MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 2277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	AATCT	2	10	2759	2768	40 %	40 %	0 %	20 %	127510938
2	NC_009092	GAAGT	2	10	4815	4824	40 %	20 %	40 %	0 %	127510939
3	NC_009092	GTCGC	2	10	6059	6068	0 %	20 %	40 %	40 %	127510939
4	NC_009092	GCACC	2	10	8224	8233	20 %	0 %	20 %	60 %	127510942
5	NC_009092	CGAGA	2	10	10538	10547	40 %	0 %	40 %	20 %	127510944
6	NC_009092	GCCCA	2	10	11293	11302	20 %	0 %	20 %	60 %	127510944
7	NC_009092	CGGCG	2	10	11419	11428	0 %	0 %	60 %	40 %	127510944
8	NC_009092	CCCAG	2	10	12092	12101	20 %	0 %	20 %	60 %	127510945
9	NC_009092	CATTC	2	10	13610	13619	20 %	40 %	0 %	40 %	127510947
10	NC_009092	TCCTG	2	10	13727	13736	0 %	40 %	20 %	40 %	127510947
11	NC_009092	ATTTC	2	10	13853	13862	20 %	60 %	0 %	20 %	127510947
12	NC_009092	GCTGA	2	10	15482	15491	20 %	20 %	40 %	20 %	127510948
13	NC_009092	TTACC	2	10	16069	16078	20 %	40 %	0 %	40 %	127510948
14	NC_009092	GCCTT	2	10	22282	22291	0 %	40 %	20 %	40 %	127510954
15	NC_009092	AGGTG	2	10	26924	26933	20 %	20 %	60 %	0 %	127510957
16	NC_009092	CTGAG	2	10	31378	31387	20 %	20 %	40 %	20 %	127510964
17	NC_009092	TCATC	2	10	32828	32837	20 %	40 %	0 %	40 %	127510965
18	NC_009092	GATGA	2	10	35356	35365	40 %	20 %	40 %	0 %	127510967
19	NC_009092	TATCG	2	10	35844	35853	20 %	40 %	20 %	20 %	127510967
20	NC_009092	CGGCA	2	10	36906	36915	20 %	0 %	40 %	40 %	127510967
21	NC_009092	CTGTT	2	10	44287	44296	0 %	60 %	20 %	20 %	127510974
22	NC_009092	CGCAG	2	10	50444	50453	20 %	0 %	40 %	40 %	127510976
23	NC_009092	GGCCT	2	10	52989	52998	0 %	20 %	40 %	40 %	127510979
24	NC_009092	GCGTG	2	10	57230	57239	0 %	20 %	60 %	20 %	127510981
25	NC_009092	GAAGA	2	10	66499	66508	60 %	0 %	40 %	0 %	127510990
26	NC_009092	CCTGG	2	10	68032	68041	0 %	20 %	40 %	40 %	127510991
27	NC_009092	CGAGC	2	10	68209	68218	20 %	0 %	40 %	40 %	127510991
28	NC_009092	GCGCG	2	10	70609	70618	0 %	0 %	60 %	40 %	127510994
29	NC_009092	AGACC	2	10	70750	70759	40 %	0 %	20 %	40 %	127510994
30	NC_009092	TACCG	2	10	71849	71858	20 %	20 %	20 %	40 %	127510994
31	NC_009092	CGTCG	2	10	72860	72869	0 %	20 %	40 %	40 %	127510995
32	NC_009092	GCGAC	2	10	78700	78709	20 %	0 %	40 %	40 %	127511000
33	NC_009092	GGTCT	2	10	79101	79110	0 %	40 %	40 %	20 %	127511000
34	NC_009092	GGGCA	2	10	85194	85203	20 %	0 %	60 %	20 %	127511006
35	NC_009092	GGCGA	2	10	85446	85455	20 %	0 %	60 %	20 %	127511006
36	NC_009092	CATTT	2	10	86438	86447	20 %	60 %	0 %	20 %	127511007
37	NC_009092	ATCTT	2	10	87459	87468	20 %	60 %	0 %	20 %	127511008
38	NC_009092	GGGCA	2	10	90937	90946	20 %	0 %	60 %	20 %	127511012
39	NC_009092	CTCGT	2	10	93806	93815	0 %	40 %	20 %	40 %	127511014
40	NC_009092	GCCAG	2	10	101179	101188	20 %	0 %	40 %	40 %	127511020
