MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei 1106a chromosome II

Total Repeats: 3995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009078	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	126455556
2	NC_009078	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	126458031
3	NC_009078	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	126458031
4	NC_009078	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	126458031
5	NC_009078	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	126457336
6	NC_009078	CGGGC	2	10	4972	4981	0 %	0 %	60 %	40 %	126458436
7	NC_009078	CGCAT	2	10	6064	6073	20 %	20 %	20 %	40 %	126457544
8	NC_009078	TCGAA	2	10	7219	7228	40 %	20 %	20 %	20 %	126455905
9	NC_009078	ACGCG	2	10	7616	7625	20 %	0 %	40 %	40 %	126455905
10	NC_009078	CGACG	2	10	10157	10166	20 %	0 %	40 %	40 %	126457861
11	NC_009078	GTGCC	2	10	10383	10392	0 %	20 %	40 %	40 %	126457861
12	NC_009078	GCACG	2	10	10532	10541	20 %	0 %	40 %	40 %	126457861
13	NC_009078	CAGCG	2	10	14520	14529	20 %	0 %	40 %	40 %	126455812
14	NC_009078	CGGCG	2	10	14563	14572	0 %	0 %	60 %	40 %	126455812
15	NC_009078	CGCGG	2	10	15470	15479	0 %	0 %	60 %	40 %	126456283
16	NC_009078	TGCGA	2	10	19498	19507	20 %	20 %	40 %	20 %	126457300
17	NC_009078	GCGCG	2	10	19515	19524	0 %	0 %	60 %	40 %	126457300
18	NC_009078	CGATG	2	10	19643	19652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009078	ACGCG	2	10	19697	19706	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009078	CGCGC	2	10	20103	20112	0 %	0 %	40 %	60 %	126455745
21	NC_009078	CGATT	2	10	23106	23115	20 %	40 %	20 %	20 %	126458038
22	NC_009078	GCGTC	2	10	23402	23411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009078	GCCGC	2	10	23710	23719	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009078	CGCGG	2	10	24747	24756	0 %	0 %	60 %	40 %	126456742
25	NC_009078	CGCAA	2	10	25006	25015	40 %	0 %	20 %	40 %	126456742
26	NC_009078	GCCGC	2	10	27324	27333	0 %	0 %	40 %	60 %	126456032
27	NC_009078	CGCGC	2	10	28767	28776	0 %	0 %	40 %	60 %	126456380
28	NC_009078	GCCGA	2	10	29783	29792	20 %	0 %	40 %	40 %	126457404
29	NC_009078	CGAGC	2	10	30533	30542	20 %	0 %	40 %	40 %	126457634
30	NC_009078	TCGCC	2	10	31398	31407	0 %	20 %	20 %	60 %	126458343
31	NC_009078	GCGTG	2	10	31613	31622	0 %	20 %	60 %	20 %	126458343
32	NC_009078	AGGCG	2	10	32318	32327	20 %	0 %	60 %	20 %	126455838
33	NC_009078	GCGCC	2	10	34422	34431	0 %	0 %	40 %	60 %	126456147
34	NC_009078	GCGAC	2	10	35715	35724	20 %	0 %	40 %	40 %	126456342
35	NC_009078	GCGCG	2	10	36257	36266	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009078	CACGG	2	10	38042	38051	20 %	0 %	40 %	40 %	126455875
37	NC_009078	CGCGA	2	10	39278	39287	20 %	0 %	40 %	40 %	126457358
38	NC_009078	GCCGC	2	10	40651	40660	0 %	0 %	40 %	60 %	126455553
39	NC_009078	GTGCG	2	10	40924	40933	0 %	20 %	60 %	20 %	126455553
40	NC_009078	ATTGC	2	10	41225	41234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009078	CGGAT	2	10	41740	41749	20 %	20 %	40 %	20 %	126456279
42	NC_009078	AGGCG	2	10	42928	42937	20 %	0 %	60 %	20 %	126457793
43	NC_009078	CGACG	2	10	44090	44099	20 %	0 %	40 %	40 %	126458521
44	NC_009078	CGCAC	2	10	44686	44695	20 %	0 %	20 %	60 %	126456258
45	NC_009078	CGACG	2	10	45338	45347	20 %	0 %	40 %	40 %	126456258
46	NC_009078	GCGCG	2	10	45673	45682	0 %	0 %	60 %	40 %	126458130
47	NC_009078	GCGCA	2	10	46773	46782	20 %	0 %	40 %	40 %	126457409
