MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 2747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	TCAAT	2	10	912	921	40 %	40 %	0 %	20 %	134297882
2	NC_009253	CACAA	2	10	2099	2108	60 %	0 %	0 %	40 %	134297883
3	NC_009253	TATTG	2	10	2120	2129	20 %	60 %	20 %	0 %	134297883
4	NC_009253	AATCA	2	10	2188	2197	60 %	20 %	0 %	20 %	134297883
5	NC_009253	TGTGA	2	10	3236	3245	20 %	40 %	40 %	0 %	134297884
6	NC_009253	AAAAG	2	10	5438	5447	80 %	0 %	20 %	0 %	134297887
7	NC_009253	AATGA	2	10	7037	7046	60 %	20 %	20 %	0 %	134297888
8	NC_009253	AACCG	2	10	7445	7454	40 %	0 %	20 %	40 %	134297888
9	NC_009253	TAAAA	2	10	9817	9826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009253	GTCAA	2	10	9902	9911	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009253	TCGTG	2	10	11186	11195	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009253	GAAGC	2	10	11372	11381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009253	GGGAG	2	10	12593	12602	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009253	GACAG	2	10	14689	14698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009253	TTATA	2	10	16107	16116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009253	ATCAA	2	10	17340	17349	60 %	20 %	0 %	20 %	134297890
17	NC_009253	ATATT	2	10	17636	17645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009253	ATATT	2	10	18000	18009	40 %	60 %	0 %	0 %	134297891
19	NC_009253	AGGAT	2	10	19864	19873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009253	CATAA	2	10	19937	19946	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009253	TTGGA	2	10	21136	21145	20 %	40 %	40 %	0 %	134297894
22	NC_009253	ATATA	2	10	25145	25154	60 %	40 %	0 %	0 %	134297897
23	NC_009253	CTCGA	2	10	26548	26557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009253	TACAT	2	10	32080	32089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009253	GATGG	2	10	34330	34339	20 %	20 %	60 %	0 %	134297905
26	NC_009253	AGAAA	2	10	38702	38711	80 %	0 %	20 %	0 %	134297909
27	NC_009253	ACTAA	2	10	39140	39149	60 %	20 %	0 %	20 %	134297909
28	NC_009253	AAAAT	2	10	42316	42325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009253	GCAAA	2	10	42695	42704	60 %	0 %	20 %	20 %	134297914
30	NC_009253	CATAA	2	10	42773	42782	60 %	20 %	0 %	20 %	134297914
31	NC_009253	TAATT	2	10	43384	43393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009253	TTATA	2	10	43440	43449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009253	AAGAG	2	10	44499	44508	60 %	0 %	40 %	0 %	134297916
34	NC_009253	CATCG	2	10	44727	44736	20 %	20 %	20 %	40 %	134297916
35	NC_009253	AGAAA	2	10	45057	45066	80 %	0 %	20 %	0 %	134297916
36	NC_009253	CTTTT	2	10	47545	47554	0 %	80 %	0 %	20 %	134297918
37	NC_009253	TTAAG	2	10	50210	50219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009253	TAATT	2	10	50414	50423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009253	GATCA	2	10	51280	51289	40 %	20 %	20 %	20 %	134297920
40	NC_009253	AAAGA	2	10	52120	52129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009253	GATTT	2	10	53031	53040	20 %	60 %	20 %	0 %	134297921
42	NC_009253	TGGAA	2	10	55582	55591	40 %	20 %	40 %	0 %	134297924
43	NC_009253	AAGTG	2	10	56265	56274	40 %	20 %	40 %	0 %	134297925
44	NC_009253	GAAAA	2	10	58797	58806	80 %	0 %	20 %	0 %	134297927
45	NC_009253	TGAAC	2	10	59355	59364	40 %	20 %	20 %	20 %	134297928
