MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE01

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009230	CTGC	2	8	3590	3597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009230	TTGC	2	8	3608	3615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009230	TCAA	2	8	5862	5869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009230	CGAC	2	8	5929	5936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009230	CAGC	2	8	8717	8724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009230	TGGC	2	8	8776	8783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009230	ACGC	2	8	10771	10778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009230	ATTG	3	12	12229	12240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009230	TCAA	2	8	13423	13430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009230	GCAA	2	8	13466	13473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009230	GCAC	2	8	13537	13544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009230	CACC	2	8	16936	16943	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009230	ACGG	2	8	18382	18389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009230	CTCA	2	8	19436	19443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009230	CGAG	2	8	19742	19749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009230	ATCA	2	8	30774	30781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009230	ATAC	2	8	30787	30794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009230	AGGG	2	8	40558	40565	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009230	CTTG	2	8	42843	42850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009230	TGCG	2	8	45788	45795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009230	CCGC	2	8	49463	49470	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009230	CAAC	2	8	50890	50897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009230	CGGC	2	8	53962	53969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009230	GCGT	2	8	54123	54130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009230	TGCT	2	8	54188	54195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009230	ACCG	2	8	54202	54209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009230	TTCG	2	8	55223	55230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009230	GTTC	2	8	56517	56524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009230	GCGG	2	8	57657	57664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009230	CAGA	2	8	62653	62660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009230	GTGA	2	8	62795	62802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009230	TGAG	2	8	64766	64773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009230	GTAT	2	8	74611	74618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009230	AGAA	2	8	76725	76732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009230	CCGC	2	8	76857	76864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_009230	CGTA	2	8	80907	80914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009230	GCCT	2	8	80985	80992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009230	GCAA	2	8	82141	82148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009230	GCCA	2	8	83061	83068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009230	AAGG	2	8	89665	89672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009230	CGGT	2	8	89674	89681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009230	AGAA	2	8	95590	95597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009230	TCGC	2	8	95907	95914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009230	GGCC	2	8	96068	96075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009230	GGAT	2	8	96085	96092	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009230	AATC	2	8	96226	96233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009230	TCGA	2	8	96417	96424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009230	CATC	2	8	97643	97650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009230	GTCC	2	8	101412	101419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009230	GCCT	2	8	101493	101500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009230	ACTC	2	8	101603	101610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009230	ACGC	2	8	102280	102287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009230	GCAA	2	8	102461	102468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009230	GGCG	2	8	102484	102491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009230	GCAG	2	8	103720	103727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009230	TGCT	2	8	104154	104161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009230	GCCC	2	8	104635	104642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009230	CTTT	2	8	104655	104662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009230	GCCG	2	8	111583	111590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009230	AGCG	2	8	111670	111677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009230	AGAC	2	8	114820	114827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009230	AGGA	2	8	115868	115875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009230	CAGT	2	8	118399	118406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009230	CGAT	2	8	118640	118647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009230	AGCG	2	8	122578	122585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009230	GTTC	2	8	129746	129753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009230	AAAT	2	8	129786	129793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009230	ACTC	2	8	131247	131254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009230	ACGA	2	8	145335	145342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009230	ATCG	2	8	145352	145359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009230	GGGC	2	8	146567	146574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009230	CGGG	2	8	149179	149186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009230	ATTG	2	8	153959	153966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009230	TCGC	2	8	159287	159294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009230	GAGC	2	8	159366	159373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009230	GGGA	2	8	159448	159455	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009230	AATA	2	8	164561	164568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009230	ATGG	2	8	164593	164600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009230	AGGT	2	8	164789	164796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009230	TGAC	2	8	166745	166752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009230	GGGT	2	8	166766	166773	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009230	GACG	2	8	175790	175797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009230	CTTT	2	8	177878	177885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009230	GTTC	2	8	181192	181199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009230	GATT	2	8	188074	188081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009230	GACC	2	8	188137	188144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009230	CCAT	2	8	191827	191834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009230	ATAC	2	8	191847	191854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009230	GACA	2	8	195073	195080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009230	TTGC	2	8	195086	195093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009230	CAAA	2	8	195147	195154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009230	ATTT	2	8	197546	197553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009230	TTGC	2	8	200748	200755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009230	TAAT	2	8	204577	204584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009230	TGTC	2	8	208065	208072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009230	TCGA	2	8	208214	208221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009230	CTAT	2	8	208666	208673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009230	TTTG	2	8	208679	208686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009230	CGAC	2	8	211789	211796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009230	ATCA	2	8	219582	219589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009230	CTTC	2	8	219631	219638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009230	