MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	TAAATT	2	12	5457	5468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009135	TTTTTA	2	12	133731	133742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009135	TTAATT	2	12	159998	160009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009135	TTAAAA	2	12	169405	169416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009135	TAATAT	2	12	189281	189292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009135	AATAAA	2	12	192692	192703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009135	TAAAAA	2	12	195708	195719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009135	TATTTT	2	12	199286	199297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009135	TTTTTG	2	12	234912	234923	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009135	TTATAT	2	12	239072	239083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009135	TTTAAA	2	12	269315	269326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009135	TAATTA	2	12	278670	278681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009135	CTTTTT	2	12	296269	296280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009135	AAAAAC	2	12	297909	297920	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009135	ATTTAA	2	12	330506	330517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009135	AATATT	2	12	346310	346321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009135	AATTTT	2	12	358407	358418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009135	ATTTCA	2	12	367248	367259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009135	TTTAAA	2	12	367664	367675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009135	GAATTA	2	12	396604	396615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009135	GTATTT	2	12	399552	399563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009135	TAAAAA	2	12	410572	410583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009135	TAATAT	2	12	426865	426876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009135	TTAATT	2	12	446815	446826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009135	TTTTTA	2	12	517869	517880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009135	TGGATT	2	12	523069	523080	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009135	ATTTAA	2	12	523933	523944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009135	TTTAAA	2	12	525208	525219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009135	AAATTA	2	12	525908	525919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009135	TAAAAA	2	12	539207	539218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009135	TGCAGT	2	12	562191	562202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009135	CATTAT	2	12	570529	570540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009135	TTAAAT	2	12	591120	591131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009135	AAATTA	2	12	613755	613766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009135	TATCAA	2	12	620284	620295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009135	TAAAAT	2	12	643257	643268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009135	TCCAGG	2	12	658385	658396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009135	CCAAAA	2	12	662847	662858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009135	TATTTT	2	12	666199	666210	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009135	TTAAAA	2	12	675237	675248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009135	TTTTAA	2	12	727598	727609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009135	GAATTT	2	12	729370	729381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009135	AAATAA	2	12	742649	742660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009135	AATTAG	2	12	748134	748145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009135	TTTTAA	2	12	749085	749096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009135	TTATAA	2	12	779297	779308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009135	TCTGCA	2	12	785154	785165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009135	ATTTAA	2	12	798699	798710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009135	TGATAT	2	12	854959	854970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009135	ATTTTT	2	12	856940	856951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009135	ATATTT	2	12	871752	871763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009135	TAAAAA	2	12	885879	885890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009135	TTCAAA	2	12	889161	889172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009135	TATAAT	2	12	889379	889390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009135	ATTTTT	2	12	899361	899372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009135	TGCAGG	2	12	902397	902408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009135	TCTTTT	2	12	903178	903189	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009135	AAATAT	2	12	910519	910530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009135	TGTTGC	2	12	922364	922375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009135	GAATTA	2	12	922660	922671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009135	AAATTA	2	12	937192	937203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009135	AAAATT	2	12	949126	949137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009135	GAAAAA	2	12	949169	949180	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009135	ATTTGG	2	12	949613	949624	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009135	TAAAAT	2	12	951477	951488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009135	ATTTAA	2	12	958936	958947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009135	ATTTTA	2	12	978379	978390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009135	AATTTT	2	12	996480	996491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009135	TTTTGA	2	12	999718	999729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009135	AAATTA	2	12	1006853	1006864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009135	AAATAT	2	12	1036721	1036732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009135	ACTTCT	2	12	1048321	1048332	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009135	TATCCA	2	12	1063801	1063812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009135	TGGTTC	2	12	1064312	1064323	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009135	TAATTT	2	12	1081974	1081985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009135	AGATTC	2	12	1082731	1082742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009135	TAAAAC	2	12	1082743	1082754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009135	TAAAAT	2	12	1087047	1087058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009135	CTTTTT	2	12	1089844	1089855	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009135	TATGAA	2	12	1090897	1090908	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009135	AATATT	2	12	1096199	1096210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009135	TTTTTA	2	12	1096781	1096792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009135	TTTAAA	2	12	1130026	1130037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009135	AAAAAT	2	12	1134275	1134286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009135	AAATTA	2	12	1142635	1142646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009135	AATATT	2	12	1175175	1175186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009135	TAAAAT	2	12	1188904	1188915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009135	TAAAAT	2	12	1208825	1208836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009135	TTTAAT	2	12	1224031	1224042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009135	AAAGAA	2	12	1240195	1240206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009135	TATTTT	2	12	1274634	1274645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009135	ATATTT	2	12	1279443	1279454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009135	AATTTT	2	12	1304475	1304486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009135	AATTTT	2	12	1309746	1309757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009135	CAAATT	2	12	1313527	1313538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009135	TTTAAA	2	12	1318579	1318590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009135	TTTCTG	2	12	1319299	1319310	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009135	ATAAAA	2	12	1333472	1333483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009135	ATTCTG	2	12	1353046	1353057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009135	CTTTTC	2	12	1353212	1353223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009135	TAAAAA	2	12	1358469	1358480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009135	AATTAT	2	12	1361023	1361034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009135	ATTACT	2	12	1382563	1382574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009135	TTTGAT	2	12	1389263	1389274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009135	TTTTAA	2	12	1405164	1405175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009135	TTTAAA	2	12	1416621	1416632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009135	CTATAC	2	12	1430583	1430594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009135	TTTAAA	2	12	1432990	1433001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009135	ATTTTT	2	12	1434931	1434942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009135	TTTTAA	2	12	1454259	1454270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009135	CCACAC	2	12	1482834	1482845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009135	TTAATT	2	12	1494677	1494688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009135	TAAAAA	2	12	1501652	1501663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009135	TAAAAC	2	12	1502984	1502995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009135	AAATTT	2	12	1538001	1538012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009135	ATTCTT	2	12	1553319	1553330	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009135	TTAATT	2	12	1585473	1585484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009135	CAAAAT	2	12	1586708	1586719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009135	TTAAAA	2	12	1586721	1586732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009135	TTAAAA	2	12	1590129	1590140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009135	GGCCTT	2	12	1595434	1595445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009135	CGTAGG	2	12	1596437	1596448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009135	AAGTTT	2	12	1605338	1605349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009135	GGCCTT	2	12	1630081	1630092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009135	CGTAGG	2	12	1631004	1631015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009135	GGCCTT	2	12	1635124	1635135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009135	CGTAGG	2	12	1636047	1636058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009135	CCCTGC	2	12	1700336	1700347	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009135	AAATAT	2	12	1726072	1726083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009135	AAATAT	2	12	1726445	1726456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009135	AATTTA	2	12	1749309	1749320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009135	TACTAT	2	12	1749374	1749385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_009135	TTTTAA	2	12	1753925	1753936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009135	ATAATT	2	12	1759295	1759306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.