MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	GGGGC	2	10	4770	4779	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009040	CCGGG	2	10	25328	25337	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009040	CAGGG	2	10	25377	25386	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009040	CCGGG	2	10	25457	25466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009040	AGGGC	2	10	31651	31660	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009040	CAGAC	2	10	33378	33387	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009040	GGGGC	2	10	40461	40470	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009040	GCAGG	2	10	40512	40521	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009040	CGGGG	2	10	43028	43037	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009040	GCCAC	2	10	56931	56940	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009040	GACGA	2	10	60433	60442	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009040	AGCAC	2	10	71912	71921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009040	GCCGC	2	10	82532	82541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009040	CCCGG	2	10	83177	83186	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009040	CAAGA	2	10	83447	83456	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009040	CGTGG	2	10	83484	83493	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009040	CAGGA	2	10	86525	86534	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009040	TCGGT	2	10	89378	89387	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009040	CCTGC	2	10	89590	89599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009040	CCGGC	2	10	99426	99435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_009040	CTGCC	2	10	100574	100583	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009040	GGCGG	2	10	102412	102421	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009040	CCCTT	2	10	104143	104152	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009040	CCGGG	2	10	109455	109464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009040	GCCCG	2	10	110232	110241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009040	TCCCG	2	10	110850	110859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009040	GCCGG	2	10	110956	110965	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009040	ACCGG	2	10	114470	114479	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.