MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 chromosome 1

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009256	CGCGAC	2	12	233	244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009256	TGATCG	2	12	10919	10930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009256	GTGGGC	2	12	62895	62906	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009256	CGCCGT	2	12	65683	65694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009256	CCTTAC	2	12	65828	65839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009256	CGATCG	2	12	100904	100915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009256	CACGAG	7	42	146480	146521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009256	CACGAC	5	30	146522	146551	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009256	CGAGCG	2	12	160603	160614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009256	GGTTTC	2	12	187456	187467	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009256	GTTCAC	2	12	189925	189936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009256	TCGACA	2	12	190387	190398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009256	GGCGCA	2	12	192233	192244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009256	CGGCGC	2	12	192790	192801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009256	TGCGGT	2	12	210204	210215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009256	TCGGTG	2	12	214915	214926	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009256	AATCGA	2	12	235173	235184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009256	TCAGCC	2	12	252666	252677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009256	TCAGCC	6	36	252684	252719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009256	CGCGGC	2	12	264283	264294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009256	ATTCCA	2	12	283462	283473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009256	CGGCCG	2	12	404509	404520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009256	TACGGC	2	12	458510	458521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009256	CCGCGA	2	12	513436	513447	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009256	GCCAGG	2	12	555257	555268	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009256	GAAAAA	2	12	575653	575664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009256	GGGCCG	2	12	577793	577804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009256	GCGAAC	2	12	605744	605755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009256	CTGCGC	2	12	625382	625393	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009256	CGGCCC	2	12	630400	630411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009256	AGCAGG	2	12	655357	655368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009256	GGGCCG	2	12	692600	692611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009256	GGGGCG	2	12	705887	705898	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009256	CGGCGA	2	12	708231	708242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009256	GATTCG	2	12	708959	708970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009256	TCGCGA	2	12	731634	731645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009256	CGCGGC	2	12	808324	808335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009256	GGCGCG	2	12	824767	824778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009256	GATGCG	3	18	824779	824796	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009256	ACGACA	2	12	828840	828851	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009256	GGCGGG	2	12	833186	833197	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009256	GGGAGC	2	12	836981	836992	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009256	AAATCG	2	12	840486	840497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009256	CGATAT	2	12	856541	856552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009256	CTTTTT	2	12	858706	858717	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009256	GCATGC	2	12	862269	862280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009256	AGGGGA	2	12	951240	951251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009256	GGCGTC	2	12	954449	954460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009256	GCGCCG	2	12	1018341	1018352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009256	TGCATG	2	12	1019786	1019797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009256	CGATCG	2	12	1028824	1028835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009256	GAACTG	2	12	1101923	1101934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009256	GAAAAA	2	12	1114597	1114608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009256	TTGCGC	2	12	1118512	1118523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009256	TTTTGT	2	12	1128825	1128836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009256	CCCGGC	2	12	1134784	1134795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009256	TCGCGC	2	12	1165242	1165253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009256	GCGCGG	2	12	1165761	1165772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009256	ATGCGC	2	12	1175736	1175747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009256	TTGGCG	2	12	1185267	1185278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009256	ACGCCA	3	18	1187367	1187384	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009256	GCGACA	2	12	1194801	1194812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009256	CGCGAG	2	12	1200083	1200094	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009256	CACGGC	2	12	1200209	1200220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009256	CGGTGC	2	12	1202682	1202693	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009256	CGGAAA	2	12	1212225	1212236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009256	GGCGCG	2	12	1219571	1219582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009256	GCGATC	2	12	1257638	1257649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009256	GCAGAA	2	12	1306189	1306200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009256	GTTGCC	15	90	1315564	1315653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009256	GTTGCC	2	12	1317125	1317136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009256	GCCGAA	2	12	1317503	1317514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009256	AGCAGG	3	18	1317616	1317633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009256	GCCGGA	2	12	1317788	1317799	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009256	CAGCGA	2	12	1318240	1318251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009256	CGCGAC	2	12	1322138	1322149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009256	TGGCAA	2	12	1365586	1365597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009256	CGGTTG	2	12	1365648	1365659	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009256	AAAAAG	2	12	1375332	1375343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009256	ACGCGC	2	12	1377079	1377090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009256	TGGCAA	2	12	1382261	1382272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009256	TTGTGT	2	12	1384649	1384660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009256	TCCTGT	3	18	1424539	1424556	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009256	GTGCGC	2	12	1479916	1479927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009256	CATGCG	2	12	1480161	1480172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009256	