MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 2

Total Repeats: 1207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009050	GGCCG	2	10	266	275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009050	GACAG	2	10	310	319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009050	CGGCG	2	10	1003	1012	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009050	GGGCC	2	10	1782	1791	0 %	0 %	60 %	40 %	126463754
5	NC_009050	CATGC	2	10	4207	4216	20 %	20 %	20 %	40 %	126463755
6	NC_009050	CCCCG	2	10	5712	5721	0 %	0 %	20 %	80 %	126463756
7	NC_009050	GCCAG	2	10	7543	7552	20 %	0 %	40 %	40 %	126463757
8	NC_009050	CCCGG	2	10	7739	7748	0 %	0 %	40 %	60 %	126463757
9	NC_009050	GCGGT	2	10	9089	9098	0 %	20 %	60 %	20 %	126463758
10	NC_009050	CGACC	2	10	9648	9657	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009050	ACGAG	2	10	10614	10623	40 %	0 %	40 %	20 %	126463759
12	NC_009050	GGCCC	2	10	10942	10951	0 %	0 %	40 %	60 %	126463760
13	NC_009050	CCGCT	2	10	15618	15627	0 %	20 %	20 %	60 %	126463764
14	NC_009050	CTGCT	2	10	17205	17214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009050	TCTGG	2	10	17699	17708	0 %	40 %	40 %	20 %	126463767
16	NC_009050	CGCCA	2	10	18993	19002	20 %	0 %	20 %	60 %	126463769
17	NC_009050	CACTC	2	10	20450	20459	20 %	20 %	0 %	60 %	126463771
18	NC_009050	CGCGC	2	10	21859	21868	0 %	0 %	40 %	60 %	126463772
19	NC_009050	GACGA	2	10	22957	22966	40 %	0 %	40 %	20 %	126463774
20	NC_009050	GGCGC	2	10	23450	23459	0 %	0 %	60 %	40 %	126463774
21	NC_009050	CCCGC	3	15	23876	23890	0 %	0 %	20 %	80 %	126463774
22	NC_009050	GCCGG	2	10	25757	25766	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009050	GTCAT	2	10	27543	27552	20 %	40 %	20 %	20 %	126463777
24	NC_009050	AGGCG	2	10	28903	28912	20 %	0 %	60 %	20 %	126463778
25	NC_009050	AGCGC	2	10	29896	29905	20 %	0 %	40 %	40 %	126463780
26	NC_009050	CTCGC	2	10	31822	31831	0 %	20 %	20 %	60 %	126463782
27	NC_009050	GGCCC	2	10	32267	32276	0 %	0 %	40 %	60 %	126463782
28	NC_009050	CGCGG	2	10	33073	33082	0 %	0 %	60 %	40 %	126463783
29	NC_009050	GGCCC	2	10	33497	33506	0 %	0 %	40 %	60 %	126463784
30	NC_009050	GGGCT	2	10	34269	34278	0 %	20 %	60 %	20 %	126463785
31	NC_009050	CCGGC	2	10	34439	34448	0 %	0 %	40 %	60 %	126463785
32	NC_009050	GCCGC	2	10	35236	35245	0 %	0 %	40 %	60 %	126463786
33	NC_009050	AGCCC	2	10	37158	37167	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009050	CCGGG	2	10	38389	38398	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009050	CCGGC	2	10	40196	40205	0 %	0 %	40 %	60 %	126463791
36	NC_009050	TCGGA	2	10	41977	41986	20 %	20 %	40 %	20 %	126463792
37	NC_009050	CCGCA	2	10	42297	42306	20 %	0 %	20 %	60 %	126463792
38	NC_009050	CCGGC	2	10	42462	42471	0 %	0 %	40 %	60 %	126463792
39	NC_009050	CGGCA	2	10	43182	43191	20 %	0 %	40 %	40 %	126463793
40	NC_009050	GGGCA	2	10	43467	43476	20 %	0 %	60 %	20 %	126463793
41	NC_009050	GCCCG	2	10	44012	44021	0 %	0 %	40 %	60 %	126463794
42	NC_009050	CGGGC	2	10	44058	44067	0 %	0 %	60 %	40 %	126463794
43	NC_009050	CGGCC	2	10	45892	45901	0 %	0 %	40 %	60 %	126463796
44	NC_009050	GCCCC	2	10	46500	46509	0 %	0 %	20 %	80 %	126463796
45	NC_009050	GATCG	2	10	46567	46576	20 %	20 %	40 %	20 %	126463796
