MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE03

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009229	TCACG	2	10	1116	1125	20 %	20 %	20 %	40 %	134287904
2	NC_009229	CGGTA	2	10	2742	2751	20 %	20 %	40 %	20 %	134287906
3	NC_009229	TGCGC	2	10	2782	2791	0 %	20 %	40 %	40 %	134287906
4	NC_009229	CTTCA	2	10	4923	4932	20 %	40 %	0 %	40 %	134287908
5	NC_009229	CGATC	2	10	9025	9034	20 %	20 %	20 %	40 %	134287911
6	NC_009229	GCCTC	2	10	9045	9054	0 %	20 %	20 %	60 %	134287911
7	NC_009229	GCCCA	2	10	9117	9126	20 %	0 %	20 %	60 %	134287911
8	NC_009229	CCAGA	2	10	10226	10235	40 %	0 %	20 %	40 %	134287913
9	NC_009229	GACGC	2	10	16108	16117	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009229	GGCGC	2	10	16148	16157	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009229	GCGCG	2	10	17646	17655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009229	CGCTC	2	10	19141	19150	0 %	20 %	20 %	60 %	134287922
13	NC_009229	GCACG	2	10	20865	20874	20 %	0 %	40 %	40 %	134287922
14	NC_009229	TGCCC	2	10	22634	22643	0 %	20 %	20 %	60 %	134287924
15	NC_009229	GCCCC	2	10	23800	23809	0 %	0 %	20 %	80 %	134287925
16	NC_009229	GCTTC	2	10	24796	24805	0 %	40 %	20 %	40 %	134287926
17	NC_009229	CCTGC	2	10	24819	24828	0 %	20 %	20 %	60 %	134287926
18	NC_009229	GCCCT	2	10	25195	25204	0 %	20 %	20 %	60 %	134287926
19	NC_009229	CGCGC	2	10	26776	26785	0 %	0 %	40 %	60 %	134287928
20	NC_009229	CGGCA	2	10	29870	29879	20 %	0 %	40 %	40 %	134287932
21	NC_009229	TCACC	2	10	31153	31162	20 %	20 %	0 %	60 %	134287932
22	NC_009229	CGGCG	2	10	34592	34601	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009229	ATCGA	2	10	39163	39172	40 %	20 %	20 %	20 %	134287939
24	NC_009229	GGACT	2	10	39880	39889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009229	TTTAC	2	10	46398	46407	20 %	60 %	0 %	20 %	134287948
26	NC_009229	CGGCT	2	10	46419	46428	0 %	20 %	40 %	40 %	134287948
27	NC_009229	CGTTC	2	10	46636	46645	0 %	40 %	20 %	40 %	134287948
28	NC_009229	TTTTA	2	10	46880	46889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009229	TTGAT	2	10	47513	47522	20 %	60 %	20 %	0 %	134287950
30	NC_009229	ATGCC	2	10	48578	48587	20 %	20 %	20 %	40 %	134287950
31	NC_009229	CCATC	2	10	50237	50246	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_009229	TTGCC	2	10	50833	50842	0 %	40 %	20 %	40 %	134287953
33	NC_009229	GTTGC	2	10	51133	51142	0 %	40 %	40 %	20 %	134287953
34	NC_009229	CCGGA	2	10	54759	54768	20 %	0 %	40 %	40 %	134287959
35	NC_009229	CCGTC	2	10	54980	54989	0 %	20 %	20 %	60 %	134287959
36	NC_009229	GCCGT	2	10	56188	56197	0 %	20 %	40 %	40 %	134287959
37	NC_009229	CAAGC	2	10	57407	57416	40 %	0 %	20 %	40 %	134287960
38	NC_009229	GCCGA	2	10	57671	57680	20 %	0 %	40 %	40 %	134287960
39	NC_009229	AAGCA	2	10	58054	58063	60 %	0 %	20 %	20 %	134287961
40	NC_009229	GGAAC	2	10	60997	61006	40 %	0 %	40 %	20 %	134287962
41	NC_009229	CGTTG	2	10	62321	62330	0 %	40 %	40 %	20 %	134287963
42	NC_009229	CAGCG	2	10	64314	64323	20 %	0 %	40 %	40 %	134287965
43	NC_009229	GCTGC	2	10	65814	65823	0 %	20 %	40 %	40 %	134287967
44	NC_009229	CCCTG	2	10	68805	68814	0 %	20 %	20 %	60 %	134287969
