MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009230	CAGGG	2	10	2420	2429	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009230	ATGTC	2	10	15706	15715	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009230	GTCCC	2	10	19719	19728	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_009230	TATCC	2	10	22648	22657	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009230	GCGCA	2	10	37420	37429	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009230	CTTCT	2	10	45440	45449	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009230	AGTGG	2	10	48866	48875	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009230	CAACG	2	10	67891	67900	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009230	CCGCG	2	10	74236	74245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_009230	GCGAA	2	10	74247	74256	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009230	CTGTG	2	10	74566	74575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009230	AGGGG	2	10	80854	80863	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009230	GCTGA	2	10	80974	80983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009230	TTCGC	2	10	92082	92091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009230	CGCAG	2	10	93405	93414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009230	CCGTC	2	10	96205	96214	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009230	TCGCG	2	10	96911	96920	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009230	CGAGA	2	10	120499	120508	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009230	ATCAC	2	10	131196	131205	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009230	GTATT	2	10	136260	136269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009230	GAATC	2	10	146471	146480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009230	AAAGC	2	10	159301	159310	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009230	AGAAA	2	10	166728	166737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009230	TCGCG	2	10	175546	175555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009230	CAGAT	2	10	178296	178305	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009230	TAAAG	2	10	187951	187960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009230	ACCTC	2	10	194654	194663	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_009230	TCTTA	2	10	195176	195185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009230	CAAGC	2	10	207489	207498	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009230	TTTTG	2	10	219655	219664	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009230	TCCCC	2	10	225767	225776	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_009230	GTTTC	2	10	234149	234158	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009230	GCGCC	2	10	261517	261526	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009230	CATTT	2	10	262402	262411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009230	TGGCA	2	10	264874	264883	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009230	TGAAA	2	10	270653	270662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009230	GAGAG	2	10	273132	273141	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009230	CCGCA	2	10	274849	274858	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_009230	TCGCG	2	10	275070	275079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009230	CGACC	2	10	275292	275301	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_009230	GAGGT	2	10	288786	288795	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009230	CGCGA	2	10	300499	300508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009230	TGCGC	2	10	304797	304806	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009230	GTGGA	2	10	314253	314262	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009230	GTTGA	2	10	317123	317132	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009230	GTCGC	2	10	319634	319643	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009230	CTTTT	2	10	325420	325429	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009230	CTGTT	2	10	329612	329621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009230	ATCGG	2	10	338136	338145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009230	TGGCG	2	10	338197	338206	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009230	GCTTC	2	10	338459	338468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009230	TGCGC	2	10	339584	339593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009230	CGAAA	2	10	340871	340880	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009230	CGGCG	2	10	356028	356037	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009230	GGGGT	2	10	362097	362106	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009230	AGTCA	2	10	373516	373525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009230	GGGCC	2	10	383665	383674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009230	TTTTC	2	10	390499	390508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009230	TGGCG	2	10	393420	393429	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.