MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	CCGAG	2	10	1642	1651	20 %	0 %	40 %	40 %	134287420
2	NC_009226	CCCGG	2	10	2627	2636	0 %	0 %	40 %	60 %	134287423
3	NC_009226	TGGCT	2	10	3231	3240	0 %	40 %	40 %	20 %	134287424
4	NC_009226	TGCGC	2	10	3366	3375	0 %	20 %	40 %	40 %	134287424
5	NC_009226	CGAGG	2	10	3487	3496	20 %	0 %	60 %	20 %	134287424
6	NC_009226	GGGCC	2	10	5154	5163	0 %	0 %	60 %	40 %	134287426
7	NC_009226	CGCGC	2	10	5213	5222	0 %	0 %	40 %	60 %	134287426
8	NC_009226	GCCGC	3	15	5514	5528	0 %	0 %	40 %	60 %	134287426
9	NC_009226	ATGGC	2	10	6108	6117	20 %	20 %	40 %	20 %	134287427
10	NC_009226	CGGCA	2	10	6173	6182	20 %	0 %	40 %	40 %	134287427
11	NC_009226	CGTAC	2	10	7152	7161	20 %	20 %	20 %	40 %	134287428
12	NC_009226	CGCAC	2	10	8989	8998	20 %	0 %	20 %	60 %	134287430
13	NC_009226	TCGCG	2	10	10553	10562	0 %	20 %	40 %	40 %	134287432
14	NC_009226	CGCGG	2	10	11853	11862	0 %	0 %	60 %	40 %	134287435
15	NC_009226	CGCGT	2	10	13638	13647	0 %	20 %	40 %	40 %	134287440
16	NC_009226	TATCG	2	10	14154	14163	20 %	40 %	20 %	20 %	134287441
17	NC_009226	GCCGA	2	10	16142	16151	20 %	0 %	40 %	40 %	134287444
18	NC_009226	CAGCA	2	10	18534	18543	40 %	0 %	20 %	40 %	134287449
19	NC_009226	CGAGC	2	10	18707	18716	20 %	0 %	40 %	40 %	134287449
20	NC_009226	CTGCT	2	10	20890	20899	0 %	40 %	20 %	40 %	134287453
21	NC_009226	CCGTG	2	10	22299	22308	0 %	20 %	40 %	40 %	134287454
22	NC_009226	TCGGC	2	10	23510	23519	0 %	20 %	40 %	40 %	134287456
23	NC_009226	TGCCC	2	10	23714	23723	0 %	20 %	20 %	60 %	134287456
24	NC_009226	CGTCC	2	10	24560	24569	0 %	20 %	20 %	60 %	134287457
25	NC_009226	AGCGC	2	10	24739	24748	20 %	0 %	40 %	40 %	134287458
26	NC_009226	CGTGC	2	10	25822	25831	0 %	20 %	40 %	40 %	134287460
27	NC_009226	CGGCG	2	10	26015	26024	0 %	0 %	60 %	40 %	134287461
28	NC_009226	TCCCT	2	10	30777	30786	0 %	40 %	0 %	60 %	134287469
29	NC_009226	ACCGC	2	10	32135	32144	20 %	0 %	20 %	60 %	134287470
30	NC_009226	CGCAG	2	10	32238	32247	20 %	0 %	40 %	40 %	134287470
31	NC_009226	GCAAC	2	10	32409	32418	40 %	0 %	20 %	40 %	134287470
32	NC_009226	GCGAA	2	10	32456	32465	40 %	0 %	40 %	20 %	134287470
33	NC_009226	GCCGC	2	10	32602	32611	0 %	0 %	40 %	60 %	134287470
34	NC_009226	CCGCG	2	10	35171	35180	0 %	0 %	40 %	60 %	134287473
35	NC_009226	CGCGT	2	10	35705	35714	0 %	20 %	40 %	40 %	134287474
