MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 1482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	ATCGC	2	10	1623567	1623576	20 %	20 %	20 %	40 %	126179563
1002	NC_009051	TTCCC	2	10	1628142	1628151	0 %	40 %	0 %	60 %	126179565
1003	NC_009051	CGTTC	2	10	1632956	1632965	0 %	40 %	20 %	40 %	126179569
1004	NC_009051	GTTCT	2	10	1637275	1637284	0 %	60 %	20 %	20 %	126179572
1005	NC_009051	CTCTC	2	10	1638476	1638485	0 %	40 %	0 %	60 %	126179573
1006	NC_009051	CTCCC	2	10	1638857	1638866	0 %	20 %	0 %	80 %	126179574
1007	NC_009051	TTCCC	2	10	1641900	1641909	0 %	40 %	0 %	60 %	126179575
1008	NC_009051	GATTT	2	10	1649995	1650004	20 %	60 %	20 %	0 %	126179585
1009	NC_009051	CGCCC	2	10	1653470	1653479	0 %	0 %	20 %	80 %	126179587
1010	NC_009051	GCCGT	2	10	1655963	1655972	0 %	20 %	40 %	40 %	126179591
1011	NC_009051	ATTTT	2	10	1656191	1656200	20 %	80 %	0 %	0 %	126179591
1012	NC_009051	CCGGG	2	10	1657252	1657261	0 %	0 %	60 %	40 %	126179592
1013	NC_009051	CGGCT	2	10	1658423	1658432	0 %	20 %	40 %	40 %	126179595
1014	NC_009051	CCCCG	2	10	1658566	1658575	0 %	0 %	20 %	80 %	126179595
1015	NC_009051	GCCCG	2	10	1660103	1660112	0 %	0 %	40 %	60 %	126179596
1016	NC_009051	CAAAG	2	10	1665255	1665264	60 %	0 %	20 %	20 %	126179602
1017	NC_009051	ACCGG	2	10	1667675	1667684	20 %	0 %	40 %	40 %	126179606
1018	NC_009051	TTCCC	2	10	1668062	1668071	0 %	40 %	0 %	60 %	126179606
1019	NC_009051	CGACC	2	10	1668960	1668969	20 %	0 %	20 %	60 %	126179608
1020	NC_009051	TCAGA	2	10	1673757	1673766	40 %	20 %	20 %	20 %	126179614
1021	NC_009051	GGACG	2	10	1676562	1676571	20 %	0 %	60 %	20 %	126179617
1022	NC_009051	GAGGT	2	10	1678119	1678128	20 %	20 %	60 %	0 %	126179621
1023	NC_009051	CGGGT	2	10	1680726	1680735	0 %	20 %	60 %	20 %	126179625
1024	NC_009051	TCCGG	2	10	1682072	1682081	0 %	20 %	40 %	40 %	126179627
1025	NC_009051	CCTTC	2	10	1682428	1682437	0 %	40 %	0 %	60 %	126179627
1026	NC_009051	CCGGG	2	10	1682609	1682618	0 %	0 %	60 %	40 %	126179627
1027	NC_009051	CGCAC	2	10	1682817	1682826	20 %	0 %	20 %	60 %	126179627
1028	NC_009051	CGGGG	2	10	1685165	1685174	0 %	0 %	80 %	20 %	126179628
1029	NC_009051	CGGAG	2	10	1686437	1686446	20 %	0 %	60 %	20 %	126179631
1030	NC_009051	CTTCT	2	10	1687452	1687461	0 %	60 %	0 %	40 %	126179633
1031	NC_009051	CTTTT	2	10	1688789	1688798	0 %	80 %	0 %	20 %	126179635
1032	NC_009051	ACGCC	2	10	1692621	1692630	20 %	0 %	20 %	60 %	126179638
1033	NC_009051	TCGTC	2	10	1693467	1693476	0 %	40 %	20 %	40 %	126179640
1034	NC_009051	CTCTC	2	10	1698429	1698438	0 %	40 %	0 %	60 %	126179644
1035	NC_009051	GTCCA	2	10	1698797	1698806	20 %	20 %	20 %	40 %	126179644
1036	NC_009051	TGAGA	2	10	1699667	1699676	40 %	20 %	40 %	0 %	126179645
1037	NC_009051	TCCTC	2	10	1702228	1702237	0 %	40 %	0 %	60 %	126179647