45	NC_009229	AAGCG	2	10	68861	68870	40 %	0 %	40 %	20 %	134287969
46	NC_009229	GCGTG	2	10	69796	69805	0 %	20 %	60 %	20 %	134287971
47	NC_009229	CTCGT	2	10	71145	71154	0 %	40 %	20 %	40 %	134287973
48	NC_009229	GAATG	2	10	71196	71205	40 %	20 %	40 %	0 %	134287973
49	NC_009229	CGGCT	2	10	72357	72366	0 %	20 %	40 %	40 %	134287974
50	NC_009229	CAGCT	2	10	72731	72740	20 %	20 %	20 %	40 %	134287975
51	NC_009229	GCTTG	2	10	74843	74852	0 %	40 %	40 %	20 %	134287976
52	NC_009229	CGCGA	2	10	75137	75146	20 %	0 %	40 %	40 %	134287976
53	NC_009229	GCGCT	2	10	75513	75522	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009229	TCGCG	2	10	75959	75968	0 %	20 %	40 %	40 %	134287977
55	NC_009229	GGAAG	2	10	77746	77755	40 %	0 %	60 %	0 %	134287979
56	NC_009229	ATAAA	2	10	78505	78514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009229	GCGCG	2	10	79835	79844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009229	CGCTG	2	10	79873	79882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009229	GTTCC	2	10	80631	80640	0 %	40 %	20 %	40 %	134287983
60	NC_009229	CATCG	2	10	82222	82231	20 %	20 %	20 %	40 %	134287985
61	NC_009229	CAAGC	2	10	82399	82408	40 %	0 %	20 %	40 %	134287985
62	NC_009229	TGCGC	2	10	82541	82550	0 %	20 %	40 %	40 %	134287986
63	NC_009229	CCGAT	2	10	85405	85414	20 %	20 %	20 %	40 %	134287988
64	NC_009229	GATGC	2	10	87576	87585	20 %	20 %	40 %	20 %	134287991
65	NC_009229	CAAGG	2	10	88446	88455	40 %	0 %	40 %	20 %	134287991
66	NC_009229	GAAGC	2	10	89153	89162	40 %	0 %	40 %	20 %	134287992
67	NC_009229	GTTGC	2	10	89649	89658	0 %	40 %	40 %	20 %	134287992
68	NC_009229	CGGCA	2	10	89706	89715	20 %	0 %	40 %	40 %	134287992
69	NC_009229	CACAA	2	10	89953	89962	60 %	0 %	0 %	40 %	134287992
70	NC_009229	GATGG	2	10	91419	91428	20 %	20 %	60 %	0 %	134287994
71	NC_009229	CAATG	2	10	91910	91919	40 %	20 %	20 %	20 %	134287994
72	NC_009229	GGCGC	2	10	97251	97260	0 %	0 %	60 %	40 %	134287999
73	NC_009229	ACGCG	2	10	98446	98455	20 %	0 %	40 %	40 %	134288002
74	NC_009229	GCAGG	2	10	98832	98841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009229	ACGCG	2	10	100030	100039	20 %	0 %	40 %	40 %	134288005
76	NC_009229	GAAAA	2	10	101073	101082	80 %	0 %	20 %	0 %	134288007
77	NC_009229	GTCGA	2	10	105535	105544	20 %	20 %	40 %	20 %	134288013
78	NC_009229	TGCTG	2	10	106993	107002	0 %	40 %	40 %	20 %	134288015
79	NC_009229	GAAAA	2	10	109922	109931	80 %	0 %	20 %	0 %	134288017
80	NC_009229	ACGCC	2	10	114375	114384	20 %	0 %	20 %	60 %	134288021
81	NC_009229	TCGCG	2	10	114458	114467	0 %	20 %	40 %	40 %	134288021
82	NC_009229	AGCGG	2	10	114736	114745	20 %	0 %	60 %	20 %	134288021
83	NC_009229	CCCTT	2	10	114869	114878	0 %	40 %	0 %	60 %	134288022
84	NC_009229	AAAGC	2	10	115940	115949	60 %	0 %	20 %	20 %	134288023
85	NC_009229	GCGCA	2	10	117822	117831	20 %	0 %	40 %	40 %	134288025
86	NC_009229	GGTAT	2	10	118583	118592	20 %	40 %	40 %	0 %	134288027
87	NC_009229	TCGTG	2	10	120537	120546	0 %	40 %	40 %	20 %	134288030
88	NC_009229	GGCCG	2	10	120776	120785	0 %	0 %	60 %	40 %	134288030
89	NC_009229	GCTCG	2	10	120988	120997	0 %	20 %	40 %	40 %	134288030
90	NC_009229	CTGCG	2	10	121124	121133	0 %	20 %	40 %	40 %	134288030
