MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	TCGG	2	8	325	332	0 %	25 %	50 %	25 %	134287419
2	NC_009226	GGTT	2	8	1375	1382	0 %	50 %	50 %	0 %	134287419
3	NC_009226	GGCG	2	8	1945	1952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009226	ATGA	2	8	2441	2448	50 %	25 %	25 %	0 %	134287422
5	NC_009226	CAAA	2	8	2452	2459	75 %	0 %	0 %	25 %	134287423
6	NC_009226	GCGA	2	8	2558	2565	25 %	0 %	50 %	25 %	134287423
7	NC_009226	TTGG	2	8	2574	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	134287423
8	NC_009226	GCGG	2	8	2769	2776	0 %	0 %	75 %	25 %	134287423
9	NC_009226	ACCG	2	8	2926	2933	25 %	0 %	25 %	50 %	134287423
10	NC_009226	ATCT	2	8	3058	3065	25 %	50 %	0 %	25 %	134287423
11	NC_009226	GACA	2	8	3205	3212	50 %	0 %	25 %	25 %	134287424
12	NC_009226	CCCG	2	8	3249	3256	0 %	0 %	25 %	75 %	134287424
13	NC_009226	CTCG	2	8	3744	3751	0 %	25 %	25 %	50 %	134287424
14	NC_009226	CTTG	2	8	3958	3965	0 %	50 %	25 %	25 %	134287425
15	NC_009226	AAGC	2	8	4533	4540	50 %	0 %	25 %	25 %	134287426
16	NC_009226	GCAG	2	8	4568	4575	25 %	0 %	50 %	25 %	134287426
17	NC_009226	CATT	2	8	5494	5501	25 %	50 %	0 %	25 %	134287426
18	NC_009226	GAAT	2	8	5702	5709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009226	CTGA	2	8	5879	5886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009226	TGCT	2	8	6211	6218	0 %	50 %	25 %	25 %	134287427
21	NC_009226	CGCT	2	8	6970	6977	0 %	25 %	25 %	50 %	134287428
22	NC_009226	CGCA	2	8	7172	7179	25 %	0 %	25 %	50 %	134287428
23	NC_009226	CGGG	2	8	7499	7506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009226	GAGG	2	8	7659	7666	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009226	CCGA	2	8	8499	8506	25 %	0 %	25 %	50 %	134287430
26	NC_009226	GCCG	2	8	8614	8621	0 %	0 %	50 %	50 %	134287430
27	NC_009226	GCGG	2	8	8779	8786	0 %	0 %	75 %	25 %	134287430
28	NC_009226	GCTC	2	8	9333	9340	0 %	25 %	25 %	50 %	134287430
29	NC_009226	CGAA	2	8	9551	9558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009226	GCAG	2	8	9695	9702	25 %	0 %	50 %	25 %	134287431
31	NC_009226	GCAG	2	8	9863	9870	25 %	0 %	50 %	25 %	134287431
32	NC_009226	ACGG	2	8	10895	10902	25 %	0 %	50 %	25 %	134287433
33	NC_009226	CCGA	2	8	10964	10971	25 %	0 %	25 %	50 %	134287433
34	NC_009226	CTGC	2	8	10999	11006	0 %	25 %	25 %	50 %	134287433
35	NC_009226	ACGA	2	8	11497	11504	50 %	0 %	25 %	25 %	134287434
36	NC_009226	GGGC	2	8	12216	12223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009226	ACGG	2	8	12315	12322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009226	GATG	2	8	12804	12811	25 %	25 %	50 %	0 %	134287437
39	NC_009226	TGCG	2	8	12985	12992	0 %	25 %	50 %	25 %	134287438
40	NC_009226	TCGA	2	8	13031	13038	25 %	25 %	25 %	25 %	134287438
41	NC_009226	GATG	2	8	13067	13074	25 %	25 %	50 %	0 %	134287438
42	NC_009226	GGGC	2	8	13329	13336	0 %	0 %	75 %	25 %	134287439
43	NC_009226	ATCG	2	8	13342	13349	25 %	25 %	25 %	25 %	134287439
44	NC_009226	GTGG	2	8	13669	13676	0 %	25 %	75 %	0 %	134287440
45	NC_009226	TCCG	2	8	13709	13716	0 %	25 %	25 %	50 %	134287440
