MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 1758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009053	ATTTA	2	10	1881	1890	40 %	60 %	0 %	0 %	126207490
2	NC_009053	GACAA	2	10	2865	2874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009053	TACCG	2	10	4541	4550	20 %	20 %	20 %	40 %	126207492
4	NC_009053	TTTAA	2	10	7716	7725	40 %	60 %	0 %	0 %	126207495
5	NC_009053	ATTTT	2	10	8594	8603	20 %	80 %	0 %	0 %	126207495
6	NC_009053	TTAAA	2	10	11683	11692	60 %	40 %	0 %	0 %	126207500
7	NC_009053	GGTAT	2	10	12447	12456	20 %	40 %	40 %	0 %	126207500
8	NC_009053	CGGTT	2	10	13598	13607	0 %	40 %	40 %	20 %	126207500
9	NC_009053	AAATT	2	10	13702	13711	60 %	40 %	0 %	0 %	126207500
10	NC_009053	TCGAT	2	10	16504	16513	20 %	40 %	20 %	20 %	126207502
11	NC_009053	TGTTA	2	10	16958	16967	20 %	60 %	20 %	0 %	126207503
12	NC_009053	CAATA	2	10	16992	17001	60 %	20 %	0 %	20 %	126207503
13	NC_009053	CTTTG	2	10	17221	17230	0 %	60 %	20 %	20 %	126207503
14	NC_009053	CTTTG	2	10	19513	19522	0 %	60 %	20 %	20 %	126207505
15	NC_009053	AAAGG	2	10	20959	20968	60 %	0 %	40 %	0 %	126207506
16	NC_009053	TGATG	2	10	24173	24182	20 %	40 %	40 %	0 %	126207508
17	NC_009053	GTACC	2	10	25429	25438	20 %	20 %	20 %	40 %	126207510
18	NC_009053	CCGTT	2	10	26876	26885	0 %	40 %	20 %	40 %	126207511
19	NC_009053	AATGA	2	10	29263	29272	60 %	20 %	20 %	0 %	126207513
20	NC_009053	AATTT	2	10	30029	30038	40 %	60 %	0 %	0 %	126207513
21	NC_009053	ATCGG	2	10	31262	31271	20 %	20 %	40 %	20 %	126207514
22	NC_009053	TAAAT	2	10	34658	34667	60 %	40 %	0 %	0 %	126207517
23	NC_009053	TAAGT	2	10	35683	35692	40 %	40 %	20 %	0 %	126207518
24	NC_009053	TTAAT	2	10	36812	36821	40 %	60 %	0 %	0 %	126207518
25	NC_009053	GTAAA	2	10	37083	37092	60 %	20 %	20 %	0 %	126207518
26	NC_009053	TTAGG	2	10	38462	38471	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009053	CGAAC	2	10	39323	39332	40 %	0 %	20 %	40 %	126207522
28	NC_009053	TTTAT	2	10	40452	40461	20 %	80 %	0 %	0 %	126207523
29	NC_009053	GCTTG	2	10	41530	41539	0 %	40 %	40 %	20 %	126207525
30	NC_009053	CGTTT	2	10	41876	41885	0 %	60 %	20 %	20 %	126207526
31	NC_009053	TTAAA	2	10	43516	43525	60 %	40 %	0 %	0 %	126207527
32	NC_009053	TGCCG	2	10	46402	46411	0 %	20 %	40 %	40 %	126207530
33	NC_009053	GTTTT	2	10	46648	46657	0 %	80 %	20 %	0 %	126207530
34	NC_009053	TGTAA	2	10	48474	48483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009053	GTTAC	2	10	48504	48513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009053	CGCTT	2	10	48704	48713	0 %	40 %	20 %	40 %	126207532
37	NC_009053	CGGTT	2	10	51934	51943	0 %	40 %	40 %	20 %	126207533
38	NC_009053	ATGCA	2	10	52441	52450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009053	GCAAT	2	10	53527	53536	40 %	20 %	20 %	20 %	126207534
40	NC_009053	GTAAA	2	10	55829	55838	60 %	20 %	20 %	0 %	126207537
41	NC_009053	AAAGT	2	10	55958	55967	60 %	20 %	20 %	0 %	126207537
42	NC_009053	TATTT	2	10	56562	56571	20 %	80 %	0 %	0 %	126207538
43	NC_009053	AATTT	2	10	57088	57097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009053	CGGCA	2	10	58549	58558	20 %	0 %	40 %	40 %	126207540
45	NC_009053	GTGAA	2	10	60074	60083	40 %	20 %	40 %	0 %	126207541
