MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 67039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697567
2	NC_009089	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697567
3	NC_009089	TGC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126697567
4	NC_009089	GGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697567
5	NC_009089	TCA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126697567
6	NC_009089	AGT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697567
7	NC_009089	TTC	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
8	NC_009089	GAA	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
9	NC_009089	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697567
10	NC_009089	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
11	NC_009089	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
12	NC_009089	TTC	2	6	951	956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
13	NC_009089	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697567
14	NC_009089	GAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
15	NC_009089	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
16	NC_009089	ACA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697567
17	NC_009089	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
18	NC_009089	GAA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
19	NC_009089	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009089	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009089	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009089	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009089	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009089	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009089	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400927236
26	NC_009089	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400927236
27	NC_009089	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400927236
28	NC_009089	AGA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
29	NC_009089	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
30	NC_009089	TGT	3	9	1759	1767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
31	NC_009089	TTG	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
32	NC_009089	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400927236
33	NC_009089	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400927236
34	NC_009089	GAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
35	NC_009089	TAG	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
36	NC_009089	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
37	NC_009089	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400927236
38	NC_009089	CAG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400927236
39	NC_009089	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
40	NC_009089	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400927236
41	NC_009089	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
42	NC_009089	ATC	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400927236
43	NC_009089	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009089	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697569
45	NC_009089	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697569
46	NC_009089	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697569
47	NC_009089	ATG	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697569
48	NC_009089	AAG	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697569
49	NC_009089	TTG	2	6	3111	3116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697570
50	NC_009089	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
51	NC_009089	GGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697570
52	NC_009089	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
53	NC_009089	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
54	NC_009089	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126697570
55	NC_009089	TGT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697570
56	NC_009089	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
57	NC_009089	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
58	NC_009089	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
59	NC_009089	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
60	NC_009089	TGA	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
61	NC_009089	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697570
62	NC_009089	TAA	2	6	3921	3926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
63	NC_009089	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697570
64	NC_009089	GAT	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
65	NC_009089	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
66	NC_009089	TGA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
67	NC_009089	TTA	2	6	4116	4121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
68	NC_009089	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697570
69	NC_009089	GTA	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
70	NC_009089	ATA	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697571
71	NC_009089	AGG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697571
72	NC_009089	GGA	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697571
73	NC_009089	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
74	NC_009089	TGA	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
75	NC_009089	GGT	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126697571
76	NC_009089	ATG	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
77	NC_009089	TGA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
78	NC_009089	GGT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126697571
79	NC_009089	AGC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697571
80	NC_009089	ATG	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
81	NC_009089	CAG	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697571
82	NC_009089	TGA	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
83	NC_009089	AGA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697571
84	NC_009089	TAT	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697571
85	NC_009089	TTC	2	6	5678	5683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697571
86	NC_009089	GCA	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697571
87	NC_009089	AAG	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697571
88	NC_009089	TTA	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697571
89	NC_009089	GAA	2	6	5820	5825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697571
90	NC_009089	AAC	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697571
91	NC_009089	TTA	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697571
92	NC_009089	AGA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697571
93	NC_009089	TGC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126697571
94	NC_009089	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697571
95	NC_009089	GAA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
96	NC_009089	GAA	2	6	6105	6110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
97	NC_009089	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697572
98	NC_009089	AGA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
99	NC_009089	TTG	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697572
100	NC_009089	CTG	2	6	6310	6315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126697572
101	NC_009089	TAT	2	6	6318	6323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697572
102	NC_009089	TAG	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
103	NC_009089	GCT	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126697572
104	NC_009089	ACT	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126697572
105	NC_009089	TGA	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
106	NC_009089	TTA	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697572
107	NC_009089	GAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
108	NC_009089	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
109	NC_009089	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
110	NC_009089	ATA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
111	NC_009089	AAT	2	6	7011	7016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
112	NC_009089	TAA	2	6	7054	7059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
113	NC_009089	AAG	2	6	7132	7137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
114	NC_009089	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697572
115	NC_009089	AAG	2	6	7148	7153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
116	NC_009089	ATA	2	6	7222	7227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
117	NC_009089	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
118	NC_009089	AAG	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
119	NC_009089	TGA	2	6	7436	7441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
120	NC_009089	TAA	2	6	7459	7464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
121	NC_009089	AAT	2	6	7478	7483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697572
122	NC_009089	TGA	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
123	NC_009089	TGA	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
124	NC_009089	AGA	3	9	7676	7684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
125	NC_009089	TAG	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
126	NC_009089	TAT	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697572
127	NC_009089	CAG	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697572
128	NC_009089	ATG	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697572
129	NC_009089	TTA	2	6	7893	7898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697572
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131	NC_009089	AAG	2	6	8032	8037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697572
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