MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	TGCC	2	8	113	120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009138	TAAG	2	8	1738	1745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009138	AGTT	2	8	5970	5977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009138	TTCA	2	8	7177	7184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009138	CATC	2	8	10778	10785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009138	CATT	2	8	12121	12128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009138	CATT	2	8	14747	14754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009138	TGAG	2	8	14907	14914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009138	CTAT	2	8	18132	18139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009138	CTTT	2	8	26002	26009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009138	TAAA	2	8	26018	26025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009138	GCTC	2	8	26765	26772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009138	CGGC	2	8	27927	27934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009138	TTTC	2	8	28028	28035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009138	GGAA	2	8	28871	28878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009138	CGCA	2	8	29572	29579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009138	GCAG	2	8	30291	30298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009138	CATT	2	8	31012	31019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009138	TTAA	2	8	33698	33705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009138	CTTC	2	8	37168	37175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009138	CAAG	2	8	41031	41038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009138	TGTT	2	8	43308	43315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009138	GCCA	2	8	44377	44384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009138	GGGA	2	8	46807	46814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009138	GTGC	2	8	48692	48699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009138	GGAA	2	8	52395	52402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009138	TGGC	2	8	52898	52905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009138	AATG	2	8	53049	53056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009138	TTGA	2	8	54091	54098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009138	TCAA	2	8	54315	54322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009138	GCCT	2	8	54339	54346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009138	AGCG	2	8	58073	58080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009138	TCCA	2	8	59192	59199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009138	TCAG	2	8	61896	61903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009138	GCTG	2	8	65667	65674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009138	GGAT	2	8	65727	65734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009138	GGCA	2	8	66897	66904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009138	TTGC	2	8	66948	66955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009138	TGAG	2	8	70054	70061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009138	ACCG	2	8	74786	74793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009138	GCAT	2	8	74885	74892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009138	GACA	2	8	78527	78534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009138	TTGC	2	8	91119	91126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009138	GGTC	2	8	107730	107737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009138	GCAG	2	8	110443	110450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009138	CAGC	2	8	110973	110980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009138	GGAA	2	8	111284	111291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009138	GTTC	2	8	114410	114417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009138	CTGC	2	8	115480	115487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009138	CTGT	2	8	124623	124630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009138	CCTC	2	8	125801	125808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009138	AGGA	2	8	130321	130328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009138	ATGC	2	8	130828	130835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009138	TCAT	2	8	131569	131576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009138	GCTT	2	8	132806	132813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009138	TGCA	2	8	138196	138203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009138	GGCA	2	8	139692	139699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009138	GACT	2	8	141534	141541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009138	CTGC	2	8	148020	148027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009138	ACTA	2	8	155521	155528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009138	CAAT	2	8	157914	157921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009138	GCAG	3	12	166961	166972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009138	GTCT	2	8	167065	167072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009138	TGCC	2	8	168097	168104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009138	AGCA	2	8	168152	168159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009138	GGTT	2	8	170103	170110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009138	CCTT	2	8	171431	171438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009138	ACGC	2	8	173872	173879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009138	ATAG	3	12	201485	201496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009138	TGCT	2	8	202361	202368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009138	GCTT	2	8	202684	202691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009138	TGAG	2	8	202772	202779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009138	GTGA	2	8	203226	203233	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009138	TACC	2	8	203803	203810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009138	TACA	2	8	204060	204067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009138	GTAG	2	8	204252	204259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009138	TGGT	3	12	204452	204463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009138	TAGA	2	8	204704	204711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009138	CTTG	2	8	204891	204898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009138	GCGA	2	8	205192	205199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009138	AAAC	2	8	205731	205738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009138	AAAG	2	8	206025	206032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009138	ACGA	2	8	206460	206467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009138	TTGA	2	8	206803	206810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009138	GTTT	2	8	207103	207110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009138	AAAG	2	8	208481	208488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009138	GAAT	2	8	208521	208528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009138	TTTC	2	8	208529	208536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009138	AAAT	2	8	208629	208636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009138	ACAG	2	8	217988	217995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009138	TTTG	2	8	222213	222220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009138	AATT	2	8	222247	222254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009138	ATTA	2	8	222304	222311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009138	GGCA	2	8	230587	230594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009138	ATCA	2	8	230669	230676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009138	TAAT	2	8	231283	231290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009138	GCCA	2	8	231840	231847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009138	CTGC	2	8	233322	233329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009138	GCGT	2	8	233475	233482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009138	CGAA	2	8	241330	241337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009138	AGAT	2	8	247587	247594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009138	ATTT	2	8	252199	252206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009138	TGCG	2	8	262628	262635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009138	TGCA	2	8	262652	262659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009138	TCTG	2	8	263155	263162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009138	CCAT	2	8	263170	263177	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009138	AATT	2	8	267163	267170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009138	TGAT	2	8	269819	269826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009138	CGCA	2	8	269893	269900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009138	AATT	2	8	271037	271044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009138	AAAG	2	8	275419	275426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009138	AAAG	2	8	275432	275439	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009138	CATT	2	8	280399	280406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009138	CAGC	2	8	281715	281722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009138	TCAT	2	8	286807	286814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009138	TTTG	2	8	288839	288846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009138	CTGC	2	8	290571	290578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009138	CATG	2	8	293733	293740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009138	GAAT	2	8	293866	293873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009138	TTAT	2	8	300408	300415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009138	ATGC	2	8	302723	302730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009138	AGAC	2	8	302774	302781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009138	AAAT	2	8	306195	306202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009138	ATAA	2	8	308463	308470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009138	GCTG	2	8	310498	310505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009138	GAAA	2	8	310654	310661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009138	CTTT	2	8	312835	312842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009138	GGTT	2	8	313243	313250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009138	TGGC	2	8	313283	313290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009138	AAAT	2	8	313629	313636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009138	GATG	2	8	313767	313774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009138	GTCC	2	8	315531	315538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009138	TGGT	2	8	317595	317602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009138	GTTA	2	8	318068	318075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009138	AAAC	2	8	318173	318180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009138	TTAA	2	8	322236	322243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009138	ATGA	2	8	328832	328839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009138	TCAT	2	8	328859	328866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009138	CTCA	2	8	334911	334918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009138	ATTG	2	8	335005	335012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009138	TTAT	2	8	339435	339442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009138	ATAG	2	8	339559	339566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009138	GCTA	2	8	341623	341630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009138	TTTC	2	8	343363	343370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009138	GATA	2	8	345017	345024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009138	TGCT	2	8	348557	348564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009138	ATTT	2	8	348631	348638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009138	ATGC	2	8	348833	348840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009138	CGGG	2	8	349081	349088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009138	GGCT	2	8	356797	356804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009138	TGCT	2	8	359164	359171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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