MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 13823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	126697567
2	NC_009089	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	126697567
3	NC_009089	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	126697567
4	NC_009089	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	126697567
5	NC_009089	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
6	NC_009089	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
7	NC_009089	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	400927236
8	NC_009089	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	400927236
9	NC_009089	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	400927236
10	NC_009089	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	126697570
11	NC_009089	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
12	NC_009089	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	126697570
13	NC_009089	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	126697570
14	NC_009089	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
15	NC_009089	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	126697571
16	NC_009089	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	126697571
17	NC_009089	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	126697571
18	NC_009089	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	126697571
19	NC_009089	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
20	NC_009089	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
21	NC_009089	TGAG	2	8	6217	6224	25 %	25 %	50 %	0 %	126697572
22	NC_009089	GATA	2	8	6653	6660	50 %	25 %	25 %	0 %	126697572
23	NC_009089	AAAG	2	8	6738	6745	75 %	0 %	25 %	0 %	126697572
24	NC_009089	AGTT	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	126697572
25	NC_009089	TAAA	2	8	7168	7175	75 %	25 %	0 %	0 %	126697572
26	NC_009089	ATAA	2	8	7953	7960	75 %	25 %	0 %	0 %	126697572
27	NC_009089	GTAA	2	8	8196	8203	50 %	25 %	25 %	0 %	126697572
28	NC_009089	AATG	2	8	8856	8863	50 %	25 %	25 %	0 %	126697573
29	NC_009089	ATTT	2	8	8920	8927	25 %	75 %	0 %	0 %	126697574
30	NC_009089	ATAA	2	8	8947	8954	75 %	25 %	0 %	0 %	126697574
31	NC_009089	TAAT	2	8	9062	9069	50 %	50 %	0 %	0 %	126697574
32	NC_009089	AAAT	2	8	9164	9171	75 %	25 %	0 %	0 %	126697575
33	NC_009089	AAAT	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	126697575
34	NC_009089	AAGA	2	8	9392	9399	75 %	0 %	25 %	0 %	126697575
35	NC_009089	GATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	25 %	0 %	126697577
36	NC_009089	AGAT	2	8	10501	10508	50 %	25 %	25 %	0 %	126697577
37	NC_009089	AAAC	2	8	10757	10764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009089	GTGA	2	8	11204	11211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009089	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009089	GAAG	2	8	13034	13041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009089	AGAA	2	8	13042	13049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009089	GGTG	2	8	14472	14479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009089	CGTA	2	8	15138	15145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009089	ATTT	2	8	15722	15729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009089	TTCA	2	8	15734	15741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009089	TGAA	2	8	16609	16616	50 %	25 %	25 %	0 %	126697579
47	NC_009089	TAAT	2	8	17147	17154	50 %	50 %	0 %	0 %	126697579
48	NC_009089	TTAA	2	8	17498	17505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009089	CAAG	2	8	19029	19036	50 %	0 %	25 %	25 %	126697580
50	NC_009089	AAAT	2	8	19218	19225	75 %	25 %	0 %	0 %	126697580
51	NC_009089	AATA	2	8	19284	19291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009089	TAAA	2	8	19464	19471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009089	GGAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009089	ATGT	2	8	21135	21142	25 %	50 %	25 %	0 %	126697582
55	NC_009089	AGAT	2	8	21158	21165	50 %	25 %	25 %	0 %	126697582
56	NC_009089	AGTG	2	8	22050	22057	25 %	25 %	50 %	0 %	126697582
57	NC_009089	CAAG	2	8	22460	22467	50 %	0 %	25 %	25 %	126697583
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59	NC_009089	GAAA	2	8	23307	23314	75 %	0 %	25 %	0 %	400927237
60	NC_009089	TATT	2	8	23550	23557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009089	TCAT	2	8	23871	23878	25 %	50 %	0 %	25 %	126697585
62	NC_009089	ACAT	2	8	23900	23907	50 %	25 %	0 %	25 %	126697585
63	NC_009089	AGAA	2	8	24101	24108	75 %	0 %	25 %	0 %	126697585
64	NC_009089	CTAT	2	8	24636	24643	25 %	50 %	0 %	25 %	126697585
65	NC_009089	AAGT	2	8	24682	24689	50 %	25 %	25 %	0 %	126697585