48	NC_009078	GCATC	2	10	46934	46943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009078	CGATC	2	10	48628	48637	20 %	20 %	20 %	40 %	126456664
50	NC_009078	CGGGC	2	10	49305	49314	0 %	0 %	60 %	40 %	126455627
51	NC_009078	GAGCG	2	10	51089	51098	20 %	0 %	60 %	20 %	126457435
52	NC_009078	ATCGT	2	10	53149	53158	20 %	40 %	20 %	20 %	126457239
53	NC_009078	GAGCC	2	10	54454	54463	20 %	0 %	40 %	40 %	126458298
54	NC_009078	GCCGC	2	10	54885	54894	0 %	0 %	40 %	60 %	126458298
55	NC_009078	GCGTC	2	10	56381	56390	0 %	20 %	40 %	40 %	126455609
56	NC_009078	CGGAC	2	10	56890	56899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009078	TGCGT	2	10	58328	58337	0 %	40 %	40 %	20 %	126458510
58	NC_009078	CGCGG	2	10	58934	58943	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009078	GGCGC	2	10	59567	59576	0 %	0 %	60 %	40 %	126457810
60	NC_009078	CGTCG	2	10	59579	59588	0 %	20 %	40 %	40 %	126457810
61	NC_009078	TCGAA	2	10	60157	60166	40 %	20 %	20 %	20 %	126457810
62	NC_009078	CCCGG	2	10	60786	60795	0 %	0 %	40 %	60 %	126457810
63	NC_009078	GCGCA	2	10	64530	64539	20 %	0 %	40 %	40 %	126457810
64	NC_009078	CGCGG	2	10	64582	64591	0 %	0 %	60 %	40 %	126457810
65	NC_009078	CTGCA	2	10	65230	65239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009078	GGCTT	2	10	65919	65928	0 %	40 %	40 %	20 %	126455970
67	NC_009078	GCGCA	2	10	66035	66044	20 %	0 %	40 %	40 %	126455970
68	NC_009078	CGGCG	2	10	68860	68869	0 %	0 %	60 %	40 %	126456720
69	NC_009078	GGCGT	2	10	70242	70251	0 %	20 %	60 %	20 %	126456247
70	NC_009078	CGGGA	2	10	72069	72078	20 %	0 %	60 %	20 %	126457972
71	NC_009078	GATTC	2	10	72698	72707	20 %	40 %	20 %	20 %	126457972
72	NC_009078	TCGCG	2	10	72710	72719	0 %	20 %	40 %	40 %	126457972
73	NC_009078	GGCAT	2	10	72839	72848	20 %	20 %	40 %	20 %	126457972
74	NC_009078	TCCGC	2	10	73432	73441	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009078	CTTTT	2	10	73616	73625	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009078	GCCGA	2	10	74158	74167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009078	TCGAT	2	10	76998	77007	20 %	40 %	20 %	20 %	126458415
78	NC_009078	GCACG	2	10	77682	77691	20 %	0 %	40 %	40 %	126458150
79	NC_009078	CGGCT	2	10	77782	77791	0 %	20 %	40 %	40 %	126458150
80	NC_009078	CTTCC	2	10	78047	78056	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_009078	TGCGC	2	10	79742	79751	0 %	20 %	40 %	40 %	126457597
82	NC_009078	CGATC	2	10	81609	81618	20 %	20 %	20 %	40 %	126457653
83	NC_009078	CGCGC	2	10	81927	81936	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_009078	GGCGC	2	10	82194	82203	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009078	TACGC	2	10	88364	88373	20 %	20 %	20 %	40 %	126457812
86	NC_009078	GGGCA	2	10	90618	90627	20 %	0 %	60 %	20 %	126457812
87	NC_009078	ATGGA	2	10	91886	91895	40 %	20 %	40 %	0 %	126457559
88	NC_009078	GGCCG	2	10	92170	92179	0 %	0 %	60 %	40 %	126457559
89	NC_009078	GCTCG	2	10	92931	92940	0 %	20 %	40 %	40 %	126457559
90	NC_009078	CAAAC	2	10	94492	94501	60 %	0 %	0 %	40 %	126458256
91	NC_009078	ACGGC	2	10	94988	94997	20 %	0 %	40 %	40 %	126458256
92	NC_009078	GCGTG	2	10	95070	95079	0 %	20 %	60 %	20 %	126456320
93	NC_009078	CTCGT	2	10	95296	95305	0 %	40 %	20 %	40 %	126456320
94	NC_009078	GTGCG	2	10	97786	97795	0 %	20 %	60 %	20 %	126457792
95	NC_009078	CGTCA	2	10	97860	97869	20 %	20 %	20 %	40 %	126457792
96	NC_009078	GTCGG	2	10	97939	97948	0 %	20 %	60 %	20 %	126457792
97	NC_009078	ATCGC	2	10	97995	98004	20 %	20 %	20 %	40 %	126457792
