MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 1

Total Repeats: 3004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009049	GATCC	2	10	1222	1231	20 %	20 %	20 %	40 %	126460779
2	NC_009049	CGGAC	2	10	4044	4053	20 %	0 %	40 %	40 %	126460782
3	NC_009049	CTGCG	2	10	4920	4929	0 %	20 %	40 %	40 %	126460783
4	NC_009049	AGCCC	2	10	4974	4983	20 %	0 %	20 %	60 %	126460784
5	NC_009049	CATCG	2	10	6849	6858	20 %	20 %	20 %	40 %	126460785
6	NC_009049	GGTGG	2	10	9798	9807	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009049	CGGGG	2	10	12752	12761	0 %	0 %	80 %	20 %	126460791
8	NC_009049	CCCTG	2	10	14101	14110	0 %	20 %	20 %	60 %	126460792
9	NC_009049	CAAAG	2	10	14182	14191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009049	CCGGG	2	10	16090	16099	0 %	0 %	60 %	40 %	126460793
11	NC_009049	AGCCG	2	10	16639	16648	20 %	0 %	40 %	40 %	126460794
12	NC_009049	CAGGG	2	10	19163	19172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009049	TCGGC	2	10	19502	19511	0 %	20 %	40 %	40 %	126460796
14	NC_009049	GCGAT	2	10	20732	20741	20 %	20 %	40 %	20 %	126460797
15	NC_009049	GCGAC	2	10	20771	20780	20 %	0 %	40 %	40 %	126460797
16	NC_009049	CGGGG	2	10	21452	21461	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009049	CGCGC	2	10	24115	24124	0 %	0 %	40 %	60 %	126460800
18	NC_009049	AGCGC	2	10	26901	26910	20 %	0 %	40 %	40 %	126460801
19	NC_009049	CGCGC	2	10	28700	28709	0 %	0 %	40 %	60 %	126460802
20	NC_009049	CGGGT	2	10	29539	29548	0 %	20 %	60 %	20 %	126460802
21	NC_009049	TCGGC	2	10	31091	31100	0 %	20 %	40 %	40 %	126460802
22	NC_009049	GGCGG	2	10	32779	32788	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009049	GATCA	2	10	32922	32931	40 %	20 %	20 %	20 %	126460803
24	NC_009049	CGCGC	2	10	35844	35853	0 %	0 %	40 %	60 %	126460804
25	NC_009049	CGCCC	2	10	36487	36496	0 %	0 %	20 %	80 %	126460805
26	NC_009049	GGCCG	2	10	36777	36786	0 %	0 %	60 %	40 %	126460805
27	NC_009049	AGGTG	2	10	38354	38363	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009049	GGGCT	2	10	39782	39791	0 %	20 %	60 %	20 %	126460808
29	NC_009049	CAGCG	2	10	41236	41245	20 %	0 %	40 %	40 %	126460809
30	NC_009049	CCTCG	2	10	41649	41658	0 %	20 %	20 %	60 %	126460809
31	NC_009049	CCGGC	2	10	42034	42043	0 %	0 %	40 %	60 %	126460810
32	NC_009049	GATCA	2	10	43530	43539	40 %	20 %	20 %	20 %	126460812
33	NC_009049	GATCG	2	10	45188	45197	20 %	20 %	40 %	20 %	126460813
34	NC_009049	CCGCA	2	10	45914	45923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009049	CCTGC	2	10	46244	46253	0 %	20 %	20 %	60 %	126460815
36	NC_009049	CTTCT	2	10	50736	50745	0 %	60 %	0 %	40 %	126460818
37	NC_009049	ATGAC	2	10	50905	50914	40 %	20 %	20 %	20 %	126460818
38	NC_009049	TGGGC	2	10	51288	51297	0 %	20 %	60 %	20 %	126460819
39	NC_009049	CGGAT	2	10	52350	52359	20 %	20 %	40 %	20 %	126460820
40	NC_009049	TCAGG	2	10	56171	56180	20 %	20 %	40 %	20 %	126460824
41	NC_009049	CCTTT	2	10	56472	56481	0 %	60 %	0 %	40 %	126460825
42	NC_009049	CCGCG	2	10	56826	56835	0 %	0 %	40 %	60 %	126460825
43	NC_009049	ATGCG	2	10	57332	57341	20 %	20 %	40 %	20 %	126460825
44	NC_009049	GCCGC	2	10	58063	58072	0 %	0 %	40 %	60 %	126460826
45	NC_009049	TGGGT	2	10	58264	58273	0 %	40 %	60 %	0 %	126460826
46	NC_009049	TTCTG	2	10	58504	58513	0 %	60 %	20 %	20 %	126460826
47	NC_009049	GCGCA	2	10	58542	58551	20 %	0 %	40 %	40 %	126460826
48	NC_009049	CGAGC	2	10	58897	58906	20 %	0 %	40 %	40 %	126460827
49	NC_009049	GGCCG	2	10	59914	59923	0 %	0 %	60 %	40 %	126460827
50	NC_009049	CGTGG	2	10	60426	60435	0 %	20 %	60 %	20 %	126460828
