MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 3351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	AAAC	2	8	10757	10764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009089	GTGA	2	8	11204	11211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009089	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009089	GAAG	2	8	13034	13041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009089	AGAA	2	8	13042	13049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009089	GGTG	2	8	14472	14479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009089	CGTA	2	8	15138	15145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009089	ATTT	2	8	15722	15729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009089	TTCA	2	8	15734	15741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009089	TTAA	2	8	17498	17505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009089	AATA	2	8	19284	19291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009089	TAAA	2	8	19464	19471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009089	GGAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009089	TATT	2	8	23550	23557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009089	GAAA	2	8	24898	24905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009089	AATT	2	8	24910	24917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009089	TAAA	2	8	24950	24957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009089	ATAA	2	8	25071	25078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009089	AAAC	2	8	25212	25219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009089	GTGA	2	8	25659	25666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009089	GAAG	2	8	27246	27253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009089	AGAA	2	8	27254	27261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009089	GGTG	2	8	28684	28691	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009089	CGTA	2	8	29350	29357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009089	TTTG	2	8	31101	31108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009089	ACAA	2	8	34840	34847	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009089	AAAT	2	8	38307	38314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009089	TATT	2	8	38362	38369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009089	TTAA	2	8	38370	38377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009089	GGTG	2	8	38527	38534	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009089	AAAT	2	8	40475	40482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009089	TAAT	2	8	40490	40497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009089	AAAG	2	8	40626	40633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009089	AATA	2	8	40755	40762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009089	TAAT	2	8	40780	40787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009089	AAAG	2	8	40883	40890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009089	ATTT	3	12	49224	49235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009089	ATAA	2	8	51638	51645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009089	TTAA	2	8	57057	57064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009089	TGGT	2	8	57171	57178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009089	AATT	2	8	57231	57238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009089	AGAT	2	8	58428	58435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009089	TTAA	2	8	61621	61628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009089	ACTT	2	8	63456	63463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009089	ATTT	2	8	63489	63496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009089	TCAA	2	8	69596	69603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009089	AAAT	2	8	75091	75098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009089	TAAA	2	8	76568	76575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009089	AATA	2	8	76770	76777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009089	AAAT	2	8	76816	76823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009089	AAAG	2	8	76830	76837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009089	TAAA	2	8	76889	76896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009089	ATAA	2	8	78602	78609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009089	AATT	2	8	83686	83693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009089	AAAG	2	8	88562	88569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009089	AAAG	2	8	88583	88590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009089	TAAA	2	8	88787	88794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009089	TAAT	2	8	88805	88812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009089	ATTT	2	8	89808	89815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009089	TAAT	2	8	93880	93887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009089	GTAA	2	8	97595	97602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009089	TCAG	2	8	97615	97622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009089	TGAT	2	8	98125	98132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009089	TAAT	2	8	100832	100839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009089	ATTT	2	8	105320	105327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009089	AAGG	2	8	106852	106859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009089	GTTA	2	8	114946	114953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009089	TTTA	2	8	122690	122697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009089	AATA	2	8	123066	123073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009089	AAAC	2	8	124097	124104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009089	GTGA	2	8	124544	124551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009089	GTTT	2	8	125914	125921	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009089	GAAG	2	8	126373	126380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009089	AGAA	2	8	126381	126388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009089	GGTG	2	8	127811	127818	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009089	CGTA	2	8	128477	128484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009089	TCAT	2	8	129072	129079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009089	AAAG	2	8	129898	129905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009089	AAAC	2	8	131044	131051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009089	GTGA	2	8	131491	131498	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009089	GTTT	2	8	132861	132868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009089	GAAG	2	8	133320	133327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009089	AGAA	2	8	133328	133335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009089	GGTG	2	8	134758	134765	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009089	CGTA	2	8	135424	135431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009089	TTCA	2	8	136019	136026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009089	TTAC	2	8	136400	136407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009089	ATAA	2	8	140936	140943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009089	AATT	2	8	141139	141146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009089	ATAA	2	8	141202	141209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009089	ATCT	2	8	141365	141372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009089	CAAA	2	8	141594	141601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009089	AAAC	2	8	141654	141661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009089	GTGA	2	8	142101	142108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009089	GTTT	2	8	143471	143478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009089	GAAG	2	8	143869	143876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009089	AGAA	2	8	143877	143884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009089	GGTG	2	8	145307	145314	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009089	CGTA	2	8	145973	145980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009089	TCAT	2	8	146568	146575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009089	AAAC	2	8	147109	147116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009089	GTGA	2	8	147556	147563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009089	GAAG	2	8	149263	149270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009089	AGAA	2	8	149271	149278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009089	GGTG	2	8	150701	150708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009089	CGTA	2	8	151367	151374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009089	ATTT	2	8	151951	151958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009089	TTCA	2	8	151963	151970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009089	TTTA	2	8	153041	153048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009089	TAAA	2	8	153366	153373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009089	TATT	2	8	153765	153772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009089	TAAA	2	8	156133	156140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009089	ATTT	2	8	171768	171775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009089	TAAA	2	8	171855	171862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009089	AGAT	2	8	174024	174031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009089	AATA	2	8	174366	174373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009089	ATTA	2	8	185215	185222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009089	TAAA	2	8	188065	188072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009089	GAAA	2	8	188181	188188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009089	AGAT	2	8	188189	188196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009089	TATT	2	8	188219	188226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009089	TAAA	2	8	188359	188366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009089	ATAA	2	8	188459	188466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009089	ATAA	2	8	189176	189183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009089	TATG	2	8	195366	195373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009089	ATAA	2	8	196857	196864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009089	GTTT	2	8	196875	196882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009089	ATTT	2	8	197622	197629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009089	TGAT	2	8	197650	197657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009089	TAAT	2	8	199027	199034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009089	AAAT	2	8	201815	201822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009089	TAAT	2	8	207854	207861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009089	AATA	2	8	208019	208026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009089	CATA	2	8	208058	208065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009089	ATGA	2	8	208129	208136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009089	AATT	2	8	208430	208437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009089	GCAG	2	8	208468	208475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009089	TAAA	2	8	208728	208735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009089	AGTT	2	8	208836	208843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009089	TTTA	2	8	208850	208857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009089	ATTT	2	8	208920	208927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009089	TTAT	2	8	208940	208947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009089	ATTA	2	8	209058	209065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009089	TAAA	2	8	209408	209415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009089	GTAA	2	8	209955	209962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009089	TACT	2	8	210149	210156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009089	ATTT	2	8	210251	210258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009089	AATA	2	8	210259	210266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009089	ATAA	2	8	210298	210305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009089	TAAA	2	8	210478	210485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009089	TAAA	2	8	210582	210589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009089	TAAA	2	8	210837	210844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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