46	NC_009226	TCAG	2	8	14628	14635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009226	GCAC	2	8	14664	14671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009226	GCCG	2	8	14733	14740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009226	GCCG	2	8	14804	14811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009226	GCCC	2	8	14833	14840	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009226	GCGA	2	8	15072	15079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009226	AATC	2	8	15161	15168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009226	GGCG	2	8	16216	16223	0 %	0 %	75 %	25 %	134287444
54	NC_009226	CGGC	2	8	16477	16484	0 %	0 %	50 %	50 %	134287445
55	NC_009226	GGTC	2	8	16640	16647	0 %	25 %	50 %	25 %	134287445
56	NC_009226	AGGC	2	8	16725	16732	25 %	0 %	50 %	25 %	134287445
57	NC_009226	CATC	2	8	17074	17081	25 %	25 %	0 %	50 %	134287446
58	NC_009226	CCAT	2	8	17868	17875	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009226	TGCG	2	8	18093	18100	0 %	25 %	50 %	25 %	134287448
60	NC_009226	GCGT	2	8	18138	18145	0 %	25 %	50 %	25 %	134287448
61	NC_009226	CTCG	2	8	18257	18264	0 %	25 %	25 %	50 %	134287449
62	NC_009226	CAGC	2	8	18698	18705	25 %	0 %	25 %	50 %	134287449
63	NC_009226	GCAG	2	8	18878	18885	25 %	0 %	50 %	25 %	134287450
64	NC_009226	ATCC	2	8	19343	19350	25 %	25 %	0 %	50 %	134287450
65	NC_009226	GACC	2	8	19384	19391	25 %	0 %	25 %	50 %	134287450
66	NC_009226	GCAC	2	8	19794	19801	25 %	0 %	25 %	50 %	134287452
67	NC_009226	TCCA	2	8	20112	20119	25 %	25 %	0 %	50 %	134287452
68	NC_009226	CAGT	2	8	20359	20366	25 %	25 %	25 %	25 %	134287452
69	NC_009226	TTTC	2	8	21111	21118	0 %	75 %	0 %	25 %	134287454
70	NC_009226	ACGA	2	8	21209	21216	50 %	0 %	25 %	25 %	134287454
71	NC_009226	GCGA	2	8	21262	21269	25 %	0 %	50 %	25 %	134287454
72	NC_009226	CCGC	2	8	21407	21414	0 %	0 %	25 %	75 %	134287454
73	NC_009226	GCCC	2	8	21840	21847	0 %	0 %	25 %	75 %	134287454
74	NC_009226	CTTG	2	8	22335	22342	0 %	50 %	25 %	25 %	134287454
75	NC_009226	GGTC	2	8	22604	22611	0 %	25 %	50 %	25 %	134287455
76	NC_009226	CTCG	2	8	22935	22942	0 %	25 %	25 %	50 %	134287455
77	NC_009226	AGAC	2	8	23027	23034	50 %	0 %	25 %	25 %	134287455
78	NC_009226	CGAC	2	8	23038	23045	25 %	0 %	25 %	50 %	134287455
79	NC_009226	GGAT	2	8	23702	23709	25 %	25 %	50 %	0 %	134287456
80	NC_009226	ACGA	2	8	24042	24049	50 %	0 %	25 %	25 %	134287456
81	NC_009226	CCGC	2	8	24178	24185	0 %	0 %	25 %	75 %	134287457
82	NC_009226	GTCG	2	8	24506	24513	0 %	25 %	50 %	25 %	134287457
83	NC_009226	GTAG	2	8	24902	24909	25 %	25 %	50 %	0 %	134287458
84	NC_009226	CCGG	2	8	25003	25010	0 %	0 %	50 %	50 %	134287458
85	NC_009226	CTTT	2	8	25066	25073	0 %	75 %	0 %	25 %	134287458
86	NC_009226	AGCC	2	8	26352	26359	25 %	0 %	25 %	50 %	134287461
87	NC_009226	GCCA	2	8	26785	26792	25 %	0 %	25 %	50 %	134287463
88	NC_009226	CTCG	2	8	26962	26969	0 %	25 %	25 %	50 %	134287463
89	NC_009226	ACGC	2	8	27024	27031	25 %	0 %	25 %	50 %	134287463
90	NC_009226	CAGT	2	8	27113	27120	25 %	25 %	25 %	25 %	134287463
91	NC_009226	CGGG	2	8	27780	27787	0 %	0 %	75 %	25 %	134287464
92	NC_009226	GCTC	2	8	27919	27926	0 %	25 %	25 %	50 %	134287464
93	NC_009226	GTCG	2	8	28029	28036	0 %	25 %	50 %	25 %	134287464
94	NC_009226	GCGT	2	8	28562	28569	0 %	25 %	50 %	25 %	134287465
95	NC_009226	CTGC	2	8	29053	29060	0 %	25 %	25 %	50 %	134287466
96	NC_009226	GAAA	2	8	29473	29480	75 %	0 %	25 %	0 %	134287466
