MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 chromosome

Total Repeats: 1215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009085	CTTTAA	2	12	3303488	3303499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126642878
1002	NC_009085	GTAAAG	2	12	3303608	3303619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126642878
1003	NC_009085	CACAAA	2	12	3307293	3307304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126642883
1004	NC_009085	AGGTGC	2	12	3307681	3307692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126642883
1005	NC_009085	AGGCTT	2	12	3308256	3308267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126642884
1006	NC_009085	CATGGA	2	12	3309870	3309881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162286722
1007	NC_009085	TCTGCT	2	12	3315653	3315664	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126642890
1008	NC_009085	TCTGCT	2	12	3315770	3315781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126642890
1009	NC_009085	GCTGTA	2	12	3316185	3316196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126642890
1010	NC_009085	CCGCTG	2	12	3321146	3321157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126642896
1011	NC_009085	ACAGAT	2	12	3326344	3326355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126642901
1012	NC_009085	TTGAAG	2	12	3328376	3328387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126642903
1013	NC_009085	TATGAA	2	12	3333295	3333306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126642908
1014	NC_009085	CACCTT	2	12	3333397	3333408	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126642908
1015	NC_009085	TCAATG	2	12	3336211	3336222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126642910
1016	NC_009085	TAAAAT	2	12	3345377	3345388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126642917
1017	NC_009085	ATTAAA	2	12	3348678	3348689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126642920
1018	NC_009085	AGGTAA	2	12	3349300	3349311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126642921
1019	NC_009085	TTAAAT	2	12	3349683	3349694	50 %	50 %	0 %	0 %	126642921
1020	NC_009085	TGCTTT	2	12	3356781	3356792	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	229577089
1021	NC_009085	ACTTTT	2	12	3358831	3358842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126642929
1022	NC_009085	TCATCG	2	12	3360978	3360989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126642930
1023	NC_009085	GAATTA	2	12	3363983	3363994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126642931
1024	NC_009085	AGTAAA	2	12	3364099	3364110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126642931
1025	NC_009085	GAAATA	2	12	3364331	3364342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126642931
1026	NC_009085	TTTCAT	2	12	3364737	3364748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126642931
1027	NC_009085	ATCGCT	2	12	3372670	3372681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126642933
1028	NC_009085	TAAAAA	2	12	3375271	3375282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126642935
1029	NC_009085	GTAATG	2	12	3376931	3376942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162286720
1030	NC_009085	TTCCGG	2	12	3380026	3380037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126642940
1031	NC_009085	TGATAA	2	12	3388832	3388843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126642950
1032	NC_009085	CAAAAT	2	12	3394297	3394308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	126642952
1033	NC_009085	TAATGA	2	12	3394497	3394508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126642952
1034	NC_009085	ATTTAC	2	12	3396101	3396112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126642953
1035	NC_009085	GCTGTT	2	12	3396253	3396264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126642953
1036	NC_009085	ATTTTA	2	12	3396676	3396687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126642953
1037	NC_009085	GCTGCC	2	12	3399781	3399792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126642955
1038	NC_009085	GCTGTT	2	12	3405038	3405049	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126642958
1039	NC_009085	AATTTC	2	12	3405984	3405995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126642959
1040	NC_009085	ACGTGG	2	12	3406485	3406496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126642959
1041	NC_009085	TTCTTT	2	12	3408335	3408346	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126642960
1042	NC_009085	CTTTTG	2	12	3408416	3408427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	126642960
1043	NC_009085	ACTCAA	2	12	3409562	3409573	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126642961
1044	NC_009085	CCAGTT	2	12	3410613	3410624	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126642962
1045	NC_009085	CCAATT	2	12	3411974	3411985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126642962
1046	NC_009085	CTTCTA	2	12	3413632	3413643	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126642964
1047	NC_009085	GTAAAG	2	12	3428429	3428440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126642968
1048	NC_009085	AACAGC	2	12	3430245	3430256	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126642969
1049	NC_009085	GTAGCA	2	12	3445597	3445608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126642978
1050	NC_009085	TATGGT	2	12	3447338	3447349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126642980
1051	NC_009085	ACATCT	2	12	3455198	3455209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126642984
1052	NC_009085	AAAAGC	2	12	3458095	3458106	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126642987
1053	NC_009085	TTTTAT	2	12	3459954	3459965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	126642989
1054	NC_009085	AAGCAA	2	12	3460568	3460579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126642990
