MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 1509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	134301170
2	NC_009257	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	134301172
3	NC_009257	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	134301172
4	NC_009257	ATTAT	2	10	5636	5645	40 %	60 %	0 %	0 %	134301175
5	NC_009257	GTTGT	2	10	5673	5682	0 %	60 %	40 %	0 %	134301175
6	NC_009257	ATACT	2	10	8282	8291	40 %	40 %	0 %	20 %	134301177
7	NC_009257	AAAAG	2	10	10199	10208	80 %	0 %	20 %	0 %	134301178
8	NC_009257	AGAAA	2	10	10257	10266	80 %	0 %	20 %	0 %	134301179
9	NC_009257	ACAAA	2	10	11064	11073	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009257	AGTTT	2	10	11193	11202	20 %	60 %	20 %	0 %	134301180
11	NC_009257	ATTTT	2	10	11463	11472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009257	TACAT	2	10	12724	12733	40 %	40 %	0 %	20 %	134301181
13	NC_009257	GTAAT	2	10	13266	13275	40 %	40 %	20 %	0 %	134301181
14	NC_009257	GAGTT	2	10	18304	18313	20 %	40 %	40 %	0 %	134301182
15	NC_009257	TAACT	2	10	19282	19291	40 %	40 %	0 %	20 %	134301183
16	NC_009257	TAAAA	2	10	19406	19415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009257	ACAAA	2	10	22391	22400	80 %	0 %	0 %	20 %	134301188
18	NC_009257	TTTGT	2	10	26558	26567	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009257	ACATC	2	10	26779	26788	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009257	AAAGT	2	10	27065	27074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009257	ACCAA	2	10	27105	27114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009257	AAAGA	2	10	27584	27593	80 %	0 %	20 %	0 %	134301192
23	NC_009257	TGAAA	2	10	34390	34399	60 %	20 %	20 %	0 %	134301194
24	NC_009257	GTCGA	2	10	35877	35886	20 %	20 %	40 %	20 %	134301195
25	NC_009257	TAAGT	2	10	37064	37073	40 %	40 %	20 %	0 %	134301197
26	NC_009257	TAAAT	2	10	37556	37565	60 %	40 %	0 %	0 %	134301197
27	NC_009257	TTATA	2	10	38001	38010	40 %	60 %	0 %	0 %	134301198
28	NC_009257	TTTTC	2	10	38015	38024	0 %	80 %	0 %	20 %	134301198
29	NC_009257	TAATA	2	10	39391	39400	60 %	40 %	0 %	0 %	134301199
30	NC_009257	TTTTA	2	10	39728	39737	20 %	80 %	0 %	0 %	134301199
31	NC_009257	GCTTG	2	10	40904	40913	0 %	40 %	40 %	20 %	134301199
32	NC_009257	TTTTC	2	10	41962	41971	0 %	80 %	0 %	20 %	134301199
33	NC_009257	ATTTT	2	10	41985	41994	20 %	80 %	0 %	0 %	134301199
34	NC_009257	TATAA	2	10	42791	42800	60 %	40 %	0 %	0 %	134301200
35	NC_009257	TATTT	2	10	43395	43404	20 %	80 %	0 %	0 %	134301201
36	NC_009257	ATTAA	2	10	45865	45874	60 %	40 %	0 %	0 %	134301203
37	NC_009257	TCTTT	2	10	46579	46588	0 %	80 %	0 %	20 %	134301203
38	NC_009257	TTCTA	2	10	48492	48501	20 %	60 %	0 %	20 %	134301205
39	NC_009257	TATAA	2	10	48803	48812	60 %	40 %	0 %	0 %	134301205
40	NC_009257	TTGTT	2	10	50733	50742	0 %	80 %	20 %	0 %	134301208
41	NC_009257	TATTC	2	10	51848	51857	20 %	60 %	0 %	20 %	134301208
42	NC_009257	TTGTT	2	10	55025	55034	0 %	80 %	20 %	0 %	134301209
43	NC_009257	GAATA	2	10	57473	57482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009257	AAAGA	2	10	62203	62212	80 %	0 %	20 %	0 %	134301210
45	NC_009257	ATGTG	2	10	62771	62780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009257	ATTTT	2	10	63496	63505	20 %	80 %	0 %	0 %	134301211
47	NC_009257	TTTAG	2	10	63684	63693	20 %	60 %	20 %	0 %	134301211
48	NC_009257	TATGG	2	10	65922	65931	20 %	40 %	40 %	0 %	134301212
49	NC_009257	TCTAC	2	10	67166	67175	20 %	40 %	0 %	40 %	134301212
50	NC_009257	AGTGG	2	10	67630	67639	20 %	20 %	60 %	0 %	134301213
51	NC_009257	GCAAA	2	10	67687	67696	60 %	0 %	20 %	20 %	134301213
52	NC_009257	GCAGA	2	10	68121	68130	40 %	0 %	40 %	20 %	134301214
