MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009140	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	134047218
2	NC_009140	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	134047218
3	NC_009140	T	7	7	3271	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	134047132
4	NC_009140	A	6	6	3280	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	134047132
5	NC_009140	A	7	7	3691	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	134047132
6	NC_009140	T	8	8	3898	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	134047153
7	NC_009140	A	6	6	8324	8329	100 %	0 %	0 %	0 %	134047268
8	NC_009140	A	6	6	13227	13232	100 %	0 %	0 %	0 %	134047244
9	NC_009140	A	6	6	16463	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	134047091
10	NC_009140	A	6	6	16667	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	134047168
11	NC_009140	T	8	8	21378	21385	0 %	100 %	0 %	0 %	134047139
12	NC_009140	G	6	6	28066	28071	0 %	0 %	100 %	0 %	134047112
13	NC_009140	A	8	8	31495	31502	100 %	0 %	0 %	0 %	134047125
14	NC_009140	A	6	6	31855	31860	100 %	0 %	0 %	0 %	134047177
15	NC_009140	T	7	7	35525	35531	0 %	100 %	0 %	0 %	134047269
16	NC_009140	T	6	6	37634	37639	0 %	100 %	0 %	0 %	134047148
17	NC_009140	T	6	6	38754	38759	0 %	100 %	0 %	0 %	134047088
18	NC_009140	T	6	6	41498	41503	0 %	100 %	0 %	0 %	134047238
19	NC_009140	A	6	6	41758	41763	100 %	0 %	0 %	0 %	134047238
20	NC_009140	A	6	6	42374	42379	100 %	0 %	0 %	0 %	134047270
21	NC_009140	A	6	6	43449	43454	100 %	0 %	0 %	0 %	134047127
22	NC_009140	G	6	6	44569	44574	0 %	0 %	100 %	0 %	134047127
23	NC_009140	G	6	6	48700	48705	0 %	0 %	100 %	0 %	134047158
24	NC_009140	A	6	6	48787	48792	100 %	0 %	0 %	0 %	134047158
25	NC_009140	A	7	7	49433	49439	100 %	0 %	0 %	0 %	134047236
26	NC_009140	G	7	7	54909	54915	0 %	0 %	100 %	0 %	134047157
27	NC_009140	T	6	6	57090	57095	0 %	100 %	0 %	0 %	134047150
28	NC_009140	T	6	6	61032	61037	0 %	100 %	0 %	0 %	134047123
29	NC_009140	T	6	6	64218	64223	0 %	100 %	0 %	0 %	134047225
30	NC_009140	C	6	6	65262	65267	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
31	NC_009140	C	7	7	66058	66064	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
32	NC_009140	A	6	6	68398	68403	100 %	0 %	0 %	0 %	134047101
33	NC_009140	T	7	7	68905	68911	0 %	100 %	0 %	0 %	134047199
34	NC_009140	T	6	6	69951	69956	0 %	100 %	0 %	0 %	134047199
35	NC_009140	A	6	6	71126	71131	100 %	0 %	0 %	0 %	134047113
36	NC_009140	A	6	6	71430	71435	100 %	0 %	0 %	0 %	134047113
37	NC_009140	A	6	6	72373	72378	100 %	0 %	0 %	0 %	134047254
38	NC_009140	A	7	7	73418	73424	100 %	0 %	0 %	0 %	134047254
39	NC_009140	T	6	6	73926	73931	0 %	100 %	0 %	0 %	134047098
40	NC_009140	G	7	7	76265	76271	0 %	0 %	100 %	0 %	134047272
41	NC_009140	G	6	6	77062	77067	0 %	0 %	100 %	0 %	134047272
42	NC_009140	A	6	6	78106	78111	100 %	0 %	0 %	0 %	134047272
43	NC_009140	A	6	6	81292	81297	100 %	0 %	0 %	0 %	134047146
44	NC_009140	T	7	7	82376	82382	0 %	100 %	0 %	0 %	134047203
45	NC_009140	T	6	6	82934	82939	0 %	100 %	0 %	0 %	134047203