41	NC_009092	TGGTG	2	10	105784	105793	0 %	40 %	60 %	0 %	127511027
42	NC_009092	TTAGA	2	10	111975	111984	40 %	40 %	20 %	0 %	127511036
43	NC_009092	GCACG	2	10	112601	112610	20 %	0 %	40 %	40 %	127511037
44	NC_009092	CGAGC	2	10	113836	113845	20 %	0 %	40 %	40 %	127511039
45	NC_009092	GCCTG	2	10	116025	116034	0 %	20 %	40 %	40 %	127511039
46	NC_009092	CCATG	2	10	116715	116724	20 %	20 %	20 %	40 %	127511040
47	NC_009092	GCCTT	2	10	117326	117335	0 %	40 %	20 %	40 %	127511041
48	NC_009092	TCATC	2	10	121839	121848	20 %	40 %	0 %	40 %	127511045
49	NC_009092	GCGCT	2	10	122057	122066	0 %	20 %	40 %	40 %	127511045
50	NC_009092	CGGCG	2	10	126792	126801	0 %	0 %	60 %	40 %	127511047
51	NC_009092	GTCCC	2	10	130542	130551	0 %	20 %	20 %	60 %	127511053
52	NC_009092	TAGAG	2	10	132634	132643	40 %	20 %	40 %	0 %	127511056
53	NC_009092	TGAAC	2	10	137026	137035	40 %	20 %	20 %	20 %	127511060
54	NC_009092	GAGTC	2	10	141286	141295	20 %	20 %	40 %	20 %	127511066
55	NC_009092	GCCTC	2	10	144229	144238	0 %	20 %	20 %	60 %	127511068
56	NC_009092	ATTAG	2	10	144672	144681	40 %	40 %	20 %	0 %	127511068
57	NC_009092	GGGCA	2	10	144949	144958	20 %	0 %	60 %	20 %	127511069
58	NC_009092	CCAGT	2	10	146184	146193	20 %	20 %	20 %	40 %	127511070
59	NC_009092	TGCCA	2	10	146875	146884	20 %	20 %	20 %	40 %	127511070
60	NC_009092	CGAGC	2	10	149781	149790	20 %	0 %	40 %	40 %	127511073
61	NC_009092	TTCAC	2	10	150217	150226	20 %	40 %	0 %	40 %	127511074
62	NC_009092	GCGCC	2	10	157553	157562	0 %	0 %	40 %	60 %	127511075
63	NC_009092	CAGGG	2	10	158025	158034	20 %	0 %	60 %	20 %	127511075
64	NC_009092	TCATA	2	10	159745	159754	40 %	40 %	0 %	20 %	127511077
65	NC_009092	GAAGA	2	10	165527	165536	60 %	0 %	40 %	0 %	127511084
66	NC_009092	AGCAA	2	10	170126	170135	60 %	0 %	20 %	20 %	127511086
67	NC_009092	CTGAT	2	10	170177	170186	20 %	40 %	20 %	20 %	127511086
68	NC_009092	GGCAT	2	10	171667	171676	20 %	20 %	40 %	20 %	127511086
69	NC_009092	TATCG	2	10	173019	173028	20 %	40 %	20 %	20 %	127511086
70	NC_009092	AAGAT	2	10	176780	176789	60 %	20 %	20 %	0 %	127511089
71	NC_009092	TGGCG	2	10	180451	180460	0 %	20 %	60 %	20 %	127511093
72	NC_009092	AGAAA	2	10	182741	182750	80 %	0 %	20 %	0 %	127511098
73	NC_009092	TAATT	2	10	184161	184170	40 %	60 %	0 %	0 %	127511101
74	NC_009092	AAGCC	2	10	186089	186098	40 %	0 %	20 %	40 %	127511106
75	NC_009092	CACTG	2	10	187338	187347	20 %	20 %	20 %	40 %	127511109
76	NC_009092	CATTG	2	10	190014	190023	20 %	40 %	20 %	20 %	127511114
77	NC_009092	ATGGC	2	10	190396	190405	20 %	20 %	40 %	20 %	127511115
78	NC_009092	CAGAA	2	10	192130	192139	60 %	0 %	20 %	20 %	127511117
79	NC_009092	AGCTC	2	10	196693	196702	20 %	20 %	20 %	40 %	127511124
80	NC_009092	CAAGT	2	10	196731	196740	40 %	20 %	20 %	20 %	127511124
81	NC_009092	CGGCT	2	10	198375	198384	0 %	20 %	40 %	40 %	127511126
