MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei 1106a chromosome I

Total Repeats: 73117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009076	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452997
2	NC_009076	CGT	2	6	84	89	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452997
3	NC_009076	TCG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452997
4	NC_009076	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452997
5	NC_009076	GCG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126452997
6	NC_009076	GTC	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452997
7	NC_009076	CAG	2	6	322	327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452997
8	NC_009076	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126452997
9	NC_009076	GAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452997
10	NC_009076	CGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452997
11	NC_009076	AAC	2	6	671	676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126452997
12	NC_009076	CCG	3	9	824	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452997
13	NC_009076	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126452997
14	NC_009076	GAC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
15	NC_009076	GCA	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
16	NC_009076	CGA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
17	NC_009076	GAC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
18	NC_009076	GTC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
19	NC_009076	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
20	NC_009076	GCG	2	6	1462	1467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126451647
21	NC_009076	ACG	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
22	NC_009076	TTC	2	6	1576	1581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126451647
23	NC_009076	GAT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126451647
24	NC_009076	AGC	3	9	1597	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
25	NC_009076	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
26	NC_009076	CGA	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
27	NC_009076	TCG	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
28	NC_009076	TCG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
29	NC_009076	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
30	NC_009076	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
31	NC_009076	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126451647
32	NC_009076	ATC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126451647
33	NC_009076	AGC	4	12	2011	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
34	NC_009076	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126451647
35	NC_009076	CAG	3	9	2130	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
36	NC_009076	GAG	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126451647
37	NC_009076	GTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451647
38	NC_009076	CGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451647
39	NC_009076	CGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451647
40	NC_009076	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126451647
41	NC_009076	GCG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
42	NC_009076	GCC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
43	NC_009076	GCC	3	9	3331	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
44	NC_009076	GCC	3	9	3349	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
45	NC_009076	TCG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
46	NC_009076	CGA	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
47	NC_009076	GCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
48	NC_009076	ACG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
49	NC_009076	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
50	NC_009076	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
51	NC_009076	CAG	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
52	NC_009076	CGA	4	12	3716	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
53	NC_009076	TCG	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
54	NC_009076	CGC	3	9	3782	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
55	NC_009076	CGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
56	NC_009076	GCG	2	6	3868	3873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
57	NC_009076	GCC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
58	NC_009076	CGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
59	NC_009076	GTC	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
60	NC_009076	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126455325
61	NC_009076	CGG	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
62	NC_009076	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
63	NC_009076	CGA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
64	NC_009076	GGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
65	NC_009076	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
66	NC_009076	CGA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
67	NC_009076	TCG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
68	NC_009076	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
69	NC_009076	TTC	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126455325
70	NC_009076	GCA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
71	NC_009076	CGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
72	NC_009076	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455325
73	NC_009076	GCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
74	NC_009076	GCC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
75	NC_009076	GCG	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
76	NC_009076	GAC	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455325
77	NC_009076	GGC	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
78	NC_009076	GCG	2	6	5125	5130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455325
79	NC_009076	CCG	2	6	5133	5138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126455325
80	NC_009076	CGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126453925
81	NC_009076	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126453925
82	NC_009076	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126453925
83	NC_009076	GTC	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
84	NC_009076	TGG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126452541
85	NC_009076	CGC	3	9	6052	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452541
86	NC_009076	CGA	2	6	6141	6146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
87	NC_009076	TCG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
88	NC_009076	TCG	2	6	6161	6166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
89	NC_009076	GCC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452541
90	NC_009076	CGC	2	6	6234	6239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452541
91	NC_009076	TGC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
92	NC_009076	GCA	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
93	NC_009076	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
94	NC_009076	TTG	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126452541
95	NC_009076	CAG	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
96	NC_009076	CGA	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
97	NC_009076	GTC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
98	NC_009076	TCG	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
99	NC_009076	CGC	2	6	6736	6741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126452541
100	NC_009076	CGT	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
101	NC_009076	CGT	3	9	6852	6860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
102	NC_009076	CGA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
103	NC_009076	GGC	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126452541
104	NC_009076	CGA	2	6	6963	6968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
105	NC_009076	TCG	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126452541
106	NC_009076	GCA	2	6	6988	6993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
107	NC_009076	CGA	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
108	NC_009076	AGC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126452541
109	NC_009076	GCA	2	6	7578	7583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455047
110	NC_009076	GCG	2	6	7699	7704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455047
111	NC_009076	GGC	2	6	7714	7719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455047
112	NC_009076	TTG	2	6	7841	7846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126455047
113	NC_009076	TCG	2	6	7928	7933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455047
114	NC_009076	CGG	2	6	7974	7979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455047
115	NC_009076	GCG	2	6	8418	8423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126454161
116	NC_009076	TCG	3	9	8438	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
117	NC_009076	CGC	2	6	8457	8462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126454161
118	NC_009076	ATC	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126454161
119	NC_009076	TCG	2	6	8591	8596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
120	NC_009076	CGC	2	6	8750	8755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126454161
121	NC_009076	GGT	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126454161
122	NC_009076	AAC	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126454161
123	NC_009076	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
124	NC_009076	AAC	2	6	8851	8856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126454161
125	NC_009076	CAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126454161
126	NC_009076	TCG	2	6	8888	8893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
127	NC_009076	ATC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126454161
128	NC_009076	GCG	2	6	8953	8958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126454161
129	NC_009076	CGT	2	6	8973	8978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
130	NC_009076	CGC	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126454161
131	NC_009076	GCT	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
132	NC_009076	GCT	3	9	9105	9113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454161
133	NC_009076	CGC	2	6	9138	9143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126454161
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252	NC_009076	CGG	2	6	15038	15043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126455158
253	NC_009076	CGA	2	6	15053	15058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126455158
254	NC_009076	TCG	2	6	15059	15064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455158
255	NC_009076	GAT	2	6	15149	15154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126455288
256	NC_009076	TCG	2	6	15163	15168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126455288
257	NC_009076	ATC	2	6	15177	15182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126455288
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497	NC_009076	GCT	2	6	26896	26901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454133
498	NC_009076	CGA	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126454133
499	NC_009076	TGA	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126454133
500	NC_009076	CGT	3	9	26986	26994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126454133

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