MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 5054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009077	CGGCC	2	10	5990075	5990084	0 %	0 %	40 %	60 %	126438301
5002	NC_009077	GCAGC	2	10	5990646	5990655	20 %	0 %	40 %	40 %	126438301
5003	NC_009077	ATCGG	2	10	5990999	5991008	20 %	20 %	40 %	20 %	126438301
5004	NC_009077	CGGCC	2	10	5992735	5992744	0 %	0 %	40 %	60 %	126438303
5005	NC_009077	GCGCC	2	10	5994251	5994260	0 %	0 %	40 %	60 %	126438304
5006	NC_009077	GCGTG	2	10	5994538	5994547	0 %	20 %	60 %	20 %	126438304
5007	NC_009077	CGATG	2	10	5994751	5994760	20 %	20 %	40 %	20 %	126438304
5008	NC_009077	GCGCC	2	10	5996494	5996503	0 %	0 %	40 %	60 %	126438305
5009	NC_009077	GCCGC	2	10	5996697	5996706	0 %	0 %	40 %	60 %	126438305
5010	NC_009077	CCGAA	2	10	5997886	5997895	40 %	0 %	20 %	40 %	126438306
5011	NC_009077	CGAAC	2	10	5998332	5998341	40 %	0 %	20 %	40 %	126438307
5012	NC_009077	GCTGA	2	10	5999270	5999279	20 %	20 %	40 %	20 %	126438309
5013	NC_009077	ACCGC	2	10	6000801	6000810	20 %	0 %	20 %	60 %	126438310
5014	NC_009077	GAAGT	2	10	6005868	6005877	40 %	20 %	40 %	0 %	126438314
5015	NC_009077	GGCGT	2	10	6006474	6006483	0 %	20 %	60 %	20 %	126438315
5016	NC_009077	CGCGG	2	10	6012305	6012314	0 %	0 %	60 %	40 %	126438319
5017	NC_009077	GCGCT	2	10	6012767	6012776	0 %	20 %	40 %	40 %	126438319
5018	NC_009077	GCGCC	2	10	6014799	6014808	0 %	0 %	40 %	60 %	126438322
5019	NC_009077	CCGGC	2	10	6015735	6015744	0 %	0 %	40 %	60 %	126438322
5020	NC_009077	TCCGG	2	10	6016110	6016119	0 %	20 %	40 %	40 %	126438322
5021	NC_009077	CCGGC	2	10	6016929	6016938	0 %	0 %	40 %	60 %	126438323
5022	NC_009077	CCAGT	2	10	6017781	6017790	20 %	20 %	20 %	40 %	126438325
5023	NC_009077	CTGGC	2	10	6017875	6017884	0 %	20 %	40 %	40 %	126438325
5024	NC_009077	GCACC	2	10	6018515	6018524	20 %	0 %	20 %	60 %	126438325
5025	NC_009077	CGCGG	2	10	6019062	6019071	0 %	0 %	60 %	40 %	126438325
5026	NC_009077	CTGCG	2	10	6019501	6019510	0 %	20 %	40 %	40 %	126438326
5027	NC_009077	CCAGC	2	10	6019960	6019969	20 %	0 %	20 %	60 %	126438327
5028	NC_009077	ACGCC	2	10	6020603	6020612	20 %	0 %	20 %	60 %	126438327
5029	NC_009077	CGGTG	2	10	6021259	6021268	0 %	20 %	60 %	20 %	126438328
5030	NC_009077	CGCAC	2	10	6021315	6021324	20 %	0 %	20 %	60 %	126438328
5031	NC_009077	TCCCG	2	10	6021559	6021568	0 %	20 %	20 %	60 %	126438328
5032	NC_009077	TCACC	2	10	6023677	6023686	20 %	20 %	0 %	60 %	126438328
5033	NC_009077	CGGTG	2	10	6026440	6026449	0 %	20 %	60 %	20 %	126438332
5034	NC_009077	ACCGC	2	10	6026898	6026907	20 %	0 %	20 %	60 %	126438332
5035	NC_009077	ACCGG	2	10	6028353	6028362	20 %	0 %	40 %	40 %	126438334
5036	NC_009077	AGCGG	2	10	6028377	6028386	20 %	0 %	60 %	20 %	126438334
5037	NC_009077	GCGCG	2	10	6028465	6028474	0 %	0 %	60 %	40 %	126438334
5038	NC_009077	CGGTC	2	10	6029548	6029557	0 %	20 %	40 %	40 %	126438335
5039	NC_009077	GGCCC	2	10	6031565	6031574	0 %	0 %	40 %	60 %	126438337
5040	NC_009077	CCGGC	2	10	6032681	6032690	0 %	0 %	40 %	60 %	126438338
5041	NC_009077	ACCCG	2	10	6034483	6034492	20 %	0 %	20 %	60 %	126438338
5042	NC_009077	CGCGG	2	10	6036369	6036378	0 %	0 %	60 %	40 %	126438339
5043	NC_009077	CGACC	2	10	6036460	6036469	20 %	0 %	20 %	60 %	126438339
5044	NC_009077	CGCGC	2	10	6036834	6036843	0 %	0 %	40 %	60 %	126438339
5045	NC_009077	ACGCC	2	10	6037355	6037364	20 %	0 %	20 %	60 %	126438339
5046	NC_009077	TCCGA	2	10	6038029	6038038	20 %	20 %	20 %	40 %	126438339
5047	NC_009077	CCGGC	2	10	6039260	6039269	0 %	0 %	40 %	60 %	126438341
5048	NC_009077	GCGCT	2	10	6039436	6039445	0 %	20 %	40 %	40 %	126438341
5049	NC_009077	CTGCG	2	10	6041476	6041485	0 %	20 %	40 %	40 %	126438343
5050	NC_009077	GCGTC	2	10	6041513	6041522	0 %	20 %	40 %	40 %	126438343
5051	NC_009077	CCGGT	2	10	6042330	6042339	0 %	20 %	40 %	40 %	126438344
5052	NC_009077	CGACG	2	10	6043190	6043199	20 %	0 %	40 %	40 %	126438345
5053	NC_009077	AGGCC	2	10	6043784	6043793	20 %	0 %	40 %	40 %	126438345
5054	NC_009077	CGCGG	2	10	6046414	6046423	0 %	0 %	60 %	40 %	126438349

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.