82	NC_009092	TGGCC	2	10	200627	200636	0 %	20 %	40 %	40 %	127511127
83	NC_009092	TGAGC	2	10	201586	201595	20 %	20 %	40 %	20 %	127511128
84	NC_009092	GGCTT	2	10	210824	210833	0 %	40 %	40 %	20 %	127511133
85	NC_009092	ATCTT	2	10	213382	213391	20 %	60 %	0 %	20 %	127511134
86	NC_009092	ATGGT	2	10	215648	215657	20 %	40 %	40 %	0 %	127511136
87	NC_009092	GGCGC	2	10	217630	217639	0 %	0 %	60 %	40 %	127511138
88	NC_009092	GCCTA	2	10	219916	219925	20 %	20 %	20 %	40 %	127511140
89	NC_009092	TCGCC	2	10	220063	220072	0 %	20 %	20 %	60 %	127511140
90	NC_009092	GATCT	2	10	221220	221229	20 %	40 %	20 %	20 %	127511141
91	NC_009092	GGCTA	2	10	223485	223494	20 %	20 %	40 %	20 %	127511141
92	NC_009092	CTATC	2	10	224408	224417	20 %	40 %	0 %	40 %	127511142
93	NC_009092	GCCTG	2	10	225664	225673	0 %	20 %	40 %	40 %	127511144
94	NC_009092	GTGGC	2	10	225822	225831	0 %	20 %	60 %	20 %	127511144
95	NC_009092	TGGCT	2	10	226579	226588	0 %	40 %	40 %	20 %	127511146
96	NC_009092	CAAGG	2	10	226886	226895	40 %	0 %	40 %	20 %	127511146
97	NC_009092	GAAGA	2	10	227306	227315	60 %	0 %	40 %	0 %	127511146
98	NC_009092	CAAAT	2	10	229268	229277	60 %	20 %	0 %	20 %	127511147
99	NC_009092	AACCG	2	10	230644	230653	40 %	0 %	20 %	40 %	127511149
100	NC_009092	TATCT	2	10	233674	233683	20 %	60 %	0 %	20 %	127511153
101	NC_009092	CTTGC	2	10	234427	234436	0 %	40 %	20 %	40 %	127511154
102	NC_009092	TGAGC	2	10	235331	235340	20 %	20 %	40 %	20 %	127511155
103	NC_009092	TGCTG	2	10	237704	237713	0 %	40 %	40 %	20 %	127511157
104	NC_009092	TTGGT	2	10	238354	238363	0 %	60 %	40 %	0 %	127511158
105	NC_009092	AGCTG	2	10	239588	239597	20 %	20 %	40 %	20 %	127511161
106	NC_009092	TTGAG	2	10	241081	241090	20 %	40 %	40 %	0 %	127511161
107	NC_009092	CATCG	2	10	242038	242047	20 %	20 %	20 %	40 %	127511162
108	NC_009092	CTGGC	2	10	243960	243969	0 %	20 %	40 %	40 %	127511164
109	NC_009092	GCTGG	2	10	247757	247766	0 %	20 %	60 %	20 %	127511167
110	NC_009092	CAAGG	2	10	249828	249837	40 %	0 %	40 %	20 %	127511167
111	NC_009092	GAGAT	2	10	250519	250528	40 %	20 %	40 %	0 %	127511169
112	NC_009092	GCGTT	2	10	252369	252378	0 %	40 %	40 %	20 %	127511170
113	NC_009092	TTCCA	2	10	254540	254549	20 %	40 %	0 %	40 %	127511172
114	NC_009092	GCCAG	2	10	255881	255890	20 %	0 %	40 %	40 %	127511173
115	NC_009092	GACCA	2	10	256988	256997	40 %	0 %	20 %	40 %	127511174
116	NC_009092	TAGGT	2	10	257329	257338	20 %	40 %	40 %	0 %	127511175
117	NC_009092	CTTCA	2	10	257710	257719	20 %	40 %	0 %	40 %	127511175
118	NC_009092	CGCGA	2	10	257876	257885	20 %	0 %	40 %	40 %	127511176
119	NC_009092	CATCT	2	10	258242	258251	20 %	40 %	0 %	40 %	127511176
120	NC_009092	AGTCG	2	10	262552	262561	20 %	20 %	40 %	20 %	127511179
121	NC_009092	TTTGA	2	10	266239	266248	20 %	60 %	20 %	0 %	127511180
