MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	GTTA	2	8	68	75	25 %	50 %	25 %	0 %	134045047
2	NC_009135	TTCA	2	8	220	227	25 %	50 %	0 %	25 %	134045047
3	NC_009135	ATTG	2	8	329	336	25 %	50 %	25 %	0 %	134045047
4	NC_009135	TGGA	2	8	394	401	25 %	25 %	50 %	0 %	134045047
5	NC_009135	GGTG	2	8	656	663	0 %	25 %	75 %	0 %	134045047
6	NC_009135	GATT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	134045048
7	NC_009135	TATT	2	8	1504	1511	25 %	75 %	0 %	0 %	134045048
8	NC_009135	CAAA	2	8	1614	1621	75 %	0 %	0 %	25 %	134045048
9	NC_009135	GAAA	2	8	1941	1948	75 %	0 %	25 %	0 %	134045049
10	NC_009135	TATT	2	8	2872	2879	25 %	75 %	0 %	0 %	134045051
11	NC_009135	TGTT	2	8	3450	3457	0 %	75 %	25 %	0 %	134045051
12	NC_009135	TCAA	2	8	4095	4102	50 %	25 %	0 %	25 %	134045052
13	NC_009135	TAAA	2	8	4211	4218	75 %	25 %	0 %	0 %	134045052
14	NC_009135	ATGA	2	8	4886	4893	50 %	25 %	25 %	0 %	134045053
15	NC_009135	TTAC	2	8	5017	5024	25 %	50 %	0 %	25 %	134045054
16	NC_009135	AGAA	2	8	5223	5230	75 %	0 %	25 %	0 %	134045054
17	NC_009135	AATA	2	8	5249	5256	75 %	25 %	0 %	0 %	134045054
18	NC_009135	ATTA	2	8	5505	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	134045055
19	NC_009135	AATT	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	134045055
20	NC_009135	TTGT	2	8	5662	5669	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
21	NC_009135	GGAT	2	8	5987	5994	25 %	25 %	50 %	0 %	134045055
22	NC_009135	TGTT	2	8	6037	6044	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
23	NC_009135	TTGT	2	8	6287	6294	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
24	NC_009135	TTCA	2	8	7603	7610	25 %	50 %	0 %	25 %	134045058
25	NC_009135	AGGT	2	8	7662	7669	25 %	25 %	50 %	0 %	134045058
26	NC_009135	GAGT	2	8	8407	8414	25 %	25 %	50 %	0 %	134045059
27	NC_009135	ACCA	2	8	8721	8728	50 %	0 %	0 %	50 %	134045060
28	NC_009135	AAAC	2	8	9680	9687	75 %	0 %	0 %	25 %	134045061
29	NC_009135	TACC	2	8	9984	9991	25 %	25 %	0 %	50 %	134045061
30	NC_009135	TAAT	2	8	10137	10144	50 %	50 %	0 %	0 %	134045062
31	NC_009135	TCCA	2	8	10292	10299	25 %	25 %	0 %	50 %	134045062
32	NC_009135	GAGT	2	8	11588	11595	25 %	25 %	50 %	0 %	134045063
33	NC_009135	CATA	2	8	11717	11724	50 %	25 %	0 %	25 %	134045063
34	NC_009135	AATG	2	8	12251	12258	50 %	25 %	25 %	0 %	134045063
35	NC_009135	CTAC	2	8	12312	12319	25 %	25 %	0 %	50 %	134045063
36	NC_009135	TGAG	2	8	12617	12624	25 %	25 %	50 %	0 %	134045063
37	NC_009135	CTGT	2	8	13653	13660	0 %	50 %	25 %	25 %	134045064
38	NC_009135	CTAC	2	8	14386	14393	25 %	25 %	0 %	50 %	134045065
39	NC_009135	GTTT	2	8	14414	14421	0 %	75 %	25 %	0 %	134045066
40	NC_009135	AACA	2	8	17359	17366	75 %	0 %	0 %	25 %	134045068
41	NC_009135	ATGG	2	8	17690	17697	25 %	25 %	50 %	0 %	134045068
42	NC_009135	AATT	2	8	17760	17767	50 %	50 %	0 %	0 %	134045068
43	NC_009135	TGTA	2	8	18014	18021	25 %	50 %	25 %	0 %	134045069
44	NC_009135	AATT	2	8	18380	18387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009135	GCAA	2	8	21388	21395	50 %	0 %	25 %	25 %	134045072
46	NC_009135	TATT	2	8	21874	21881	25 %	75 %	0 %	0 %	134045073
47	NC_009135	GATA	2	8	21893	21900	50 %	25 %	25 %	0 %	134045073
48	NC_009135	CAAT	2	8	22026	22033	50 %	25 %	0 %	25 %	134045073
