MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE03

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009229	CTTT	2	8	16593	16600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009229	CCGA	2	8	28174	28181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009229	GACT	2	8	34693	34700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009229	GCAA	2	8	37624	37631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009229	GCGT	2	8	43414	43421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009229	CAGA	2	8	46212	46219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009229	CATT	2	8	46235	46242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009229	AAAT	2	8	46300	46307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009229	ATTT	2	8	46359	46366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009229	GCAT	2	8	62045	62052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009229	CCGA	2	8	70899	70906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009229	TCGA	2	8	71455	71462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009229	CCAT	2	8	74035	74042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009229	TTTA	2	8	78523	78530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009229	GGCG	2	8	79770	79777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009229	ATCA	2	8	81897	81904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009229	GCGT	2	8	84510	84517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009229	GGGC	2	8	90978	90985	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009229	CTTT	2	8	96923	96930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009229	CTTC	2	8	100200	100207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009229	CCTT	2	8	101133	101140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009229	GCCG	2	8	103273	103280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009229	AACG	2	8	122812	122819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009229	TGCG	2	8	129753	129760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009229	GTTG	2	8	130872	130879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009229	CGAG	2	8	130902	130909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009229	GCCG	2	8	132207	132214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009229	TTAA	2	8	133889	133896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009229	CATG	2	8	134607	134614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009229	TGAT	2	8	136379	136386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009229	CTTC	2	8	136582	136589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009229	TCGG	2	8	137017	137024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009229	GATC	2	8	137122	137129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009229	AAGA	2	8	137516	137523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009229	TCGG	2	8	137529	137536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009229	TCGT	2	8	137598	137605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009229	CGAG	2	8	153064	153071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009229	TCAC	2	8	159241	159248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009229	CCGT	2	8	162778	162785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009229	TGGG	2	8	164222	164229	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009229	GCGT	2	8	167621	167628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009229	TTGC	2	8	167694	167701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009229	TTGA	2	8	167737	167744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009229	CAAT	3	12	168927	168938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009229	GCGT	2	8	170389	170396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009229	GCCA	2	8	172384	172391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009229	GCTG	2	8	172443	172450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009229	GTCG	2	8	175231	175238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009229	ATTG	2	8	175297	175304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009229	GACT	2	8	178699	178706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009229	ATCT	2	8	178725	178732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009229	TCCC	2	8	194102	194109	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_009229	ATTG	2	8	199702	199709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009229	CTGC	2	8	202343	202350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009229	GCGG	2	8	202403	202410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009229	CGAA	2	8	221071	221078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009229	CACT	2	8	221093	221100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009229	CCTT	2	8	221285	221292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009229	GAAA	2	8	226422	226429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.