36	NC_009226	CTCCG	2	10	44274	44283	0 %	20 %	20 %	60 %	134287486
37	NC_009226	GCGCT	2	10	45094	45103	0 %	20 %	40 %	40 %	134287487
38	NC_009226	CGAAT	2	10	45829	45838	40 %	20 %	20 %	20 %	134287488
39	NC_009226	TCTGC	2	10	48767	48776	0 %	40 %	20 %	40 %	134287491
40	NC_009226	GCTCG	2	10	49101	49110	0 %	20 %	40 %	40 %	134287491
41	NC_009226	GCTGC	2	10	49924	49933	0 %	20 %	40 %	40 %	134287491
42	NC_009226	GCGAG	2	10	53911	53920	20 %	0 %	60 %	20 %	134287498
43	NC_009226	GCCCG	2	10	55675	55684	0 %	0 %	40 %	60 %	134287499
44	NC_009226	GAGCC	2	10	55698	55707	20 %	0 %	40 %	40 %	134287499
45	NC_009226	GCGCG	2	10	56430	56439	0 %	0 %	60 %	40 %	134287499
46	NC_009226	CCGCA	2	10	56971	56980	20 %	0 %	20 %	60 %	134287500
47	NC_009226	GCGCA	2	10	57516	57525	20 %	0 %	40 %	40 %	134287500
48	NC_009226	CGGAC	2	10	57570	57579	20 %	0 %	40 %	40 %	134287500
49	NC_009226	GCACG	2	10	59726	59735	20 %	0 %	40 %	40 %	134287502
50	NC_009226	AGCGC	2	10	62166	62175	20 %	0 %	40 %	40 %	134287507
51	NC_009226	GCGCG	2	10	62356	62365	0 %	0 %	60 %	40 %	134287507
52	NC_009226	TTGCT	2	10	62436	62445	0 %	60 %	20 %	20 %	134287507
53	NC_009226	GTTCG	2	10	62858	62867	0 %	40 %	40 %	20 %	134287507
54	NC_009226	GAATC	2	10	64024	64033	40 %	20 %	20 %	20 %	134287507
55	NC_009226	AGCGC	2	10	65953	65962	20 %	0 %	40 %	40 %	134287507
56	NC_009226	CTCGT	2	10	67896	67905	0 %	40 %	20 %	40 %	134287507
57	NC_009226	CGATG	2	10	68030	68039	20 %	20 %	40 %	20 %	134287507
58	NC_009226	CCGGG	2	10	68825	68834	0 %	0 %	60 %	40 %	134287508
59	NC_009226	CGGCG	2	10	71660	71669	0 %	0 %	60 %	40 %	134287509
60	NC_009226	CGTCA	2	10	72674	72683	20 %	20 %	20 %	40 %	134287509
61	NC_009226	GGGCC	2	10	73288	73297	0 %	0 %	60 %	40 %	134287509
62	NC_009226	AGGCG	2	10	74268	74277	20 %	0 %	60 %	20 %	134287511
63	NC_009226	GCGCG	2	10	76533	76542	0 %	0 %	60 %	40 %	134287516
64	NC_009226	TCGCC	2	10	78337	78346	0 %	20 %	20 %	60 %	134287520
65	NC_009226	CCGGC	2	10	78536	78545	0 %	0 %	40 %	60 %	134287520
66	NC_009226	TGCCA	2	10	80011	80020	20 %	20 %	20 %	40 %	134287523
67	NC_009226	GCGTG	2	10	81139	81148	0 %	20 %	60 %	20 %	134287525
68	NC_009226	GGCCC	2	10	85619	85628	0 %	0 %	40 %	60 %	134287527
69	NC_009226	GGCGC	2	10	86811	86820	0 %	0 %	60 %	40 %	134287529
70	NC_009226	CGCGG	2	10	87813	87822	0 %	0 %	60 %	40 %	134287529

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.