MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	TTGACG	2	12	1039	1050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287419
2	NC_009226	CGAAGC	2	12	4543	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287426
3	NC_009226	GGCAAG	2	12	4983	4994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134287426
4	NC_009226	CCTGAA	2	12	7041	7052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287428
5	NC_009226	GCAGCG	2	12	9056	9067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287430
6	NC_009226	TTCGAG	2	12	11233	11244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287434
7	NC_009226	TCGCAA	2	12	16502	16513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287445
8	NC_009226	TTCAAC	2	12	17225	17236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287446
9	NC_009226	TCGTAG	2	12	17990	18001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287448
10	NC_009226	CGAGCA	2	12	18421	18432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287449
11	NC_009226	TGCCAC	2	12	19467	19478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134287451
12	NC_009226	GAGAAT	2	12	25173	25184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134287459
13	NC_009226	GCTTGC	2	12	27812	27823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287464
14	NC_009226	GCGATG	2	12	30428	30439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134287468
15	NC_009226	CGAGCG	2	12	32160	32171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287470
16	NC_009226	CTCGCG	2	12	32794	32805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287471
17	NC_009226	CGAGCG	2	12	39205	39216	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287479
18	NC_009226	AAGCTC	2	12	39284	39295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287479
19	NC_009226	GCGCTC	2	12	40439	40450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287480
20	NC_009226	CGTTGC	2	12	42467	42478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287483
21	NC_009226	CGCCTG	2	12	44040	44051	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287486
22	NC_009226	CGAGCA	2	12	44438	44449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287486
23	NC_009226	CGCGAG	2	12	46748	46759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287489
24	NC_009226	CGTCCA	2	12	50485	50496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134287492
25	NC_009226	TGTCGG	2	12	52570	52581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134287496
26	NC_009226	CGATTT	2	12	53208	53219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134287497
27	NC_009226	GGGCGA	4	24	54319	54342	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	134287499
28	NC_009226	CGTCAA	2	12	55308	55319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134287499
29	NC_009226	TGCCAT	2	12	62099	62110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134287507
30	NC_009226	GATCTT	2	12	63857	63868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134287507
31	NC_009226	TCGGCG	2	12	67101	67112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134287507
32	NC_009226	CGCGAG	2	12	69180	69191	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134287508
33	NC_009226	TCCGGC	2	12	71109	71120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134287509
34	NC_009226	TCGCAG	2	12	76789	76800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287517
35	NC_009226	CGCAGT	2	12	78401	78412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134287520
36	NC_009226	GACATG	2	12	78504	78515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134287520
37	NC_009226	TTCACC	2	12	81433	81444	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134287525
38	NC_009226	CATTGG	2	12	82824	82835	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287525
39	NC_009226	GCGGGC	2	12	85156	85167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287527
40	NC_009226	GGCGAG	2	12	86743	86754	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	134287529
41	NC_009226	ATTCGG	2	12	87157	87168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287529
42	NC_009226	CGACAC	2	12	87175	87186	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134287529

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.