MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE01

Total Repeats: 5677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009230	CAT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288153
2	NC_009230	CGT	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
3	NC_009230	GTT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134288153
4	NC_009230	GTC	2	6	188	193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
5	NC_009230	GAA	2	6	207	212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
6	NC_009230	GAA	2	6	222	227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
7	NC_009230	AGC	2	6	251	256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288153
8	NC_009230	CCG	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288153
9	NC_009230	CGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288153
10	NC_009230	GAA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
11	NC_009230	TCG	2	6	521	526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
12	NC_009230	CCA	2	6	597	602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288153
13	NC_009230	GAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288153
14	NC_009230	GAA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
15	NC_009230	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288154
16	NC_009230	CGA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
17	NC_009230	CTG	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
18	NC_009230	GCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
19	NC_009230	AGG	2	6	850	855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288154
20	NC_009230	CGT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
21	NC_009230	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
22	NC_009230	GCT	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
23	NC_009230	CGG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
24	NC_009230	CGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
25	NC_009230	CAT	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
26	NC_009230	GGC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
27	NC_009230	CCG	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288154
28	NC_009230	TCT	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288154
29	NC_009230	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134288154
30	NC_009230	ACC	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288154
31	NC_009230	TGA	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
32	NC_009230	CTA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
33	NC_009230	ATC	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
34	NC_009230	CCA	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288154
35	NC_009230	TTG	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134288154
36	NC_009230	CGG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
37	NC_009230	AGT	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
38	NC_009230	AGC	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
39	NC_009230	CCG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288155
40	NC_009230	CCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288155
41	NC_009230	CGA	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
42	NC_009230	GCA	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
43	NC_009230	TCA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288155
44	NC_009230	TGG	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288155
45	NC_009230	TGC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288155
46	NC_009230	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288155
47	NC_009230	CGA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
48	NC_009230	GCT	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288155
49	NC_009230	GAT	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288155
50	NC_009230	CAG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
51	NC_009230	GCC	2	6	2394	2399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009230	ACG	2	6	2558	2563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
53	NC_009230	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
54	NC_009230	GAC	2	6	2713	2718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
55	NC_009230	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288156
56	NC_009230	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288156
57	NC_009230	TTC	2	6	2894	2899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288156
58	NC_009230	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288156
59	NC_009230	ACG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
60	NC_009230	GGC	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288156
61	NC_009230	TCA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288156
62	NC_009230	ACG	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009230	GGC	2	6	3332	3337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009230	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009230	CAC	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009230	CCG	2	6	3533	3538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009230	TCG	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009230	TCC	2	6	3738	3743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009230	ACG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009230	CCG	2	6	3925	3930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288157
71	NC_009230	TGC	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288157
72	NC_009230	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288157
73	NC_009230	ATC	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009230	GAC	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009230	CGG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009230	CAA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009230	ATC	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009230	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009230	GAT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288158
80	NC_009230	CCG	2	6	4483	4488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288158
81	NC_009230	CGT	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288158
82	NC_009230	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288158
83	NC_009230	TAG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288158
84	NC_009230	GGA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288158
85	NC_009230	CGA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288158
86	NC_009230	GCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288158
87	NC_009230	TGG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288158
88	NC_009230	ACT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288158
89	NC_009230	TCG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288158
90	NC_009230	ACA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009230	ATT	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134288159
92	NC_009230	CCG	3	9	5310	5318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
93	NC_009230	GCC	2	6	5333	5338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
94	NC_009230	CCA	2	6	5364	5369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
95	NC_009230	CAC	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
96	NC_009230	CAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
97	NC_009230	ACC	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
98	NC_009230	CGA	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
99	NC_009230	CTT	2	6	5558	5563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288159
100	NC_009230	GAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
101	NC_009230	CGC	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
102	NC_009230	CGA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
103	NC_009230	CCT	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_009230	CTT	2	6	5889	5894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009230	AGA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009230	ATC	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288160
107	NC_009230	TCG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288160
108	NC_009230	ATC	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288160
109	NC_009230	ACG	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
110	NC_009230	TGC	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288160
111	NC_009230	CGG	2	6	6553	6558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288160
112	NC_009230	GCA	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
113	NC_009230	CCG	2	6	6637	6642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288160
114	NC_009230	CGA	2	6	6655	6660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
115	NC_009230	CCA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
116	NC_009230	ACC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
117	NC_009230	CTC	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134288161
118	NC_009230	GTC	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288161
119	NC_009230	GCG	2	6	7057	7062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
120	NC_009230	GTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288161
121	NC_009230	ACC	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
122	NC_009230	AGC	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
123	NC_009230	GCG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
124	NC_009230	GCG	2	6	7425	7430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
125	NC_009230	GCA	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
126	NC_009230	GCC	2	6	7630	7635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288161
127	NC_009230	CAG	2	6	7636	7641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
128	NC_009230	CCA	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
129	NC_009230	CAG	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
130	NC_009230	CCG	2	6	7841	7846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288161
131	NC_009230	GCG	2	6	7968	7973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
132	NC_009230	AGG	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288161
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139	NC_009230	GCA	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_009230	TCG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_009230	CGA	2	6	14468	14473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
259	NC_009230	GCC	2	6	14527	14532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288168
260	NC_009230	CGA	2	6	14606	14611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
261	NC_009230	GCC	2	6	14646	14651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288168
262	NC_009230	GCA	2	6	14672	14677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
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273	NC_009230	CGA	2	6	15319	15324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288169
274	NC_009230	TGA	2	6	15418	15423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288169
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279	NC_009230	GCA	2	6	15601	15606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288169
280	NC_009230	CCG	2	6	15607	15612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288169
281	NC_009230	CCG	2	6	15790	15795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_009230	GAT	2	6	15819	15824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288170
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284	NC_009230	TGA	2	6	15892	15897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288170
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327	NC_009230	GCC	2	6	19702	19707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
328	NC_009230	GCT	2	6	19869	19874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288174
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374	NC_009230	AGG	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
375	NC_009230	TCG	3	9	22717	22725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_009230	CAT	2	6	22778	22783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288176
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380	NC_009230	CTG	2	6	23097	23102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288177
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497	NC_009230	CGG	2	6	30293	30298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288181
498	NC_009230	ATT	2	6	30340	30345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_009230	GCT	2	6	30420	30425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288182
500	NC_009230	GAG	3	9	30490	30498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288182

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