53	NC_009257	CTTAT	2	10	68377	68386	20 %	60 %	0 %	20 %	134301214
54	NC_009257	ATTAC	2	10	70580	70589	40 %	40 %	0 %	20 %	134301214
55	NC_009257	TACAC	2	10	72773	72782	40 %	20 %	0 %	40 %	134301216
56	NC_009257	TTTTA	2	10	73486	73495	20 %	80 %	0 %	0 %	134301216
57	NC_009257	AGTTA	2	10	79236	79245	40 %	40 %	20 %	0 %	134301219
58	NC_009257	TTTAG	2	10	79333	79342	20 %	60 %	20 %	0 %	134301219
59	NC_009257	TAAAA	2	10	79575	79584	80 %	20 %	0 %	0 %	134301219
60	NC_009257	TCTTA	2	10	79922	79931	20 %	60 %	0 %	20 %	134301220
61	NC_009257	TGCTT	2	10	81821	81830	0 %	60 %	20 %	20 %	134301221
62	NC_009257	TTTTA	2	10	84950	84959	20 %	80 %	0 %	0 %	134301224
63	NC_009257	GGTGA	2	10	87700	87709	20 %	20 %	60 %	0 %	134301226
64	NC_009257	ATTAC	2	10	88412	88421	40 %	40 %	0 %	20 %	134301226
65	NC_009257	GCTAA	2	10	89814	89823	40 %	20 %	20 %	20 %	134301227
66	NC_009257	ACTAA	2	10	91125	91134	60 %	20 %	0 %	20 %	134301227
67	NC_009257	AAAAT	2	10	91141	91150	80 %	20 %	0 %	0 %	134301227
68	NC_009257	AGCTA	2	10	91367	91376	40 %	20 %	20 %	20 %	134301227
69	NC_009257	AAAGA	2	10	93295	93304	80 %	0 %	20 %	0 %	134301228
70	NC_009257	TTTCT	2	10	96539	96548	0 %	80 %	0 %	20 %	134301230
71	NC_009257	ACAGT	2	10	98603	98612	40 %	20 %	20 %	20 %	134301232
72	NC_009257	CTTTT	2	10	99392	99401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009257	TAATG	2	10	99508	99517	40 %	40 %	20 %	0 %	134301233
74	NC_009257	TAGGT	2	10	101821	101830	20 %	40 %	40 %	0 %	134301235
75	NC_009257	TTTGA	2	10	102819	102828	20 %	60 %	20 %	0 %	134301236
76	NC_009257	TAGAT	2	10	103093	103102	40 %	40 %	20 %	0 %	134301237
77	NC_009257	GATTA	2	10	104933	104942	40 %	40 %	20 %	0 %	134301238
78	NC_009257	GATGT	2	10	105089	105098	20 %	40 %	40 %	0 %	134301238
79	NC_009257	GATTT	2	10	106764	106773	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009257	ATTTT	2	10	107196	107205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009257	ATTAA	2	10	109482	109491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009257	GTATG	2	10	111012	111021	20 %	40 %	40 %	0 %	134301242
83	NC_009257	GCTAA	2	10	112221	112230	40 %	20 %	20 %	20 %	134301243
84	NC_009257	ATTCT	2	10	114892	114901	20 %	60 %	0 %	20 %	134301244
85	NC_009257	GTTTT	2	10	115137	115146	0 %	80 %	20 %	0 %	134301244
86	NC_009257	CAAGG	2	10	118147	118156	40 %	0 %	40 %	20 %	134301249
87	NC_009257	ACCAA	2	10	120703	120712	60 %	0 %	0 %	40 %	134301252
88	NC_009257	TACAG	2	10	124125	124134	40 %	20 %	20 %	20 %	134301254
89	NC_009257	ATTTT	2	10	124538	124547	20 %	80 %	0 %	0 %	134301255
90	NC_009257	ATTTT	2	10	124962	124971	20 %	80 %	0 %	0 %	134301255
91	NC_009257	TATTC	2	10	128107	128116	20 %	60 %	0 %	20 %	134301258
92	NC_009257	TAGTT	2	10	129462	129471	20 %	60 %	20 %	0 %	134301259
93	NC_009257	AAGCT	2	10	130772	130781	40 %	20 %	20 %	20 %	134301260
94	NC_009257	GATTT	2	10	131049	131058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009257	TTGGT	2	10	131250	131259	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009257	GATAG	2	10	131948	131957	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009257	TTAAT	2	10	132351	132360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009257	AAAAT	2	10	134502	134511	80 %	20 %	0 %	0 %	134301263
99	NC_009257	TAATT	2	10	135532	135541	40 %	60 %	0 %	0 %	134301263
100	NC_009257	TGAAA	2	10	137844	137853	60 %	20 %	20 %	0 %	134301264
101	NC_009257	TAAAT	2	10	139335	139344	60 %	40 %	0 %	0 %	134301266
102	NC_009257	CAAAC	2	10	140459	140468	60 %	0 %	0 %	40 %	134301267
103	NC_009257	GCAAA	2	10	141507	141516	60 %	0 %	20 %	20 %	134301268
104	NC_009257	TTTAG	2	10	142414	142423	20 %	60 %	20 %	0 %	134301269
