MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	GCAATC	2	12	516	527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045047
2	NC_009135	ATATTG	2	12	1602	1613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045048
3	NC_009135	TAAATT	2	12	5457	5468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009135	ACCTGC	2	12	9952	9963	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045061
5	NC_009135	CTGCAA	2	12	10823	10834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045062
6	NC_009135	TGATCT	2	12	13473	13484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045064
7	NC_009135	CCACCG	2	12	15119	15130	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	134045067
8	NC_009135	TTTTGT	2	12	23843	23854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134045075
9	NC_009135	TTTAAT	2	12	25216	25227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045078
10	NC_009135	CCTTTA	2	12	26171	26182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045079
11	NC_009135	TTTTAA	2	12	28883	28894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045082
12	NC_009135	CTTTTT	2	12	29269	29280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045082
13	NC_009135	ATTTTA	2	12	31570	31581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045086
14	NC_009135	AAATCA	2	12	36406	36417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045092
15	NC_009135	TCAACA	2	12	40834	40845	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045096
16	NC_009135	AATTTC	2	12	43383	43394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134045098
17	NC_009135	ATTACC	2	12	45751	45762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045102
18	NC_009135	AGAAAC	2	12	49899	49910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134045106
19	NC_009135	CTATCT	2	12	51455	51466	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045107
20	NC_009135	TTAAAG	2	12	52756	52767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045108
21	NC_009135	TTGAAG	2	12	54190	54201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045109
22	NC_009135	GCATTC	2	12	55514	55525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045110
23	NC_009135	AAGTTA	2	12	61121	61132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045118
24	NC_009135	AGATGT	2	12	61173	61184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045118
25	NC_009135	TTGGTG	2	12	65931	65942	0 %	50 %	50 %	0 %	134045123
26	NC_009135	TTTTAT	2	12	67598	67609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045125
27	NC_009135	CTTTTT	2	12	69553	69564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045127
28	NC_009135	TAAATG	2	12	72308	72319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045130
29	NC_009135	TTTTAT	2	12	75026	75037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045133
30	NC_009135	ATTTCA	2	12	76111	76122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134045134
31	NC_009135	AAATAA	2	12	77162	77173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045134
32	NC_009135	AATTCA	2	12	77607	77618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045135
33	NC_009135	CGCTAC	2	12	82428	82439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045139
34	NC_009135	AAGATA	2	12	83307	83318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045140
35	NC_009135	TCAAAT	2	12	86654	86665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045144
36	NC_009135	ATTTTC	2	12	86953	86964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045144
37	NC_009135	CTGCAT	2	12	88792	88803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045146
38	NC_009135	CATCTT	2	12	92737	92748	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045150
39	NC_009135	TAAATC	2	12	93278	93289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045150
40	NC_009135	ACTTTT	2	12	94859	94870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045151
41	NC_009135	AATTTG	2	12	96365	96376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045153
42	NC_009135	TGCACC	2	12	97560	97571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045154
43	NC_009135	GAAAAA	2	12	98763	98774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134045156
44	NC_009135	TAGATA	2	12	102093	102104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045161
45	NC_009135	CTACCT	2	12	113958	113969	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134045181
46	NC_009135	CAAACT	2	12	116457	116468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045184
47	NC_009135	TCCAAT	2	12	118214	118225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045186
48	NC_009135	TCTTTT	2	12	120277	120288	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045187
49	NC_009135	CAGTTG	2	12	121138	121149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045188
50	NC_009135	ATTTTT	2	12	127333	127344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	134045196
51	NC_009135	ATTGGA	2	12	133230	133241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045201
52	NC_009135	TTTTTA	2	12	133731	133742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009135	TTCTTT	2	12	138112	138123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045208
54	NC_009135	TTACTT	2	12	144859	144870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045223
55	NC_009135	GTTTTT	2	12	145972	145983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134045226
56	NC_009135	ATATTG	2	12	157664	157675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045233
57	NC_009135	TTAATT	2	12	159998	160009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009135	ATCCAA	2	12	160806	160817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045236
59	NC_009135	TCACGT	2	12	162238	162249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045237
60	NC_009135	TCTTAG	2	12	164239	164250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045240
61	NC_009135	TTTTCT	2	12	164316	164327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045240
62	NC_009135	CATTTT	2	12	166893	166904	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045242
63	NC_009135	TTCCAA	2	12	167612	167623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045243
64	NC_009135	GCAATT	2	12	168876	168887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045244
65	NC_009135	TTAAAA	2	12	169405	169416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009135	TGAATC	2	12	169908	169919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045246
67	NC_009135	CTAAAA	2	12	171340	171351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134045248
68	NC_009135	CTCTTT	2	12	176923	176934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045253
69	NC_009135	CAGTTT	2	12	179005	179016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134045254
70	NC_009135	TTTTAA	2	12	180426	180437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045256
71	NC_009135	TCAGCT	2	12	184025	184036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045260
72	NC_009135	TCTAAC	2	12	186312	186323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045261
73	NC_009135	CAACTA	2	12	187169	187180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045261
74	NC_009135	TAATAT	2	12	189281	189292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009135	TTGAAG	2	12	190459	190470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045264