46	NC_009140	A	6	6	85257	85262	100 %	0 %	0 %	0 %	134047266
47	NC_009140	A	6	6	86726	86731	100 %	0 %	0 %	0 %	134047249
48	NC_009140	T	7	7	87267	87273	0 %	100 %	0 %	0 %	134047249
49	NC_009140	G	6	6	88079	88084	0 %	0 %	100 %	0 %	134047133
50	NC_009140	A	6	6	90246	90251	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
51	NC_009140	A	7	7	90636	90642	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
52	NC_009140	G	6	6	94945	94950	0 %	0 %	100 %	0 %	134047175
53	NC_009140	T	7	7	95503	95509	0 %	100 %	0 %	0 %	134047175
54	NC_009140	A	6	6	99827	99832	100 %	0 %	0 %	0 %	134047208
55	NC_009140	T	6	6	101228	101233	0 %	100 %	0 %	0 %	134047208
56	NC_009140	T	6	6	101753	101758	0 %	100 %	0 %	0 %	134047183
57	NC_009140	A	6	6	102550	102555	100 %	0 %	0 %	0 %	134047195
58	NC_009140	G	6	6	106492	106497	0 %	0 %	100 %	0 %	134047102
59	NC_009140	G	6	6	108100	108105	0 %	0 %	100 %	0 %	134047248
60	NC_009140	A	6	6	108965	108970	100 %	0 %	0 %	0 %	134047248
61	NC_009140	T	6	6	109291	109296	0 %	100 %	0 %	0 %	134047130
62	NC_009140	T	6	6	110495	110500	0 %	100 %	0 %	0 %	134047097
63	NC_009140	A	7	7	110693	110699	100 %	0 %	0 %	0 %	134047097
64	NC_009140	A	6	6	117973	117978	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
65	NC_009140	A	6	6	118661	118666	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
66	NC_009140	A	6	6	118813	118818	100 %	0 %	0 %	0 %	134047267
67	NC_009140	T	6	6	120933	120938	0 %	100 %	0 %	0 %	134047231
68	NC_009140	T	7	7	125974	125980	0 %	100 %	0 %	0 %	134047161
69	NC_009140	T	6	6	136169	136174	0 %	100 %	0 %	0 %	134047265
70	NC_009140	A	7	7	139016	139022	100 %	0 %	0 %	0 %	134047184
71	NC_009140	A	6	6	139060	139065	100 %	0 %	0 %	0 %	134047184
72	NC_009140	T	6	6	147381	147386	0 %	100 %	0 %	0 %	134047226
73	NC_009140	A	7	7	147831	147837	100 %	0 %	0 %	0 %	134047227
74	NC_009140	A	6	6	148119	148124	100 %	0 %	0 %	0 %	134047227
75	NC_009140	A	6	6	148451	148456	100 %	0 %	0 %	0 %	134047142
76	NC_009140	T	7	7	149808	149814	0 %	100 %	0 %	0 %	134047138
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78	NC_009140	T	6	6	150004	150009	0 %	100 %	0 %	0 %	134047217
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80	NC_009140	A	6	6	151003	151008	100 %	0 %	0 %	0 %	134047115
81	NC_009140	A	6	6	155409	155414	100 %	0 %	0 %	0 %	134047119
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83	NC_009140	A	6	6	158119	158124	100 %	0 %	0 %	0 %	134047147
84	NC_009140	A	6	6	162790	162795	100 %	0 %	0 %	0 %	134047219
85	NC_009140	A	6	6	163085	163090	100 %	0 %	0 %	0 %	134047219
86	NC_009140	A	6	6	165361	165366	100 %	0 %	0 %	0 %	134047253
87	NC_009140	A	6	6	165511	165516	100 %	0 %	0 %	0 %	134047253
88	NC_009140	A	6	6	170624	170629	100 %	0 %	0 %	0 %	134047246
89	NC_009140	T	7	7	171543	171549	0 %	100 %	0 %	0 %	134047240
90	NC_009140	A	6	6	173932	173937	100 %	0 %	0 %	0 %	134047245
91	NC_009140	T	7	7	174578	174584	0 %	100 %	0 %	0 %	134047120

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.