MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	CTTAAA	2	12	6793	6804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009253	AAAGCG	2	12	12846	12857	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009253	CGCAGG	2	12	15263	15274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009253	CTAACC	2	12	23066	23077	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009253	GGCTGC	2	12	37348	37359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009253	ATTATG	2	12	37642	37653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009253	AATTTA	2	12	37904	37915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009253	GTTATT	2	12	56133	56144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009253	CTATTA	2	12	94744	94755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009253	CATAAG	2	12	99885	99896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009253	TTTTGT	2	12	104828	104839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009253	AAAAAT	2	12	178863	178874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009253	TAAGGA	2	12	182161	182172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009253	CGCAGG	2	12	189854	189865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009253	TTGCCA	2	12	256349	256360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009253	AAAGTA	2	12	324535	324546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009253	AAAGCG	2	12	360430	360441	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009253	AAAGCG	2	12	360863	360874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009253	ATAAAA	2	12	373030	373041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009253	ATTTAT	2	12	379339	379350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009253	TTTTAT	2	12	392306	392317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009253	AATATA	2	12	392366	392377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009253	CATCCC	2	12	397034	397045	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009253	ATTTTT	2	12	405022	405033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009253	GTAATT	2	12	406616	406627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009253	ACGTTA	2	12	421350	421361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009253	AATAAA	2	12	436951	436962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009253	AAAAAT	2	12	440968	440979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009253	AAAGCG	2	12	443999	444010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009253	CGCAGG	2	12	446416	446427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009253	AGTCTT	2	12	453042	453053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009253	TAACAA	2	12	471532	471543	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009253	TTAATA	2	12	476878	476889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009253	AATAAA	2	12	489515	489526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009253	TTAATT	2	12	494500	494511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009253	ATGCAA	2	12	499048	499059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009253	CTTAAC	2	12	507260	507271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009253	CAAAAC	2	12	508172	508183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009253	AAGTGA	2	12	542411	542422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009253	AACTGC	2	12	545702	545713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009253	TGCTCC	2	12	546184	546195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009253	GGGTTG	2	12	546496	546507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009253	TTCCAC	2	12	592497	592508	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009253	TTTAAT	2	12	643566	643577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009253	AAAATA	2	12	678102	678113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009253	TTTTGC	2	12	678551	678562	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009253	TAAATA	2	12	680157	680168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009253	CCAAAA	2	12	723980	723991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009253	GAAAGG	3	18	725467	725484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009253	AATTAA	2	12	727996	728007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009253	CAGGTA	2	12	745703	745714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009253	TTATTG	2	12	751908	751919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009253	TTTTTG	2	12	773989	774000	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009253	CCAACT	2	12	796374	796385	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009253	GTTGAA	2	12	811400	811411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009253	TTAAGG	2	12	811922	811933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009253	CTATTA	2	12	826664	826675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009253	AAATCA	2	12	846813	846824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009253	GTTTTT	2	12	871712	871723	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009253	AATAGG	2	12	872662	872673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009253	AAAAGA	2	12	873028	873039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009253	GTTTTT	2	12	873715	873726	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009253	AATATT	2	12	904500	904511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009253	AGAAAA	2	12	910562	910573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009253	ATTAAC	2	12	936618	936629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009253	AGTATA	2	12	943546	943557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009253	ATTAAC	2	12	949996	950007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009253	CACTTA	2	12	964915	964926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009253	GAAAAT	2	12	968543	968554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009253	GAAAAC	2	12	984848	984859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009253	GGTTTT	2	12	991883	991894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009253	AAAGAT	2	12	1043720	1043731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009253	CAATGT	2	12	1105144	1105155	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009253	TTTTAT	2	12	1118745	1118756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009253	CCCCGT	2	12	1147841	1147852	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009253	TTTAAG	2	12	1165521	1165532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009253	ATCCAT	2	12	1234718	1234729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009253	GTAATA	2	12	1236888	1236899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009253	TAAAAA	2	12	1244544	1244555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009253	ATAAAA	2	12	1244949	1244960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009253	CAAAAA	2	12	1262578	1262589	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009253	TCAGTA	2	12	1270553	1270564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009253	CGTACA	2	12	1274777	1274788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009253	ATTAAT	2	12	1319814	1319825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009253	AGGTTT	2	12	1327108	1327119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009253	AAAGCG	2	12	1335314	1335325	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009253	CGCAGG	2	12	1337731	1337742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009253	AAAGCG	2	12	1348176	1348187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009253	CGCAGG	2	12	1350593	1350604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009253	CCCATC	2	12	1401309	1401320	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009253	AGATAA	2	12	1429545	1429556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009253	GTCCTG	2	12	1434195	1434206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009253	TTTGTT	2	12	1438272	1438283	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009253	TTTATA	2	12	1443529	1443540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009253	TTAAAA	2	12	1460932	1460943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009253	AGCTAT	2	12	1563722	1563733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009253	AAAATA	2	12	1575157	1575168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009253	CTTTAT	2	12	1577039	1577050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009253	CTATTA	2	12	1581297	1581308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009253	AATAAA	2	12	1597870	1597881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009253	CTATTA	2	12	1624269	1624280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009253	TAAAAC	2	12	1684503	1684514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009253	AAAGAT	2	12	1732863	1732874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009253	TGAGTT	2	12	1733141	1733152	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009253	GAAAAG	2	12	1752275	1752286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009253	TAATAG	2	12	1766041	1766052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009253	TTTTAT	2	12	1789289	1789300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009253	CGGTAA	2	12	1833909	1833920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009253	AAAATC	2	12	1848434	1848445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009253	GAAGGG	2	12	1886490	1886501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009253	GATGTT	2	12	1887231	1887242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009253	GTGCAG	2	12	1903414	1903425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009253	GGAAGG	2	12	1923167	1923178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009253	ATCAAA	2	12	1923218	1923229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009253	GGTATA	2	12	1925103	1925114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009253	AATACA	2	12	1927911	1927922	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009253	AATAAA	2	12	1933058	1933069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009253	ATATTT	2	12	1939015	1939026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009253	AATTGT	2	12	1959466	1959477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009253	TTTTTA	2	12	1964690	1964701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009253	AAAGAG	2	12	1970233	1970244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009253	AGTTAG	2	12	1977150	1977161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009253	TACTGT	2	12	1991463	1991474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009253	ATAAGA	2	12	2003502	2003513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009253	ATTTTT	2	12	2013860	2013871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009253	AATATA	2	12	2027915	2027926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009253	TCTCTT	2	12	2032025	2032036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009253	ACCATT	2	12	2036476	2036487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.