46	NC_009053	TTTAC	2	10	60192	60201	20 %	60 %	0 %	20 %	126207541
47	NC_009053	CATCG	2	10	61418	61427	20 %	20 %	20 %	40 %	126207543
48	NC_009053	ATCAC	2	10	61485	61494	40 %	20 %	0 %	40 %	126207543
49	NC_009053	GGTGA	2	10	63588	63597	20 %	20 %	60 %	0 %	126207545
50	NC_009053	ATTAA	2	10	67021	67030	60 %	40 %	0 %	0 %	126207548
51	NC_009053	GCCAA	2	10	67495	67504	40 %	0 %	20 %	40 %	126207549
52	NC_009053	AGTGA	2	10	67546	67555	40 %	20 %	40 %	0 %	126207549
53	NC_009053	TTCAC	2	10	68052	68061	20 %	40 %	0 %	40 %	126207550
54	NC_009053	TCGTA	2	10	68542	68551	20 %	40 %	20 %	20 %	126207550
55	NC_009053	TTGAA	2	10	69352	69361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009053	AGTCG	2	10	72555	72564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009053	AGGTT	2	10	72882	72891	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009053	GGTGT	2	10	74283	74292	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009053	ATTTA	2	10	79460	79469	40 %	60 %	0 %	0 %	126207553
60	NC_009053	CGAGT	2	10	80152	80161	20 %	20 %	40 %	20 %	126207554
61	NC_009053	ATTAA	2	10	82312	82321	60 %	40 %	0 %	0 %	126207556
62	NC_009053	AATTT	2	10	82973	82982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009053	TTCAT	2	10	83833	83842	20 %	60 %	0 %	20 %	126207559
64	NC_009053	GTTTG	2	10	83942	83951	0 %	60 %	40 %	0 %	126207559
65	NC_009053	GAATA	2	10	84255	84264	60 %	20 %	20 %	0 %	126207560
66	NC_009053	CAACA	2	10	88583	88592	60 %	0 %	0 %	40 %	126207566
67	NC_009053	GGTAC	2	10	91666	91675	20 %	20 %	40 %	20 %	126207571
68	NC_009053	ATTGA	2	10	92233	92242	40 %	40 %	20 %	0 %	126207571
69	NC_009053	TTCAA	2	10	95950	95959	40 %	40 %	0 %	20 %	126207576
70	NC_009053	AATAA	2	10	97638	97647	80 %	20 %	0 %	0 %	126207578
71	NC_009053	AGGTG	2	10	99136	99145	20 %	20 %	60 %	0 %	126207580
72	NC_009053	AATAA	2	10	99282	99291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009053	TAGTT	2	10	100373	100382	20 %	60 %	20 %	0 %	126207582
74	NC_009053	AGCGA	2	10	100526	100535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009053	ATTGT	2	10	100809	100818	20 %	60 %	20 %	0 %	126207583
76	NC_009053	GCCGG	2	10	102807	102816	0 %	0 %	60 %	40 %	126207585
77	NC_009053	CATCG	2	10	103607	103616	20 %	20 %	20 %	40 %	126207585
78	NC_009053	ACCGG	2	10	105506	105515	20 %	0 %	40 %	40 %	126207587
79	NC_009053	GAATC	2	10	105693	105702	40 %	20 %	20 %	20 %	126207587
80	NC_009053	ATTTA	2	10	106129	106138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009053	TTTAT	3	15	106261	106275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009053	CAAAG	2	10	107350	107359	60 %	0 %	20 %	20 %	126207588
83	NC_009053	GGTGC	2	10	109303	109312	0 %	20 %	60 %	20 %	126207591
84	NC_009053	TTAAT	2	10	110181	110190	40 %	60 %	0 %	0 %	126207591
85	NC_009053	GTGGC	2	10	113107	113116	0 %	20 %	60 %	20 %	126207592
86	NC_009053	ACGGT	2	10	115000	115009	20 %	20 %	40 %	20 %	126207592
87	NC_009053	GAACG	2	10	115334	115343	40 %	0 %	40 %	20 %	126207592
88	NC_009053	CGAAA	2	10	117062	117071	60 %	0 %	20 %	20 %	126207592
89	NC_009053	CGTAT	2	10	117075	117084	20 %	40 %	20 %	20 %	126207592
90	NC_009053	TAACT	2	10	117215	117224	40 %	40 %	0 %	20 %	126207592