91	NC_009229	GTGAT	2	10	122108	122117	20 %	40 %	40 %	0 %	134288031
92	NC_009229	AAAAT	2	10	122943	122952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009229	TCGAC	2	10	125312	125321	20 %	20 %	20 %	40 %	134288034
94	NC_009229	GCGTC	2	10	127351	127360	0 %	20 %	40 %	40 %	134288035
95	NC_009229	CTTCG	2	10	128196	128205	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009229	TGGCG	2	10	128217	128226	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009229	AGCCA	2	10	129438	129447	40 %	0 %	20 %	40 %	134288038
98	NC_009229	CCACG	2	10	130218	130227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_009229	TCGGC	2	10	135525	135534	0 %	20 %	40 %	40 %	134288050
100	NC_009229	GCTTG	2	10	135789	135798	0 %	40 %	40 %	20 %	134288050
101	NC_009229	GCGCC	2	10	137291	137300	0 %	0 %	40 %	60 %	134288052
102	NC_009229	GCACG	2	10	138488	138497	20 %	0 %	40 %	40 %	134288054
103	NC_009229	GGTCA	2	10	138507	138516	20 %	20 %	40 %	20 %	134288054
104	NC_009229	GAGCT	2	10	138817	138826	20 %	20 %	40 %	20 %	134288055
105	NC_009229	CGGTG	2	10	142230	142239	0 %	20 %	60 %	20 %	134288057
106	NC_009229	GGGCG	2	10	143317	143326	0 %	0 %	80 %	20 %	134288057
107	NC_009229	CGAAA	2	10	144168	144177	60 %	0 %	20 %	20 %	134288058
108	NC_009229	CGCTG	2	10	145206	145215	0 %	20 %	40 %	40 %	134288059
109	NC_009229	CGACC	2	10	146740	146749	20 %	0 %	20 %	60 %	134288060
110	NC_009229	CGTGC	2	10	148606	148615	0 %	20 %	40 %	40 %	134288062
111	NC_009229	TGCGC	2	10	148953	148962	0 %	20 %	40 %	40 %	134288062
112	NC_009229	AGGCG	2	10	150396	150405	20 %	0 %	60 %	20 %	134288062
113	NC_009229	AGCAC	2	10	150834	150843	40 %	0 %	20 %	40 %	134288063
114	NC_009229	TATCC	2	10	152136	152145	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009229	GGATA	2	10	152150	152159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009229	GCTCA	2	10	153184	153193	20 %	20 %	20 %	40 %	134288066
117	NC_009229	CCGGC	2	10	155387	155396	0 %	0 %	40 %	60 %	134288067
118	NC_009229	CGATG	2	10	155807	155816	20 %	20 %	40 %	20 %	134288067
119	NC_009229	ATTGT	2	10	157322	157331	20 %	60 %	20 %	0 %	134288067
120	NC_009229	TTGAT	2	10	158604	158613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009229	GCAAC	2	10	159912	159921	40 %	0 %	20 %	40 %	134288070
122	NC_009229	TCAGA	2	10	160670	160679	40 %	20 %	20 %	20 %	134288071
123	NC_009229	CACGT	2	10	161005	161014	20 %	20 %	20 %	40 %	134288071
124	NC_009229	GACGG	2	10	161436	161445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009229	GATTG	2	10	162320	162329	20 %	40 %	40 %	0 %	134288072
126	NC_009229	GGACA	2	10	162602	162611	40 %	0 %	40 %	20 %	134288072
127	NC_009229	ATCTG	2	10	163413	163422	20 %	40 %	20 %	20 %	134288073
128	NC_009229	AACAA	2	10	163554	163563	80 %	0 %	0 %	20 %	134288073
129	NC_009229	CCAGC	2	10	163910	163919	20 %	0 %	20 %	60 %	134288073
130	NC_009229	TCCGG	2	10	164758	164767	0 %	20 %	40 %	40 %	134288075
131	NC_009229	TGACA	2	10	165451	165460	40 %	20 %	20 %	20 %	134288076
132	NC_009229	CGGCG	2	10	166144	166153	0 %	0 %	60 %	40 %	134288076
133	NC_009229	GCCCG	2	10	167235	167244	0 %	0 %	40 %	60 %	134288077
