MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	CT	3	6	61	66	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009040	AG	3	6	78	83	50 %	0 %	50 %	0 %	126464806
3	NC_009040	GC	3	6	441	446	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
4	NC_009040	GC	3	6	585	590	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
5	NC_009040	GA	3	6	2549	2554	50 %	0 %	50 %	0 %	126464806
6	NC_009040	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
7	NC_009040	GC	3	6	3465	3470	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
8	NC_009040	GC	3	6	3513	3518	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
9	NC_009040	GC	3	6	3705	3710	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
10	NC_009040	GC	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
11	NC_009040	GC	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
12	NC_009040	GC	3	6	4221	4226	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
13	NC_009040	CG	3	6	4891	4896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009040	TC	3	6	5049	5054	0 %	50 %	0 %	50 %	126464807
15	NC_009040	TC	3	6	5722	5727	0 %	50 %	0 %	50 %	126464807
16	NC_009040	GC	4	8	5845	5852	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
17	NC_009040	GC	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
18	NC_009040	CG	3	6	6806	6811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009040	GC	3	6	6963	6968	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
20	NC_009040	GC	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
21	NC_009040	CG	4	8	7380	7387	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
22	NC_009040	CG	3	6	7692	7697	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
23	NC_009040	GC	3	6	7959	7964	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
24	NC_009040	GC	3	6	8339	8344	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
25	NC_009040	GC	3	6	8670	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
26	NC_009040	CG	5	10	8790	8799	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
27	NC_009040	GC	3	6	8843	8848	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
28	NC_009040	GC	3	6	8946	8951	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
29	NC_009040	CG	3	6	9350	9355	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
30	NC_009040	CG	3	6	9428	9433	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
31	NC_009040	CG	3	6	9483	9488	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
32	NC_009040	GC	4	8	9588	9595	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
33	NC_009040	GC	3	6	9630	9635	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
34	NC_009040	CG	3	6	9710	9715	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
35	NC_009040	CG	3	6	9777	9782	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
36	NC_009040	GC	3	6	9863	9868	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
37	NC_009040	CG	3	6	9905	9910	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
38	NC_009040	GC	4	8	9923	9930	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
39	NC_009040	CG	3	6	10054	10059	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
40	NC_009040	CG	3	6	11044	11049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009040	GC	3	6	11213	11218	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
42	NC_009040	CG	3	6	11278	11283	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
43	NC_009040	CG	3	6	11547	11552	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
44	NC_009040	GC	4	8	11992	11999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009040	CG	5	10	12052	12061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009040	GC	3	6	12265	12270	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
47	NC_009040	GC	3	6	12383	12388	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
48	NC_009040	GC	3	6	12603	12608	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
49	NC_009040	CG	3	6	12828	12833	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
50	NC_009040	GC	3	6	12963	12968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009040	GA	3	6	13089	13094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009040	CG	4	8	13199	13206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009040	CG	3	6	13603	13608	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
54	NC_009040	GC	3	6	13649	13654	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
55	NC_009040	CG	3	6	13741	13746	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
56	NC_009040	CG	3	6	13802	13807	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
57	NC_009040	GC	3	6	13914	13919	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
58	NC_009040	GC	3	6	13999	14004	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
59	NC_009040	GC	3	6	14346	14351	0 %	0 %	50 %	50 %	126464814
60	NC_009040	GC	3	6	14679	14684	0 %	0 %	50 %	50 %	126464814
61	NC_009040	GA	3	6	15121	15126	50 %	0 %	50 %	0 %	126464815
62	NC_009040	CG	3	6	15164	15169	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
63	NC_009040	CG	3	6	15248	15253	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
64	NC_009040	CG	3	6	15345	15350	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
65	NC_009040	CG	3	6	15621	15626	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
66	NC_009040	CG	3	6	15704	15709	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
67	NC_009040	GC	4	8	15787	15794	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
68	NC_009040	GC	3	6	16278	16283	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
69	NC_009040	GC	3	6	16636	16641	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
70	NC_009040	CG	4	8	16829	16836	0 %	0 %	50 %	50 %	126464817
71	NC_009040	CT	3	6	16973	16978	0 %	50 %	0 %	50 %	126464817
72	NC_009040	GC	3	6	17590	17595	0 %	0 %	50 %	50 %	126464818
73	NC_009040	CG	3	6	18596	18601	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