91	NC_009053	TTCGG	2	10	117327	117336	0 %	40 %	40 %	20 %	126207592
92	NC_009053	AACCT	2	10	119148	119157	40 %	20 %	0 %	40 %	126207592
93	NC_009053	TAGAA	2	10	120157	120166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009053	CGCTT	2	10	122037	122046	0 %	40 %	20 %	40 %	126207594
95	NC_009053	GGCAC	2	10	123508	123517	20 %	0 %	40 %	40 %	126207594
96	NC_009053	TAATT	2	10	126818	126827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009053	AACGT	2	10	127422	127431	40 %	20 %	20 %	20 %	126207596
98	NC_009053	TGCGG	2	10	127871	127880	0 %	20 %	60 %	20 %	126207596
99	NC_009053	TTTGT	2	10	128496	128505	0 %	80 %	20 %	0 %	126207597
100	NC_009053	AAACC	2	10	132815	132824	60 %	0 %	0 %	40 %	126207603
101	NC_009053	CCAAG	2	10	132861	132870	40 %	0 %	20 %	40 %	126207603
102	NC_009053	TACGA	2	10	133101	133110	40 %	20 %	20 %	20 %	126207603
103	NC_009053	TGTAT	2	10	133819	133828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009053	ATGAC	2	10	133899	133908	40 %	20 %	20 %	20 %	126207605
105	NC_009053	TTGAA	2	10	135148	135157	40 %	40 %	20 %	0 %	126207606
106	NC_009053	ATGAA	2	10	137325	137334	60 %	20 %	20 %	0 %	126207608
107	NC_009053	AAGGG	2	10	138076	138085	40 %	0 %	60 %	0 %	126207608
108	NC_009053	AATCA	2	10	140039	140048	60 %	20 %	0 %	20 %	126207610
109	NC_009053	AAATT	2	10	140234	140243	60 %	40 %	0 %	0 %	126207610
110	NC_009053	ACGCG	2	10	140402	140411	20 %	0 %	40 %	40 %	126207610
111	NC_009053	GCAAA	2	10	143680	143689	60 %	0 %	20 %	20 %	126207616
112	NC_009053	AACTA	2	10	144681	144690	60 %	20 %	0 %	20 %	126207617
113	NC_009053	AATTA	2	10	145348	145357	60 %	40 %	0 %	0 %	126207618
114	NC_009053	TTAAA	2	10	146896	146905	60 %	40 %	0 %	0 %	126207619
115	NC_009053	ACGGT	2	10	147610	147619	20 %	20 %	40 %	20 %	126207620
116	NC_009053	GTAAA	2	10	147852	147861	60 %	20 %	20 %	0 %	126207620
117	NC_009053	TGATT	2	10	148794	148803	20 %	60 %	20 %	0 %	126207621
118	NC_009053	AGTTA	2	10	149567	149576	40 %	40 %	20 %	0 %	126207622
119	NC_009053	TTTGG	2	10	149955	149964	0 %	60 %	40 %	0 %	126207623
120	NC_009053	CCGTG	2	10	150629	150638	0 %	20 %	40 %	40 %	126207623
121	NC_009053	ACCAA	2	10	151830	151839	60 %	0 %	0 %	40 %	126207624
122	NC_009053	ACGTA	2	10	152438	152447	40 %	20 %	20 %	20 %	126207624
123	NC_009053	TTAAT	2	10	154174	154183	40 %	60 %	0 %	0 %	126207627
124	NC_009053	CGGTG	2	10	156068	156077	0 %	20 %	60 %	20 %	126207628
125	NC_009053	AAGCG	2	10	156356	156365	40 %	0 %	40 %	20 %	126207628
126	NC_009053	CTTAT	2	10	156698	156707	20 %	60 %	0 %	20 %	126207628
127	NC_009053	GGTTC	2	10	158579	158588	0 %	40 %	40 %	20 %	126207630
128	NC_009053	GATCC	2	10	162437	162446	20 %	20 %	20 %	40 %	126207633
129	NC_009053	CGGTG	2	10	163784	163793	0 %	20 %	60 %	20 %	126207634
130	NC_009053	AAAGC	2	10	163807	163816	60 %	0 %	20 %	20 %	126207634
131	NC_009053	AATTT	2	10	164374	164383	40 %	60 %	0 %	0 %	126207635
132	NC_009053	CAAGC	2	10	164956	164965	40 %	0 %	20 %	40 %	126207635
133	NC_009053	TTTTA	2	10	166434	166443	20 %	80 %	0 %	0 %	126207636
134	NC_009053	TTTAT	2	10	167918	167927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009053	CAATG	2	10	168538	168547	40 %	20 %	20 %	20 %	126207638