98	NC_009078	CGTGA	2	10	98393	98402	20 %	20 %	40 %	20 %	126458432
99	NC_009078	GCCGC	2	10	99322	99331	0 %	0 %	40 %	60 %	126456528
100	NC_009078	CGATG	2	10	100994	101003	20 %	20 %	40 %	20 %	126456011
101	NC_009078	CCGCG	2	10	101092	101101	0 %	0 %	40 %	60 %	126456011
102	NC_009078	GGGGA	2	10	101291	101300	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009078	GCCGT	2	10	103838	103847	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009078	CGAGG	2	10	104445	104454	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009078	GGGCC	2	10	104589	104598	0 %	0 %	60 %	40 %	126457003
106	NC_009078	CGGCG	2	10	107606	107615	0 %	0 %	60 %	40 %	126458397
107	NC_009078	CGCGC	2	10	108188	108197	0 %	0 %	40 %	60 %	126458397
108	NC_009078	AAAAG	2	10	108978	108987	80 %	0 %	20 %	0 %	126457476
109	NC_009078	CGCAG	2	10	110202	110211	20 %	0 %	40 %	40 %	126457347
110	NC_009078	TCGGC	2	10	112013	112022	0 %	20 %	40 %	40 %	126457629
111	NC_009078	TTGCG	2	10	114282	114291	0 %	40 %	40 %	20 %	126457629
112	NC_009078	GGCGC	2	10	114382	114391	0 %	0 %	60 %	40 %	126458042
113	NC_009078	TCGAG	2	10	114941	114950	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009078	CGAAC	2	10	116101	116110	40 %	0 %	20 %	40 %	126456220
115	NC_009078	CGGAG	2	10	116752	116761	20 %	0 %	60 %	20 %	126456220
116	NC_009078	GGCCG	2	10	121819	121828	0 %	0 %	60 %	40 %	126456681
117	NC_009078	GATCG	2	10	122610	122619	20 %	20 %	40 %	20 %	126457603
118	NC_009078	CGCTG	2	10	123166	123175	0 %	20 %	40 %	40 %	126457603
119	NC_009078	GCGGA	2	10	123178	123187	20 %	0 %	60 %	20 %	126457603
120	NC_009078	CGAGC	2	10	125962	125971	20 %	0 %	40 %	40 %	126457982
121	NC_009078	CGGCG	2	10	126610	126619	0 %	0 %	60 %	40 %	126457982
122	NC_009078	CTGCG	2	10	128904	128913	0 %	20 %	40 %	40 %	126457271
123	NC_009078	CGGCC	2	10	129354	129363	0 %	0 %	40 %	60 %	126457271
124	NC_009078	GCGAC	2	10	130078	130087	20 %	0 %	40 %	40 %	126457271
125	NC_009078	GCGCG	2	10	132471	132480	0 %	0 %	60 %	40 %	126455803
126	NC_009078	CTTGC	2	10	137254	137263	0 %	40 %	20 %	40 %	126455537
127	NC_009078	GCATC	2	10	138241	138250	20 %	20 %	20 %	40 %	126456359
128	NC_009078	AGCGC	2	10	138471	138480	20 %	0 %	40 %	40 %	126456359
129	NC_009078	GGGTG	2	10	138487	138496	0 %	20 %	80 %	0 %	126456359
130	NC_009078	GCGCG	2	10	138639	138648	0 %	0 %	60 %	40 %	126458527
131	NC_009078	GCGAT	2	10	139329	139338	20 %	20 %	40 %	20 %	126458527
132	NC_009078	AGCTG	2	10	139949	139958	20 %	20 %	40 %	20 %	126456197
133	NC_009078	TTCCG	2	10	140193	140202	0 %	40 %	20 %	40 %	126456197
134	NC_009078	TTCGC	2	10	143379	143388	0 %	40 %	20 %	40 %	126458215
135	NC_009078	CGGCA	2	10	147130	147139	20 %	0 %	40 %	40 %	126457183
136	NC_009078	GGGCC	2	10	147605	147614	0 %	0 %	60 %	40 %	126455824
137	NC_009078	GAATG	2	10	148542	148551	40 %	20 %	40 %	0 %	126455824
138	NC_009078	GCATT	2	10	149051	149060	20 %	40 %	20 %	20 %	126455824
139	NC_009078	AGCGC	2	10	149267	149276	20 %	0 %	40 %	40 %	126455824
140	NC_009078	CGTCG	2	10	149589	149598	0 %	20 %	40 %	40 %	126455824
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264	NC_009078	CCGGC	2	10	245078	245087	0 %	0 %	40 %	60 %	126455703
265	NC_009078	GCGTC	2	10	245121	245130	0 %	20 %	40 %	40 %	126455703
266	NC_009078	GCGCG	2	10	245200	245209	0 %	0 %	60 %	40 %	126455703
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401	NC_009078	CGAGC	2	10	354694	354703	20 %	0 %	40 %	40 %	126455639
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