MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	ACAAA	2	10	11064	11073	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009257	ATTTT	2	10	11463	11472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009257	TAAAA	2	10	19406	19415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009257	TTTGT	2	10	26558	26567	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009257	ACATC	2	10	26779	26788	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009257	AAAGT	2	10	27065	27074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009257	ACCAA	2	10	27105	27114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009257	GAATA	2	10	57473	57482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009257	ATGTG	2	10	62771	62780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009257	CTTTT	2	10	99392	99401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009257	GATTT	2	10	106764	106773	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009257	ATTTT	2	10	107196	107205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009257	ATTAA	2	10	109482	109491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009257	GATTT	2	10	131049	131058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009257	TTGGT	2	10	131250	131259	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009257	GATAG	2	10	131948	131957	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009257	TTAAT	2	10	132351	132360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009257	AATTT	2	10	144476	144485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009257	TTTAT	2	10	173583	173592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009257	GTTTT	2	10	177816	177825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009257	AATGT	2	10	181622	181631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009257	AATAT	2	10	181651	181660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009257	TTTCT	2	10	188368	188377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009257	TTGAT	2	10	190275	190284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009257	GTATG	2	10	219624	219633	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009257	GGTGT	2	10	220866	220875	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009257	TTTAT	2	10	253179	253188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009257	TAAAA	2	10	258198	258207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009257	AGCTA	2	10	259034	259043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009257	AGTAA	2	10	259224	259233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009257	AATGT	2	10	266661	266670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009257	TATAA	2	10	271363	271372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009257	AGCAG	2	10	277610	277619	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009257	GTTTA	2	10	280828	280837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009257	GTTTT	2	10	285473	285482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009257	ATCTT	2	10	285570	285579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009257	AAATA	2	10	285642	285651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009257	AAAAT	2	10	301626	301635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009257	ATCTA	2	10	301703	301712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009257	GTAAA	2	10	302013	302022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009257	AAAAT	2	10	312264	312273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009257	GATTA	2	10	318719	318728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009257	GTTTG	2	10	329859	329868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009257	CAATT	2	10	329870	329879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009257	AATGA	2	10	332583	332592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009257	TAGAT	2	10	332595	332604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009257	AAATT	2	10	334549	334558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009257	AGAAA	2	10	337046	337055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009257	GATAA	2	10	344340	344349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009257	TTCTT	2	10	350651	350660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009257	GTAAA	2	10	356497	356506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009257	ATTTA	2	10	370338	370347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009257	ACTAA	2	10	379819	379828	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009257	AGTTA	2	10	388751	388760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009257	ATTTA	2	10	389136	389145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009257	GTATT	2	10	389317	389326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009257	TTTAG	2	10	390861	390870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009257	AAAAT	2	10	403523	403532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009257	GAATG	2	10	404305	404314	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009257	TTTCT	2	10	407992	408001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009257	AATTT	2	10	425621	425630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009257	TTTCT	2	10	433838	433847	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009257	TAATT	2	10	439753	439762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009257	TCTCG	2	10	444177	444186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009257	TAACT	2	10	448150	448159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009257	AATAT	2	10	450473	450482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009257	GCTAT	2	10	451536	451545	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009257	ACTAG	2	10	451756	451765	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009257	AATCA	2	10	454651	454660	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009257	AACTA	2	10	457192	457201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009257	TATTT	2	10	462675	462684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009257	AAAGT	2	10	463670	463679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009257	TTAAA	2	10	491757	491766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009257	TAAAT	2	10	491776	491785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009257	AAGTT	2	10	494082	494091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009257	AAAGC	2	10	500326	500335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009257	TTTTG	2	10	503292	503301	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009257	TAATT	2	10	507259	507268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009257	AAATA	2	10	516020	516029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009257	AAGTA	2	10	516165	516174	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009257	AAAAT	2	10	516629	516638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009257	GAATA	2	10	547186	547195	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009257	TTTAA	2	10	550675	550684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009257	AATCA	2	10	562250	562259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009257	TAAAA	2	10	564673	564682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009257	CTTTT	2	10	567348	567357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009257	AAATT	2	10	573483	573492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009257	TATAT	2	10	595810	595819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009257	TAAAA	2	10	603105	603114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009257	AATAT	2	10	606063	606072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009257	ACAAA	2	10	611493	611502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009257	TAGTA	2	10	615275	615284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009257	TTTCT	2	10	626129	626138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009257	ATTTA	2	10	633077	633086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009257	TGGTA	2	10	634068	634077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009257	AATCA	2	10	635147	635156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009257	TAATT	2	10	635814	635823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009257	TAAAC	2	10	640789	640798	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009257	AAATC	2	10	641158	641167	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009257	TTTTG	2	10	646206	646215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009257	ATTTT	2	10	646673	646682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009257	AAATA	2	10	653292	653301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009257	ATTGA	2	10	660010	660019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009257	ATAGC	2	10	661881	661890	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009257	AAAAT	2	10	662059	662068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009257	ATTTA	2	10	672260	672269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009257	TTTAG	2	10	682615	682624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009257	ATCTC	2	10	682696	682705	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009257	ATAAA	2	10	684607	684616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009257	TTATA	2	10	684638	684647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009257	TAGTT	2	10	690124	690133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009257	TGTTT	2	10	693508	693517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009257	TAAAT	2	10	704039	704048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009257	AAAAT	2	10	706644	706653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009257	GATTT	2	10	712725	712734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009257	TATAA	2	10	713622	713631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009257	TGATT	2	10	722676	722685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009257	AAGTT	2	10	722713	722722	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009257	TAACT	2	10	723183	723192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009257	CTAAA	2	10	727032	727041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009257	TGTTA	2	10	734709	734718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009257	TTTTA	2	10	734723	734732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009257	GAATA	2	10	736801	736810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009257	TAATT	2	10	741456	741465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009257	TTTCT	2	10	744188	744197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009257	TAATT	2	10	746060	746069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009257	TTTCT	2	10	746829	746838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009257	AGTTT	2	10	747041	747050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009257	TATCA	2	10	753397	753406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009257	TTTGA	2	10	755586	755595	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009257	GTTAT	2	10	763011	763020	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009257	AGCTA	2	10	796557	796566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009257	GTCCA	2	10	802914	802923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009257	CTATT	2	10	803435	803444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009257	TAGAG	2	10	820261	820270	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009257	GATAT	2	10	821172	821181	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009257	TCTAT	2	10	830595	830604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009257	ATTGA	2	10	847705	847714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009257	ATCAA	2	10	849216	849225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009257	ATTAA	2	10	850347	850356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009257	AATAA	2	10	851864	851873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009257	TGTTA	2	10	854758	854767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009257	TATTT	2	10	858469	858478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009257	TATTT	2	10	858481	858490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009257	TAAAA	2	10	858942	858951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009257	AGCAA	2	10	868031	868040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009257	AATAT	2	10	868761	868770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.