MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE03

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009229	CGGAGC	2	12	3375	3386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287906
2	NC_009229	GTAGCG	2	12	10973	10984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134287914
3	NC_009229	ACGTCG	2	12	11417	11428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287914
4	NC_009229	ACCGTC	2	12	17837	17848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134287921
5	NC_009229	GTAGCC	2	12	18732	18743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287922
6	NC_009229	GTCGAG	2	12	29750	29761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134287932
7	NC_009229	GTTCCG	2	12	32866	32877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287932
8	NC_009229	CCATCA	2	12	39422	39433	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134287940
9	NC_009229	TCGCGG	2	12	45718	45729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134287947
10	NC_009229	GCCGTC	2	12	46758	46769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287948
11	NC_009229	CTCGAT	2	12	51386	51397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134287953
12	NC_009229	TGCCAT	2	12	52700	52711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134287955
13	NC_009229	GCTGGC	2	12	55147	55158	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134287959
14	NC_009229	TTCGCG	2	12	59851	59862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287962
15	NC_009229	TCTTGT	2	12	62980	62991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	134287963
16	NC_009229	CAGTCG	2	12	65538	65549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287967
17	NC_009229	GCACCT	2	12	69052	69063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134287970
18	NC_009229	CGGTGA	2	12	69133	69144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134287970
19	NC_009229	AGCCGA	2	12	72864	72875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287975
20	NC_009229	CGAGCG	2	12	74920	74931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287976
21	NC_009229	TCGCGA	2	12	75992	76003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287977
22	NC_009229	CAGGCG	2	12	82773	82784	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287986
23	NC_009229	TCAACC	2	12	88669	88680	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134287991
24	NC_009229	TCGAGC	2	12	89505	89516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287992
25	NC_009229	GGTTTC	2	12	94069	94080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	134287996
26	NC_009229	GGCAGG	2	12	94782	94793	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	134287997
27	NC_009229	CGAACG	2	12	96731	96742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287998
28	NC_009229	GACGTC	2	12	98538	98549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288002
29	NC_009229	GATATT	2	12	104860	104871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134288013
30	NC_009229	TCGATC	2	12	108096	108107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134288015
31	NC_009229	TGCCGA	2	12	116724	116735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288024
32	NC_009229	AAAAGA	2	12	118724	118735	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134288027
33	NC_009229	TCGCGA	2	12	125929	125940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288034
34	NC_009229	TGCGGC	2	12	130363	130374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134288040
35	NC_009229	CGCTCG	2	12	141877	141888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134288057
36	NC_009229	GACGGC	2	12	143742	143753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134288057
37	NC_009229	GACGCT	2	12	145597	145608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288060
38	NC_009229	TCGGCG	2	12	145947	145958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134288060
39	NC_009229	GAGCGG	2	12	147343	147354	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	134288061
40	NC_009229	CGGCGA	2	12	152765	152776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134288065
41	NC_009229	TGGCTG	2	12	154616	154627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134288066
42	NC_009229	GCATCA	2	12	154703	154714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134288066
43	NC_009229	ACGATT	2	12	155146	155157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134288067
44	NC_009229	CGCGAA	2	12	155589	155600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288067
45	NC_009229	GCCAGT	2	12	156718	156729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288067
46	NC_009229	TCGACG	2	12	158567	158578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288068
47	NC_009229	CAACGC	2	12	165092	165103	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134288075
48	NC_009229	CGACGC	2	12	166069	166080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134288076
49	NC_009229	CTTCGA	2	12	166132	166143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134288076
50	NC_009229	ATCACT	2	12	169843	169854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288080
51	NC_009229	AATGCT	2	12	171312	171323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134288083
52	NC_009229	GCAAGG	2	12	172169	172180	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134288083
53	NC_009229	CGGCCG	2	12	174337	174348	0 %	0 %	50 %	50 %	134288084
54	NC_009229	GCCGAC	2	12	176000	176011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134288086
55	NC_009229	TGTGGA	2	12	179094	179105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134288091
56	NC_009229	TCACCG	2	12	179661	179672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134288092
57	NC_009229	CGAGCG	2	12	186121	186132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134288098
58	NC_009229	ACCCAT	2	12	189941	189952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	134288103
59	NC_009229	TCTCGG	2	12	197562	197573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288109
60	NC_009229	GCGGGG	2	12	203209	203220	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	134288120
61	NC_009229	AGCGGT	2	12	206589	206600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134288126
62	NC_009229	CGAGCT	2	12	206929	206940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134288126
63	NC_009229	CCGCGC	2	12	213440	213451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288137
64	NC_009229	CATCTC	2	12	219641	219652	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134288144
65	NC_009229	GCGGAA	2	12	221713	221724	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134288148
66	NC_009229	TTCCGC	2	12	223796	223807	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	134288149

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.