MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009140	C	6	6	2256	2261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_009140	T	7	7	2292	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009140	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	134047218
4	NC_009140	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	134047218
5	NC_009140	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009140	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009140	T	7	7	3271	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	134047132
8	NC_009140	A	6	6	3280	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	134047132
9	NC_009140	A	7	7	3691	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	134047132
10	NC_009140	T	8	8	3898	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	134047153
11	NC_009140	T	6	6	4853	4858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009140	A	6	6	8324	8329	100 %	0 %	0 %	0 %	134047268
13	NC_009140	A	6	6	13227	13232	100 %	0 %	0 %	0 %	134047244
14	NC_009140	A	8	8	13454	13461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009140	A	6	6	16463	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	134047091
16	NC_009140	A	6	6	16667	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	134047168
17	NC_009140	A	6	6	17892	17897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009140	G	6	6	20201	20206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009140	A	8	8	20279	20286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009140	T	8	8	21378	21385	0 %	100 %	0 %	0 %	134047139
21	NC_009140	G	6	6	28066	28071	0 %	0 %	100 %	0 %	134047112
22	NC_009140	A	8	8	31495	31502	100 %	0 %	0 %	0 %	134047125
23	NC_009140	A	6	6	31855	31860	100 %	0 %	0 %	0 %	134047177
24	NC_009140	T	7	7	33050	33056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009140	T	7	7	35525	35531	0 %	100 %	0 %	0 %	134047269
26	NC_009140	A	6	6	37180	37185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009140	T	6	6	37634	37639	0 %	100 %	0 %	0 %	134047148
28	NC_009140	T	6	6	38754	38759	0 %	100 %	0 %	0 %	134047088
29	NC_009140	T	6	6	41498	41503	0 %	100 %	0 %	0 %	134047238
30	NC_009140	A	6	6	41758	41763	100 %	0 %	0 %	0 %	134047238
31	NC_009140	A	6	6	42374	42379	100 %	0 %	0 %	0 %	134047270
32	NC_009140	A	6	6	43449	43454	100 %	0 %	0 %	0 %	134047127
33	NC_009140	G	6	6	44569	44574	0 %	0 %	100 %	0 %	134047127
34	NC_009140	A	6	6	46257	46262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009140	G	8	8	46286	46293	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009140	G	6	6	48700	48705	0 %	0 %	100 %	0 %	134047158
37	NC_009140	A	6	6	48787	48792	100 %	0 %	0 %	0 %	134047158
38	NC_009140	A	7	7	49433	49439	100 %	0 %	0 %	0 %	134047236
39	NC_009140	T	6	6	53285	53290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009140	A	6	6	54647	54652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009140	T	7	7	54669	54675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009140	G	7	7	54909	54915	0 %	0 %	100 %	0 %	134047157
43	NC_009140	T	6	6	57090	57095	0 %	100 %	0 %	0 %	134047150
44	NC_009140	T	6	6	58920	58925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009140	A	6	6	59494	59499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009140	A	6	6	59798	59803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009140	T	6	6	61032	61037	0 %	100 %	0 %	0 %	134047123
48	NC_009140	A	8	8	61619	61626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009140	T	6	6	64218	64223	0 %	100 %	0 %	0 %	134047225
50	NC_009140	C	6	6	65262	65267	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
51	NC_009140	C	7	7	66058	66064	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
52	NC_009140	A	7	7	67395	67401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009140	A	6	6	68398	68403	100 %	0 %	0 %	0 %	134047101
54	NC_009140	A	7	7	68769	68775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009140	T	7	7	68905	68911	0 %	100 %	0 %	0 %	134047199
56	NC_009140	T	6	6	69951	69956	0 %	100 %	0 %	0 %	134047199
57	NC_009140	T	6	6	70096	70101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009140	A	6	6	71126	71131	100 %	0 %	0 %	0 %	134047113
59	NC_009140	A	6	6	71430	71435	100 %	0 %	0 %	0 %	134047113
60	NC_009140	A	6	6	72228	72233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009140	A	6	6	72373	72378	100 %	0 %	0 %	0 %	134047254
62	NC_009140	A	7	7	73418	73424	100 %	0 %	0 %	0 %	134047254
63	NC_009140	T	7	7	73554	73560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009140	T	6	6	73926	73931	0 %	100 %	0 %	0 %	134047098
65	NC_009140	T	7	7	74928	74934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009140	G	7	7	76265	76271	0 %	0 %	100 %	0 %	134047272