122	NC_009092	TTGCC	2	10	266258	266267	0 %	40 %	20 %	40 %	127511180
123	NC_009092	CAAAT	2	10	272679	272688	60 %	20 %	0 %	20 %	127511187
124	NC_009092	GTACG	2	10	276557	276566	20 %	20 %	40 %	20 %	127511191
125	NC_009092	GCCAG	2	10	276812	276821	20 %	0 %	40 %	40 %	127511191
126	NC_009092	GGCCC	2	10	278102	278111	0 %	0 %	40 %	60 %	127511192
127	NC_009092	CTTGG	2	10	279120	279129	0 %	40 %	40 %	20 %	127511193
128	NC_009092	GAAGA	2	10	279841	279850	60 %	0 %	40 %	0 %	127511194
129	NC_009092	ACGGT	2	10	280316	280325	20 %	20 %	40 %	20 %	127511194
130	NC_009092	CTTCT	2	10	285269	285278	0 %	60 %	0 %	40 %	127511201
131	NC_009092	ACTGC	2	10	289636	289645	20 %	20 %	20 %	40 %	127511206
132	NC_009092	ATTGC	2	10	289726	289735	20 %	40 %	20 %	20 %	127511206
133	NC_009092	AGGTC	2	10	292160	292169	20 %	20 %	40 %	20 %	127511208
134	NC_009092	CAGGC	2	10	292452	292461	20 %	0 %	40 %	40 %	127511209
135	NC_009092	ATGCA	2	10	295673	295682	40 %	20 %	20 %	20 %	127511212
136	NC_009092	GCACT	2	10	295864	295873	20 %	20 %	20 %	40 %	127511212
137	NC_009092	TGCTC	2	10	300402	300411	0 %	40 %	20 %	40 %	127511217
138	NC_009092	GCTCA	2	10	300547	300556	20 %	20 %	20 %	40 %	127511217
139	NC_009092	GATCT	2	10	300739	300748	20 %	40 %	20 %	20 %	127511217
140	NC_009092	TGGTG	2	10	301008	301017	0 %	40 %	60 %	0 %	127511217
141	NC_009092	CAGGG	2	10	305167	305176	20 %	0 %	60 %	20 %	127511220
142	NC_009092	ATACC	2	10	310966	310975	40 %	20 %	0 %	40 %	127511225
143	NC_009092	TGGCG	2	10	314116	314125	0 %	20 %	60 %	20 %	127511227
144	NC_009092	AGCTG	2	10	314560	314569	20 %	20 %	40 %	20 %	127511227
145	NC_009092	TGGGT	2	10	316899	316908	0 %	40 %	60 %	0 %	127511229
146	NC_009092	GAGAT	2	10	318202	318211	40 %	20 %	40 %	0 %	127511231
147	NC_009092	AGGAT	2	10	318595	318604	40 %	20 %	40 %	0 %	127511231
148	NC_009092	TCTGT	2	10	318929	318938	0 %	60 %	20 %	20 %	127511231
149	NC_009092	TGTCA	2	10	324044	324053	20 %	40 %	20 %	20 %	127511235
150	NC_009092	GCGCC	2	10	325167	325176	0 %	0 %	40 %	60 %	127511237
151	NC_009092	TGAGG	2	10	326237	326246	20 %	20 %	60 %	0 %	127511237
152	NC_009092	CTCTT	2	10	326736	326745	0 %	60 %	0 %	40 %	127511238
153	NC_009092	ACCAG	2	10	328815	328824	40 %	0 %	20 %	40 %	127511239
154	NC_009092	GGTGA	2	10	328931	328940	20 %	20 %	60 %	0 %	127511239
155	NC_009092	GATCT	2	10	328985	328994	20 %	40 %	20 %	20 %	127511239
156	NC_009092	CGGGC	2	10	329040	329049	0 %	0 %	60 %	40 %	127511239
157	NC_009092	GCTGA	2	10	329731	329740	20 %	20 %	40 %	20 %	127511240
158	NC_009092	TGGCG	2	10	330327	330336	0 %	20 %	60 %	20 %	127511240
159	NC_009092	TCGCC	2	10	336217	336226	0 %	20 %	20 %	60 %	127511244
160	NC_009092	ATGCG	2	10	337126	337135	20 %	20 %	40 %	20 %	127511244
161	NC_009092	AGTTC	2	10	337456	337465	20 %	40 %	20 %	20 %	127511245
