MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 2

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009050	GGGCAG	2	12	401	412	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009050	GCCCCT	2	12	31559	31570	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009050	CGGCCC	2	12	39531	39542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009050	TCATTT	2	12	85208	85219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009050	CGGGGC	2	12	124781	124792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009050	GCGGCT	2	12	161548	161559	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009050	CGGGCC	2	12	176630	176641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009050	CGAGCG	2	12	176777	176788	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009050	CGGCCG	2	12	183039	183050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009050	TGGCCG	2	12	206853	206864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009050	GCAGCC	2	12	210263	210274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009050	CCTTGC	2	12	236540	236551	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009050	ATTGCG	2	12	246197	246208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009050	GCCGCG	2	12	253439	253450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009050	TTGGGT	2	12	276777	276788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009050	CGCAGC	2	12	281568	281579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009050	CCGGTC	2	12	281610	281621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009050	GCCTCG	2	12	295499	295510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009050	CTTTCA	2	12	327695	327706	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009050	GGCAGC	2	12	364080	364091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009050	CGGCCG	2	12	415641	415652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009050	CGAGCT	2	12	445992	446003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009050	GCGGGA	2	12	452027	452038	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009050	CCGGCC	2	12	456786	456797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009050	GCCCGA	2	12	488442	488453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009050	ACCTCA	2	12	488593	488604	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009050	TCGGGA	2	12	490963	490974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009050	CGGCAG	2	12	538402	538413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009050	GCCAGC	2	12	577680	577691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009050	TCCGGG	2	12	580272	580283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009050	ATCGGA	2	12	589893	589904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009050	GCGGGC	2	12	591964	591975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009050	CCCGTC	2	12	595083	595094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009050	GCCCGC	2	12	608984	608995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009050	GCCAGC	2	12	613326	613337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009050	TCCGGG	2	12	615918	615929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009050	GCAGGG	2	12	627892	627903	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009050	ACCGGC	2	12	645818	645829	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009050	GGCCGC	2	12	650370	650381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009050	GACCCC	2	12	695058	695069	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009050	CAGCGA	2	12	696814	696825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009050	TCATCC	2	12	750885	750896	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009050	GCCCGC	2	12	776349	776360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009050	CGGCCG	2	12	783981	783992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009050	GCCAGC	2	12	820877	820888	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009050	TCCGGG	2	12	823469	823480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009050	GCTGGT	2	12	826892	826903	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009050	CTGCGG	2	12	827366	827377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009050	GGCCGC	2	12	871342	871353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009050	CAGGCC	2	12	892308	892319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009050	CTTCCG	2	12	920021	920032	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009050	GGCTTG	2	12	950717	950728	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009050	GCGAGG	2	12	973555	973566	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009050	CCGACG	2	12	986562	986573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009050	GGTTTG	2	12	988753	988764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009050	GGGGAA	2	12	1056468	1056479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009050	CGCCAG	2	12	1065264	1065275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009050	GGCGCA	2	12	1108202	1108213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009050	CTGCGG	2	12	1187947	1187958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009050	TCTTCC	2	12	1188004	1188015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009050	GGGTCC	2	12	1209905	1209916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009050	AGCCGC	2	12	1214241	1214252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.