1055	NC_009085	TTTATT	2	12	3460868	3460879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	126642990
1056	NC_009085	ATACTT	2	12	3464882	3464893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126642993
1057	NC_009085	TCTAAA	2	12	3465783	3465794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126642994
1058	NC_009085	TTGAAG	2	12	3466552	3466563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126642995
1059	NC_009085	GTGATG	9	54	3468391	3468444	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126642998
1060	NC_009085	TCATTG	2	12	3481936	3481947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126643014
1061	NC_009085	AAACTT	2	12	3485004	3485015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126643018
1062	NC_009085	AACAAA	2	12	3487278	3487289	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	126643021
1063	NC_009085	GTTCAA	2	12	3490949	3490960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126643025
1064	NC_009085	CAGTAG	2	12	3496347	3496358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126643029
1065	NC_009085	AGACTT	2	12	3515943	3515954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126643044
1066	NC_009085	TTCAGC	2	12	3518029	3518040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126643047
1067	NC_009085	AGCTTA	2	12	3523754	3523765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126643053
1068	NC_009085	GAGGTA	2	12	3524143	3524154	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126643053
1069	NC_009085	CAACTG	2	12	3530177	3530188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126643058
1070	NC_009085	AAAAAG	2	12	3534356	3534367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	126643060
1071	NC_009085	TACCAA	2	12	3537468	3537479	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126643064
1072	NC_009085	AAAAGA	2	12	3540116	3540127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	126643065
1073	NC_009085	ATATTT	2	12	3541087	3541098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643066
1074	NC_009085	TACGAG	2	12	3546205	3546216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126643070
1075	NC_009085	CTTTAG	2	12	3546292	3546303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126643070
1076	NC_009085	ACCTTT	2	12	3552017	3552028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	395342369
1077	NC_009085	AAGGTT	2	12	3552179	3552190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395342369
1078	NC_009085	ACCAAC	2	12	3552221	3552232	50 %	0 %	0 %	50 %	395342369
1079	NC_009085	AGCAGG	2	12	3555536	3555547	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	395342366
1080	NC_009085	ACCTTT	2	12	3558873	3558884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	395342364
1081	NC_009085	TGGTTA	2	12	3565418	3565429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126643102
1082	NC_009085	ATCTTT	2	12	3566975	3566986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126643104
1083	NC_009085	AGAGCT	2	12	3567383	3567394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126643104
1084	NC_009085	AAAAAT	2	12	3578082	3578093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126643113
1085	NC_009085	AAACCT	2	12	3584336	3584347	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126643119
1086	NC_009085	CTATTT	2	12	3589235	3589246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126643123
1087	NC_009085	ATTTTA	2	12	3590189	3590200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577087
1088	NC_009085	GCTACA	2	12	3591872	3591883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126643125
1089	NC_009085	AAATTA	2	12	3599871	3599882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643132
1090	NC_009085	ACTTCC	2	12	3602082	3602093	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126643133
1091	NC_009085	CGTTTA	2	12	3604341	3604352	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126643134
1092	NC_009085	AGATTT	2	12	3606052	3606063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126643136
1093	NC_009085	ACATTC	2	12	3606348	3606359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126643136
1094	NC_009085	ACTACA	2	12	3608118	3608129	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126643138
1095	NC_009085	TTTAGT	2	12	3610785	3610796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	126643141
1096	NC_009085	AATGCA	2	12	3613072	3613083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126643142
1097	NC_009085	AACCTA	2	12	3614237	3614248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	162286718
1098	NC_009085	ACGTAA	2	12	3614433	3614444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162286718
1099	NC_009085	CTTTCA	2	12	3615621	3615632	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126643145
1100	NC_009085	AATTTA	2	12	3623684	3623695	50 %	50 %	0 %	0 %	126643151
1101	NC_009085	ATCTTT	2	12	3626507	3626518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126643154
1102	NC_009085	GTAAAG	2	12	3628122	3628133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126643156
1103	NC_009085	CTAAAG	2	12	3633862	3633873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126643161
1104	NC_009085	AAAATT	2	12	3635768	3635779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643164
1105	NC_009085	CTAAAA	2	12	3637025	3637036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	126643166
1106	NC_009085	TGCTTC	2	12	3639252	3639263	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126643167
1107	NC_009085	CGCGTA	2	12	3639307	3639318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126643167
1108	NC_009085	CAATCA	2	12	3642354	3642365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126643172
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1110	NC_009085	CTTCTG	2	12	3642808	3642819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126643173
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.