MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 1914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	ACAT	2	8	9623	9630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009253	TATT	2	8	9656	9663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009253	TGAG	2	8	9801	9808	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009253	AAAC	2	8	9854	9861	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009253	ATGA	2	8	9934	9941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009253	CCTG	2	8	10263	10270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009253	GAGC	2	8	10653	10660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009253	GGTC	2	8	11693	11700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009253	AATA	2	8	11814	11821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009253	AAAC	2	8	11956	11963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009253	AAGA	2	8	12070	12077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009253	AGAA	2	8	12285	12292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009253	AGGT	2	8	14261	14268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009253	CTAA	2	8	14837	14844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009253	GGAA	2	8	14945	14952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009253	GGAC	2	8	15316	15323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009253	ATTG	2	8	17554	17561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009253	CAAA	2	8	17780	17787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009253	TCTA	2	8	19297	19304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009253	TAAA	2	8	19430	19437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009253	ATTT	2	8	19472	19479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009253	ACAA	2	8	19911	19918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009253	CTTG	2	8	24556	24563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009253	CTCC	2	8	24680	24687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009253	AGAT	2	8	24696	24703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009253	AAAT	2	8	25566	25573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009253	AATT	2	8	25586	25593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009253	TAAG	2	8	25653	25660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009253	CAAA	2	8	28896	28903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009253	AAAG	2	8	29362	29369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009253	GGAA	2	8	29889	29896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009253	TGAT	2	8	30111	30118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009253	CTTT	2	8	30136	30143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009253	TTAA	2	8	30422	30429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009253	TTTC	2	8	30542	30549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009253	TTCC	2	8	30813	30820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009253	ATTT	2	8	31798	31805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009253	AAGG	2	8	32026	32033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009253	TGGG	2	8	34210	34217	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009253	AGGT	2	8	37188	37195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009253	GCAG	2	8	37322	37329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009253	TATC	2	8	37547	37554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009253	CCTC	2	8	40303	40310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009253	ACTC	2	8	40336	40343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009253	AATA	2	8	40394	40401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009253	TGGT	2	8	40410	40417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009253	GGTC	2	8	41996	42003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009253	TAGT	2	8	42243	42250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009253	ATTA	2	8	42306	42313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009253	ATAA	3	12	48376	48387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009253	TAAG	2	8	49684	49691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009253	CTGT	2	8	50220	50227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009253	ACAG	2	8	50233	50240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009253	AGAT	2	8	54574	54581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009253	TGAT	2	8	55847	55854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009253	AAAT	2	8	55864	55871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009253	ATTT	2	8	55880	55887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009253	TAAT	2	8	56929	56936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009253	TAAT	2	8	65278	65285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009253	AAAC	2	8	65963	65970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009253	TCCC	2	8	71524	71531	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009253	GTAA	2	8	71618	71625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009253	GTCG	2	8	71822	71829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009253	ACTA	2	8	71866	71873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009253	AAAT	2	8	76406	76413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009253	AATG	2	8	76434	76441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009253	GCTA	2	8	77489	77496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009253	AGGA	2	8	83181	83188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009253	TTTA	2	8	84760	84767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009253	AATT	2	8	92705	92712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009253	GAAA	2	8	94290	94297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009253	ACTG	2	8	94606	94613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009253	TCAG	2	8	98280	98287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009253	ACCT	2	8	99675	99682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009253	TACT	2	8	100626	100633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009253	TAAA	2	8	101635	101642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009253	AAAG	2	8	104421	104428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009253	TAGA	2	8	110464	110471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009253	GGAA	2	8	110940	110947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009253	AGGG	2	8	112063	112070	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009253	CCTC	2	8	115593	115600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009253	TCCA	2	8	115604	115611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009253	GTAA	2	8	115685	115692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009253	TCCC	2	8	120395	120402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009253	AGGT	2	8	121240	121247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009253	AGGA	2	8	122795	122802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009253	GGAG	2	8	123538	123545	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009253	TGTA	2	8	126918	126925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009253	GAAG	2	8	130470	130477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009253	GGAA	2	8	130497	130504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009253	TAAT	2	8	130546	130553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009253	CCTT	2	8	134100	134107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009253	GTTT	2	8	137152	137159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009253	AGTC	2	8	137824	137831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009253	GCTT	2	8	137928	137935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009253	TAAA	2	8	138059	138066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009253	AAAC	3	12	138082	138093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009253	ATTA	2	8	138977	138984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009253	CAAA	2	8	145079	145086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009253	CTAA	2	8	145427	145434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009253	ACAA	2	8	148886	148893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009253	AAAG	2	8	149012	149019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009253	AGAT	2	8	152370	152377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009253	ACAA	2	8	156924	156931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009253	AAAG	2	8	157050	157057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009253	TACA	2	8	160485	160492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009253	TTGA	2	8	168176	168183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009253	TAAT	2	8	174865	174872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009253	AGTT	2	8	174878	174885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009253	GGCT	2	8	178898	178905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009253	TTGA	2	8	178964	178971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009253	AAAG	2	8	182064	182071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009253	TAAT	2	8	184335	184342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009253	TAAA	2	8	184384	184391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009253	ATGA	2	8	184529	184536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009253	CCTG	2	8	184854	184861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009253	GAGC	2	8	185244	185251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009253	GGTC	2	8	186284	186291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009253	AATA	2	8	186405	186412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009253	AAAC	2	8	186547	186554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009253	AAGA	2	8	186661	186668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009253	AGAA	2	8	186876	186883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009253	AGGT	2	8	188852	188859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009253	CTAA	2	8	189428	189435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009253	GGAA	2	8	189536	189543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009253	GGAC	2	8	189907	189914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009253	CCAA	2	8	211361	211368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009253	ATTT	2	8	212650	212657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009253	TCAG	2	8	213481	213488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009253	TGCA	2	8	213589	213596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009253	GTAG	2	8	213979	213986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009253	AGTC	2	8	214132	214139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009253	GATG	2	8	214404	214411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009253	ATTT	2	8	218613	218620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009253	ATAG	2	8	219844	219851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009253	TAAA	2	8	219949	219956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009253	AGGA	2	8	236607	236614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009253	AGGA	2	8	238497	238504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009253	GGAC	2	8	240408	240415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009253	TAAA	2	8	248518	248525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009253	GTAT	2	8	257201	257208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009253	CAAA	2	8	258272	258279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009253	TATT	2	8	260546	260553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009253	ACTT	2	8	265971	265978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009253	CCTT	2	8	268148	268155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009253	CTGC	2	8	271505	271512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009253	AGAT	2	8	273061	273068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009253	TAAA	2	8	274260	274267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009253	ATAA	2	8	292968	292975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009253	GGGA	2	8	293044	293051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009253	GGGA	2	8	294736	294743	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009253	TAAA	2	8	302442	302449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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