MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009140	GA	3	6	60	65	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009140	AT	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009140	TA	3	6	2422	2427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009140	TA	3	6	15436	15441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009140	TC	3	6	17851	17856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009140	TG	3	6	22763	22768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009140	AG	3	6	35173	35178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009140	GA	4	8	42271	42278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009140	GT	3	6	46338	46343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009140	AG	3	6	53274	53279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009140	AT	3	6	59100	59105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009140	TA	3	6	60096	60101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009140	CA	3	6	60662	60667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009140	TG	3	6	67263	67268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009140	GT	3	6	67274	67279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009140	GT	3	6	70091	70096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009140	CA	3	6	70148	70153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009140	AT	3	6	70732	70737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009140	TG	3	6	72176	72181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009140	AC	3	6	75050	75055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009140	CA	3	6	75061	75066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009140	TC	3	6	93056	93061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009140	CT	3	6	93131	93136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009140	GA	3	6	97238	97243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009140	CA	3	6	102064	102069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009140	CT	3	6	102160	102165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009140	TG	3	6	102249	102254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009140	CT	3	6	106571	106576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009140	GA	3	6	107485	107490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009140	CT	3	6	109663	109668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009140	TC	3	6	113575	113580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009140	GA	3	6	113593	113598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009140	GC	3	6	124281	124286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009140	AT	3	6	127052	127057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009140	AT	3	6	127981	127986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009140	GC	5	10	128130	128139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009140	CG	3	6	128153	128158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009140	CA	3	6	131912	131917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009140	TG	3	6	132128	132133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009140	CA	4	8	133428	133435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009140	AT	3	6	133613	133618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009140	TC	3	6	135777	135782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009140	TC	3	6	135804	135809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009140	GC	3	6	141000	141005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009140	CG	3	6	141201	141206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009140	CG	3	6	144652	144657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009140	AG	4	8	156104	156111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009140	TC	3	6	157265	157270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009140	TG	3	6	157815	157820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009140	TC	3	6	161163	161168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009140	TC	3	6	161173	161178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009140	TC	4	8	161183	161190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009140	CA	3	6	161207	161212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009140	CA	3	6	161331	161336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009140	CA	3	6	162275	162280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009140	AT	3	6	162306	162311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009140	TG	3	6	172146	172151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.