76	NC_009135	AATAAA	2	12	192692	192703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009135	AAAAGT	2	12	193923	193934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134045269
78	NC_009135	TAAAAA	2	12	195708	195719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009135	CATAAC	2	12	197248	197259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045273
80	NC_009135	AAAAGA	2	12	198123	198134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134045273
81	NC_009135	TATTTT	2	12	199286	199297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009135	TATCGG	2	12	200915	200926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045277
83	NC_009135	ACAAAA	2	12	203345	203356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134045280
84	NC_009135	TAATTT	2	12	203997	204008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045281
85	NC_009135	TTCAGA	2	12	206520	206531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045282
86	NC_009135	CTTTTT	2	12	206878	206889	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045282
87	NC_009135	TCATTT	2	12	207476	207487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134045283
88	NC_009135	ATTTAA	2	12	208953	208964	50 %	50 %	0 %	0 %	134045285
89	NC_009135	TGAATA	2	12	209319	209330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134045285
90	NC_009135	AACTTC	2	12	210342	210353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045286
91	NC_009135	TGAATT	2	12	211577	211588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045287
92	NC_009135	TTCAAA	2	12	213062	213073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134045288
93	NC_009135	CATCTG	2	12	223724	223735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045303
94	NC_009135	TTCATC	2	12	224949	224960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045304
95	NC_009135	ATCTTC	2	12	229751	229762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134045310
96	NC_009135	AATTTT	2	12	231452	231463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045314
97	NC_009135	AGCTTC	2	12	232405	232416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134045316
98	NC_009135	TTTTTG	2	12	234912	234923	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009135	AAATCG	2	12	236360	236371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134045320
100	NC_009135	TTATAT	2	12	239072	239083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009135	AGTTGT	2	12	240642	240653	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134045324
102	NC_009135	GCAATG	2	12	241102	241113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134045324
103	NC_009135	TTCAAC	2	12	241360	241371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045324
104	NC_009135	TTTAAT	2	12	242629	242640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045326
105	NC_009135	TTTTAG	2	12	246804	246815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045332
106	NC_009135	GTGCAG	2	12	255032	255043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134045340
107	NC_009135	TCCAAA	2	12	256979	256990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045341
108	NC_009135	TTCTTT	2	12	257561	257572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045342
109	NC_009135	TCATAC	2	12	259147	259158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045343
110	NC_009135	TTTTTC	2	12	259672	259683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045343
111	NC_009135	TTTCTT	2	12	260015	260026	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	134045343
112	NC_009135	TTGCAA	2	12	261344	261355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045344
113	NC_009135	AACCAC	2	12	265846	265857	50 %	0 %	0 %	50 %	134045347
114	NC_009135	TCGCCA	2	12	268470	268481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134045350
115	NC_009135	TTTAAA	2	12	269315	269326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009135	ATTTTA	2	12	271200	271211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045353
117	NC_009135	TTTGTA	2	12	272343	272354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045354
118	NC_009135	ATTTTG	2	12	273142	273153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045354
119	NC_009135	TAAAAA	2	12	273641	273652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045354
120	NC_009135	TTCCAA	2	12	275533	275544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045357
121	NC_009135	TGGCGG	2	12	276987	276998	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	134045360
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221	NC_009135	TTTAAA	2	12	525208	525219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_009135	CATTAT	2	12	570529	570540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
239	NC_009135	TAAAAA	2	12	577305	577316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134045652
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244	NC_009135	TTAAAT	2	12	591120	591131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009135	TGATTT	2	12	601657	601668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045674
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251	NC_009135	CAATGT	2	12	621709	621720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045688
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325	NC_009135	AATCGG	2	12	780128	780139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134045848
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334	NC_009135	TATCCA	2	12	804070	804081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045869
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344	NC_009135	GTTGCA	2	12	827277	827288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045889
345	NC_009135	TGCAAT	2	12	827765	827776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134045890
346	NC_009135	TAGGAT	2	12	829993	830004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045890
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349	NC_009135	GTATTT	2	12	842570	842581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134045902
350	NC_009135	ATTGGC	2	12	843492	843503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134045903
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352	NC_009135	TAAACC	2	12	844880	844891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134045903
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469	NC_009135	TGGTTC	2	12	1064312	1064323	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
470	NC_009135	TGTCAA	2	12	1064852	1064863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134046149
471	NC_009135	TTCGAG	2	12	1067708	1067719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134046152
472	NC_009135	TTAAAA	2	12	1073745	1073756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046161
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474	NC_009135	TAATTT	2	12	1081974	1081985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_009135	AGATTC	2	12	1082731	1082742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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487	NC_009135	TTTTTA	2	12	1096781	1096792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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