MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmid pAB2

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009084	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640110
2	NC_009084	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126640110
3	NC_009084	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640110
4	NC_009084	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
5	NC_009084	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
6	NC_009084	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
7	NC_009084	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
8	NC_009084	AAG	2	6	3211	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640111
9	NC_009084	AGG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126640111
10	NC_009084	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640111
11	NC_009084	TGC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
12	NC_009084	CAT	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
13	NC_009084	GCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
14	NC_009084	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
15	NC_009084	GCA	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
16	NC_009084	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640111
17	NC_009084	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
18	NC_009084	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
19	NC_009084	ATG	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
20	NC_009084	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640112
21	NC_009084	GCA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
22	NC_009084	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
23	NC_009084	AAG	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
24	NC_009084	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
25	NC_009084	TGG	4	12	4647	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
26	NC_009084	TGC	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
27	NC_009084	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
28	NC_009084	CAT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
29	NC_009084	AGC	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
30	NC_009084	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
31	NC_009084	TCA	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
32	NC_009084	TGG	3	9	5106	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
33	NC_009084	TAC	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
34	NC_009084	TGA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
35	NC_009084	TAT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
36	NC_009084	AAT	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
37	NC_009084	GTG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640113
38	NC_009084	CAG	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
39	NC_009084	CTC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
40	NC_009084	AGA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
41	NC_009084	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
42	NC_009084	ATG	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
43	NC_009084	TAT	2	6	7115	7120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
44	NC_009084	TCA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
45	NC_009084	ACT	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
46	NC_009084	ATT	2	6	7320	7325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
47	NC_009084	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
48	NC_009084	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
49	NC_009084	ACC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640113
50	NC_009084	CAG	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
51	NC_009084	TAA	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
52	NC_009084	TAA	2	6	7714	7719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
53	NC_009084	CTA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
54	NC_009084	AAT	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
55	NC_009084	GAT	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
56	NC_009084	CTG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640113
57	NC_009084	CCT	2	6	8309	8314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
58	NC_009084	TGA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
59	NC_009084	ATA	2	6	8397	8402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
60	NC_009084	AAT	2	6	8507	8512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
61	NC_009084	GAA	2	6	8571	8576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
62	NC_009084	AGA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
63	NC_009084	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
64	NC_009084	AGC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640114
65	NC_009084	ATT	2	6	8953	8958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
66	NC_009084	ATA	2	6	9090	9095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640114
67	NC_009084	ATT	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
68	NC_009084	GAA	2	6	9152	9157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
69	NC_009084	TAT	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
70	NC_009084	TAT	2	6	9197	9202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
71	NC_009084	CAC	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640114

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.