1038	NC_009051	CCTCG	2	10	1707966	1707975	0 %	20 %	20 %	60 %	126179651
1039	NC_009051	GCGCC	2	10	1708920	1708929	0 %	0 %	40 %	60 %	126179652
1040	NC_009051	CCGAG	2	10	1711750	1711759	20 %	0 %	40 %	40 %	126179655
1041	NC_009051	GCTCC	2	10	1712246	1712255	0 %	20 %	20 %	60 %	126179655
1042	NC_009051	CGCTT	2	10	1712800	1712809	0 %	40 %	20 %	40 %	126179656
1043	NC_009051	GCCGG	2	10	1719708	1719717	0 %	0 %	60 %	40 %	126179663
1044	NC_009051	CAATC	2	10	1719899	1719908	40 %	20 %	0 %	40 %	126179663
1045	NC_009051	GGGCC	2	10	1720581	1720590	0 %	0 %	60 %	40 %	126179664
1046	NC_009051	CACCT	2	10	1721045	1721054	20 %	20 %	0 %	60 %	126179664
1047	NC_009051	TCCCG	2	10	1721821	1721830	0 %	20 %	20 %	60 %	126179664
1048	NC_009051	GGAGC	2	10	1723009	1723018	20 %	0 %	60 %	20 %	126179664
1049	NC_009051	CGCAG	2	10	1723456	1723465	20 %	0 %	40 %	40 %	126179664
1050	NC_009051	CGGAT	2	10	1725784	1725793	20 %	20 %	40 %	20 %	126179666
1051	NC_009051	CCGTC	2	10	1729074	1729083	0 %	20 %	20 %	60 %	126179671
1052	NC_009051	CGATC	2	10	1731195	1731204	20 %	20 %	20 %	40 %	126179673
1053	NC_009051	CACCG	2	10	1732378	1732387	20 %	0 %	20 %	60 %	126179676
1054	NC_009051	ACAGT	2	10	1737510	1737519	40 %	20 %	20 %	20 %	126179680
1055	NC_009051	AAAGA	2	10	1741008	1741017	80 %	0 %	20 %	0 %	126179685
1056	NC_009051	CGGGA	2	10	1742530	1742539	20 %	0 %	60 %	20 %	126179687
1057	NC_009051	GTGCA	2	10	1745396	1745405	20 %	20 %	40 %	20 %	126179691
1058	NC_009051	GGTTC	2	10	1749399	1749408	0 %	40 %	40 %	20 %	126179695
1059	NC_009051	CGACG	2	10	1749807	1749816	20 %	0 %	40 %	40 %	126179695
1060	NC_009051	AACTG	2	10	1751855	1751864	40 %	20 %	20 %	20 %	126179697
1061	NC_009051	GCGAC	2	10	1752283	1752292	20 %	0 %	40 %	40 %	126179698
1062	NC_009051	CATGG	2	10	1755383	1755392	20 %	20 %	40 %	20 %	126179701
1063	NC_009051	ACGGC	2	10	1756514	1756523	20 %	0 %	40 %	40 %	126179702
1064	NC_009051	TTCTC	2	10	1757427	1757436	0 %	60 %	0 %	40 %	126179703
1065	NC_009051	GCAGA	2	10	1758566	1758575	40 %	0 %	40 %	20 %	126179704
1066	NC_009051	GGTAC	2	10	1758763	1758772	20 %	20 %	40 %	20 %	126179705
1067	NC_009051	CCTGC	2	10	1758913	1758922	0 %	20 %	20 %	60 %	126179705
1068	NC_009051	CCGGC	2	10	1759188	1759197	0 %	0 %	40 %	60 %	126179706
1069	NC_009051	GACGG	2	10	1761515	1761524	20 %	0 %	60 %	20 %	126179708
1070	NC_009051	GCCGG	2	10	1762112	1762121	0 %	0 %	60 %	40 %	126179709
1071	NC_009051	CCGTC	2	10	1762215	1762224	0 %	20 %	20 %	60 %	126179709
1072	NC_009051	GGAGA	2	10	1762401	1762410	40 %	0 %	60 %	0 %	126179709
1073	NC_009051	CCCGG	2	10	1762656	1762665	0 %	0 %	40 %	60 %	126179709
1074	NC_009051	CCGGG	2	10	1765899	1765908	0 %	0 %	60 %	40 %	126179714
1075	NC_009051	GAAGA	2	10	1766173	1766182	60 %	0 %	40 %	0 %	126179714