46	NC_009050	CATGG	2	10	46818	46827	20 %	20 %	40 %	20 %	126463797
47	NC_009050	GAGGC	2	10	47792	47801	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009050	GCGCA	2	10	48569	48578	20 %	0 %	40 %	40 %	126463798
49	NC_009050	AGGAC	2	10	49610	49619	40 %	0 %	40 %	20 %	126463799
50	NC_009050	TGCCC	2	10	49898	49907	0 %	20 %	20 %	60 %	126463799
51	NC_009050	GGCCG	2	10	52444	52453	0 %	0 %	60 %	40 %	126463802
52	NC_009050	GCCGG	2	10	52558	52567	0 %	0 %	60 %	40 %	126463802
53	NC_009050	CGCGG	2	10	54516	54525	0 %	0 %	60 %	40 %	126463804
54	NC_009050	CCTGC	2	10	54590	54599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_009050	CTGGC	2	10	55030	55039	0 %	20 %	40 %	40 %	126463805
56	NC_009050	GCGCG	2	10	56425	56434	0 %	0 %	60 %	40 %	126463805
57	NC_009050	GCGCC	2	10	57051	57060	0 %	0 %	40 %	60 %	126463806
58	NC_009050	GCCCG	2	10	59180	59189	0 %	0 %	40 %	60 %	126463807
59	NC_009050	GCCGG	2	10	59475	59484	0 %	0 %	60 %	40 %	126463807
60	NC_009050	CCGCG	2	10	59662	59671	0 %	0 %	40 %	60 %	126463807
61	NC_009050	GCCCG	2	10	60739	60748	0 %	0 %	40 %	60 %	126463808
62	NC_009050	GGCCG	2	10	61994	62003	0 %	0 %	60 %	40 %	126463809
63	NC_009050	GCGAG	2	10	62658	62667	20 %	0 %	60 %	20 %	126463810
64	NC_009050	GGCGC	2	10	65638	65647	0 %	0 %	60 %	40 %	126463813
65	NC_009050	GATCG	2	10	65935	65944	20 %	20 %	40 %	20 %	126463813
66	NC_009050	CGAGA	2	10	67665	67674	40 %	0 %	40 %	20 %	126463815
67	NC_009050	CCGGC	2	10	68618	68627	0 %	0 %	40 %	60 %	126463816
68	NC_009050	GCTCC	2	10	69412	69421	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_009050	GGCAG	2	10	69495	69504	20 %	0 %	60 %	20 %	126463817
70	NC_009050	GCCAG	2	10	70805	70814	20 %	0 %	40 %	40 %	126463818
71	NC_009050	GCGCC	2	10	72046	72055	0 %	0 %	40 %	60 %	126463819
72	NC_009050	CCCGG	2	10	72325	72334	0 %	0 %	40 %	60 %	126463819
73	NC_009050	CCGCC	2	10	73457	73466	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_009050	CTCCG	2	10	73571	73580	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009050	CACCG	2	10	76854	76863	20 %	0 %	20 %	60 %	126463822
76	NC_009050	CGGGC	2	10	77008	77017	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009050	AGAGG	2	10	77049	77058	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009050	GGACG	2	10	79254	79263	20 %	0 %	60 %	20 %	126463824
79	NC_009050	GCTCC	2	10	79562	79571	0 %	20 %	20 %	60 %	126463824
80	NC_009050	CAGGC	2	10	79984	79993	20 %	0 %	40 %	40 %	126463824
81	NC_009050	CGGGA	2	10	80407	80416	20 %	0 %	60 %	20 %	126463825
82	NC_009050	GATCC	2	10	81608	81617	20 %	20 %	20 %	40 %	126463827
83	NC_009050	GGCGG	2	10	82279	82288	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009050	CCGGC	2	10	82651	82660	0 %	0 %	40 %	60 %	126463828
85	NC_009050	GCCCA	2	10	84343	84352	20 %	0 %	20 %	60 %	126463830
86	NC_009050	ACGCT	2	10	85156	85165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009050	CCCCG	2	10	86614	86623	0 %	0 %	20 %	80 %	126463831
88	NC_009050	CGCTC	2	10	87458	87467	0 %	20 %	20 %	60 %	126463832
89	NC_009050	CGACC	2	10	88320	88329	20 %	0 %	20 %	60 %	126463832
90	NC_009050	ATCTG	2	10	88781	88790	20 %	40 %	20 %	20 %	126463832
91	NC_009050	CCGCC	2	10	89575	89584	0 %	0 %	20 %	80 %	126463833
