MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	AAAGTA	2	12	3190	3201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009138	TCGACA	2	12	29662	29673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009138	AATATG	2	12	66845	66856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009138	CGGTAA	2	12	76626	76637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009138	TTTGTA	2	12	118732	118743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009138	GTGCGG	2	12	153377	153388	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009138	GCTGCC	2	12	163377	163388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009138	CTCATG	2	12	203037	203048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009138	TGCCTG	2	12	208212	208223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009138	TGCCGC	2	12	231958	231969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009138	GTTTTT	2	12	281723	281734	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009138	GAACTA	2	12	306175	306186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009138	TTTCTG	2	12	313308	313319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009138	TCATTA	2	12	359307	359318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009138	AGTATT	2	12	363143	363154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009138	GCTGGA	2	12	410513	410524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009138	CAAAAT	2	12	410907	410918	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009138	CGTTGT	2	12	442626	442637	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009138	ATGTTT	2	12	442748	442759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009138	GAAGGC	2	12	466123	466134	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009138	GAACAA	2	12	467242	467253	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009138	TACGGC	2	12	500406	500417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009138	ATGACG	2	12	547827	547838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009138	GCCGAT	2	12	566096	566107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009138	CTCATG	2	12	575272	575283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009138	TACGCA	2	12	608477	608488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009138	CAGAAT	2	12	611081	611092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009138	ACTTCC	2	12	621521	621532	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009138	GGCAAG	2	12	648909	648920	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009138	GGCAGG	2	12	690774	690785	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009138	ATATTG	2	12	738645	738656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009138	GTACTG	2	12	793465	793476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009138	CATCTA	2	12	840337	840348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009138	TTTTTG	2	12	843358	843369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009138	TTTTAC	2	12	870747	870758	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009138	TTTTTA	2	12	898009	898020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009138	CATGTC	2	12	963436	963447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009138	ATTGAA	2	12	1010075	1010086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009138	TGAAAA	2	12	1043660	1043671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009138	GTAGCA	2	12	1045476	1045487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009138	CCGGTG	2	12	1059468	1059479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009138	CATCAG	2	12	1117550	1117561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009138	GATGCA	2	12	1120197	1120208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009138	CTAGCG	2	12	1181521	1181532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009138	AATCTG	2	12	1194304	1194315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009138	ATAGCC	2	12	1221169	1221180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009138	TTGCGC	2	12	1237625	1237636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009138	TTTTCA	2	12	1240525	1240536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009138	CTCTTT	2	12	1266122	1266133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009138	TTTTCT	2	12	1292456	1292467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009138	AATCGA	2	12	1352373	1352384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009138	GCAAGG	2	12	1356026	1356037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009138	GAAATT	2	12	1367074	1367085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009138	GCGTTT	2	12	1383456	1383467	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009138	GTTTTG	2	12	1459549	1459560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009138	GAGCTT	2	12	1501207	1501218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009138	TTTTTG	2	12	1523908	1523919	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009138	GAGAAA	2	12	1525104	1525115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009138	ATTTAC	2	12	1535670	1535681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009138	CTGCCA	2	12	1599578	1599589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009138	TACTTA	2	12	1603876	1603887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009138	GTGAAT	2	12	1642366	1642377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009138	TCTATC	2	12	1655052	1655063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009138	GAAAAA	2	12	1713046	1713057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009138	GTTGCG	3	18	1745479	1745496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009138	TTCAAC	2	12	1765901	1765912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009138	ATCAGC	2	12	1804051	1804062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009138	TGAAAA	2	12	1806706	1806717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009138	TTGTTT	2	12	1840106	1840117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009138	GTTTTT	2	12	1841608	1841619	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009138	ATATCG	2	12	1862841	1862852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009138	AATACT	2	12	1863494	1863505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009138	AATAGG	2	12	1879827	1879838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009138	TGGAAG	2	12	1892690	1892701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009138	CGTCAC	2	12	1991272	1991283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009138	CGGTGC	2	12	1993466	1993477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009138	CTATGG	2	12	2005557	2005568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009138	TCGATA	2	12	2235796	2235807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009138	GAACGA	2	12	2239504	2239515	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009138	TGCTTC	2	12	2281403	2281414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009138	CTGTTT	2	12	2314203	2314214	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009138	CATGCG	2	12	2349480	2349491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009138	TAAAAA	2	12	2477237	2477248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009138	TTTTCC	2	12	2500988	2500999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009138	AATGGA	2	12	2508237	2508248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009138	AAAAAC	2	12	2518186	2518197	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009138	TTGCCA	2	12	2522215	2522226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009138	GTGCCG	2	12	2563298	2563309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009138	TAATGA	2	12	2596129	2596140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009138	CTGATT	2	12	2639960	2639971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009138	TATGGT	2	12	2658919	2658930	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009138	ATCGAG	2	12	2718272	2718283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009138	ACGGCG	2	12	2728296	2728307	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009138	AAAATT	2	12	2779190	2779201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009138	CGGTCG	2	12	2789949	2789960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009138	TTCCTG	2	12	2876137	2876148	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009138	TACAAC	2	12	2921322	2921333	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009138	ATTCGG	2	12	2940123	2940134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009138	ACAGCG	2	12	2988107	2988118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009138	CCTGCC	2	12	3031255	3031266	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009138	CAACCA	2	12	3063378	3063389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009138	ACGCGA	2	12	3150784	3150795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009138	TCCGCC	2	12	3209921	3209932	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_009138	CAGGCG	2	12	3264816	3264827	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009138	AAAGTT	2	12	3363175	3363186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009138	TAATAG	2	12	3375642	3375653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009138	TTGCAG	2	12	3411679	3411690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.