MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 43960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	CGC	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
2	NC_009138	CGC	2	6	363	368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
3	NC_009138	GCC	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
4	NC_009138	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
5	NC_009138	CGA	2	6	571	576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
6	NC_009138	CGC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
7	NC_009138	GCG	2	6	710	715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
8	NC_009138	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093295
9	NC_009138	GGC	2	6	770	775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
10	NC_009138	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
11	NC_009138	TTA	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093295
12	NC_009138	TTG	2	6	947	952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134093295
13	NC_009138	GAC	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
14	NC_009138	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
15	NC_009138	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093295
16	NC_009138	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093295
17	NC_009138	ATC	3	9	1046	1054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093295
18	NC_009138	GCC	2	6	1141	1146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
19	NC_009138	CGA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
20	NC_009138	AAG	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093295
21	NC_009138	CGG	2	6	1543	1548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
22	NC_009138	GCC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
23	NC_009138	TGA	3	9	1658	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093295
24	NC_009138	GCT	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
25	NC_009138	CAC	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093296
26	NC_009138	CGA	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
27	NC_009138	TGC	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
28	NC_009138	GGC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093296
29	NC_009138	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
30	NC_009138	GCA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
31	NC_009138	CTG	3	9	2483	2491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
32	NC_009138	TCA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093296
33	NC_009138	CTG	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
34	NC_009138	GTG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093296
35	NC_009138	AAC	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
36	NC_009138	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
37	NC_009138	CAT	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093296
38	NC_009138	GCA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
39	NC_009138	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
40	NC_009138	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
41	NC_009138	CGG	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093296
42	NC_009138	CTG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
43	NC_009138	AAC	2	6	2996	3001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
44	NC_009138	ACA	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
45	NC_009138	CGT	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
46	NC_009138	CCG	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093297
47	NC_009138	AGC	2	6	3390	3395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093297
48	NC_009138	ACA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
49	NC_009138	CAG	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
50	NC_009138	GAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
51	NC_009138	GGC	2	6	3811	3816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
52	NC_009138	CGG	2	6	3846	3851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
53	NC_009138	TGA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
54	NC_009138	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
55	NC_009138	CAA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
56	NC_009138	GAA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093298
57	NC_009138	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
58	NC_009138	CAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
59	NC_009138	CGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
60	NC_009138	ACG	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
61	NC_009138	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
62	NC_009138	CGG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
63	NC_009138	TCA	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
64	NC_009138	CGA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
65	NC_009138	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
66	NC_009138	TCG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
67	NC_009138	ACG	2	6	4655	4660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
68	NC_009138	ATC	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
69	NC_009138	TCG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
70	NC_009138	CTC	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134093298
71	NC_009138	GGC	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
72	NC_009138	CAC	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
73	NC_009138	ACC	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
74	NC_009138	ATC	3	9	5035	5043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
75	NC_009138	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
76	NC_009138	GCT	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
77	NC_009138	CCG	2	6	5152	5157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
78	NC_009138	GAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
79	NC_009138	GAA	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093298
80	NC_009138	ATG	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
81	NC_009138	ACG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
82	NC_009138	CCG	2	6	5261	5266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
83	NC_009138	GCG	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
84	NC_009138	ACA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
85	NC_009138	CAT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
86	NC_009138	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093298
87	NC_009138	CAT	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
88	NC_009138	ACG	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
89	NC_009138	GCC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
90	NC_009138	CCA	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
91	NC_009138	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
92	NC_009138	AAC	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
93	NC_009138	CGA	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
94	NC_009138	CGT	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
95	NC_009138	CTG	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
96	NC_009138	TGG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093299
97	NC_009138	ATG	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093299
98	NC_009138	TAA	2	6	6308	6313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093299
99	NC_009138	TTA	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093299
100	NC_009138	ATC	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093299
101	NC_009138	GCT	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093300
102	NC_009138	CCA	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093300
103	NC_009138	AGA	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093300
104	NC_009138	CTT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093300
105	NC_009138	TCT	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093300
106	NC_009138	ATT	2	6	7753	7758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093300
107	NC_009138	ATC	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093300
108	NC_009138	CAT	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093300
109	NC_009138	TGA	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093301
110	NC_009138	CTA	2	6	8284	8289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093301
111	NC_009138	TAA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093301
112	NC_009138	ACG	2	6	8543	8548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093301
113	NC_009138	GAA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093301
114	NC_009138	TCC	2	6	8616	8621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134093301
115	NC_009138	GAT	2	6	8879	8884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093301
116	NC_009138	ATT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093301
117	NC_009138	CGC	2	6	9022	9027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093302
118	NC_009138	AAG	2	6	9111	9116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093302
119	NC_009138	CTT	2	6	9339	9344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093302
120	NC_009138	TCC	2	6	9360	9365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134093302
121	NC_009138	AAT	2	6	9413	9418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093302
122	NC_009138	GTA	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093302
123	NC_009138	CGG	2	6	9550	9555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093302
124	NC_009138	TGG	2	6	9679	9684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093302
125	NC_009138	GCG	2	6	9794	9799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093302
126	NC_009138	AGC	2	6	9800	9805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093302
127	NC_009138	GAA	2	6	9817	9822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093302
128	NC_009138	CCA	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093302
129	NC_009138	AAT	2	6	10055	10060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093303
130	NC_009138	TAC	2	6	10117	10122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093303
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253	NC_009138	TCT	2	6	19567	19572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093313
254	NC_009138	ACG	2	6	19621	19626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093313
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257	NC_009138	GAT	2	6	19840	19845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093313
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499	NC_009138	CAT	2	6	37199	37204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093332
500	NC_009138	TGC	2	6	37213	37218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093332

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