1076	NC_009051	GACCG	2	10	1767275	1767284	20 %	0 %	40 %	40 %	126179715
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1081	NC_009051	AGCGG	2	10	1777399	1777408	20 %	0 %	60 %	20 %	126179727
1082	NC_009051	ACCGC	2	10	1777686	1777695	20 %	0 %	20 %	60 %	126179727
1083	NC_009051	ACGGC	2	10	1780304	1780313	20 %	0 %	40 %	40 %	126179729
1084	NC_009051	CCACC	2	10	1780935	1780944	20 %	0 %	0 %	80 %	126179729
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1089	NC_009051	GACGA	2	10	1795328	1795337	40 %	0 %	40 %	20 %	126179747
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1091	NC_009051	CAAAC	2	10	1797824	1797833	60 %	0 %	0 %	40 %	126179752
1092	NC_009051	TACCA	2	10	1798872	1798881	40 %	20 %	0 %	40 %	126179754
1093	NC_009051	ACCCG	2	10	1799609	1799618	20 %	0 %	20 %	60 %	126179755
1094	NC_009051	CGGCG	2	10	1803816	1803825	0 %	0 %	60 %	40 %	126179759
1095	NC_009051	GGGAA	2	10	1804249	1804258	40 %	0 %	60 %	0 %	126179759
1096	NC_009051	GACGA	2	10	1807107	1807116	40 %	0 %	40 %	20 %	126179761
1097	NC_009051	TTCCT	2	10	1807314	1807323	0 %	60 %	0 %	40 %	126179761
1098	NC_009051	CGGGA	2	10	1810023	1810032	20 %	0 %	60 %	20 %	126179764
1099	NC_009051	GCGGG	2	10	1813658	1813667	0 %	0 %	80 %	20 %	126179768
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1101	NC_009051	GGGCG	2	10	1817398	1817407	0 %	0 %	80 %	20 %	126179772
1102	NC_009051	CGGTG	2	10	1817728	1817737	0 %	20 %	60 %	20 %	126179772
1103	NC_009051	CACCG	2	10	1826481	1826490	20 %	0 %	20 %	60 %	126179774
1104	NC_009051	CTCCG	2	10	1827253	1827262	0 %	20 %	20 %	60 %	126179774
1105	NC_009051	CCCGG	2	10	1834173	1834182	0 %	0 %	40 %	60 %	126179780
1106	NC_009051	CGGCT	2	10	1835034	1835043	0 %	20 %	40 %	40 %	126179781
1107	NC_009051	CGGCG	2	10	1835465	1835474	0 %	0 %	60 %	40 %	126179781
1108	NC_009051	ACCGC	2	10	1838092	1838101	20 %	0 %	20 %	60 %	126179786
1109	NC_009051	GGGAG	2	10	1839461	1839470	20 %	0 %	80 %	0 %	126179787
1110	NC_009051	CGGCA	2	10	1839519	1839528	20 %	0 %	40 %	40 %	126179787
1111	NC_009051	GCCGC	2	10	1841043	1841052	0 %	0 %	40 %	60 %	126179788
1112	NC_009051	CGCGG	2	10	1841551	1841560	0 %	0 %	60 %	40 %	126179789
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1116	NC_009051	TCCTT	2	10	1848805	1848814	0 %	60 %	0 %	40 %	126179795
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1119	NC_009051	CATCG	2	10	1853333	1853342	20 %	20 %	20 %	40 %	126179801
1120	NC_009051	CCGGG	2	10	1855665	1855674	0 %	0 %	60 %	40 %	126179804
1121	NC_009051	ATGCG	2	10	1856895	1856904	20 %	20 %	40 %	20 %	126179806
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1409	NC_009051	CGGGA	2	10	2352282	2352291	20 %	0 %	60 %	20 %	126180305
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