MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009051	TGAA	2	8	219	226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009051	CCTG	2	8	8537	8544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009051	CCGG	2	8	8689	8696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009051	CAAA	2	8	8758	8765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009051	CGGA	2	8	9825	9832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009051	CTCC	2	8	14633	14640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009051	GGGC	2	8	22795	22802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009051	TTTA	2	8	22852	22859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009051	CGAT	2	8	26864	26871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009051	GAAA	2	8	28314	28321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009051	TTCT	2	8	28443	28450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009051	GGCA	2	8	28522	28529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009051	GGGA	2	8	29360	29367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009051	TTCA	2	8	34395	34402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009051	GATT	2	8	39504	39511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009051	TGGT	2	8	47269	47276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009051	CCTC	2	8	47381	47388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009051	CCCT	2	8	52490	52497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009051	AGGA	2	8	54731	54738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009051	CGGC	2	8	64251	64258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009051	CGGC	3	12	66424	66435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009051	GCCG	2	8	66482	66489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009051	CCTC	2	8	66499	66506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009051	GCTG	2	8	72875	72882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009051	CTTC	2	8	77101	77108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009051	TGCC	2	8	77676	77683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009051	CTCC	2	8	79537	79544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009051	CTCC	2	8	80957	80964	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009051	TATC	2	8	82874	82881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009051	ATCT	2	8	83249	83256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009051	TCCG	2	8	83269	83276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009051	GTCG	2	8	85772	85779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009051	TTCA	2	8	88046	88053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009051	GGCA	2	8	88111	88118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009051	AACG	2	8	88211	88218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009051	CCGG	2	8	88309	88316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009051	CCCG	2	8	92598	92605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009051	ATCG	2	8	96944	96951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009051	TCCC	2	8	106167	106174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009051	GAGC	2	8	112739	112746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009051	GATG	2	8	118138	118145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009051	GAAA	2	8	118260	118267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009051	GTAG	2	8	121447	121454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009051	TCCA	2	8	121597	121604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009051	ACGA	2	8	130400	130407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009051	TCAA	2	8	133031	133038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009051	AGGG	2	8	135886	135893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009051	TCGT	2	8	153335	153342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009051	TCGT	2	8	153651	153658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009051	ATCC	2	8	153757	153764	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009051	CCGG	2	8	154277	154284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009051	AGGA	2	8	156392	156399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009051	GAGG	2	8	156818	156825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009051	TAAT	2	8	160453	160460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009051	GTGG	2	8	160517	160524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009051	CCGG	2	8	160552	160559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009051	CGAC	2	8	161866	161873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009051	TCTG	2	8	162001	162008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009051	GAGG	2	8	170783	170790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009051	AAAT	2	8	178130	178137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009051	CCTG	2	8	182229	182236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009051	GCTC	2	8	182575	182582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009051	CCTC	2	8	182914	182921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009051	GATC	2	8	195440	195447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009051	TGGA	2	8	197842	197849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009051	TGCA	2	8	198777	198784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009051	CAAC	2	8	206446	206453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009051	ATCC	2	8	207584	207591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009051	TGAG	2	8	209724	209731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009051	TAAA	2	8	210314	210321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009051	ATTC	2	8	210322	210329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009051	ACGC	2	8	222374	222381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009051	TCCC	2	8	225400	225407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_009051	CCAT	2	8	225553	225560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009051	GCGG	2	8	225669	225676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009051	GTTG	2	8	226463	226470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009051	CGGC	2	8	226506	226513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009051	GCCG	2	8	234667	234674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009051	CCCT	2	8	238571	238578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009051	GCCG	2	8	240530	240537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009051	CAGG	2	8	258503	258510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009051	CGTT	2	8	258576	258583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009051	GTTG	2	8	269312	269319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009051	TTAT	2	8	271638	271645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009051	AAGT	2	8	273595	273602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009051	TAGA	2	8	274085	274092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009051	CGGT	2	8	286986	286993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009051	TTAT	2	8	287358	287365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009051	AAGT	2	8	289315	289322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009051	TAGA	2	8	289805	289812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009051	GGCC	2	8	306845	306852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009051	GCCC	2	8	306984	306991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_009051	TATT	2	8	315085	315092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009051	TTTC	2	8	318266	318273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009051	GTCT	2	8	321047	321054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009051	CGCA	2	8	322415	322422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009051	GGTG	2	8	322448	322455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009051	