MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 10472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	126697567
2	NC_009089	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	126697567
3	NC_009089	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	126697567
4	NC_009089	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	126697567
5	NC_009089	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
6	NC_009089	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
7	NC_009089	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	400927236
8	NC_009089	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	400927236
9	NC_009089	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	400927236
10	NC_009089	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	126697570
11	NC_009089	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
12	NC_009089	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	126697570
13	NC_009089	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	126697570
14	NC_009089	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
15	NC_009089	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	126697571
16	NC_009089	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	126697571
17	NC_009089	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	126697571
18	NC_009089	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	126697571
19	NC_009089	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
20	NC_009089	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
21	NC_009089	TGAG	2	8	6217	6224	25 %	25 %	50 %	0 %	126697572
22	NC_009089	GATA	2	8	6653	6660	50 %	25 %	25 %	0 %	126697572
23	NC_009089	AAAG	2	8	6738	6745	75 %	0 %	25 %	0 %	126697572
24	NC_009089	AGTT	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	126697572
25	NC_009089	TAAA	2	8	7168	7175	75 %	25 %	0 %	0 %	126697572
26	NC_009089	ATAA	2	8	7953	7960	75 %	25 %	0 %	0 %	126697572
27	NC_009089	GTAA	2	8	8196	8203	50 %	25 %	25 %	0 %	126697572
28	NC_009089	AATG	2	8	8856	8863	50 %	25 %	25 %	0 %	126697573
29	NC_009089	ATTT	2	8	8920	8927	25 %	75 %	0 %	0 %	126697574
30	NC_009089	ATAA	2	8	8947	8954	75 %	25 %	0 %	0 %	126697574
31	NC_009089	TAAT	2	8	9062	9069	50 %	50 %	0 %	0 %	126697574
32	NC_009089	AAAT	2	8	9164	9171	75 %	25 %	0 %	0 %	126697575
33	NC_009089	AAAT	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	126697575
34	NC_009089	AAGA	2	8	9392	9399	75 %	0 %	25 %	0 %	126697575
35	NC_009089	GATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	25 %	0 %	126697577
36	NC_009089	AGAT	2	8	10501	10508	50 %	25 %	25 %	0 %	126697577
37	NC_009089	TGAA	2	8	16609	16616	50 %	25 %	25 %	0 %	126697579
38	NC_009089	TAAT	2	8	17147	17154	50 %	50 %	0 %	0 %	126697579
39	NC_009089	CAAG	2	8	19029	19036	50 %	0 %	25 %	25 %	126697580
40	NC_009089	AAAT	2	8	19218	19225	75 %	25 %	0 %	0 %	126697580
41	NC_009089	ATGT	2	8	21135	21142	25 %	50 %	25 %	0 %	126697582
42	NC_009089	AGAT	2	8	21158	21165	50 %	25 %	25 %	0 %	126697582
43	NC_009089	AGTG	2	8	22050	22057	25 %	25 %	50 %	0 %	126697582
44	NC_009089	CAAG	2	8	22460	22467	50 %	0 %	25 %	25 %	126697583
45	NC_009089	ATGG	2	8	22871	22878	25 %	25 %	50 %	0 %	126697584
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50	NC_009089	CTAT	2	8	24636	24643	25 %	50 %	0 %	25 %	126697585
51	NC_009089	AAGT	2	8	24682	24689	50 %	25 %	25 %	0 %	126697585
52	NC_009089	ATGG	2	8	35065	35072	25 %	25 %	50 %	0 %	126697587
53	NC_009089	CAAA	2	8	35321	35328	75 %	0 %	0 %	25 %	126697587
54	NC_009089	AATA	2	8	36096	36103	75 %	25 %	0 %	0 %	126697587
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60	NC_009089	ATGA	2	8	38077	38084	50 %	25 %	25 %	0 %	126697587
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62	NC_009089	TCAA	2	8	38236	38243	50 %	25 %	0 %	25 %	126697587
63	NC_009089	AACT	2	8	38859	38866	50 %	25 %	0 %	25 %	400927238
64	NC_009089	TAAA	2	8	38892	38899	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
65	NC_009089	ATAA	2	8	39419	39426	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
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67	NC_009089	TAAA	2	8	39669	39676	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
68	NC_009089	ATAA	2	8	40250	40257	75 %	25 %	0 %	0 %	400927238
69	NC_009089	GCTA	2	8	40450	40457	25 %	25 %	25 %	25 %	400927238
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80	NC_009089	AGAA	2	8	43921	43928	75 %	0 %	25 %	0 %	126697592
81	NC_009089	CAGA	2	8	44079	44086	50 %	0 %	25 %	25 %	126697592
82	NC_009089	TTGA	2	8	44111	44118	25 %	50 %	25 %	0 %	126697592
83	NC_009089	GAAA	2	8	44995	45002	75 %	0 %	25 %	0 %	126697592
84	NC_009089	CACT	2	8	45074	45081	25 %	25 %	0 %	50 %	126697592
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103	NC_009089	TTAC	2	8	50871	50878	25 %	50 %	0 %	25 %	126697596
104	NC_009089	AGAT	2	8	51028	51035	50 %	25 %	25 %	0 %	126697596
105	NC_009089	AGCT	2	8	51211	51218	25 %	25 %	25 %	25 %	126697596
106	NC_009089	GATG	2	8	51308	51315	25 %	25 %	50 %	0 %	126697596
107	NC_009089	TTTA	2	8	51414	51421	25 %	75 %	0 %	0 %	126697596
108	NC_009089	TTAA	2	8	51786	51793	50 %	50 %	0 %	0 %	126697597
109	NC_009089	TAAG	2	8	51836	51843	50 %	25 %	25 %	0 %	126697597
110	NC_009089	TAAT	2	8	51936	51943	50 %	50 %	0 %	0 %	126697597
111	NC_009089	TACA	2	8	53055	53062	50 %	25 %	0 %	25 %	126697598
112	NC_009089	AGAA	2	8	53233	53240	75 %	0 %	25 %	0 %	126697598
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121	NC_009089	TTAT	2	8	56055	56062	25 %	75 %	0 %	0 %	126697600
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123	NC_009089	TTTA	2	8	56368	56375	25 %	75 %	0 %	0 %	126697600
124	NC_009089	TATT	2	8	56418	56425	25 %	75 %	0 %	0 %	126697600
125	NC_009089	CCTA	2	8	56929	56936	25 %	25 %	0 %	50 %	126697600
126	NC_009089	ATGA	2	8	58144	58151	50 %	25 %	25 %	0 %	126697601
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131	NC_009089	CAAT	2	8	59336	59343	50 %	25 %	0 %	25 %	126697602
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