MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei 668 chromosome I

Total Repeats: 71803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009074	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441253
2	NC_009074	CGT	2	6	84	89	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441253
3	NC_009074	TCG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441253
4	NC_009074	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441253
5	NC_009074	GCG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441253
6	NC_009074	TCC	2	6	293	298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126441253
7	NC_009074	CAG	2	6	322	327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441253
8	NC_009074	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441253
9	NC_009074	GAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441253
10	NC_009074	CGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441253
11	NC_009074	AAC	2	6	671	676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126441253
12	NC_009074	CCG	3	9	824	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441253
13	NC_009074	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126441253
14	NC_009074	GAC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
15	NC_009074	GCA	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
16	NC_009074	CGA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
17	NC_009074	GAC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
18	NC_009074	GTC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
19	NC_009074	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
20	NC_009074	GCG	2	6	1462	1467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126438404
21	NC_009074	ACG	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
22	NC_009074	TTC	2	6	1576	1581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126438404
23	NC_009074	GAT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126438404
24	NC_009074	AGC	3	9	1597	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
25	NC_009074	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
26	NC_009074	CGA	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
27	NC_009074	TCG	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
28	NC_009074	TCG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
29	NC_009074	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
30	NC_009074	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
31	NC_009074	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126438404
32	NC_009074	ATC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126438404
33	NC_009074	AGC	4	12	2011	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
34	NC_009074	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126438404
35	NC_009074	CAG	3	9	2130	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
36	NC_009074	GAG	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126438404
37	NC_009074	GTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438404
38	NC_009074	CGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126438404
39	NC_009074	CGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126438404
40	NC_009074	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126438404
41	NC_009074	GCG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
42	NC_009074	GCC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
43	NC_009074	GCC	3	9	3331	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
44	NC_009074	GCC	3	9	3349	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
45	NC_009074	TCG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
46	NC_009074	CGA	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
47	NC_009074	GCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
48	NC_009074	ACG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
49	NC_009074	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
50	NC_009074	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
51	NC_009074	CAG	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
52	NC_009074	CGA	4	12	3716	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
53	NC_009074	TCG	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
54	NC_009074	CGC	3	9	3782	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
55	NC_009074	CGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
56	NC_009074	GCG	2	6	3868	3873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
57	NC_009074	GCC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
58	NC_009074	CGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
59	NC_009074	GTC	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
60	NC_009074	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126441676
61	NC_009074	CGG	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
62	NC_009074	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
63	NC_009074	CGA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
64	NC_009074	GGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
65	NC_009074	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
66	NC_009074	CGA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
67	NC_009074	TCG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
68	NC_009074	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
69	NC_009074	TTC	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126441676
70	NC_009074	GCA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
71	NC_009074	CGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
72	NC_009074	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441676
73	NC_009074	GCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
74	NC_009074	GCC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
75	NC_009074	GCG	2	6	5024	5029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
76	NC_009074	GAC	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441676
77	NC_009074	GGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
78	NC_009074	GCG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441676
79	NC_009074	CCG	2	6	5124	5129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441676
80	NC_009074	CGC	2	6	5508	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126442121
81	NC_009074	CTC	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126442121
82	NC_009074	AAG	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126442121
83	NC_009074	GTC	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
84	NC_009074	TGG	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126439695
85	NC_009074	CGC	3	9	6043	6051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126439695
86	NC_009074	CGA	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
87	NC_009074	TCG	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
88	NC_009074	TCG	2	6	6152	6157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
89	NC_009074	GCC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126439695
90	NC_009074	CGC	2	6	6225	6230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126439695
91	NC_009074	TGC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
92	NC_009074	GCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
93	NC_009074	TCG	2	6	6389	6394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
94	NC_009074	CGT	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
95	NC_009074	TTG	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126439695
96	NC_009074	CAG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
97	NC_009074	CGA	2	6	6699	6704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
98	NC_009074	GTC	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
99	NC_009074	TCG	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
100	NC_009074	CGC	2	6	6727	6732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126439695
101	NC_009074	CGT	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
102	NC_009074	CGT	3	9	6843	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
103	NC_009074	CGA	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
104	NC_009074	GGC	2	6	6942	6947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126439695
105	NC_009074	CGA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
106	NC_009074	TCG	2	6	6965	6970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439695
107	NC_009074	GCA	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
108	NC_009074	CGA	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
109	NC_009074	AGC	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439695
110	NC_009074	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439885
111	NC_009074	GCG	2	6	7690	7695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126439885
112	NC_009074	GGC	2	6	7705	7710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126439885
113	NC_009074	TTG	2	6	7832	7837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126439885
114	NC_009074	TCG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439885
115	NC_009074	CGG	2	6	7965	7970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126439885
116	NC_009074	GCG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441466
117	NC_009074	TCG	3	9	8429	8437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
118	NC_009074	CGC	2	6	8448	8453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441466
119	NC_009074	ATC	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126441466
120	NC_009074	TCG	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
121	NC_009074	CGC	2	6	8741	8746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441466
122	NC_009074	GGT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126441466
123	NC_009074	AAC	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126441466
124	NC_009074	TGC	2	6	8819	8824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
125	NC_009074	AAC	2	6	8842	8847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126441466
126	NC_009074	CAA	2	6	8868	8873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126441466
127	NC_009074	TCG	2	6	8879	8884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
128	NC_009074	ATC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126441466
129	NC_009074	GCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441466
130	NC_009074	CGT	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
131	NC_009074	CGC	2	6	9000	9005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126441466
132	NC_009074	GCT	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
133	NC_009074	GCT	3	9	9096	9104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
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149	NC_009074	CGA	2	6	9474	9479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441466
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151	NC_009074	GTC	2	6	9622	9627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126441466
152	NC_009074	CGA	2	6	9638	9643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441466
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155	NC_009074	GGC	2	6	9775	9780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441466
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159	NC_009074	GGC	2	6	10087	10092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126441466
160	NC_009074	GGA	2	6	10116	10121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126441466
161	NC_009074	GGT	2	6	10128	10133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126441466
162	NC_009074	ACG	2	6	10147	10152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126441466
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252	NC_009074	GCG	2	6	14935	14940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126440850
253	NC_009074	CGG	2	6	15029	15034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126440850
254	NC_009074	CGA	2	6	15044	15049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126440850
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256	NC_009074	GAT	2	6	15140	15145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126439950
257	NC_009074	TCG	2	6	15154	15159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439950
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497	NC_009074	CGA	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126439585
498	NC_009074	TGA	2	6	26899	26904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126439585
499	NC_009074	CGT	3	9	26933	26941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439585
500	NC_009074	GCT	3	9	26969	26977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126439585

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