66	NC_009089	GAAA	2	8	24898	24905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009089	AATT	2	8	24910	24917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009089	TAAA	2	8	24950	24957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009089	ATAA	2	8	25071	25078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009089	AAAC	2	8	25212	25219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009089	GTGA	2	8	25659	25666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009089	GAAG	2	8	27246	27253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009089	AGAA	2	8	27254	27261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009089	GGTG	2	8	28684	28691	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009089	CGTA	2	8	29350	29357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009089	TTTG	2	8	31101	31108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_009089	AATA	2	8	36096	36103	75 %	25 %	0 %	0 %	126697587
81	NC_009089	ATTT	2	8	36236	36243	25 %	75 %	0 %	0 %	126697587
82	NC_009089	GAAG	2	8	36385	36392	50 %	0 %	50 %	0 %	126697587
83	NC_009089	ATCA	2	8	36491	36498	50 %	25 %	0 %	25 %	126697587
84	NC_009089	ATTT	2	8	37247	37254	25 %	75 %	0 %	0 %	126697587
85	NC_009089	TAAA	2	8	37886	37893	75 %	25 %	0 %	0 %	126697587
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87	NC_009089	AGCA	2	8	38100	38107	50 %	0 %	25 %	25 %	126697587
88	NC_009089	TCAA	2	8	38236	38243	50 %	25 %	0 %	25 %	126697587
89	NC_009089	AAAT	2	8	38307	38314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009089	TATT	2	8	38362	38369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009089	TTAA	2	8	38370	38377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009089	GGTG	2	8	38527	38534	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009089	AACT	2	8	38859	38866	50 %	25 %	0 %	25 %	400927238
94	NC_009089	TAAA	2	8	38892	38899	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
95	NC_009089	ATAA	2	8	39419	39426	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
96	NC_009089	AGAT	2	8	39588	39595	50 %	25 %	25 %	0 %	400927238
97	NC_009089	TAAA	2	8	39669	39676	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
98	NC_009089	ATAA	2	8	40250	40257	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
99	NC_009089	GCTA	2	8	40450	40457	25 %	25 %	25 %	25 %	400927238
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102	NC_009089	AAAG	2	8	40626	40633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009089	AATA	2	8	40755	40762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009089	TAAT	2	8	40780	40787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009089	AAAG	2	8	40883	40890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009089	AAAT	2	8	41036	41043	75 %	25 %	0 %	0 %	126697589
107	NC_009089	ATAG	2	8	41068	41075	50 %	25 %	25 %	0 %	126697589
108	NC_009089	AGTG	2	8	41479	41486	25 %	25 %	50 %	0 %	126697590
109	NC_009089	TAGA	2	8	41801	41808	50 %	25 %	25 %	0 %	126697590
110	NC_009089	GCTA	2	8	41937	41944	25 %	25 %	25 %	25 %	126697591
111	NC_009089	AAAT	2	8	41970	41977	75 %	25 %	0 %	0 %	126697591
112	NC_009089	GAAC	2	8	42478	42485	50 %	0 %	25 %	25 %	126697591
113	NC_009089	AAAT	2	8	43198	43205	75 %	25 %	0 %	0 %	126697592
114	NC_009089	TTAT	2	8	43754	43761	25 %	75 %	0 %	0 %	126697592
115	NC_009089	AGCC	2	8	43833	43840	25 %	0 %	25 %	50 %	126697592
116	NC_009089	AGAA	2	8	43921	43928	75 %	0 %	25 %	0 %	126697592
117	NC_009089	CAGA	2	8	44079	44086	50 %	0 %	25 %	25 %	126697592
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119	NC_009089	GAAA	2	8	44995	45002	75 %	0 %	25 %	0 %	126697592
120	NC_009089	CACT	2	8	45074	45081	25 %	25 %	0 %	50 %	126697592
121	NC_009089	AATT	2	8	45186	45193	50 %	50 %	0 %	0 %	126697592
122	NC_009089	ATGT	2	8	45563	45570	25 %	50 %	25 %	0 %	126697593
123	NC_009089	CAGT	2	8	45707	45714	25 %	25 %	25 %	25 %	126697593
124	NC_009089	TAGA	2	8	45770	45777	50 %	25 %	25 %	0 %	126697593
125	NC_009089	AATA	2	8	46910	46917	75 %	25 %	0 %	0 %	126697593
126	NC_009089	ATGG	2	8	47130	47137	25 %	25 %	50 %	0 %	126697594
127	NC_009089	AAAC	2	8	47259	47266	75 %	0 %	0 %	25 %	126697594
128	NC_009089	AGTA	2	8	47567	47574	50 %	25 %	25 %	0 %	126697594
129	NC_009089	TAAA	2	8	48263	48270	75 %	25 %	0 %	0 %	126697595
130	NC_009089	TATT	2	8	48373	48380	25 %	75 %	0 %	0 %	126697595
131	NC_009089	ATTT	2	8	48488	48495	25 %	75 %	0 %	0 %	126697595
132	NC_009089	AGAA	2	8	48770	48777	75 %	0 %	25 %	0 %	126697595
133	NC_009089	TAAA	2	8	48896	48903	75 %	25 %	0 %	0 %	126697595
134	NC_009089	ATTT	3	12	49224	49235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009089	TCTT	2	8	49317	49324	0 %	75 %	0 %	25 %	126697596
136	NC_009089	TAAA	2	8	49885	49892	75 %	25 %	0 %	0 %	126697596
137	NC_009089	ATTG	2	8	49937	49944	25 %	50 %	25 %	0 %	126697596
138	NC_009089	GATG	2	8	50372	50379	25 %	25 %	50 %	0 %	126697596
139	NC_009089	TTTA	2	8	50480	50487	25 %	75 %	0 %	0 %	126697596
140	NC_009089	TTAC	2	8	50871	50878	25 %	50 %	0 %	25 %	126697596
141	NC_009089	AGAT	2	8	51028	51035	50 %	25 %	25 %	0 %	126697596
142	NC_009089	AGCT	2	8	51211	51218	25 %	25 %	25 %	25 %	126697596
143	NC_009089	GATG	2	8	51308	51315	25 %	25 %	50 %	0 %	126697596
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