46	NC_009253	TTTAA	2	10	60853	60862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009253	AAGGT	2	10	63035	63044	40 %	20 %	40 %	0 %	134297933
48	NC_009253	CGGTC	2	10	63223	63232	0 %	20 %	40 %	40 %	134297933
49	NC_009253	ATTAT	2	10	64203	64212	40 %	60 %	0 %	0 %	134297934
50	NC_009253	AAAAG	2	10	64386	64395	80 %	0 %	20 %	0 %	134297934
51	NC_009253	CAGGC	2	10	65010	65019	20 %	0 %	40 %	40 %	134297934
52	NC_009253	AATAC	2	10	65124	65133	60 %	20 %	0 %	20 %	134297934
53	NC_009253	TTTTC	2	10	65242	65251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009253	ATACA	2	10	65385	65394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009253	GTAAA	2	10	65735	65744	60 %	20 %	20 %	0 %	134297936
56	NC_009253	GGTAC	2	10	65823	65832	20 %	20 %	40 %	20 %	134297936
57	NC_009253	ATAAA	2	10	66034	66043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009253	CTGCC	2	10	70041	70050	0 %	20 %	20 %	60 %	134297940
59	NC_009253	TAAAA	2	10	75108	75117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009253	GGCGG	2	10	75576	75585	0 %	0 %	80 %	20 %	134297947
61	NC_009253	ATATT	2	10	76363	76372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009253	GGCGG	2	10	78841	78850	0 %	0 %	80 %	20 %	134297950
63	NC_009253	TGGTA	2	10	79029	79038	20 %	40 %	40 %	0 %	134297950
64	NC_009253	TACAG	2	10	82523	82532	40 %	20 %	20 %	20 %	134297955
65	NC_009253	CCCTT	2	10	82886	82895	0 %	40 %	0 %	60 %	134297955
66	NC_009253	TAAAT	2	10	86788	86797	60 %	40 %	0 %	0 %	134297959
67	NC_009253	AAAGG	2	10	87117	87126	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009253	GTTAA	2	10	88494	88503	40 %	40 %	20 %	0 %	134297961
69	NC_009253	GCTTC	2	10	88547	88556	0 %	40 %	20 %	40 %	134297961
70	NC_009253	ATGAA	2	10	91351	91360	60 %	20 %	20 %	0 %	134297963
71	NC_009253	CGGAT	2	10	92510	92519	20 %	20 %	40 %	20 %	134297965
72	NC_009253	CAAAA	2	10	95343	95352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009253	AAATC	2	10	97166	97175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009253	AATAC	2	10	98716	98725	60 %	20 %	0 %	20 %	134297971
75	NC_009253	CATTT	2	10	99229	99238	20 %	60 %	0 %	20 %	134297971
76	NC_009253	TTATG	2	10	100540	100549	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009253	AAATC	2	10	104994	105003	60 %	20 %	0 %	20 %	134297978
78	NC_009253	TGGAA	2	10	108605	108614	40 %	20 %	40 %	0 %	134297980
79	NC_009253	GGCTA	2	10	110271	110280	20 %	20 %	40 %	20 %	134297982
80	NC_009253	AGAAA	2	10	110825	110834	80 %	0 %	20 %	0 %	134297983
81	NC_009253	CTTTT	2	10	112853	112862	0 %	80 %	0 %	20 %	134297986
82	NC_009253	ATTTG	2	10	112987	112996	20 %	60 %	20 %	0 %	134297986
83	NC_009253	CCAAC	2	10	113168	113177	40 %	0 %	0 %	60 %	134297986
84	NC_009253	CCATT	2	10	113590	113599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009253	ATACA	2	10	115652	115661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009253	GATGG	2	10	116577	116586	20 %	20 %	60 %	0 %	134297990
87	NC_009253	TTTGA	2	10	119479	119488	20 %	60 %	20 %	0 %	134297991
88	NC_009253	AGTAA	2	10	119683	119692	60 %	20 %	20 %	0 %	134297991
89	NC_009253	GGGAC	2	10	119964	119973	20 %	0 %	60 %	20 %	134297991
90	NC_009253	ATAGC	2	10	120206	120215	40 %	20 %	20 %	20 %	134297991
91	NC_009253	GGTAT	2	10	121148	121157	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009253	GACTG	2	10	121884	121893	20 %	20 %	40 %	20 %	134297993
93	NC_009253	AGTCC	2	10	122236	122245	20 %	20 %	20 %	40 %	134297993
94	NC_009253	TTTTA	2	10	124464	124473	20 %	80 %	0 %	0 %	134297996