49	NC_009135	TGTT	2	8	22434	22441	0 %	75 %	25 %	0 %	134045073
50	NC_009135	CTTC	2	8	22574	22581	0 %	50 %	0 %	50 %	134045073
51	NC_009135	TCTA	2	8	22726	22733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009135	GAAT	2	8	22999	23006	50 %	25 %	25 %	0 %	134045074
53	NC_009135	ATTT	2	8	23109	23116	25 %	75 %	0 %	0 %	134045074
54	NC_009135	ATTG	2	8	23240	23247	25 %	50 %	25 %	0 %	134045074
55	NC_009135	AAAT	2	8	23346	23353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009135	AATT	2	8	23379	23386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009135	GAAC	2	8	23433	23440	50 %	0 %	25 %	25 %	134045075
58	NC_009135	TGTT	2	8	23655	23662	0 %	75 %	25 %	0 %	134045075
59	NC_009135	TTTC	2	8	23860	23867	0 %	75 %	0 %	25 %	134045075
60	NC_009135	AATG	2	8	24121	24128	50 %	25 %	25 %	0 %	134045076
61	NC_009135	TGCA	2	8	24200	24207	25 %	25 %	25 %	25 %	134045076
62	NC_009135	TCTT	2	8	24459	24466	0 %	75 %	0 %	25 %	134045076
63	NC_009135	TTTC	2	8	24872	24879	0 %	75 %	0 %	25 %	134045077
64	NC_009135	TTAA	2	8	25655	25662	50 %	50 %	0 %	0 %	134045078
65	NC_009135	TATT	2	8	26985	26992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009135	TAAT	2	8	27583	27590	50 %	50 %	0 %	0 %	134045080
67	NC_009135	AATT	2	8	27671	27678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009135	CTTC	2	8	28543	28550	0 %	50 %	0 %	50 %	134045081
69	NC_009135	TTTA	2	8	28692	28699	25 %	75 %	0 %	0 %	134045081
70	NC_009135	ATTA	2	8	29367	29374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009135	TAAC	2	8	29726	29733	50 %	25 %	0 %	25 %	134045083
72	NC_009135	AATT	2	8	30141	30148	50 %	50 %	0 %	0 %	134045084
73	NC_009135	TATT	2	8	30433	30440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009135	AAGG	2	8	30868	30875	50 %	0 %	50 %	0 %	134045085
75	NC_009135	ACTT	2	8	31175	31182	25 %	50 %	0 %	25 %	134045086
76	NC_009135	AATA	2	8	31515	31522	75 %	25 %	0 %	0 %	134045086
77	NC_009135	CTTT	2	8	32095	32102	0 %	75 %	0 %	25 %	134045086
78	NC_009135	TTTC	2	8	32514	32521	0 %	75 %	0 %	25 %	134045087
79	NC_009135	ACTG	2	8	32706	32713	25 %	25 %	25 %	25 %	134045087
80	NC_009135	GATT	2	8	33099	33106	25 %	50 %	25 %	0 %	134045088
81	NC_009135	TTAT	2	8	33441	33448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009135	CGAT	2	8	34589	34596	25 %	25 %	25 %	25 %	134045089
83	NC_009135	TGCA	2	8	34911	34918	25 %	25 %	25 %	25 %	134045089
84	NC_009135	AAGC	2	8	35140	35147	50 %	0 %	25 %	25 %	134045090
85	NC_009135	AAGG	2	8	35460	35467	50 %	0 %	50 %	0 %	134045090
86	NC_009135	GTAA	2	8	35858	35865	50 %	25 %	25 %	0 %	134045090
87	NC_009135	CTTT	2	8	36980	36987	0 %	75 %	0 %	25 %	134045092
88	NC_009135	ATTT	2	8	37025	37032	25 %	75 %	0 %	0 %	134045092
89	NC_009135	CCCA	2	8	37405	37412	25 %	0 %	0 %	75 %	134045093
90	NC_009135	AAAT	2	8	37690	37697	75 %	25 %	0 %	0 %	134045093
91	NC_009135	AAAT	2	8	37911	37918	75 %	25 %	0 %	0 %	134045093
92	NC_009135	GAAA	2	8	37928	37935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009135	TACG	2	8	39899	39906	25 %	25 %	25 %	25 %	134045095
94	NC_009135	TTAA	2	8	40037	40044	50 %	50 %	0 %	0 %	134045096
95	NC_009135	AGAA	2	8	40149	40156	75 %	0 %	25 %	0 %	134045096
