893685
89	NC_009328	ATG	2	6	6979	6984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893685
90	NC_009328	GGT	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893685
91	NC_009328	CGA	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
92	NC_009328	CCG	2	6	7080	7085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
93	NC_009328	TTG	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893685
94	NC_009328	AGC	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
95	NC_009328	ATT	2	6	7305	7310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893685
96	NC_009328	CGA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
97	NC_009328	GCG	2	6	7451	7456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893685
98	NC_009328	ATT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893685
99	NC_009328	CGC	2	6	7617	7622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
100	NC_009328	GCA	2	6	7743	7748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
101	NC_009328	ATT	2	6	7929	7934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893685
102	NC_009328	CGA	2	6	7937	7942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
103	NC_009328	GCG	2	6	7976	7981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893685
104	NC_009328	GTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893685
105	NC_009328	GAC	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
106	NC_009328	TTA	2	6	8176	8181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893685
107	NC_009328	GAC	2	6	8352	8357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
108	NC_009328	CTC	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	138893685
109	NC_009328	CTC	2	6	8411	8416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	138893685
110	NC_009328	CAA	2	6	8432	8437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893685
111	NC_009328	TGA	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893685
112	NC_009328	ATG	2	6	8617	8622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893685
113	NC_009328	AGA	2	6	8645	8650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893685
114	NC_009328	CCA	2	6	8651	8656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	138893685
115	NC_009328	TTG	2	6	8665	8670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893685
116	NC_009328	CGG	2	6	8729	8734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893685
117	NC_009328	GTC	2	6	8778	8783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893685
118	NC_009328	GAC	2	6	8789	8794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893685
119	NC_009328	GTG	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893685
120	NC_009328	GAA	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893685
121	NC_009328	AGC	2	6	9147	9152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893686
122	NC_009328	TCA	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893686
123	NC_009328	GTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893686
124	NC_009328	CGA	2	6	9343	9348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893686
125	NC_009328	TGT	2	6	9360	9365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893686
126	NC_009328	CAA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893686
127	NC_009328	ACA	2	6	9515	9520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893686
128	NC_009328	AGA	2	6	9523	9528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893686
129	NC_009328	TCA	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893686
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500	NC_009328	CTT	2	6	50510	50515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893718

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