95	NC_009253	TTTCT	2	10	124541	124550	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009253	CTTTC	2	10	125319	125328	0 %	60 %	0 %	40 %	134297998
97	NC_009253	CCCTT	2	10	125377	125386	0 %	40 %	0 %	60 %	134297998
98	NC_009253	AAAGG	2	10	125963	125972	60 %	0 %	40 %	0 %	134298000
99	NC_009253	CTATA	2	10	127878	127887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009253	GGTCG	2	10	127957	127966	0 %	20 %	60 %	20 %	134298003
101	NC_009253	AGGCA	2	10	128956	128965	40 %	0 %	40 %	20 %	134298003
102	NC_009253	AATGA	2	10	130718	130727	60 %	20 %	20 %	0 %	134298004
103	NC_009253	AACAA	2	10	132323	132332	80 %	0 %	0 %	20 %	134298005
104	NC_009253	AGAAA	2	10	133395	133404	80 %	0 %	20 %	0 %	134298005
105	NC_009253	GGCAA	2	10	133873	133882	40 %	0 %	40 %	20 %	134298005
106	NC_009253	ACTAG	2	10	135058	135067	40 %	20 %	20 %	20 %	134298007
107	NC_009253	GTTGT	2	10	136059	136068	0 %	60 %	40 %	0 %	134298008
108	NC_009253	AAAGA	2	10	136448	136457	80 %	0 %	20 %	0 %	134298008
109	NC_009253	AAAAT	2	10	136971	136980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009253	TCATC	2	10	137440	137449	20 %	40 %	0 %	40 %	134298009
111	NC_009253	AAATC	2	10	137483	137492	60 %	20 %	0 %	20 %	134298009
112	NC_009253	GATAA	2	10	140127	140136	60 %	20 %	20 %	0 %	134298012
113	NC_009253	AACTT	2	10	142017	142026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009253	GCTAA	2	10	144663	144672	40 %	20 %	20 %	20 %	134298015
115	NC_009253	GTTAA	2	10	145585	145594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009253	ACCCA	2	10	146379	146388	40 %	0 %	0 %	60 %	134298016
117	NC_009253	TGAAC	2	10	146905	146914	40 %	20 %	20 %	20 %	134298016
118	NC_009253	GTATG	2	10	147682	147691	20 %	40 %	40 %	0 %	134298016
119	NC_009253	ACCAA	2	10	147810	147819	60 %	0 %	0 %	40 %	134298016
120	NC_009253	GTGAG	2	10	149534	149543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009253	AGAAA	2	10	149596	149605	80 %	0 %	20 %	0 %	134298017
122	NC_009253	ACCCA	2	10	154417	154426	40 %	0 %	0 %	60 %	134298021
123	NC_009253	TGAAC	2	10	154943	154952	40 %	20 %	20 %	20 %	134298021
124	NC_009253	GTATG	2	10	155720	155729	20 %	40 %	40 %	0 %	134298021
125	NC_009253	ACCAA	2	10	155848	155857	60 %	0 %	0 %	40 %	134298021
126	NC_009253	GTGAG	2	10	157572	157581	20 %	20 %	60 %	0 %	134298023
127	NC_009253	AGAAA	2	10	157634	157643	80 %	0 %	20 %	0 %	134298024
128	NC_009253	TGATA	2	10	161470	161479	40 %	40 %	20 %	0 %	134298028
129	NC_009253	AAACT	2	10	164498	164507	60 %	20 %	0 %	20 %	134298032
130	NC_009253	CCCGG	2	10	164682	164691	0 %	0 %	40 %	60 %	134298032
131	NC_009253	GATAA	2	10	166750	166759	60 %	20 %	20 %	0 %	134298036
132	NC_009253	AAATA	2	10	168122	168131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009253	TTATT	2	10	168750	168759	20 %	80 %	0 %	0 %	134298037
134	NC_009253	GTTGG	2	10	170061	170070	0 %	40 %	60 %	0 %	134298039
135	NC_009253	CGGAA	2	10	172090	172099	40 %	0 %	40 %	20 %	134298041
136	NC_009253	CGGAG	2	10	172782	172791	20 %	0 %	60 %	20 %	134298042
137	NC_009253	TGGTC	2	10	173535	173544	0 %	40 %	40 %	20 %	134298042
138	NC_009253	AGTTT	2	10	175509	175518	20 %	60 %	20 %	0 %	134298044
139	NC_009253	AGAAA	2	10	176202	176211	80 %	0 %	20 %	0 %	134298045
140	NC_009253	GCAAG	2	10	176746	176755	40 %	0 %	40 %	20 %	134298046
141	NC_009253	CAAAG	2	10	176791	176800	60 %	0 %	20 %	20 %	134298046
142	NC_009253	CCAAT	2	10	176879	176888	40 %	20 %	0 %	40 %	134298046