67	NC_009140	G	6	6	77062	77067	0 %	0 %	100 %	0 %	134047272
68	NC_009140	A	6	6	78106	78111	100 %	0 %	0 %	0 %	134047272
69	NC_009140	T	8	8	80703	80710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009140	A	6	6	81292	81297	100 %	0 %	0 %	0 %	134047146
71	NC_009140	T	7	7	82376	82382	0 %	100 %	0 %	0 %	134047203
72	NC_009140	T	6	6	82934	82939	0 %	100 %	0 %	0 %	134047203
73	NC_009140	A	6	6	85257	85262	100 %	0 %	0 %	0 %	134047266
74	NC_009140	A	6	6	86726	86731	100 %	0 %	0 %	0 %	134047249
75	NC_009140	T	7	7	87267	87273	0 %	100 %	0 %	0 %	134047249
76	NC_009140	G	6	6	88079	88084	0 %	0 %	100 %	0 %	134047133
77	NC_009140	A	6	6	90246	90251	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
78	NC_009140	A	7	7	90636	90642	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
79	NC_009140	A	6	6	91595	91600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009140	A	8	8	91617	91624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009140	T	8	8	92571	92578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009140	G	6	6	94945	94950	0 %	0 %	100 %	0 %	134047175
83	NC_009140	T	7	7	95503	95509	0 %	100 %	0 %	0 %	134047175
84	NC_009140	G	7	7	97194	97200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009140	A	6	6	99827	99832	100 %	0 %	0 %	0 %	134047208
86	NC_009140	T	6	6	101228	101233	0 %	100 %	0 %	0 %	134047208
87	NC_009140	T	6	6	101753	101758	0 %	100 %	0 %	0 %	134047183
88	NC_009140	A	6	6	102550	102555	100 %	0 %	0 %	0 %	134047195
89	NC_009140	G	6	6	106492	106497	0 %	0 %	100 %	0 %	134047102
90	NC_009140	G	6	6	108100	108105	0 %	0 %	100 %	0 %	134047248
91	NC_009140	A	6	6	108965	108970	100 %	0 %	0 %	0 %	134047248
92	NC_009140	T	6	6	109291	109296	0 %	100 %	0 %	0 %	134047130
93	NC_009140	G	6	6	110438	110443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009140	T	6	6	110495	110500	0 %	100 %	0 %	0 %	134047097
95	NC_009140	A	7	7	110693	110699	100 %	0 %	0 %	0 %	134047097
96	NC_009140	A	6	6	117973	117978	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
97	NC_009140	A	6	6	118661	118666	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
98	NC_009140	A	6	6	118813	118818	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
99	NC_009140	T	6	6	120933	120938	0 %	100 %	0 %	0 %	134047231
100	NC_009140	T	6	6	124147	124152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009140	T	7	7	125974	125980	0 %	100 %	0 %	0 %	134047161
102	NC_009140	A	6	6	133435	133440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009140	A	6	6	133477	133482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009140	T	6	6	136169	136174	0 %	100 %	0 %	0 %	134047265
105	NC_009140	A	7	7	139016	139022	100 %	0 %	0 %	0 %	134047184
106	NC_009140	A	6	6	139060	139065	100 %	0 %	0 %	0 %	134047184
107	NC_009140	T	6	6	147381	147386	0 %	100 %	0 %	0 %	134047226
108	NC_009140	A	7	7	147831	147837	100 %	0 %	0 %	0 %	134047227
109	NC_009140	A	6	6	148119	148124	100 %	0 %	0 %	0 %	134047227
110	NC_009140	A	6	6	148451	148456	100 %	0 %	0 %	0 %	134047142
111	NC_009140	T	7	7	149808	149814	0 %	100 %	0 %	0 %	134047138
112	NC_009140	A	7	7	149865	149871	100 %	0 %	0 %	0 %	134047138
113	NC_009140	T	7	7	149932	149938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009140	T	6	6	150004	150009	0 %	100 %	0 %	0 %	134047217
115	NC_009140	G	6	6	150445	150450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009140	T	6	6	150671	150676	0 %	100 %	0 %	0 %	134047115
117	NC_009140	A	6	6	151003	151008	100 %	0 %	0 %	0 %	134047115
118	NC_009140	A	6	6	155409	155414	100 %	0 %	0 %	0 %	134047119
119	NC_009140	T	6	6	156670	156675	0 %	100 %	0 %	0 %	134047214
120	NC_009140	T	6	6	157309	157314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009140	A	6	6	158119	158124	100 %	0 %	0 %	0 %	134047147
122	NC_009140	A	6	6	162790	162795	100 %	0 %	0 %	0 %	134047219
123	NC_009140	A	6	6	163085	163090	100 %	0 %	0 %	0 %	134047219
124	NC_009140	A	6	6	165361	165366	100 %	0 %	0 %	0 %	134047253
125	NC_009140	A	6	6	165511	165516	100 %	0 %	0 %	0 %	134047253
126	NC_009140	A	6	6	170624	170629	100 %	0 %	0 %	0 %	134047246
127	NC_009140	T	7	7	171543	171549	0 %	100 %	0 %	0 %	134047240
128	NC_009140	A	6	6	171878	171883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009140	T	6	6	171906	171911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009140	T	6	6	172409	172414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009140	G	6	6	173358	173363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009140	A	6	6	173932	173937	100 %	0 %	0 %	0 %	134047245
133	NC_009140	T	7	7	174578	174584	0 %	100 %	0 %	0 %	134047120

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.