MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 2576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	GCCTG	2	10	145	154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009138	AGCGC	2	10	3770	3779	20 %	0 %	40 %	40 %	134093298
3	NC_009138	ATTGA	2	10	5920	5929	40 %	40 %	20 %	0 %	134093298
4	NC_009138	AATGG	2	10	6636	6645	40 %	20 %	40 %	0 %	134093299
5	NC_009138	TTCGC	2	10	8172	8181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009138	GCTTT	2	10	9913	9922	0 %	60 %	20 %	20 %	134093302
7	NC_009138	GTACG	2	10	10637	10646	20 %	20 %	40 %	20 %	134093304
8	NC_009138	GATGG	2	10	10674	10683	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009138	CTGCG	2	10	13556	13565	0 %	20 %	40 %	40 %	134093308
10	NC_009138	GCATT	2	10	15838	15847	20 %	40 %	20 %	20 %	134093309
11	NC_009138	GACCG	2	10	20642	20651	20 %	0 %	40 %	40 %	134093314
12	NC_009138	CCAGC	2	10	21791	21800	20 %	0 %	20 %	60 %	134093314
13	NC_009138	AGTGA	2	10	25721	25730	40 %	20 %	40 %	0 %	134093318
14	NC_009138	TGGGT	2	10	26411	26420	0 %	40 %	60 %	0 %	134093319
15	NC_009138	TTTGC	2	10	26438	26447	0 %	60 %	20 %	20 %	134093319
16	NC_009138	TTCAA	2	10	28040	28049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009138	GCGCG	2	10	29459	29468	0 %	0 %	60 %	40 %	134093323
18	NC_009138	CGCAA	2	10	29490	29499	40 %	0 %	20 %	40 %	134093323
19	NC_009138	GAAAT	2	10	30629	30638	60 %	20 %	20 %	0 %	134093325
20	NC_009138	ACCTG	2	10	30937	30946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009138	GATGG	2	10	31414	31423	20 %	20 %	60 %	0 %	134093326
22	NC_009138	CGAAT	2	10	36231	36240	40 %	20 %	20 %	20 %	134093331
23	NC_009138	TACCG	2	10	36900	36909	20 %	20 %	20 %	40 %	134093331
24	NC_009138	TCGCG	2	10	37934	37943	0 %	20 %	40 %	40 %	134093332
25	NC_009138	CGATA	2	10	37952	37961	40 %	20 %	20 %	20 %	134093332
26	NC_009138	TGCCA	2	10	44481	44490	20 %	20 %	20 %	40 %	134093338
27	NC_009138	CAGAA	2	10	45573	45582	60 %	0 %	20 %	20 %	134093338
28	NC_009138	CCAGC	2	10	45932	45941	20 %	0 %	20 %	60 %	134093338
29	NC_009138	TGCAG	2	10	46326	46335	20 %	20 %	40 %	20 %	134093338
30	NC_009138	GCCAG	2	10	46399	46408	20 %	0 %	40 %	40 %	134093338
31	NC_009138	CAGTC	2	10	46432	46441	20 %	20 %	20 %	40 %	134093338
32	NC_009138	GTGCA	2	10	46724	46733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009138	TCGAT	2	10	46921	46930	20 %	40 %	20 %	20 %	134093339
34	NC_009138	ATGGA	2	10	46947	46956	40 %	20 %	40 %	0 %	134093339
35	NC_009138	TGAAA	2	10	49621	49630	60 %	20 %	20 %	0 %	134093340
36	NC_009138	TCGGA	2	10	50823	50832	20 %	20 %	40 %	20 %	134093342
37	NC_009138	TTGCC	2	10	51443	51452	0 %	40 %	20 %	40 %	134093344
38	NC_009138	TGCTC	2	10	52769	52778	0 %	40 %	20 %	40 %	134093345
39	NC_009138	AATTT	2	10	53138	53147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009138	TGCAA	2	10	54819	54828	40 %	20 %	20 %	20 %	134093347
41	NC_009138	GTACA	2	10	57603	57612	40 %	20 %	20 %	20 %	134093348
