MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 1312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	GGGGAG	2	12	910331	910342	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	126178881
502	NC_009051	CTACGA	2	12	911251	911262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126178882
503	NC_009051	GATCTC	2	12	911937	911948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126178883
504	NC_009051	TCGAGG	2	12	914350	914361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178885
505	NC_009051	ATCGGT	2	12	923433	923444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126178892
506	NC_009051	TTGTCC	2	12	924418	924429	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126178893
507	NC_009051	CTCGAT	2	12	928320	928331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126178897
508	NC_009051	GCATCC	2	12	928543	928554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178897
509	NC_009051	GTCGAT	2	12	928641	928652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126178897
510	NC_009051	GATCGC	2	12	933678	933689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178901
511	NC_009051	CGGTGC	2	12	934144	934155	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178902
512	NC_009051	ACCGAA	2	12	935741	935752	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126178904
513	NC_009051	TCGCCC	2	12	936363	936374	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126178904
514	NC_009051	CGGGTG	2	12	936869	936880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126178904
515	NC_009051	TTGGGG	2	12	937041	937052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178904
516	NC_009051	GCAGAG	2	12	938492	938503	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178905
517	NC_009051	TCTACG	2	12	945182	945193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126178911
518	NC_009051	CTCATC	2	12	945826	945837	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126178911
519	NC_009051	CCTGCT	2	12	945885	945896	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126178911
520	NC_009051	CGCATC	2	12	950082	950093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178915
521	NC_009051	CCGGGG	2	12	950999	951010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178917
522	NC_009051	TGGTCG	2	12	951566	951577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126178918
523	NC_009051	TCACCG	2	12	953685	953696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178921
524	NC_009051	TCGCCC	3	18	955249	955266	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126178922
525	NC_009051	TTCGGG	2	12	956541	956552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126178923
526	NC_009051	CGGAGG	2	12	958638	958649	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126178925
527	NC_009051	GCGCCA	2	12	959912	959923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178926
528	NC_009051	GGAAGA	2	12	960750	960761	50 %	0 %	50 %	0 %	126178927
529	NC_009051	GCGACG	2	12	960893	960904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178927
530	NC_009051	AGGATC	2	12	961859	961870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126178928
531	NC_009051	GGAAGA	2	12	961887	961898	50 %	0 %	50 %	0 %	126178928
532	NC_009051	TGCTCC	2	12	963176	963187	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126178930
533	NC_009051	GAGGGA	2	12	964128	964139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178930
534	NC_009051	CACCTC	2	12	968821	968832	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	126178935
535	NC_009051	GTCTGC	2	12	969022	969033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178935
536	NC_009051	GGCGAT	2	12	976791	976802	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178940
537	NC_009051	GACGAG	2	12	979518	979529	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178943
538	NC_009051	CCGTCG	2	12	981590	981601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126178945
539	NC_009051	CGGGTG	2	12	986836	986847	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126178949
540	NC_009051	ACGGCG	2	12	988610	988621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178951
541	NC_009051	CGTCCC	2	12	991688	991699	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126178954
542	NC_009051	GTCGCA	2	12	992046	992057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178954
543	NC_009051	CGTTCG	2	12	993602	993613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178956
544	NC_009051	ACGTCC	2	12	993772	993783	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178956
545	NC_009051	CGATAT	2	12	996020	996031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126178958
546	NC_009051	CAGGAT	2	12	997779	997790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126178961
547	NC_009051	CCGGCA	2	12	1001520	1001531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178967
548	NC_009051	CGGCAT	2	12	1002971	1002982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178968
549	NC_009051	CCCGGG	2	12	1003686	1003697	0 %	0 %	50 %	50 %	126178969
550	NC_009051	CGCCGG	2	12	1003900	1003911	0 %	0 %	50 %	50 %	126178969
551	NC_009051	CGGCGA	2	12	1004382	1004393	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178969
552	NC_009051	GTAGCG	2	12	1004571	1004582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178970
553	NC_009051	GGAGGG	2	12	1005017	1005028	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	126178970
554	NC_009051	GCCCCG	2	12	1005530	1005541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178971
555	NC_009051	GGCGAA	2	12	1005647	1005658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178971
556	NC_009051	GGACGA	2	12	1007318	1007329	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178974
557	NC_009051	CGGCGA	2	12	1008896	1008907	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178976
558	NC_009051	CGGTGC	2	12	1009071	1009082	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178976
559	NC_009051	GCCACC	2	12	1010005	1010016	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126178978
560	NC_009051	ACCGGC	2	12	1012414	1012425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178980
561	NC_009051	TCGCGG	2	12	1017322	1017333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178983
562	NC_009051	TCTCGA	2	12	1022244	1022255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126178989
563	NC_009051	CCTGCG	2	12	1023433	1023444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126178991
564	NC_009051	ACCGGC	2	12	1025466	1025477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178991
565	NC_009051	TCGGCG	2	12	1029686	1029697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178995
566	NC_009051	CGAGAG	2	12	1030936	1030947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178995
567	NC_009051	GCGGGT	2	12	1032207	1032218	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126178996
568	NC_009051	CGAGAT	2	12	1032489	1032500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126178997
569	NC_009051	GCCCGG	2	12	1033792	1033803	0 %	0 %	50 %	50 %	126178998
570	NC_009051	ACCGGG	2	12	1033847	1033858	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178998
571	NC_009051	TGCCGT	2	12	1036412	1036423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179000
572	NC_009051	GCCGTC	2	12	1036626	1036637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179000
573	NC_009051	GTTCCT	2	12	1038993	1039004	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126179001
574	NC_009051	CCGAGG	2	12	1040854	1040865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126179004
575	NC_009051	CCGCGA	2	12	1045797	1045808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179009
576	NC_009051	GCCCTT	2	12	1046448	1046459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126179010
577	NC_009051	ACCTCG	2	12	1046677	1046688	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126179010
578	NC_009051	GGTTCG	2	12	1049185	1049196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126179011