51	NC_009049	CGGGG	2	10	62208	62217	0 %	0 %	80 %	20 %	126460830
52	NC_009049	CTGCG	2	10	62326	62335	0 %	20 %	40 %	40 %	126460830
53	NC_009049	GGCCG	2	10	62463	62472	0 %	0 %	60 %	40 %	126460830
54	NC_009049	AGCCG	2	10	64247	64256	20 %	0 %	40 %	40 %	126460832
55	NC_009049	TCCGC	2	10	64445	64454	0 %	20 %	20 %	60 %	126460832
56	NC_009049	CGGCA	2	10	65904	65913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009049	CGGCG	2	10	66112	66121	0 %	0 %	60 %	40 %	126460834
58	NC_009049	CGTTC	2	10	68157	68166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009049	ATGAG	2	10	68183	68192	40 %	20 %	40 %	0 %	126460836
60	NC_009049	GCTGC	2	10	69840	69849	0 %	20 %	40 %	40 %	126460837
61	NC_009049	ATGGC	2	10	69973	69982	20 %	20 %	40 %	20 %	126460837
62	NC_009049	GGCGT	2	10	70455	70464	0 %	20 %	60 %	20 %	126460837
63	NC_009049	TCGGC	2	10	71521	71530	0 %	20 %	40 %	40 %	126460839
64	NC_009049	AGCGC	2	10	76904	76913	20 %	0 %	40 %	40 %	126460845
65	NC_009049	CGACC	2	10	79861	79870	20 %	0 %	20 %	60 %	126460849
66	NC_009049	GATCG	2	10	82305	82314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009049	CTGCA	2	10	83341	83350	20 %	20 %	20 %	40 %	126460853
68	NC_009049	CGCCA	2	10	85171	85180	20 %	0 %	20 %	60 %	126460854
69	NC_009049	CTGCG	2	10	86111	86120	0 %	20 %	40 %	40 %	126460855
70	NC_009049	TCTGG	2	10	86752	86761	0 %	40 %	40 %	20 %	126460856
71	NC_009049	CGCTG	2	10	86865	86874	0 %	20 %	40 %	40 %	126460856
72	NC_009049	TGTGG	2	10	87286	87295	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009049	TCGTG	2	10	88778	88787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009049	GATCA	2	10	89891	89900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009049	CTCAT	2	10	92438	92447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009049	ATCCC	2	10	92946	92955	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_009049	CGAGC	2	10	94249	94258	20 %	0 %	40 %	40 %	126460860
78	NC_009049	AGCGC	2	10	95340	95349	20 %	0 %	40 %	40 %	126460861
79	NC_009049	TCGGC	2	10	95942	95951	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009049	CGGCT	2	10	97339	97348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009049	AGGCG	2	10	97898	97907	20 %	0 %	60 %	20 %	126460864
82	NC_009049	GACCC	2	10	98043	98052	20 %	0 %	20 %	60 %	126460864
83	NC_009049	GGGCG	2	10	98293	98302	0 %	0 %	80 %	20 %	126460865
84	NC_009049	GCGCG	2	10	98313	98322	0 %	0 %	60 %	40 %	126460865
85	NC_009049	GCCAG	2	10	98581	98590	20 %	0 %	40 %	40 %	126460865
86	NC_009049	GCCGC	2	10	98820	98829	0 %	0 %	40 %	60 %	126460865
87	NC_009049	GCGCC	2	10	98905	98914	0 %	0 %	40 %	60 %	126460865
88	NC_009049	AGCGC	2	10	100158	100167	20 %	0 %	40 %	40 %	126460866
89	NC_009049	GGCGC	2	10	100899	100908	0 %	0 %	60 %	40 %	126460866
90	NC_009049	GGCGC	2	10	101279	101288	0 %	0 %	60 %	40 %	126460867
91	NC_009049	TCTGC	2	10	102863	102872	0 %	40 %	20 %	40 %	126460867
92	NC_009049	GATCG	2	10	103576	103585	20 %	20 %	40 %	20 %	126460868
93	NC_009049	GGCGC	2	10	103997	104006	0 %	0 %	60 %	40 %	126460868
94	NC_009049	CCGCC	2	10	105162	105171	0 %	0 %	20 %	80 %	126460869
95	NC_009049	CTGGG	2	10	106428	106437	0 %	20 %	60 %	20 %	126460870
96	NC_009049	GCCTC	2	10	106816	106825	0 %	20 %	20 %	60 %	126460870
97	NC_009049	GGGCG	2	10	108554	108563	0 %	0 %	80 %	20 %	126460872
98	NC_009049	CGGGT	2	10	108685	108694	0 %	20 %	60 %	20 %	126460872
99	NC_009049	CGGGA	2	10	108962	108971	20 %	0 %	60 %	20 %	126460873
100	NC_009049	CTCGG	2	10	109490	109499	0 %	20 %	40 %	40 %	126460873