74	NC_009040	GC	3	6	19125	19130	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
75	NC_009040	CG	3	6	19417	19422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009040	GC	3	6	19524	19529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009040	GC	4	8	19637	19644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009040	GC	3	6	19704	19709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009040	GA	3	6	19787	19792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009040	TA	4	8	19859	19866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009040	GC	3	6	20123	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
82	NC_009040	TC	3	6	20163	20168	0 %	50 %	0 %	50 %	126464820
83	NC_009040	GC	3	6	20238	20243	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
84	NC_009040	GC	3	6	20264	20269	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
85	NC_009040	GC	3	6	20455	20460	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
86	NC_009040	CG	3	6	20819	20824	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
87	NC_009040	GC	3	6	20871	20876	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
88	NC_009040	GC	5	10	21176	21185	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
89	NC_009040	GC	3	6	21223	21228	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
90	NC_009040	CG	4	8	21533	21540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009040	CG	4	8	21589	21596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009040	GA	3	6	21623	21628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009040	GC	5	10	22184	22193	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
94	NC_009040	CG	3	6	22314	22319	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
95	NC_009040	CG	4	8	22704	22711	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
96	NC_009040	CG	3	6	23027	23032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009040	CG	4	8	23349	23356	0 %	0 %	50 %	50 %	126464822
98	NC_009040	CG	3	6	23785	23790	0 %	0 %	50 %	50 %	126464822
99	NC_009040	GC	3	6	24441	24446	0 %	0 %	50 %	50 %	126464823
100	NC_009040	CG	3	6	24693	24698	0 %	0 %	50 %	50 %	126464823
101	NC_009040	CG	3	6	25127	25132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009040	CG	3	6	25484	25489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009040	CG	3	6	27637	27642	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
104	NC_009040	GC	3	6	27874	27879	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
105	NC_009040	CG	3	6	28483	28488	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
106	NC_009040	GC	3	6	28638	28643	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
107	NC_009040	TC	3	6	29455	29460	0 %	50 %	0 %	50 %	126464826
108	NC_009040	CT	3	6	29932	29937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009040	CG	3	6	30869	30874	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
110	NC_009040	CG	3	6	30895	30900	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
111	NC_009040	CG	4	8	30917	30924	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
112	NC_009040	GC	3	6	30971	30976	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
113	NC_009040	GC	3	6	31584	31589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009040	CG	3	6	31796	31801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009040	GC	3	6	32739	32744	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
116	NC_009040	GC	3	6	32772	32777	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
117	NC_009040	CG	3	6	32907	32912	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
118	NC_009040	CG	3	6	33368	33373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009040	GC	3	6	33405	33410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009040	TC	3	6	33445	33450	0 %	50 %	0 %	50 %	126464829
121	NC_009040	GC	3	6	33493	33498	0 %	0 %	50 %	50 %	126464829
122	NC_009040	CG	3	6	34654	34659	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
123	NC_009040	CG	3	6	34800	34805	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
124	NC_009040	AT	3	6	35079	35084	50 %	50 %	0 %	0 %	126464830
125	NC_009040	CG	3	6	35381	35386	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
126	NC_009040	CG	3	6	36055	36060	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
127	NC_009040	CG	3	6	36479	36484	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
128	NC_009040	CT	3	6	36682	36687	0 %	50 %	0 %	50 %	126464832
129	NC_009040	GA	3	6	37395	37400	50 %	0 %	50 %	0 %	126464832
130	NC_009040	CG	3	6	37581	37586	0 %	0 %	50 %	50 %	126464832
131	NC_009040	TC	3	6	37708	37713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009040	CG	3	6	37889	37894	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
133	NC_009040	CG	3	6	38054	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
134	NC_009040	GC	3	6	38442	38447	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
135	NC_009040	GC	3	6	38681	38686	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
136	NC_009040	CG	3	6	38865	38870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009040	AG	3	6	39507	39512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009040	GC	3	6	39563	39568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009040	CG	3	6	39725	39730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009040	GC	3	6	39816	39821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009040	AC	3	6	39915	39920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009040	CG	3	6	40069	40074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009040	GC	3	6	40199	40204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009040	CG	3	6	40584	40589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009040	CG	3	6	40973	40978	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
146	NC_009040	CG	3	6	41017	41022	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
147	NC_009040	CG	3	6	41205	41210	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.