97	NC_009226	TTCG	2	8	29888	29895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009226	AGGA	2	8	29973	29980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009226	TCGG	2	8	30007	30014	0 %	25 %	50 %	25 %	134287468
100	NC_009226	GCTG	2	8	30487	30494	0 %	25 %	50 %	25 %	134287468
101	NC_009226	AAAG	2	8	30844	30851	75 %	0 %	25 %	0 %	134287469
102	NC_009226	GCAA	2	8	30920	30927	50 %	0 %	25 %	25 %	134287469
103	NC_009226	CCAT	2	8	31031	31038	25 %	25 %	0 %	50 %	134287469
104	NC_009226	CGCT	2	8	31045	31052	0 %	25 %	25 %	50 %	134287469
105	NC_009226	GTGC	2	8	31220	31227	0 %	25 %	50 %	25 %	134287469
106	NC_009226	CCGC	2	8	31284	31291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009226	CACC	2	8	31352	31359	25 %	0 %	0 %	75 %	134287470
108	NC_009226	CGAG	2	8	31451	31458	25 %	0 %	50 %	25 %	134287470
109	NC_009226	CCGG	2	8	31621	31628	0 %	0 %	50 %	50 %	134287470
110	NC_009226	TTCG	2	8	31968	31975	0 %	50 %	25 %	25 %	134287470
111	NC_009226	CCCG	2	8	32700	32707	0 %	0 %	25 %	75 %	134287471
112	NC_009226	CTCG	2	8	32958	32965	0 %	25 %	25 %	50 %	134287471
113	NC_009226	AGTC	2	8	34276	34283	25 %	25 %	25 %	25 %	134287473
114	NC_009226	AGGC	2	8	34813	34820	25 %	0 %	50 %	25 %	134287473
115	NC_009226	TCGT	2	8	34863	34870	0 %	50 %	25 %	25 %	134287473
116	NC_009226	TTCG	2	8	34952	34959	0 %	50 %	25 %	25 %	134287473
117	NC_009226	GAGC	2	8	35422	35429	25 %	0 %	50 %	25 %	134287474
118	NC_009226	GGTC	2	8	35721	35728	0 %	25 %	50 %	25 %	134287474
119	NC_009226	ACGC	2	8	36125	36132	25 %	0 %	25 %	50 %	134287474
120	NC_009226	CGTC	2	8	36694	36701	0 %	25 %	25 %	50 %	134287476
121	NC_009226	CCGC	2	8	36766	36773	0 %	0 %	25 %	75 %	134287476
122	NC_009226	AACA	2	8	36963	36970	75 %	0 %	0 %	25 %	134287476
123	NC_009226	ACCC	2	8	37184	37191	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009226	AACA	2	8	37465	37472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009226	ACCC	2	8	37625	37632	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_009226	CGGG	2	8	38189	38196	0 %	0 %	75 %	25 %	134287477
127	NC_009226	CCGC	2	8	38736	38743	0 %	0 %	25 %	75 %	134287478
128	NC_009226	CTCG	2	8	39999	40006	0 %	25 %	25 %	50 %	134287480
129	NC_009226	AGAA	2	8	40944	40951	75 %	0 %	25 %	0 %	134287480
130	NC_009226	CGCA	2	8	41002	41009	25 %	0 %	25 %	50 %	134287480
131	NC_009226	CGAG	2	8	41146	41153	25 %	0 %	50 %	25 %	134287480
132	NC_009226	GGCA	2	8	41456	41463	25 %	0 %	50 %	25 %	134287481
133	NC_009226	GATG	2	8	41871	41878	25 %	25 %	50 %	0 %	134287482
134	NC_009226	CGCC	2	8	42038	42045	0 %	0 %	25 %	75 %	134287482
135	NC_009226	CTCA	2	8	42166	42173	25 %	25 %	0 %	50 %	134287482
136	NC_009226	GGCA	2	8	42323	42330	25 %	0 %	50 %	25 %	134287483
137	NC_009226	GTCG	2	8	42482	42489	0 %	25 %	50 %	25 %	134287483
138	NC_009226	CTGC	2	8	42913	42920	0 %	25 %	25 %	50 %	134287484
139	NC_009226	CGAC	2	8	43162	43169	25 %	0 %	25 %	50 %	134287484
140	NC_009226	CGCC	2	8	43976	43983	0 %	0 %	25 %	75 %	134287486
141	NC_009226	TCGG	2	8	44143	44150	0 %	25 %	50 %	25 %	134287486
142	NC_009226	TCGC	2	8	44410	44417	0 %	25 %	25 %	50 %	134287486
143	NC_009226	CCGT	2	8	45264	45271	0 %	25 %	25 %	50 %	134287487
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.