MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE04

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009228	GCTCG	2	10	2386	2395	0 %	20 %	40 %	40 %	134287795
2	NC_009228	ATCGA	2	10	2570	2579	40 %	20 %	20 %	20 %	134287795
3	NC_009228	GTACC	2	10	3775	3784	20 %	20 %	20 %	40 %	134287795
4	NC_009228	CGAGA	2	10	5207	5216	40 %	0 %	40 %	20 %	134287795
5	NC_009228	GGCAC	2	10	6383	6392	20 %	0 %	40 %	40 %	134287797
6	NC_009228	CACGA	2	10	6799	6808	40 %	0 %	20 %	40 %	134287798
7	NC_009228	TCAGC	2	10	7343	7352	20 %	20 %	20 %	40 %	134287799
8	NC_009228	CATCT	2	10	11288	11297	20 %	40 %	0 %	40 %	134287806
9	NC_009228	CTGCG	2	10	11420	11429	0 %	20 %	40 %	40 %	134287807
10	NC_009228	TCGCC	2	10	11873	11882	0 %	20 %	20 %	60 %	134287807
11	NC_009228	CATCG	2	10	12006	12015	20 %	20 %	20 %	40 %	134287807
12	NC_009228	TTCGA	2	10	12994	13003	20 %	40 %	20 %	20 %	134287807
13	NC_009228	CGGAT	2	10	14563	14572	20 %	20 %	40 %	20 %	134287809
14	NC_009228	CGCGC	2	10	18711	18720	0 %	0 %	40 %	60 %	134287811
15	NC_009228	TCGGT	2	10	20099	20108	0 %	40 %	40 %	20 %	134287812
16	NC_009228	CTTTG	2	10	23415	23424	0 %	60 %	20 %	20 %	134287816
17	NC_009228	CGCCC	2	10	23740	23749	0 %	0 %	20 %	80 %	134287817
18	NC_009228	ATACA	2	10	27734	27743	60 %	20 %	0 %	20 %	134287821
19	NC_009228	CATCG	2	10	29251	29260	20 %	20 %	20 %	40 %	134287821
20	NC_009228	GCCGG	2	10	29671	29680	0 %	0 %	60 %	40 %	134287821
21	NC_009228	TGAGC	2	10	31874	31883	20 %	20 %	40 %	20 %	134287822
22	NC_009228	CCGCG	2	10	32566	32575	0 %	0 %	40 %	60 %	134287823
23	NC_009228	TGGCC	2	10	41222	41231	0 %	20 %	40 %	40 %	134287832
24	NC_009228	CGCGG	2	10	41286	41295	0 %	0 %	60 %	40 %	134287832
25	NC_009228	TTGCC	2	10	45708	45717	0 %	40 %	20 %	40 %	134287837
26	NC_009228	TCAAC	2	10	46036	46045	40 %	20 %	0 %	40 %	134287838
27	NC_009228	CATCG	2	10	48787	48796	20 %	20 %	20 %	40 %	134287841
28	NC_009228	TAGTG	2	10	55676	55685	20 %	40 %	40 %	0 %	134287849
29	NC_009228	GCGAC	2	10	59803	59812	20 %	0 %	40 %	40 %	134287853
30	NC_009228	ATGGA	2	10	63573	63582	40 %	20 %	40 %	0 %	134287855
31	NC_009228	CTGGC	2	10	64060	64069	0 %	20 %	40 %	40 %	134287856
32	NC_009228	GCCGC	2	10	66951	66960	0 %	0 %	40 %	60 %	134287859
33	NC_009228	GCAGG	2	10	71386	71395	20 %	0 %	60 %	20 %	134287862
34	NC_009228	GGCTC	2	10	74472	74481	0 %	20 %	40 %	40 %	134287866
35	NC_009228	TGAAA	2	10	77501	77510	60 %	20 %	20 %	0 %	134287871
36	NC_009228	GACGC	2	10	78805	78814	20 %	0 %	40 %	40 %	134287871
37	NC_009228	GCGCC	2	10	79022	79031	0 %	0 %	40 %	60 %	134287871
38	NC_009228	GGATG	2	10	80287	80296	20 %	20 %	60 %	0 %	134287873
39	NC_009228	CGTCG	2	10	81515	81524	0 %	20 %	40 %	40 %	134287874
40	NC_009228	TGACG	2	10	85031	85040	20 %	20 %	40 %	20 %	134287881
41	NC_009228	AGGGC	2	10	86496	86505	20 %	0 %	60 %	20 %	134287881
42	NC_009228	GTCAG	2	10	86902	86911	20 %	20 %	40 %	20 %	134287881
43	NC_009228	GATTC	2	10	88414	88423	20 %	40 %	20 %	20 %	134287883
44	NC_009228	GCCAG	2	10	88473	88482	20 %	0 %	40 %	40 %	134287883
45	NC_009228	GTCGT	2	10	89215	89224	0 %	40 %	40 %	20 %	134287884
46	NC_009228	AACCG	2	10	90277	90286	40 %	0 %	20 %	40 %	134287886
47	NC_009228	TCGCG	2	10	91556	91565	0 %	20 %	40 %	40 %	134287887
48	NC_009228	CGTGC	2	10	91661	91670	0 %	20 %	40 %	40 %	134287887
49	NC_009228	ACGCC	2	10	94236	94245	20 %	0 %	20 %	60 %	134287889
50	NC_009228	TGCGC	2	10	95169	95178	0 %	20 %	40 %	40 %	134287889
51	NC_009228	GAATC	2	10	95576	95585	40 %	20 %	20 %	20 %	134287890
52	NC_009228	TGCGA	2	10	95777	95786	20 %	20 %	40 %	20 %	134287890
53	NC_009228	GCGCT	2	10	96786	96795	0 %	20 %	40 %	40 %	134287891
54	NC_009228	CCAGT	2	10	97434	97443	20 %	20 %	20 %	40 %	134287891
55	NC_009228	GCGAC	2	10	99875	99884	20 %	0 %	40 %	40 %	134287893
56	NC_009228	GCTCG	2	10	101506	101515	0 %	20 %	40 %	40 %	134287894
57	NC_009228	AACGC	2	10	103045	103054	40 %	0 %	20 %	40 %	134287894
58	NC_009228	TTCGG	2	10	103421	103430	0 %	40 %	40 %	20 %	134287895
59	NC_009228	CGCGC	2	10	107077	107086	0 %	0 %	40 %	60 %	134287901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.