MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C5 plasmid pMMC501

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009136	TG	3	6	188	193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009136	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009136	AT	3	6	309	314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009136	AT	3	6	677	682	50 %	50 %	0 %	0 %	134046899
5	NC_009136	TA	3	6	765	770	50 %	50 %	0 %	0 %	134046899
6	NC_009136	TA	3	6	1049	1054	50 %	50 %	0 %	0 %	134046900
7	NC_009136	AT	4	8	2623	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	134046900
8	NC_009136	AT	4	8	2732	2739	50 %	50 %	0 %	0 %	134046900
9	NC_009136	TG	3	6	2811	2816	0 %	50 %	50 %	0 %	134046900
10	NC_009136	CA	3	6	2851	2856	50 %	0 %	0 %	50 %	134046900
11	NC_009136	AT	3	6	3217	3222	50 %	50 %	0 %	0 %	134046900
12	NC_009136	AT	3	6	3430	3435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009136	CT	3	6	3549	3554	0 %	50 %	0 %	50 %	134046901
14	NC_009136	TA	5	10	3848	3857	50 %	50 %	0 %	0 %	134046901
15	NC_009136	AT	3	6	3868	3873	50 %	50 %	0 %	0 %	134046901
16	NC_009136	AT	4	8	3886	3893	50 %	50 %	0 %	0 %	134046901
17	NC_009136	AT	3	6	4046	4051	50 %	50 %	0 %	0 %	134046902
18	NC_009136	AT	3	6	5315	5320	50 %	50 %	0 %	0 %	134046905
19	NC_009136	AT	3	6	5346	5351	50 %	50 %	0 %	0 %	134046905
20	NC_009136	TA	5	10	6123	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009136	AT	3	6	6152	6157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009136	AT	4	8	6607	6614	50 %	50 %	0 %	0 %	134046906
23	NC_009136	AT	4	8	6637	6644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009136	TA	3	6	6664	6669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009136	GA	3	6	7908	7913	50 %	0 %	50 %	0 %	134046907
26	NC_009136	TA	3	6	8167	8172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.