MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	TCC	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009040	CCA	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009040	TTC	2	6	4844	4849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009040	GCG	2	6	4853	4858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009040	CGC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009040	CCG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009040	TCC	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009040	GCG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009040	GAG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009040	CCT	2	6	6799	6804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009040	CGC	2	6	6878	6883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009040	CGC	2	6	11111	11116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009040	CCG	2	6	12011	12016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009040	GCC	2	6	12022	12027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009040	CCG	2	6	12042	12047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009040	GCG	2	6	12076	12081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009040	GCG	2	6	12913	12918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009040	GCG	2	6	13032	13037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009040	CGC	2	6	18363	18368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009040	CCG	2	6	19378	19383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009040	CTG	3	9	19471	19479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009040	GGC	2	6	19550	19555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009040	CCG	2	6	19559	19564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009040	CCG	2	6	19842	19847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009040	GTT	2	6	21526	21531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009040	CGG	2	6	21570	21575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009040	TCC	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009040	CGC	3	9	22775	22783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009040	TCC	2	6	22791	22796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009040	GGT	2	6	22888	22893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009040	GCG	2	6	22934	22939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009040	GGC	2	6	23853	23858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009040	AGG	3	9	25013	25021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009040	GCC	4	12	25068	25079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009040	GCC	2	6	25092	25097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009040	GCC	4	12	25167	25178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009040	CGG	2	6	25280	25285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009040	CGC	2	6	25292	25297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009040	CGG	2	6	25397	25402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009040	CGC	2	6	25433	25438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009040	GCC	3	9	25658	25666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009040	GTT	2	6	26550	26555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009040	CAG	2	6	29882	29887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009040	TCC	2	6	31448	31453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009040	CGA	2	6	31466	31471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009040	CTT	2	6	31474	31479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009040	GAG	2	6	31578	31583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009040	CGC	2	6	31632	31637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009040	CGG	2	6	31675	31680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009040	GCC	2	6	31704	31709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009040	GAG	2	6	31718	31723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009040	CGG	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009040	CGG	2	6	31758	31763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009040	CGG	2	6	31784	31789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009040	CGG	2	6	31804	31809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009040	CGG	2	6	31861	31866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009040	AGG	2	6	31867	31872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009040	GCG	2	6	31919	31924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009040	CGG	2	6	33270	33275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009040	CGG	2	6	33316	33321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009040	CTT	2	6	33324	33329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009040	TTC	2	6	33355	33360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009040	GCC	2	6	34378	34383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009040	GCG	2	6	34425	34430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009040	GTT	2	6	35835	35840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009040	AGA	2	6	35873	35878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009040	GCG	2	6	38786	38791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009040	CGA	2	6	38882	38887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009040	CGC	2	6	38893	38898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009040	CGG	2	6	38941	38946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009040	CGC	2	6	38952	38957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009040	GCT	2	6	38991	38996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009040	GCC	2	6	39000	39005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009040	CTT	2	6	39429	39434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009040	GGC	2	6	39852	39857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009040	GCA	2	6	39926	39931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009040	CGG	2	6	39997	40002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009040	GCG	2	6	40272	40277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009040	GCC	2	6	40289	40294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009040	GCC	2	6	40315	40320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009040	CGA	2	6	40355	40360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009040	GGC	2	6	40381	40386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009040	GGA	2	6	40449	40454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009040	CGG	2	6	40542	40547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009040	TCC	3	9	42864	42872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009040	CCG	2	6	42928	42933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009040	GCT	2	6	42946	42951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009040	CTC	2	6	42983	42988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009040	GCT	2	6	42997	43002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009040	GGC	2	6	43003	43008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009040	GCT	2	6	43045	43050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009040	GCC	3	9	43052	43060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009040	CGG	2	6	43072	43077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009040	GCG	2	6	43093	43098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009040	CGG	2	6	47125	47130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009040	CGC	2	6	47138	47143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009040	GCC	2	6	47170	47175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009040	GGC	3	9	47322	47330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009040	CGG	2	6	47355	47360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009040	CGG	2	6	47381	47386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009040	GCC	2	6	47420	47425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009040	GAC	2	6	47433	47438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009040	CTG	2	6	47662	47667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009040	CAT	2	6	47673	47678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009040	CGC	2	6	47784	47789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009040	TGG	2	6	48176	48181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009040	TAC	2	6	48463	48468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009040	GCC	2	6	48511	48516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009040	GGC	2	6	48554	48559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009040	GGA	2	6	48586	48591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009040	CGC	2	6	48619	48624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009040	AGA	2	6	49427	49432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009040	CGG	2	6	49521	49526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009040	GGT	2	6	49576	49581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009040	CGG	2	6	49597	49602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009040	GAT	2	6	49605	49610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009040	TGT	2	6	49659	49664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009040	GCC	2	6	49665	49670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009040	CTC	2	6	49746	49751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009040	CGT	2	6	49820	49825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009040	AAT	2	6	49902	49907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009040	TCA	2	6	50050	50055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009040	GGC	2	6	50085	50090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009040	GAA	2	6	50374	50379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009040	GTA	2	6	50409	50414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009040	CGG	2	6	50572	50577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009040	GCC	2	6	50930	50935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009040	AAT	2	6	50946	50951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009040	TGT	2	6	50952	50957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009040	AGG	2	6	56881	56886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009040	AGC	2	6	57091	57096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009040	CTT	2	6	57121	57126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009040	CGA	2	6	57226	57231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009040	GCC	2	6	57258	57263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009040	GAG	2	6	57293	57298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009040	CCG	2	6	57358	57363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009040	GTT	2	6	57416	57421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009040	TCC	2	6	57439	57444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009040	GGC	2	6	57455	57460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009040	GTC	2	6	58453	58458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009040	GTC	2	6	59861	59866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_009040	CGC	2	6	114433	114438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_009040	CCT	2	6	119203	119208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_009040	GCC	2	6	122601	122606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.