105	NC_009257	AAACA	2	10	143077	143086	80 %	0 %	0 %	20 %	134301269
106	NC_009257	TAAGA	2	10	144067	144076	60 %	20 %	20 %	0 %	134301270
107	NC_009257	AATTT	2	10	144476	144485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009257	AATAA	2	10	145003	145012	80 %	20 %	0 %	0 %	134301272
109	NC_009257	GTGAA	2	10	148181	148190	40 %	20 %	40 %	0 %	134301276
110	NC_009257	GTGCA	2	10	150769	150778	20 %	20 %	40 %	20 %	134301278
111	NC_009257	GCATA	2	10	151192	151201	40 %	20 %	20 %	20 %	134301279
112	NC_009257	ATAAA	2	10	153256	153265	80 %	20 %	0 %	0 %	134301280
113	NC_009257	TATCT	2	10	156877	156886	20 %	60 %	0 %	20 %	134301284
114	NC_009257	AAAAT	2	10	157190	157199	80 %	20 %	0 %	0 %	134301285
115	NC_009257	TCACT	2	10	159119	159128	20 %	40 %	0 %	40 %	134301286
116	NC_009257	TTATC	2	10	159266	159275	20 %	60 %	0 %	20 %	134301287
117	NC_009257	AAGAA	2	10	160949	160958	80 %	0 %	20 %	0 %	134301288
118	NC_009257	ATAGA	2	10	162644	162653	60 %	20 %	20 %	0 %	134301290
119	NC_009257	TAATG	2	10	162891	162900	40 %	40 %	20 %	0 %	134301290
120	NC_009257	ACTCT	2	10	164075	164084	20 %	40 %	0 %	40 %	134301290
121	NC_009257	TAAAT	2	10	164899	164908	60 %	40 %	0 %	0 %	134301290
122	NC_009257	GAACC	2	10	168202	168211	40 %	0 %	20 %	40 %	134301293
123	NC_009257	GTCTT	2	10	169251	169260	0 %	60 %	20 %	20 %	134301295
124	NC_009257	AAACT	2	10	170468	170477	60 %	20 %	0 %	20 %	134301297
125	NC_009257	TTTGA	2	10	171145	171154	20 %	60 %	20 %	0 %	134301299
126	NC_009257	GTATT	2	10	172319	172328	20 %	60 %	20 %	0 %	134301300
127	NC_009257	TTTAT	2	10	173583	173592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009257	TAGTA	2	10	174747	174756	40 %	40 %	20 %	0 %	134301302
129	NC_009257	TGATA	2	10	176572	176581	40 %	40 %	20 %	0 %	134301303
130	NC_009257	ATAGA	2	10	176655	176664	60 %	20 %	20 %	0 %	134301303
131	NC_009257	ATTAG	2	10	177209	177218	40 %	40 %	20 %	0 %	134301303
132	NC_009257	GTTTT	2	10	177816	177825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009257	TATCA	2	10	178665	178674	40 %	40 %	0 %	20 %	134301304
134	NC_009257	AATGT	2	10	181622	181631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009257	AATAT	2	10	181651	181660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009257	TTAAC	2	10	182347	182356	40 %	40 %	0 %	20 %	134301305
137	NC_009257	GTCAA	2	10	182489	182498	40 %	20 %	20 %	20 %	134301305
138	NC_009257	CAGAT	2	10	185391	185400	40 %	20 %	20 %	20 %	134301309
139	NC_009257	CATCT	2	10	187204	187213	20 %	40 %	0 %	40 %	134301311
140	NC_009257	TTCTT	2	10	187276	187285	0 %	80 %	0 %	20 %	134301311
141	NC_009257	TTTCT	2	10	188368	188377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009257	ATTTA	2	10	189471	189480	40 %	60 %	0 %	0 %	134301312
143	NC_009257	CATAT	2	10	189717	189726	40 %	40 %	0 %	20 %	134301312
144	NC_009257	CATTT	2	10	189873	189882	20 %	60 %	0 %	20 %	134301312
145	NC_009257	ACAAT	2	10	190074	190083	60 %	20 %	0 %	20 %	134301312
146	NC_009257	TTGAT	2	10	190275	190284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009257	AAACT	2	10	193214	193223	60 %	20 %	0 %	20 %	134301315
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150	NC_009257	CTCTA	2	10	196172	196181	20 %	40 %	0 %	40 %	134301316
151	NC_009257	AAACT	2	10	196318	196327	60 %	20 %	0 %	20 %	134301316
152	NC_009257	TTTTC	2	10	199758	199767	0 %	80 %	0 %	20 %	134301319
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159	NC_009257	TGTAT	2	10	210130	210139	20 %	60 %	20 %	0 %	134301327
160	NC_009257	TGCAA	2	10	210598	210607	40 %	20 %	20 %	20 %	134301327
161	NC_009257	GTATT	2	10	215402	215411	20 %	60 %	20 %	0 %	134301331