134	NC_009229	CGCTT	2	10	168871	168880	0 %	40 %	20 %	40 %	134288079
135	NC_009229	CCCGG	2	10	169179	169188	0 %	0 %	40 %	60 %	134288080
136	NC_009229	CGGAC	2	10	169733	169742	20 %	0 %	40 %	40 %	134288080
137	NC_009229	CGGCA	2	10	171202	171211	20 %	0 %	40 %	40 %	134288082
138	NC_009229	CAGCG	2	10	171387	171396	20 %	0 %	40 %	40 %	134288083
139	NC_009229	GCCTT	2	10	173821	173830	0 %	40 %	20 %	40 %	134288084
140	NC_009229	GGCCG	2	10	174149	174158	0 %	0 %	60 %	40 %	134288084
141	NC_009229	CAAGA	2	10	175267	175276	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009229	ATCGA	2	10	176210	176219	40 %	20 %	20 %	20 %	134288086
143	NC_009229	CGAAC	2	10	177239	177248	40 %	0 %	20 %	40 %	134288088
144	NC_009229	TGTCC	2	10	177380	177389	0 %	40 %	20 %	40 %	134288088
145	NC_009229	CGCGC	2	10	178179	178188	0 %	0 %	40 %	60 %	134288090
146	NC_009229	GCATG	2	10	180604	180613	20 %	20 %	40 %	20 %	134288093
147	NC_009229	GGACA	2	10	180767	180776	40 %	0 %	40 %	20 %	134288093
148	NC_009229	GGCGC	2	10	181715	181724	0 %	0 %	60 %	40 %	134288094
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150	NC_009229	CGGCG	2	10	183362	183371	0 %	0 %	60 %	40 %	134288095
151	NC_009229	CGGTC	2	10	183752	183761	0 %	20 %	40 %	40 %	134288095
152	NC_009229	GTCGC	2	10	186944	186953	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_009229	ACTTC	2	10	190374	190383	20 %	40 %	0 %	40 %	134288103
154	NC_009229	CACGG	2	10	194193	194202	20 %	0 %	40 %	40 %	134288105
155	NC_009229	CTCGT	2	10	194638	194647	0 %	40 %	20 %	40 %	134288105
156	NC_009229	GCGCC	2	10	196546	196555	0 %	0 %	40 %	60 %	134288107
157	NC_009229	CGCGC	2	10	197857	197866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_009229	GAAAC	2	10	198570	198579	60 %	0 %	20 %	20 %	134288111
159	NC_009229	TGCGA	2	10	199561	199570	20 %	20 %	40 %	20 %	134288113
160	NC_009229	ATTCA	2	10	201262	201271	40 %	40 %	0 %	20 %	134288117
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167	NC_009229	CCGTA	2	10	209425	209434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_009229	GCCGC	2	10	210641	210650	0 %	0 %	40 %	60 %	134288131
169	NC_009229	ATCGC	2	10	214636	214645	20 %	20 %	20 %	40 %	134288138
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171	NC_009229	CGGCA	2	10	216604	216613	20 %	0 %	40 %	40 %	134288139
172	NC_009229	CGAAC	2	10	218143	218152	40 %	0 %	20 %	40 %	134288141
173	NC_009229	GCGCA	2	10	218842	218851	20 %	0 %	40 %	40 %	134288142
174	NC_009229	TGCAG	2	10	220041	220050	20 %	20 %	40 %	20 %	134288145
175	NC_009229	TCCGG	2	10	221193	221202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_009229	ACCCA	2	10	221521	221530	40 %	0 %	0 %	60 %	134288147
177	NC_009229	TAGTG	2	10	222267	222276	20 %	40 %	40 %	0 %	134288148
178	NC_009229	CACTA	2	10	223244	223253	40 %	20 %	0 %	40 %	134288149
179	NC_009229	CATCC	2	10	224083	224092	20 %	20 %	0 %	60 %	134288150
180	NC_009229	ACTCG	2	10	225713	225722	20 %	20 %	20 %	40 %	134288151
181	NC_009229	AGACG	2	10	226538	226547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_009229	GCAAC	2	10	226602	226611	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.