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163	NC_009092	AATCC	2	10	339204	339213	40 %	20 %	0 %	40 %	127511246
164	NC_009092	TGATC	2	10	339465	339474	20 %	40 %	20 %	20 %	127511246
165	NC_009092	TACTG	2	10	344235	344244	20 %	40 %	20 %	20 %	127511247
166	NC_009092	CCTTT	2	10	355328	355337	0 %	60 %	0 %	40 %	127511247
167	NC_009092	AGGTT	2	10	356833	356842	20 %	40 %	40 %	0 %	127511248
168	NC_009092	CTCCA	2	10	357388	357397	20 %	20 %	0 %	60 %	127511248
169	NC_009092	GCTTG	2	10	362498	362507	0 %	40 %	40 %	20 %	127511250
170	NC_009092	TCTTT	2	10	362627	362636	0 %	80 %	0 %	20 %	127511250
171	NC_009092	CACGT	2	10	363589	363598	20 %	20 %	20 %	40 %	127511251
172	NC_009092	TGCCT	2	10	364368	364377	0 %	40 %	20 %	40 %	127511252
173	NC_009092	AGTGG	2	10	367576	367585	20 %	20 %	60 %	0 %	127511254
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177	NC_009092	GGCAC	2	10	372294	372303	20 %	0 %	40 %	40 %	127511260
178	NC_009092	TCGAG	2	10	377212	377221	20 %	20 %	40 %	20 %	127511266
179	NC_009092	GAGCT	2	10	378105	378114	20 %	20 %	40 %	20 %	127511267
180	NC_009092	GGGCA	2	10	380035	380044	20 %	0 %	60 %	20 %	127511268
181	NC_009092	CTGAG	2	10	380120	380129	20 %	20 %	40 %	20 %	127511268
182	NC_009092	TACCT	2	10	383003	383012	20 %	40 %	0 %	40 %	127511271
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188	NC_009092	TCTTA	2	10	393605	393614	20 %	60 %	0 %	20 %	127511279
189	NC_009092	GGCGC	2	10	395107	395116	0 %	0 %	60 %	40 %	127511281
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191	NC_009092	CACGC	2	10	397272	397281	20 %	0 %	20 %	60 %	127511282
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193	NC_009092	TTAGT	2	10	400258	400267	20 %	60 %	20 %	0 %	127511285
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197	NC_009092	GCGAG	2	10	403466	403475	20 %	0 %	60 %	20 %	127511289
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199	NC_009092	GAGTG	2	10	404287	404296	20 %	20 %	60 %	0 %	127511289
200	NC_009092	GGGGC	2	10	405184	405193	0 %	0 %	80 %	20 %	127511290
201	NC_009092	GACGC	2	10	406314	406323	20 %	0 %	40 %	40 %	127511291
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205	NC_009092	AAAGT	2	10	411550	411559	60 %	20 %	20 %	0 %	127511296
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209	NC_009092	CCTGG	2	10	417525	417534	0 %	20 %	40 %	40 %	127511302
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231	NC_009092	AGCAG	2	10	460490	460499	40 %	0 %	40 %	20 %	127511342
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233	NC_009092	TGACC	2	10	468266	468275	20 %	20 %	20 %	40 %	127511348
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244	NC_009092	TGGTC	2	10	483475	483484	0 %	40 %	40 %	20 %	127511365