579	NC_009051	TGCTCG	2	12	1054025	1054036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179015
580	NC_009051	TCCTCG	2	12	1054759	1054770	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126179017
581	NC_009051	CATCGG	2	12	1060044	1060055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126179022
582	NC_009051	CATCGT	2	12	1060431	1060442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126179022
583	NC_009051	ACCGGC	2	12	1061731	1061742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179023
584	NC_009051	GGAGGC	2	12	1061968	1061979	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126179023
585	NC_009051	ACCGGC	2	12	1062519	1062530	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179024
586	NC_009051	TGGCGA	2	12	1068044	1068055	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126179029
587	NC_009051	CGGAGA	2	12	1068236	1068247	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126179029
588	NC_009051	GCCTCC	2	12	1068941	1068952	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126179030
589	NC_009051	ACGCCG	2	12	1069608	1069619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179031
590	NC_009051	ACCTCG	2	12	1069964	1069975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126179032
591	NC_009051	TCGCTA	2	12	1070957	1070968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126179032
592	NC_009051	GATCGT	2	12	1076027	1076038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126179036
593	NC_009051	TCTCGG	2	12	1077366	1077377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179037
594	NC_009051	GTGGGT	2	12	1077820	1077831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126179037
595	NC_009051	GTGGAC	2	12	1079038	1079049	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126179039
596	NC_009051	ATTTAT	2	12	1080462	1080473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126179040
597	NC_009051	AGTCGA	2	12	1083402	1083413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126179042
598	NC_009051	CGCGCT	2	12	1083983	1083994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179042
599	NC_009051	TCCGCC	2	12	1084798	1084809	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126179043
600	NC_009051	CATCGG	2	12	1085415	1085426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126179044
601	NC_009051	CCAGCC	2	12	1086143	1086154	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126179044
602	NC_009051	CCGGTC	2	12	1087591	1087602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179044
603	NC_009051	ATAATT	2	12	1090461	1090472	50 %	50 %	0 %	0 %	126179045
604	NC_009051	TGCACG	2	12	1092328	1092339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126179051
605	NC_009051	GTCCGG	2	12	1095457	1095468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126179058
606	NC_009051	TCCCGG	2	12	1097866	1097877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179064
607	NC_009051	ATCCAG	2	12	1099451	1099462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126179067
608	NC_009051	CGCGAG	2	12	1099668	1099679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126179068
609	NC_009051	TTCTGG	2	12	1101847	1101858	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126179069
610	NC_009051	AGCAGG	2	12	1107655	1107666	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126179078
611	NC_009051	GCGTCT	2	12	1110100	1110111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179080
612	NC_009051	ACCAGC	2	12	1113750	1113761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126179084
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722	NC_009051	CTCTAC	2	12	1337743	1337754	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126179296
723	NC_009051	AGGCCC	2	12	1338128	1338139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179296
724	NC_009051	CGGAGG	2	12	1338494	1338505	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126179296
725	NC_009051	TCGCCG	2	12	1338509	1338520	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179296
726	NC_009051	ACCGGT	2	12	1342232	1342243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126179298
727	NC_009051	CGATTC	2	12	1343221	1343232	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126179299
728	NC_009051	GCGCTC	2	12	1344546	1344557	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179299
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730	NC_009051	ACCTCG	2	12	1347828	1347839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126179302
731	NC_009051	TCGTGA	2	12	1349242	1349253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126179303
732	NC_009051	TCGCCC	2	12	1352379	1352390	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126179305
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752	NC_009051	CGGTCT	2	12	1382700	1382711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179335
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833	NC_009051	CGAAAA	2	12	1564503	1564514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126179505
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939	NC_009051	CCGGTG	2	12	1817291	1817302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126179772
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941	NC_009051	ATATCC	2	12	1818456	1818467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126179772
942	NC_009051	GCCACC	2	12	1825410	1825421	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126179773
943	NC_009051	CCTGCT	2	12	1828043	1828054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126179774
944	NC_009051	CGTTCC	2	12	1828099	1828110	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126179774
945	NC_009051	AGATCG	2	12	1829572	1829583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126179775
946	NC_009051	GCTCCC	2	12	1831778	1831789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126179777
947	NC_009051	AAGGGA	2	12	1835969	1835980	50 %	0 %	50 %	0 %	126179782
948	NC_009051	TCGAGC	2	12	1837995	1838006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126179786
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951	NC_009051	ATGATC	2	12	1845338	1845349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126179792
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953	NC_009051	CTCGGT	2	12	1849418	1849429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179797
954	NC_009051	CTCGAA	2	12	1849980	1849991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126179798
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958	NC_009051	GTCTCG	2	12	1858779	1858790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126179808
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961	NC_009051	GTCGGC	2	12	1862957	1862968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126179811
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963	NC_009051	TCGTCT	2	12	1865078	1865089	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126179813
964	NC_009051	GTTCGA	2	12	1865511	1865522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126179813
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967	NC_009051	GACCTC	2	12	1868723	1868734	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126179816
968	NC_009051	GACCCG	2	12	1871311	1871322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126179818
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970	NC_009051	CTACGA	2	12	1874129	1874140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126179820
971	NC_009051	GCCCAC	2	12	1874528	1874539	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126179820
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998	NC_009051	GTCGCC	2	12	1905242	1905253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126179850
999	NC_009051	TCGCCC	2	12	1906198	1906209	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126179851
1000	NC_009051	TGATCG	2	12	1907670	1907681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126179854

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