42	NC_009138	AAGTG	2	10	58593	58602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009138	AGGGA	2	10	58997	59006	40 %	0 %	60 %	0 %	134093351
44	NC_009138	CTTGC	2	10	62910	62919	0 %	40 %	20 %	40 %	134093358
45	NC_009138	GCAAC	2	10	64973	64982	40 %	0 %	20 %	40 %	134093360
46	NC_009138	TCCCA	2	10	65231	65240	20 %	20 %	0 %	60 %	134093360
47	NC_009138	GCCGC	2	10	67518	67527	0 %	0 %	40 %	60 %	134093363
48	NC_009138	GTTCG	2	10	67670	67679	0 %	40 %	40 %	20 %	134093363
49	NC_009138	GTTCA	2	10	67967	67976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009138	GGTTT	2	10	68314	68323	0 %	60 %	40 %	0 %	134093365
51	NC_009138	TTCGC	2	10	69460	69469	0 %	40 %	20 %	40 %	134093365
52	NC_009138	TGCGT	2	10	70742	70751	0 %	40 %	40 %	20 %	134093367
53	NC_009138	CGTCA	2	10	71214	71223	20 %	20 %	20 %	40 %	134093368
54	NC_009138	TCGGT	2	10	78207	78216	0 %	40 %	40 %	20 %	134093373
55	NC_009138	TTTCC	2	10	82864	82873	0 %	60 %	0 %	40 %	134093378
56	NC_009138	TTGCC	2	10	83323	83332	0 %	40 %	20 %	40 %	134093379
57	NC_009138	GATGC	2	10	83838	83847	20 %	20 %	40 %	20 %	134093379
58	NC_009138	ATGGC	2	10	85827	85836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009138	CTGCG	2	10	86340	86349	0 %	20 %	40 %	40 %	134093381
60	NC_009138	TGATC	2	10	87299	87308	20 %	40 %	20 %	20 %	134093383
61	NC_009138	GCGAT	2	10	87514	87523	20 %	20 %	40 %	20 %	134093383
62	NC_009138	ATCGA	2	10	87777	87786	40 %	20 %	20 %	20 %	134093383
63	NC_009138	TGATT	2	10	88274	88283	20 %	60 %	20 %	0 %	134093383
64	NC_009138	CGCGC	2	10	89940	89949	0 %	0 %	40 %	60 %	134093385
65	NC_009138	GAGCG	2	10	90220	90229	20 %	0 %	60 %	20 %	134093386
66	NC_009138	GATTC	2	10	92659	92668	20 %	40 %	20 %	20 %	134093388
67	NC_009138	GGCAA	2	10	93516	93525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009138	CAAAA	2	10	93540	93549	80 %	0 %	0 %	20 %	134093389
69	NC_009138	CGTGC	2	10	95002	95011	0 %	20 %	40 %	40 %	134093390
70	NC_009138	ACATG	2	10	95462	95471	40 %	20 %	20 %	20 %	134093391
71	NC_009138	CCAGC	2	10	98637	98646	20 %	0 %	20 %	60 %	134093394
72	NC_009138	CCAAA	2	10	100246	100255	60 %	0 %	0 %	40 %	134093394
73	NC_009138	ATGCC	2	10	101734	101743	20 %	20 %	20 %	40 %	134093396
74	NC_009138	GTCAT	2	10	101933	101942	20 %	40 %	20 %	20 %	134093396
75	NC_009138	GGTGC	2	10	102110	102119	0 %	20 %	60 %	20 %	134093396
76	NC_009138	GAATT	2	10	103724	103733	40 %	40 %	20 %	0 %	134093399
77	NC_009138	ATGGC	2	10	104834	104843	20 %	20 %	40 %	20 %	134093400
78	NC_009138	AGTGA	2	10	106305	106314	40 %	20 %	40 %	0 %	134093401
79	NC_009138	CCAGC	2	10	107019	107028	20 %	0 %	20 %	60 %	134093403
80	NC_009138	TTTTC	2	10	107239	107248	0 %	80 %	0 %	20 %	134093403
81	NC_009138	CATCG	2	10	107363	107372	20 %	20 %	20 %	40 %	134093403
82	NC_009138	TGGCC	2	10	114000	114009	0 %	20 %	40 %	40 %	134093408
83	NC_009138	AGCGC	2	10	115426	115435	20 %	0 %	40 %	40 %	134093409
84	NC_009138	GGCGC	2	10	117318	117327	0 %	0 %	60 %	40 %	134093412
85	NC_009138	CGGCA	2	10	117446	117455	20 %	0 %	40 %	40 %	134093412
86	NC_009138	ATGAA	2	10	119111	119120	60 %	20 %	20 %	0 %	134093414