GTCGAT	2	12	1491154	1491165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009256	GATTTG	2	12	1497712	1497723	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009256	GGTGCG	2	12	1519769	1519780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009256	TGCTCC	2	12	1540991	1541002	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009256	GCCGAC	2	12	1568072	1568083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009256	CGAGCG	2	12	1618668	1618679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009256	GAGCGT	2	12	1619620	1619631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009256	CGGCAT	2	12	1656669	1656680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009256	CGGATG	2	12	1658976	1658987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009256	GCGGGT	2	12	1659002	1659013	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009256	CCGTGC	2	12	1660651	1660662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009256	TGCGCG	2	12	1663566	1663577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009256	CACGGC	2	12	1674954	1674965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009256	CCGTGC	2	12	1684181	1684192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009256	CGCGCT	2	12	1709465	1709476	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009256	CGCCGG	2	12	1762102	1762113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009256	CGGATG	2	12	1765568	1765579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009256	GCTCCT	2	12	1804168	1804179	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009256	CTGCCG	2	12	1814140	1814151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009256	GCCGCG	2	12	1880580	1880591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009256	GAAATC	2	12	1884001	1884012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009256	CGCGGG	3	18	1899745	1899762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009256	GTGAAG	2	12	1930084	1930095	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009256	CGATGG	2	12	1988091	1988102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009256	GTTTGC	2	12	1991015	1991026	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009256	TGCGTG	2	12	2001089	2001100	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009256	CGGCCG	2	12	2009885	2009896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009256	ACGCGC	2	12	2037171	2037182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009256	TCGACG	2	12	2044706	2044717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009256	GCCGGC	2	12	2102471	2102482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009256	GTGCGC	2	12	2102595	2102606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009256	GCGCGG	2	12	2139198	2139209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009256	ATCGCC	2	12	2172065	2172076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009256	GCACCC	2	12	2187399	2187410	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009256	AAATCG	2	12	2221150	2221161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009256	AGGCGC	2	12	2221707	2221718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009256	GATCTC	2	12	2234203	2234214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009256	GGATTC	2	12	2293751	2293762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009256	TTGCTG	2	12	2305750	2305761	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009256	TCGCTG	2	12	2305766	2305777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009256	GCAAAG	2	12	2311575	2311586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009256	CAGGCG	2	12	2316091	2316102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009256	CGGGCT	2	12	2322679	2322690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009256	AGACCG	2	12	2330358	2330369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009256	GGATGC	2	12	2335316	2335327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009256	GCCCGA	2	12	2360609	2360620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009256	CTGCCG	2	12	2362280	2362291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009256	CGCTGG	2	12	2383512	2383523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009256	GTCGCG	2	12	2383582	2383593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009256	GCGCCT	2	12	2383849	2383860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009256	GCGTGG	2	12	2383867	2383878	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_009256	GCATGC	3	18	2490099	2490116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009256	CACGCG	2	12	2500228	2500239	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009256	TCGCGC	2	12	2505552	2505563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009256	GCGGCC	2	12	2538999	2539010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009256	GCCGCG	2	12	2571717	2571728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009256	GGCGCA	2	12	2626574	2626585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009256	TTCCCG	2	12	2650072	2650083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009256	CGGCCG	2	12	2665381	2665392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009256	GCGCCC	2	12	2689208	2689219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009256	GAAACC	2	12	2738216	2738227	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009256	CAGCGG	2	12	2782750	2782761	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009256	TCCCAT	2	12	2786438	2786449	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009256	CGGCCG	2	12	2802528	2802539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009256	GCCCGC	2	12	2816825	2816836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_009256	CGTACG	2	12	2838948	2838959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009256	CGCGCC	2	12	2851798	2851809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_009256	CGCATC	2	12	2873727	2873738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009256	CGAAGC	2	12	2882206	2882217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_009256	CGGGCA	2	12	2905013	2905024	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_009256	GGCGCT	2	12	2922917	2922928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_009256	GCCGGC	2	12	2949410	2949421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_009256	TGTCTT	2	12	2964451	2964462	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_009256	GTTGCC	2	12	2985502	2985513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_009256	GCCCCG	2	12	2985733	2985744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_009256	CGGAAC	2	12	3025671	3025682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_009256	ACGGCC	2	12	3027737	3027748	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009256	CCCTTT	2	12	3041284	3041295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_009256	ACGGCA	2	12	3077856	3077867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009256	TGCAGT	2	12	3088952	3088963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_009256	CCCGCT	2	12	3099112	3099123	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_009256	AGCGCC	2	12	3104038	3104049	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_009256	CCAAGA	3	18	3111460	3111477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_009256	GACTGG	3	18	3111488	3111505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_009256	CAAAAA	2	12	3111620	3111631	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.