143	NC_009253	CCAAA	2	10	178079	178088	60 %	0 %	0 %	40 %	134298047
144	NC_009253	GTTTT	2	10	180786	180795	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009253	GCTTT	2	10	180923	180932	0 %	60 %	20 %	20 %	134298051
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147	NC_009253	GTTAT	2	10	184133	184142	20 %	60 %	20 %	0 %	134298053
148	NC_009253	GTCAA	2	10	184498	184507	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_009253	TCGTG	2	10	185777	185786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_009253	GAAGC	2	10	185963	185972	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_009253	GGGAG	2	10	187184	187193	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009253	GACAG	2	10	189280	189289	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_009253	TAAAA	2	10	191139	191148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009253	GGTGA	2	10	191289	191298	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009253	AGGGG	2	10	191489	191498	20 %	0 %	80 %	0 %	134298055
156	NC_009253	TAATC	2	10	193030	193039	40 %	40 %	0 %	20 %	134298057
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173	NC_009253	TAAAG	2	10	211344	211353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009253	GATAA	2	10	213866	213875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009253	CTTCG	2	10	215593	215602	0 %	40 %	20 %	40 %	134298077
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188	NC_009253	TCCGG	2	10	245265	245274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_009253	GATTG	2	10	247614	247623	20 %	40 %	40 %	0 %	134298123
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192	NC_009253	CCCAT	2	10	250562	250571	20 %	20 %	0 %	60 %	134298126
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199	NC_009253	GGCGT	2	10	261020	261029	0 %	20 %	60 %	20 %	134298137
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239	NC_009253	CCATT	2	10	310896	310905	20 %	40 %	0 %	40 %	134298174
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249	NC_009253	ACCAA	2	10	323890	323899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
250	NC_009253	AAATT	2	10	324016	324025	60 %	40 %	0 %	0 %	134298186
251	NC_009253	AACTT	2	10	324938	324947	40 %	40 %	0 %	20 %	134298187
252	NC_009253	CAATA	2	10	325021	325030	60 %	20 %	0 %	20 %	134298187
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254	NC_009253	GGTTG	2	10	327844	327853	0 %	40 %	60 %	0 %	134298190
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258	NC_009253	TTACT	2	10	329293	329302	20 %	60 %	0 %	20 %	134298191
259	NC_009253	AAAAC	2	10	333416	333425	80 %	0 %	0 %	20 %	134298196
260	NC_009253	AAACG	2	10	333905	333914	60 %	0 %	20 %	20 %	134298196
261	NC_009253	AGAAA	2	10	334342	334351	80 %	0 %	20 %	0 %	134298197
262	NC_009253	CAAAG	2	10	335239	335248	60 %	0 %	20 %	20 %	134298198
263	NC_009253	AAGTG	2	10	337166	337175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009253	AGTGG	2	10	338440	338449	20 %	20 %	60 %	0 %	134298201
265	NC_009253	GTGTT	2	10	339896	339905	0 %	60 %	40 %	0 %	134298202
266	NC_009253	AGGGC	2	10	343015	343024	20 %	0 %	60 %	20 %	134298205
267	NC_009253	ATTTT	2	10	348833	348842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_009253	ATTTT	2	10	349291	349300	20 %	80 %	0 %	0 %	134298211
269	NC_009253	GAAAA	2	10	350341	350350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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