MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 plasmid pMMC501

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009136	TCCT	2	8	588	595	0 %	50 %	0 %	50 %	134046899
2	NC_009136	TTAA	2	8	634	641	50 %	50 %	0 %	0 %	134046899
3	NC_009136	GATT	2	8	1413	1420	25 %	50 %	25 %	0 %	134046900
4	NC_009136	ATTT	2	8	1492	1499	25 %	75 %	0 %	0 %	134046900
5	NC_009136	AATA	2	8	1823	1830	75 %	25 %	0 %	0 %	134046900
6	NC_009136	CCCG	2	8	2038	2045	0 %	0 %	25 %	75 %	134046900
7	NC_009136	ATTT	2	8	2869	2876	25 %	75 %	0 %	0 %	134046900
8	NC_009136	CTAT	2	8	2940	2947	25 %	50 %	0 %	25 %	134046900
9	NC_009136	AAAG	2	8	4355	4362	75 %	0 %	25 %	0 %	134046902
10	NC_009136	ATTA	2	8	4373	4380	50 %	50 %	0 %	0 %	134046902
11	NC_009136	ACAA	2	8	4612	4619	75 %	0 %	0 %	25 %	134046903
12	NC_009136	ATGA	2	8	5018	5025	50 %	25 %	25 %	0 %	134046904
13	NC_009136	ATTT	2	8	5250	5257	25 %	75 %	0 %	0 %	134046905
14	NC_009136	ATTA	2	8	5425	5432	50 %	50 %	0 %	0 %	134046905
15	NC_009136	ATTA	2	8	5590	5597	50 %	50 %	0 %	0 %	134046905
16	NC_009136	TAAA	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	134046906
17	NC_009136	TAAG	2	8	7272	7279	50 %	25 %	25 %	0 %	134046907
18	NC_009136	AATA	2	8	7360	7367	75 %	25 %	0 %	0 %	134046907
19	NC_009136	TGAA	2	8	7395	7402	50 %	25 %	25 %	0 %	134046907
20	NC_009136	AATG	2	8	7631	7638	50 %	25 %	25 %	0 %	134046907
21	NC_009136	AAAT	2	8	7710	7717	75 %	25 %	0 %	0 %	134046907
22	NC_009136	AAGA	2	8	7775	7782	75 %	0 %	25 %	0 %	134046907
23	NC_009136	AACC	2	8	7826	7833	50 %	0 %	0 %	50 %	134046907
24	NC_009136	AAAG	2	8	7843	7850	75 %	0 %	25 %	0 %	134046907
25	NC_009136	AAAG	2	8	7954	7961	75 %	0 %	25 %	0 %	134046907

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.