92	NC_009050	CCGAC	2	10	92775	92784	20 %	0 %	20 %	60 %	126463835
93	NC_009050	GCGCC	2	10	93471	93480	0 %	0 %	40 %	60 %	126463836
94	NC_009050	GTCGC	2	10	95332	95341	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009050	CCCTT	2	10	95356	95365	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_009050	GCCGT	2	10	101054	101063	0 %	20 %	40 %	40 %	126463844
97	NC_009050	CCTCG	2	10	101148	101157	0 %	20 %	20 %	60 %	126463844
98	NC_009050	CGATG	2	10	101517	101526	20 %	20 %	40 %	20 %	126463845
99	NC_009050	CGGCG	2	10	102499	102508	0 %	0 %	60 %	40 %	126463846
100	NC_009050	CGCCC	2	10	103009	103018	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
101	NC_009050	GGCGG	2	10	103228	103237	0 %	0 %	80 %	20 %	126463847
102	NC_009050	ACCCG	2	10	104925	104934	20 %	0 %	20 %	60 %	126463848
103	NC_009050	CATGG	2	10	106437	106446	20 %	20 %	40 %	20 %	126463850
104	NC_009050	CCGCG	2	10	106490	106499	0 %	0 %	40 %	60 %	126463850
105	NC_009050	CTTCC	2	10	107921	107930	0 %	40 %	0 %	60 %	126463851
106	NC_009050	CCGCG	2	10	108047	108056	0 %	0 %	40 %	60 %	126463851
107	NC_009050	CATCG	2	10	108640	108649	20 %	20 %	20 %	40 %	126463852
108	NC_009050	GCGCC	2	10	109496	109505	0 %	0 %	40 %	60 %	126463853
109	NC_009050	TGCGC	2	10	111318	111327	0 %	20 %	40 %	40 %	126463855
110	NC_009050	CCCCG	2	10	111664	111673	0 %	0 %	20 %	80 %	126463855
111	NC_009050	TTCCC	2	10	113735	113744	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_009050	GGCGA	2	10	115713	115722	20 %	0 %	60 %	20 %	126463860
113	NC_009050	GCGCG	2	10	116369	116378	0 %	0 %	60 %	40 %	126463860
114	NC_009050	TTTCG	2	10	116576	116585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009050	CATGC	2	10	117119	117128	20 %	20 %	20 %	40 %	126463861
116	NC_009050	CGGGA	2	10	117377	117386	20 %	0 %	60 %	20 %	126463861
117	NC_009050	CCCCA	2	10	117897	117906	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
118	NC_009050	GCTCG	2	10	119177	119186	0 %	20 %	40 %	40 %	126463863
119	NC_009050	GCCGC	2	10	119247	119256	0 %	0 %	40 %	60 %	126463863
120	NC_009050	GCCCG	2	10	123858	123867	0 %	0 %	40 %	60 %	126463868
121	NC_009050	CCGTC	2	10	124736	124745	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_009050	CGGGC	2	10	125242	125251	0 %	0 %	60 %	40 %	126463870
123	NC_009050	GCCGG	2	10	125317	125326	0 %	0 %	60 %	40 %	126463870
124	NC_009050	CGGCG	2	10	125356	125365	0 %	0 %	60 %	40 %	126463870
125	NC_009050	CGGCT	2	10	125594	125603	0 %	20 %	40 %	40 %	126463870
126	NC_009050	GCCGC	2	10	126125	126134	0 %	0 %	40 %	60 %	126463870
127	NC_009050	TCTCG	2	10	127256	127265	0 %	40 %	20 %	40 %	126463871
128	NC_009050	CGCAG	2	10	130972	130981	20 %	0 %	40 %	40 %	126463876
129	NC_009050	AGGCG	2	10	135007	135016	20 %	0 %	60 %	20 %	126463878
130	NC_009050	CGATC	2	10	136158	136167	20 %	20 %	20 %	40 %	126463879
131	NC_009050	CCGGC	2	10	136240	136249	0 %	0 %	40 %	60 %	126463879
132	NC_009050	TGCGC	2	10	136518	136527	0 %	20 %	40 %	40 %	126463879
133	NC_009050	CATGA	2	10	139686	139695	40 %	20 %	20 %	20 %	126463882
134	NC_009050	GCGCC	2	10	140050	140059	0 %	0 %	40 %	60 %	126463883
135	NC_009050	TGCCC	2	10	140669	140678	0 %	20 %	20 %	60 %	126463884