ACCG	2	8	327998	328005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009051	GGGA	2	8	332835	332842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009051	TCAC	2	8	333069	333076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009051	CCGG	2	8	335799	335806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009051	CCGC	2	8	335815	335822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009051	CGGG	2	8	339331	339338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009051	TAAT	2	8	344835	344842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009051	CCGG	2	8	344866	344873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009051	ATCA	2	8	356763	356770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009051	CCGT	2	8	359445	359452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009051	TCCC	2	8	362109	362116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009051	GCAC	2	8	362181	362188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009051	ACCC	2	8	362671	362678	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009051	TCCC	2	8	364106	364113	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_009051	TTCC	2	8	369188	369195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009051	ATCA	2	8	381034	381041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009051	GCCC	2	8	383019	383026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009051	GCGG	2	8	383102	383109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009051	ACCC	2	8	388904	388911	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_009051	TGAA	2	8	398261	398268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009051	ATCC	2	8	400998	401005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009051	ATTT	2	8	406665	406672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009051	CATT	2	8	406912	406919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009051	CCGG	2	8	407097	407104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009051	GATA	2	8	415947	415954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009051	GAAG	2	8	416182	416189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009051	ATCT	2	8	421019	421026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009051	ATCG	2	8	421064	421071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009051	GTCC	2	8	424584	424591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009051	ATGC	2	8	424669	424676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009051	CAAC	2	8	427880	427887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009051	TCCC	2	8	427976	427983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_009051	TGGT	2	8	429679	429686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009051	CGGA	2	8	429713	429720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009051	CGGC	2	8	435603	435610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009051	ATGA	3	12	435619	435630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009051	CGCA	2	8	439746	439753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009051	GCGG	2	8	445750	445757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009051	GGGC	2	8	448075	448082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009051	CGAA	2	8	448203	448210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009051	AAGG	2	8	448215	448222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009051	CCCG	2	8	450488	450495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_009051	GGGT	2	8	463186	463193	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009051	CCGC	2	8	470632	470639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_009051	GGGC	2	8	470666	470673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009051	GGCC	2	8	483025	483032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009051	ACTC	2	8	487094	487101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009051	GCCC	2	8	503835	503842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_009051	CCGG	2	8	505569	505576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009051	AAAC	2	8	516532	516539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009051	CCGG	2	8	516587	516594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009051	CAGG	2	8	520474	520481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009051	GGTT	2	8	522303	522310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009051	AGGG	2	8	525075	525082	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009051	TTAA	2	8	528535	528542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009051	CGGG	2	8	529376	529383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009051	GGCG	2	8	529394	529401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009051	GGAG	2	8	529472	529479	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_009051	TCCG	2	8	532228	532235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_009051	CGGA	2	8	542393	542400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_009051	TTCA	2	8	548742	548749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_009051	TCCG	2	8	548885	548892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009051	TTGA	2	8	549441	549448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_009051	CGGG	2	8	620110	620117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_009051	CCGG	2	8	633146	633153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_009051	TTCA	2	8	636102	636109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_009051	GTTC	2	8	864657	864664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_009051	AGGA	2	8	874131	874138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_009051	GCGG	2	8	908868	908875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_009051	ACGC	2	8	910042	910049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
295	NC_009051	CCCG	2	8	915301	915308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
296	NC_009051	TACC	2	8	918762	918769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
297	NC_009051	AACT	2	8	921348	921355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_009051	GCAG	2	8	1337093	1337100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_009051	CTGC	2	8	1352715	1352722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_009051	AGCG	2	8	1360951	1360958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_009051	CCCG	2	8	1361110	1361117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
476	NC_009051	CGGC	2	8	1363239	1363246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
477	NC_009051	TCAC	2	8	1369316	1369323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_009051	TCCG	2	8	1376563	1376570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
481	NC_009051	AATA	2	8	1384509	1384516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_009051	GAAA	2	8	1387477	1387484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_009051	AATG	2	8	1387842	1387849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_009051	AATT	2	8	1387863	1387870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_009051	CGGG	2	8	1388792	1388799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_009051	GAGT	2	8	1388951	1388958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_009051	CGCT	2	8	1389092	1389099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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492	NC_009051	GCGA	2	8	1413824	1413831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_009051	TAGA	2	8	1415137	1415144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_009051	CGAG	2	8	1420885	1420892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_009051	ATCC	2	8	1432672	1432679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_009051	CACC	2	8	1433740	1433747	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
500	NC_009051	GCGA	2	8	1434615	1434622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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