87	NC_009138	ATTCG	2	10	119501	119510	20 %	40 %	20 %	20 %	134093414
88	NC_009138	TGCAA	2	10	121145	121154	40 %	20 %	20 %	20 %	134093414
89	NC_009138	ATTGC	2	10	121846	121855	20 %	40 %	20 %	20 %	134093414
90	NC_009138	GCGAT	2	10	123226	123235	20 %	20 %	40 %	20 %	134093415
91	NC_009138	AATGT	2	10	123767	123776	40 %	40 %	20 %	0 %	134093416
92	NC_009138	TGCTG	2	10	124024	124033	0 %	40 %	40 %	20 %	134093416
93	NC_009138	ATGGA	2	10	124167	124176	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009138	AGCGC	2	10	124461	124470	20 %	0 %	40 %	40 %	134093417
95	NC_009138	GCGTC	2	10	126216	126225	0 %	20 %	40 %	40 %	134093420
96	NC_009138	CGCTG	2	10	126572	126581	0 %	20 %	40 %	40 %	134093420
97	NC_009138	CGGTT	2	10	129866	129875	0 %	40 %	40 %	20 %	134093422
98	NC_009138	CACAT	2	10	130425	130434	40 %	20 %	0 %	40 %	134093423
99	NC_009138	TTGAA	2	10	132317	132326	40 %	40 %	20 %	0 %	134093425
100	NC_009138	CCGGG	2	10	133617	133626	0 %	0 %	60 %	40 %	134093428
101	NC_009138	CGCGG	2	10	136476	136485	0 %	0 %	60 %	40 %	134093432
102	NC_009138	ATGAG	2	10	136682	136691	40 %	20 %	40 %	0 %	134093433
103	NC_009138	GGCCT	2	10	137551	137560	0 %	20 %	40 %	40 %	134093433
104	NC_009138	AAGGC	2	10	137627	137636	40 %	0 %	40 %	20 %	134093433
105	NC_009138	GGCTG	2	10	138894	138903	0 %	20 %	60 %	20 %	134093434
106	NC_009138	TGGTG	2	10	139508	139517	0 %	40 %	60 %	0 %	134093434
107	NC_009138	GCCAT	2	10	139815	139824	20 %	20 %	20 %	40 %	134093435
108	NC_009138	CGCTG	2	10	142879	142888	0 %	20 %	40 %	40 %	134093438
109	NC_009138	CCATC	2	10	143684	143693	20 %	20 %	0 %	60 %	134093439
110	NC_009138	TGGTG	2	10	145542	145551	0 %	40 %	60 %	0 %	134093441
111	NC_009138	TTTCC	2	10	146416	146425	0 %	60 %	0 %	40 %	134093442
112	NC_009138	ATGCC	2	10	147676	147685	20 %	20 %	20 %	40 %	134093443
113	NC_009138	GCCGC	2	10	150164	150173	0 %	0 %	40 %	60 %	134093446
114	NC_009138	TGGCG	2	10	150246	150255	0 %	20 %	60 %	20 %	134093446
115	NC_009138	ATTTT	2	10	152027	152036	20 %	80 %	0 %	0 %	134093447
116	NC_009138	GAAGC	2	10	152424	152433	40 %	0 %	40 %	20 %	134093448
117	NC_009138	GCGCC	2	10	154405	154414	0 %	0 %	40 %	60 %	134093449
118	NC_009138	TGAAA	2	10	157282	157291	60 %	20 %	20 %	0 %	134093452
119	NC_009138	GGCTT	2	10	159024	159033	0 %	40 %	40 %	20 %	134093454
120	NC_009138	CTGAT	2	10	159786	159795	20 %	40 %	20 %	20 %	134093454
121	NC_009138	CTGCG	2	10	159898	159907	0 %	20 %	40 %	40 %	134093454
122	NC_009138	GCGCC	2	10	159967	159976	0 %	0 %	40 %	60 %	134093454
123	NC_009138	TTTTG	2	10	160105	160114	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009138	CACGC	2	10	160378	160387	20 %	0 %	20 %	60 %	134093455
125	NC_009138	ATTTA	2	10	161872	161881	40 %	60 %	0 %	0 %	134093456
126	NC_009138	GGCCG	2	10	161979	161988	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009138	GCATG	2	10	166102	166111	20 %	20 %	40 %	20 %	134093460
128	NC_009138	TGGTG	2	10	166417	166426	0 %	40 %	60 %	0 %	134093460