96	NC_009135	TTCT	2	8	41315	41322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009135	AAAG	2	8	41495	41502	75 %	0 %	25 %	0 %	134045097
98	NC_009135	GATT	2	8	42171	42178	25 %	50 %	25 %	0 %	134045097
99	NC_009135	GTAT	2	8	42313	42320	25 %	50 %	25 %	0 %	134045098
100	NC_009135	TAGA	2	8	42548	42555	50 %	25 %	25 %	0 %	134045098
101	NC_009135	ATGG	2	8	42760	42767	25 %	25 %	50 %	0 %	134045098
102	NC_009135	CATT	2	8	43010	43017	25 %	50 %	0 %	25 %	134045098
103	NC_009135	TTGT	2	8	43315	43322	0 %	75 %	25 %	0 %	134045098
104	NC_009135	TAAA	2	8	43452	43459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009135	ATTT	2	8	43624	43631	25 %	75 %	0 %	0 %	134045099
106	NC_009135	TATT	3	12	43644	43655	25 %	75 %	0 %	0 %	134045099
107	NC_009135	TGAA	2	8	44090	44097	50 %	25 %	25 %	0 %	134045099
108	NC_009135	ATTT	2	8	44259	44266	25 %	75 %	0 %	0 %	134045099
109	NC_009135	AAAT	2	8	44747	44754	75 %	25 %	0 %	0 %	134045100
110	NC_009135	TTTA	2	8	44968	44975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009135	AATA	2	8	45295	45302	75 %	25 %	0 %	0 %	134045101
112	NC_009135	ATGC	2	8	45455	45462	25 %	25 %	25 %	25 %	134045101
113	NC_009135	CTTT	2	8	46132	46139	0 %	75 %	0 %	25 %	134045102
114	NC_009135	TTAA	2	8	46353	46360	50 %	50 %	0 %	0 %	134045102
115	NC_009135	ATTG	2	8	46424	46431	25 %	50 %	25 %	0 %	134045102
116	NC_009135	TAGA	2	8	46468	46475	50 %	25 %	25 %	0 %	134045102
117	NC_009135	CAAT	2	8	47524	47531	50 %	25 %	0 %	25 %	134045103
118	NC_009135	TAAT	2	8	47532	47539	50 %	50 %	0 %	0 %	134045103
119	NC_009135	TAAA	2	8	47642	47649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009135	CATT	2	8	47993	48000	25 %	50 %	0 %	25 %	134045104
121	NC_009135	AAAG	2	8	48355	48362	75 %	0 %	25 %	0 %	134045105
122	NC_009135	AAAT	2	8	48864	48871	75 %	25 %	0 %	0 %	134045105
123	NC_009135	ATAC	2	8	49120	49127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009135	TTGC	2	8	49586	49593	0 %	50 %	25 %	25 %	134045106
125	NC_009135	AAAG	2	8	49819	49826	75 %	0 %	25 %	0 %	134045106
126	NC_009135	AAGC	2	8	50003	50010	50 %	0 %	25 %	25 %	134045106
127	NC_009135	GCAA	2	8	50563	50570	50 %	0 %	25 %	25 %	134045106
128	NC_009135	AATA	2	8	51300	51307	75 %	25 %	0 %	0 %	134045107
129	NC_009135	AATG	2	8	51505	51512	50 %	25 %	25 %	0 %	134045107
130	NC_009135	TTCA	2	8	51919	51926	25 %	50 %	0 %	25 %	134045107
131	NC_009135	CTTA	2	8	53155	53162	25 %	50 %	0 %	25 %	134045108
132	NC_009135	CAAA	2	8	53518	53525	75 %	0 %	0 %	25 %	134045108
133	NC_009135	ACAA	2	8	53530	53537	75 %	0 %	0 %	25 %	134045108
134	NC_009135	TTGT	2	8	54796	54803	0 %	75 %	25 %	0 %	134045109
135	NC_009135	TTTG	2	8	55094	55101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009135	ATTA	2	8	55615	55622	50 %	50 %	0 %	0 %	134045110
137	NC_009135	AGAC	2	8	55926	55933	50 %	0 %	25 %	25 %	134045110
138	NC_009135	AATT	2	8	56426	56433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009135	CAAG	2	8	57594	57601	50 %	0 %	25 %	25 %	134045111
140	NC_009135	GTTT	2	8	57918	57925	0 %	75 %	25 %	0 %	134045112
141	NC_009135	ATTT	2	8	57966	57973	25 %	75 %	0 %	0 %	134045112
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143	NC_009135	TTTG	2	8	58893	58900	0 %	75 %	25 %	0 %	134045113
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