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246	NC_009092	CCGTG	2	10	486951	486960	0 %	20 %	40 %	40 %	127511370
247	NC_009092	GCAAC	2	10	489241	489250	40 %	0 %	20 %	40 %	127511372
248	NC_009092	AGATC	2	10	489267	489276	40 %	20 %	20 %	20 %	127511372
249	NC_009092	GCGAG	2	10	494859	494868	20 %	0 %	60 %	20 %	127511377
250	NC_009092	TCAGT	2	10	496548	496557	20 %	40 %	20 %	20 %	127511378
251	NC_009092	CGCCC	2	10	497899	497908	0 %	0 %	20 %	80 %	127511380
252	NC_009092	GCCTG	2	10	499055	499064	0 %	20 %	40 %	40 %	127511381
253	NC_009092	GCCTG	2	10	499858	499867	0 %	20 %	40 %	40 %	127511382
254	NC_009092	TGCAG	2	10	502644	502653	20 %	20 %	40 %	20 %	127511386
255	NC_009092	CTGGG	2	10	506629	506638	0 %	20 %	60 %	20 %	127511390
256	NC_009092	GATCA	2	10	510757	510766	40 %	20 %	20 %	20 %	127511392
257	NC_009092	CAGCG	2	10	512893	512902	20 %	0 %	40 %	40 %	127511393
258	NC_009092	GCGTC	2	10	513412	513421	0 %	20 %	40 %	40 %	127511393
259	NC_009092	CGTGA	2	10	513964	513973	20 %	20 %	40 %	20 %	127511393
260	NC_009092	CGCGC	2	10	517697	517706	0 %	0 %	40 %	60 %	127511394
261	NC_009092	GCTCG	2	10	522500	522509	0 %	20 %	40 %	40 %	127511400
262	NC_009092	CTTAC	2	10	524247	524256	20 %	40 %	0 %	40 %	127511400
263	NC_009092	CAGCG	2	10	524613	524622	20 %	0 %	40 %	40 %	127511401
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370	NC_009092	TTGAG	2	10	733949	733958	20 %	40 %	40 %	0 %	127511579
371	NC_009092	TGGGC	2	10	734412	734421	0 %	20 %	60 %	20 %	127511579
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373	NC_009092	GAAAT	2	10	740546	740555	60 %	20 %	20 %	0 %	127511587
374	NC_009092	CGATG	2	10	741329	741338	20 %	20 %	40 %	20 %	127511588
375	NC_009092	GTCGA	2	10	742640	742649	20 %	20 %	40 %	20 %	127511589
376	NC_009092	CCAGG	2	10	743130	743139	20 %	0 %	40 %	40 %	127511589
377	NC_009092	GTGAT	2	10	749370	749379	20 %	40 %	40 %	0 %	127511593
378	NC_009092	AGGCC	2	10	750804	750813	20 %	0 %	40 %	40 %	127511594
379	NC_009092	CGGCG	2	10	750919	750928	0 %	0 %	60 %	40 %	127511594
380	NC_009092	CTGGC	2	10	751210	751219	0 %	20 %	40 %	40 %	127511594
381	NC_009092	CGCTC	2	10	754921	754930	0 %	20 %	20 %	60 %	127511598
382	NC_009092	CAACG	2	10	754984	754993	40 %	0 %	20 %	40 %	127511598
383	NC_009092	AGGCG	2	10	755722	755731	20 %	0 %	60 %	20 %	127511599
384	NC_009092	ACTCT	2	10	756514	756523	20 %	40 %	0 %	40 %	127511599
385	NC_009092	GCGCG	2	10	756985	756994	0 %	0 %	60 %	40 %	127511599
386	NC_009092	AGATA	2	10	757500	757509	60 %	20 %	20 %	0 %	127511600
387	NC_009092	TGGAG	2	10	759483	759492	20 %	20 %	60 %	0 %	127511601
388	NC_009092	GCTGA	2	10	762362	762371	20 %	20 %	40 %	20 %	127511603
389	NC_009092	GATAG	2	10	764247	764256	40 %	20 %	40 %	0 %	127511605
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