129	NC_009138	TGCGG	2	10	169526	169535	0 %	20 %	60 %	20 %	134093463
130	NC_009138	GGCAA	2	10	170775	170784	40 %	0 %	40 %	20 %	134093464
131	NC_009138	CGCTG	2	10	170921	170930	0 %	20 %	40 %	40 %	134093464
132	NC_009138	GTACG	2	10	172396	172405	20 %	20 %	40 %	20 %	134093466
133	NC_009138	AAGAC	2	10	172652	172661	60 %	0 %	20 %	20 %	134093467
134	NC_009138	ATTCA	2	10	174698	174707	40 %	40 %	0 %	20 %	134093469
135	NC_009138	CCTGA	2	10	175893	175902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_009138	CGATT	2	10	207865	207874	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_009138	GAAGA	2	10	345156	345165	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009138	CAAGA	2	10	348054	348063	60 %	0 %	20 %	20 %	134093632
253	NC_009138	TGCAT	2	10	348377	348386	20 %	40 %	20 %	20 %	134093632
254	NC_009138	TGAAA	2	10	350498	350507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009138	TGCAG	2	10	352152	352161	20 %	20 %	40 %	20 %	134093635
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263	NC_009138	CTGCG	2	10	358992	359001	0 %	20 %	40 %	40 %	134093638
264	NC_009138	CGGTG	2	10	361292	361301	0 %	20 %	60 %	20 %	134093641
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268	NC_009138	TCCGA	2	10	366490	366499	20 %	20 %	20 %	40 %	134093644
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372	NC_009138	CATGC	2	10	528246	528255	20 %	20 %	20 %	40 %	134093787
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374	NC_009138	TCAAT	2	10	530900	530909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
375	NC_009138	GCCCA	2	10	533431	533440	20 %	0 %	20 %	60 %	134093793
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382	NC_009138	TCGTT	2	10	545178	545187	0 %	60 %	20 %	20 %	134093801
383	NC_009138	TTGTC	2	10	546823	546832	0 %	60 %	20 %	20 %	134093804
384	NC_009138	GAAGA	2	10	548455	548464	60 %	0 %	40 %	0 %	134093805
385	NC_009138	GCGAG	2	10	552370	552379	20 %	0 %	60 %	20 %	134093809
386	NC_009138	CGTTG	2	10	553907	553916	0 %	40 %	40 %	20 %	134093810
387	NC_009138	TGCGC	2	10	555933	555942	0 %	20 %	40 %	40 %	134093813
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389	NC_009138	CTTCA	2	10	556125	556134	20 %	40 %	0 %	40 %	134093813
390	NC_009138	GGCCA	2	10	557436	557445	20 %	0 %	40 %	40 %	134093815
391	NC_009138	TGAGG	2	10	557849	557858	20 %	20 %	60 %	0 %	134093815
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393	NC_009138	GCGCG	2	10	560651	560660	0 %	0 %	60 %	40 %	134093818
394	NC_009138	GAATG	2	10	560891	560900	40 %	20 %	40 %	0 %	134093818
395	NC_009138	GTTTC	2	10	563731	563740	0 %	60 %	20 %	20 %	134093820
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398	NC_009138	GCGTG	2	10	567494	567503	0 %	20 %	60 %	20 %	134093824
399	NC_009138	GGATG	2	10	568176	568185	20 %	20 %	60 %	0 %	134093825
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500	NC_009138	GGGAT	2	10	706362	706371	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

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