136	NC_009053	ATTGC	2	10	171505	171514	20 %	40 %	20 %	20 %	126207641
137	NC_009053	TCCGG	2	10	171817	171826	0 %	20 %	40 %	40 %	126207641
138	NC_009053	ATTTT	2	10	172690	172699	20 %	80 %	0 %	0 %	126207643
139	NC_009053	TATTT	2	10	175578	175587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009053	TACTG	2	10	175847	175856	20 %	40 %	20 %	20 %	126207646
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147	NC_009053	CGATT	2	10	182327	182336	20 %	40 %	20 %	20 %	126207651
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151	NC_009053	CGATT	2	10	187532	187541	20 %	40 %	20 %	20 %	126207656
152	NC_009053	GTTTC	2	10	187979	187988	0 %	60 %	20 %	20 %	126207657
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154	NC_009053	ATACC	2	10	192284	192293	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_009053	CTGAT	2	10	192302	192311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009053	GCATG	2	10	193716	193725	20 %	20 %	40 %	20 %	126207663
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158	NC_009053	AAAAT	2	10	198134	198143	80 %	20 %	0 %	0 %	126207667
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176	NC_009053	CATTT	2	10	222772	222781	20 %	60 %	0 %	20 %	126207691
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187	NC_009053	TTTGC	2	10	239287	239296	0 %	60 %	20 %	20 %	126207705
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192	NC_009053	TATAT	2	10	245364	245373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_009053	AAATA	2	10	252319	252328	80 %	20 %	0 %	0 %	126207721
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249	NC_009053	TCAAA	2	10	309023	309032	60 %	20 %	0 %	20 %	126207767
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251	NC_009053	ATCAA	2	10	310498	310507	60 %	20 %	0 %	20 %	126207768
252	NC_009053	TAATT	2	10	312891	312900	40 %	60 %	0 %	0 %	126207770
253	NC_009053	ACGAT	2	10	317360	317369	40 %	20 %	20 %	20 %	126207774
254	NC_009053	CCGCA	2	10	318174	318183	20 %	0 %	20 %	60 %	126207774
255	NC_009053	AAGAT	2	10	318383	318392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009053	GAGCA	2	10	319484	319493	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_009053	ATCCA	2	10	320210	320219	40 %	20 %	0 %	40 %	126207775
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259	NC_009053	TGGAA	2	10	320461	320470	40 %	20 %	40 %	0 %	126207776
260	NC_009053	CAGCC	2	10	321310	321319	20 %	0 %	20 %	60 %	126207776
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262	NC_009053	ATTTA	2	10	325780	325789	40 %	60 %	0 %	0 %	126207777
263	NC_009053	TGCGG	2	10	329957	329966	0 %	20 %	60 %	20 %	126207781
264	NC_009053	ACCGA	2	10	336468	336477	40 %	0 %	20 %	40 %	126207787
265	NC_009053	ACTTC	2	10	336505	336514	20 %	40 %	0 %	40 %	126207787
266	NC_009053	CAATT	2	10	338105	338114	40 %	40 %	0 %	20 %	126207789
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268	NC_009053	TTCCG	2	10	338990	338999	0 %	40 %	20 %	40 %	126207790
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399	NC_009053	CGAAA	2	10	507073	507082	60 %	0 %	20 %	20 %	126207927
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