162	NC_009257	GTATG	2	10	219624	219633	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009257	GGTGT	2	10	220866	220875	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009257	ATTAC	2	10	224455	224464	40 %	40 %	0 %	20 %	134301336
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176	NC_009257	TACAT	2	10	244786	244795	40 %	40 %	0 %	20 %	134301354
177	NC_009257	CTATA	2	10	245033	245042	40 %	40 %	0 %	20 %	134301354
178	NC_009257	GTGAT	2	10	246540	246549	20 %	40 %	40 %	0 %	134301354
179	NC_009257	ATGGT	2	10	246951	246960	20 %	40 %	40 %	0 %	134301354
180	NC_009257	TTTAT	2	10	253179	253188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009257	ACTAC	2	10	253381	253390	40 %	20 %	0 %	40 %	134301361
182	NC_009257	TGCTA	2	10	253694	253703	20 %	40 %	20 %	20 %	134301361
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186	NC_009257	AGCTA	2	10	259034	259043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_009257	AGTAA	2	10	259224	259233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_009257	TAAAA	2	10	266988	266997	80 %	20 %	0 %	0 %	134301374
198	NC_009257	TAAGA	2	10	267819	267828	60 %	20 %	20 %	0 %	134301374
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201	NC_009257	TAGCT	2	10	273742	273751	20 %	40 %	20 %	20 %	134301380
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211	NC_009257	GTTTA	2	10	280828	280837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_009257	AAAAT	2	10	301626	301635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_009257	ATCTA	2	10	301703	301712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
236	NC_009257	GTAAA	2	10	302013	302022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_009257	TATGG	2	10	310883	310892	20 %	40 %	40 %	0 %	134301413
244	NC_009257	AAAAT	2	10	312264	312273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009257	GTTAT	2	10	316602	316611	20 %	60 %	20 %	0 %	134301416
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249	NC_009257	CCAAG	2	10	318833	318842	40 %	0 %	20 %	40 %	134301418
250	NC_009257	TATTC	2	10	318920	318929	20 %	60 %	0 %	20 %	134301418
251	NC_009257	GTATG	2	10	321300	321309	20 %	40 %	40 %	0 %	134301418
252	NC_009257	CATCT	2	10	322028	322037	20 %	40 %	0 %	40 %	134301419
253	NC_009257	TTCTT	2	10	322100	322109	0 %	80 %	0 %	20 %	134301419
254	NC_009257	TTGAT	2	10	325862	325871	20 %	60 %	20 %	0 %	134301425
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256	NC_009257	CCTTG	2	10	328128	328137	0 %	40 %	20 %	40 %	134301428
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258	NC_009257	TACAT	2	10	328935	328944	40 %	40 %	0 %	20 %	134301430
259	NC_009257	TTTTG	3	15	329254	329268	0 %	80 %	20 %	0 %	134301431
260	NC_009257	AGTTT	2	10	329704	329713	20 %	60 %	20 %	0 %	134301432
261	NC_009257	GTTTG	2	10	329859	329868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009257	CAATT	2	10	329870	329879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_009257	ATATA	2	10	329995	330004	60 %	40 %	0 %	0 %	134301433
264	NC_009257	AATGA	2	10	332583	332592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009257	TAGAT	2	10	332595	332604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009257	AGAGA	2	10	333702	333711	60 %	0 %	40 %	0 %	134301435
267	NC_009257	AAGCA	2	10	334347	334356	60 %	0 %	20 %	20 %	134301436
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269	NC_009257	AAAGA	2	10	335080	335089	80 %	0 %	20 %	0 %	134301437
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400	NC_009257	TAATT	2	10	507259	507268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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