136	NC_009050	GCGCA	2	10	140755	140764	20 %	0 %	40 %	40 %	126463884
137	NC_009050	CGCGG	2	10	141208	141217	0 %	0 %	60 %	40 %	126463884
138	NC_009050	GACGG	2	10	141393	141402	20 %	0 %	60 %	20 %	126463884
139	NC_009050	CGGAC	2	10	141560	141569	20 %	0 %	40 %	40 %	126463884
140	NC_009050	GCCCG	2	10	142200	142209	0 %	0 %	40 %	60 %	126463884
141	NC_009050	CGCGG	2	10	143058	143067	0 %	0 %	60 %	40 %	126463885
142	NC_009050	CCCCG	2	10	143255	143264	0 %	0 %	20 %	80 %	126463885
143	NC_009050	CTCGG	2	10	143268	143277	0 %	20 %	40 %	40 %	126463885
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150	NC_009050	GCCGT	2	10	145634	145643	0 %	20 %	40 %	40 %	126463888
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153	NC_009050	CGCGC	2	10	147137	147146	0 %	0 %	40 %	60 %	126463889
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157	NC_009050	GCCGC	2	10	150687	150696	0 %	0 %	40 %	60 %	126463890
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243	NC_009050	TCCCG	2	10	230554	230563	0 %	20 %	20 %	60 %	126463950
244	NC_009050	AGGCC	2	10	230590	230599	20 %	0 %	40 %	40 %	126463950
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246	NC_009050	TCCGT	2	10	233118	233127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
247	NC_009050	CGGTC	2	10	233882	233891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_009050	GCCGC	2	10	234616	234625	0 %	0 %	40 %	60 %	126463952
249	NC_009050	GGGCA	2	10	235546	235555	20 %	0 %	60 %	20 %	126463952
250	NC_009050	GGCAG	2	10	235944	235953	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_009050	CGATC	2	10	254350	254359	20 %	20 %	20 %	40 %	126463961
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400	NC_009050	CGGCG	2	10	397608	397617	0 %	0 %	60 %	40 %	126464099
401	NC_009050	CAGGA	2	10	397732	397741	40 %	0 %	40 %	20 %	126464099
402	NC_009050	GCGCT	2	10	397771	397780	0 %	20 %	40 %	40 %	126464099
403	NC_009050	GGTCA	2	10	398296	398305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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434	NC_009050	TGGCC	2	10	431233	431242	0 %	20 %	40 %	40 %	126464135
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440	NC_009050	CCGCA	2	10	439904	439913	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
441	NC_009050	CTGCC	2	10	444122	444131	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
442	NC_009050	TCGCC	2	10	445818	445827	0 %	20 %	20 %	60 %	126464144
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444	NC_009050	CCCGG	2	10	447085	447094	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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451	NC_009050	GCGCC	2	10	454317	454326	0 %	0 %	40 %	60 %	126464151
452	NC_009050	GCGCC	2	10	456120	456129	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
453	NC_009050	GAGAG	2	10	456347	456356	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_009050	GCCTC	2	10	507904	507913	0 %	20 %	20 %	60 %	126464190
498	NC_009050	GGCGC	2	10	508241	508250	0 %	0 %	60 %	40 %	126464190
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500	NC_009050	CCTCG	2	10	508553	508562	0 %	20 %	20 %	60 %	126464190

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