CCTT	2	8	219725	219732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009230	TTTC	2	8	221503	221510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009230	AACC	2	8	223943	223950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009230	TATT	2	8	224520	224527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009230	CCGC	2	8	225687	225694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009230	CATC	2	8	230692	230699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009230	GCCT	2	8	231346	231353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009230	TTCC	2	8	233683	233690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009230	TACG	2	8	233728	233735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009230	GTAT	2	8	233785	233792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009230	CGGC	2	8	233836	233843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009230	GCTT	2	8	234164	234171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009230	TCTG	2	8	234395	234402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009230	GAAA	2	8	235199	235206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009230	GACC	2	8	237353	237360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009230	GGAT	2	8	237378	237385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009230	TCGA	2	8	238215	238222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009230	CAAA	2	8	238584	238591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009230	TTGA	2	8	240240	240247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009230	GTAT	2	8	242147	242154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009230	GCGA	2	8	242221	242228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009230	AGAA	2	8	246037	246044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009230	AGAA	2	8	246503	246510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009230	ATCG	2	8	247753	247760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009230	GTAT	2	8	254067	254074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009230	CGGC	2	8	256275	256282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009230	CATC	2	8	258076	258083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009230	GTTG	2	8	260180	260187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009230	TCCT	2	8	260291	260298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009230	GAAT	2	8	261329	261336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009230	AGGA	2	8	262820	262827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009230	CTCA	2	8	263910	263917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009230	CGGG	2	8	264418	264425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009230	TCCC	2	8	265340	265347	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_009230	TGTA	2	8	266625	266632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009230	TTTG	2	8	270848	270855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009230	CGTT	2	8	272022	272029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009230	TATG	2	8	274919	274926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009230	GCTG	2	8	275110	275117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009230	CGCA	2	8	277080	277087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009230	CCCG	2	8	280257	280264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_009230	GGGT	2	8	289017	289024	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009230	ACGG	2	8	295207	295214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009230	TCCA	2	8	296542	296549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009230	TTGC	2	8	299077	299084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009230	CGAG	2	8	300523	300530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009230	GTAT	2	8	303228	303235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009230	CAGC	2	8	313486	313493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009230	TTTG	2	8	314034	314041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009230	GATC	2	8	318121	318128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009230	CAAA	2	8	318445	318452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009230	TTTC	2	8	318971	318978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009230	GTCG	2	8	319589	319596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009230	TCCC	2	8	319672	319679	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
156	NC_009230	CGAA	2	8	320277	320284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_009230	ACCC	2	8	323430	323437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_009230	GCTC	2	8	325431	325438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_009230	CTTG	2	8	325441	325448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_009230	TAGC	2	8	326504	326511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_009230	GGTC	2	8	327556	327563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_009230	AGAT	2	8	329865	329872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009230	CCCG	2	8	332919	332926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
164	NC_009230	TCCA	2	8	333994	334001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_009230	CAGC	2	8	334960	334967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_009230	GCTG	2	8	335959	335966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_009230	CTCG	2	8	337378	337385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_009230	GTTT	2	8	337882	337889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009230	TCGT	2	8	338100	338107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_009230	AAGC	2	8	339216	339223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_009230	ACGT	2	8	339789	339796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_009230	AACG	2	8	340751	340758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_009230	CGTC	2	8	348115	348122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_009230	CGTG	2	8	350530	350537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
175	NC_009230	ACAG	2	8	352948	352955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_009230	TTGA	2	8	358277	358284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009230	CCAT	2	8	360690	360697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_009230	TGCG	2	8	360704	360711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_009230	TTGG	2	8	362011	362018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009230	GCGT	2	8	366699	366706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_009230	GGAT	2	8	367336	367343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009230	GGGC	2	8	369883	369890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
185	NC_009230	GTTT	2	8	372215	372222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009230	CGCT	2	8	374528	374535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_009230	CCAA	2	8	375091	375098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_009230	TCGC	2	8	375223	375230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
189	NC_009230	TCAA	2	8	378097	378104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_009230	TTTC	2	8	379396	379403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_009230	AGCC	2	8	380408	380415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_009230	CGGA	2	8	381552	381559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
194	NC_009230	GAAG	2	8	381932	381939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009230	CGAG	2	8	381999	382006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
196	NC_009230	CGGC	2	8	385728	385735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
197	NC_009230	CTTA	2	8	385740	385747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
198	NC_009230	ATCA	2	8	389542	389549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
199	NC_009230	GGCA	2	8	390335	390342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
200	NC_009230	TGGT	2	8	391536	391543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_009230	AGAA	2	8	392242	392249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
202	NC_009230	CACG	2	8	394624	394631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
203	NC_009230	ACCC	2	8	394662	394669	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.