101	NC_009049	CGGGG	2	10	110178	110187	0 %	0 %	80 %	20 %	126460874
102	NC_009049	CGGCG	2	10	110436	110445	0 %	0 %	60 %	40 %	126460874
103	NC_009049	GCCGC	2	10	110694	110703	0 %	0 %	40 %	60 %	126460874
104	NC_009049	CCCGG	2	10	110944	110953	0 %	0 %	40 %	60 %	126460875
105	NC_009049	TGCGT	2	10	113166	113175	0 %	40 %	40 %	20 %	126460877
106	NC_009049	TGCCA	2	10	114922	114931	20 %	20 %	20 %	40 %	126460878
107	NC_009049	TCCAC	2	10	115334	115343	20 %	20 %	0 %	60 %	126460878
108	NC_009049	CGATC	2	10	115848	115857	20 %	20 %	20 %	40 %	126460879
109	NC_009049	GGGCG	2	10	115944	115953	0 %	0 %	80 %	20 %	126460879
110	NC_009049	GCGCC	2	10	119951	119960	0 %	0 %	40 %	60 %	126460882
111	NC_009049	GCCGT	2	10	120530	120539	0 %	20 %	40 %	40 %	126460882
112	NC_009049	TCCGG	2	10	122815	122824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009049	GCCGT	2	10	122936	122945	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009049	GCCCT	2	10	123311	123320	0 %	20 %	20 %	60 %	126460885
115	NC_009049	CTGGC	2	10	123347	123356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009049	CCGGC	2	10	123626	123635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_009049	GCCCC	2	10	124193	124202	0 %	0 %	20 %	80 %	126460886
118	NC_009049	GCGCC	2	10	124404	124413	0 %	0 %	40 %	60 %	126460886
119	NC_009049	GATCG	2	10	124487	124496	20 %	20 %	40 %	20 %	126460886
120	NC_009049	GAGTC	2	10	125391	125400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009049	GCCGG	2	10	125625	125634	0 %	0 %	60 %	40 %	126460887
122	NC_009049	CTCGG	2	10	126478	126487	0 %	20 %	40 %	40 %	126460888
123	NC_009049	CGGCC	2	10	127301	127310	0 %	0 %	40 %	60 %	126460890
124	NC_009049	CGCGG	2	10	128579	128588	0 %	0 %	60 %	40 %	126460891
125	NC_009049	CGGGG	2	10	129518	129527	0 %	0 %	80 %	20 %	126460892
126	NC_009049	GCGCG	2	10	129932	129941	0 %	0 %	60 %	40 %	126460892
127	NC_009049	GCGCC	2	10	131851	131860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_009049	GCTGG	2	10	132716	132725	0 %	20 %	60 %	20 %	126460895
129	NC_009049	GCCCG	2	10	133981	133990	0 %	0 %	40 %	60 %	126460896
130	NC_009049	CAGGG	2	10	136792	136801	20 %	0 %	60 %	20 %	126460899
131	NC_009049	GAAAG	2	10	137540	137549	60 %	0 %	40 %	0 %	126460900
132	NC_009049	TGCGC	2	10	137729	137738	0 %	20 %	40 %	40 %	126460901
133	NC_009049	GCCGT	2	10	138323	138332	0 %	20 %	40 %	40 %	126460902
134	NC_009049	CGCGG	2	10	138373	138382	0 %	0 %	60 %	40 %	126460902
135	NC_009049	TGGCC	2	10	139093	139102	0 %	20 %	40 %	40 %	126460903
136	NC_009049	GATCG	2	10	141243	141252	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009049	CGGCG	2	10	141891	141900	0 %	0 %	60 %	40 %	126460905
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139	NC_009049	CGCGC	2	10	146741	146750	0 %	0 %	40 %	60 %	126460909
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397	NC_009049	CGGCG	2	10	412050	412059	0 %	0 %	60 %	40 %	126461172
398	NC_009049	GCGGT	2	10	412578	412587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
399	NC_009049	GCGCC	2	10	413899	413908	0 %	0 %	40 %	60 %	126461173
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401	NC_009049	GTTTC	2	10	415204	415213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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454	NC_009049	GTCGG	2	10	456929	456938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
455	NC_009049	CCGGG	2	10	457564	457573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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